hy en en en en en en en en pt en en en en en en en en en en hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy en en en en hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy hy it fr de en sv fr de de fr fr fr sv en fr en ja fr de fr en es nb fr de en en sv de de fr en fr en it fr en sv en hy en en en en en en hy en en en en en en hy en hy en hy en hy en en en en en en
ԴՆԹ-ի կոդավորումը – Caucasus Barcode of Life
Assessing the Biodiversity of the Caucasus
The first long-term beech forest monitoring plots in Georgia
First Meeting of Arachnologists in the Caucasus, March 2021
Առաջին նախագծերի առանցքային տարրը (Օր. Kintrishi transect-ը GGBC- ում) ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորումն է։ Ապագա նախագծերը կառուցվելու են այս ենթակառուցվածքի վրա:
Ի՞նչ է ԴՆԹ–ի կոդավորումը:
ԴՆԹ-ի շտրիխ ծածկագրերը (տե՛ս Wiki) շատ կարճ գենի հատվածներ են, որոնք օգտագործվում են որպես ԴՆԹ-ի յուրահատւկ հետքանիշ: Այս հետքանիշների հաջորդականությունների հիման վրա անհայտ առանձնյակները (կենդանիներ, բույսեր, սնկեր, մանրէներ) կարող են տարբերակվել տեսակների: Յուրաքանչյուր տեսակ բնութագրվում է հստակ շտրիխ կոդով: ԴՆԹ-ի շտրիխ ծածկագրերի միջոցով կասկածելի տեսակների նույնականացումը կարող է հեշտությամբ լուծվել. Շտրիխ կոդավորումը բացահայտում է տեսակների հարուստ խմբերը և կրիպտիկ տեսակների համակարգերը և թույլ է տալիս աշխատել զարգացման բարդ փուլերի (սպորներ, ձվեր, թրթուրներ) կամ հյուսվածքների բեկորների (օրինակ՝ միջատների ոտքեր, բույսերի արմատներ,  սնկային հիֆեր կամ մազեր) վրա:  Ահա ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորման տասը հիմնավոր պատճառներ (pdf ՝ CBOL):
Ստեղծված ԴՆԹ շտրիխ կոդերի տվյալների շտեմարանն առաջարկում է նույնիսկ ոչ մասնագետներին տեսակների նույնականացման արագ, հուսալի և ծախսարդյունավետ գործիք:  Օգտագործելով ԴՆԹ հետքերը, որոնք օրգանիզմները թողնում են իրենց միջավայրում, նույնիսկ ջրի, հողի կամ միջատների թակարդների վրա, նմուշները կարող են վերլուծվել առանց անհատների տեսակավորման և առանց հյուսվածքների նմուշների օգտագործման:
Կովկասի համար շտրիխ կոդերի տվյալների շտեմարանի կառուցում ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորման նախագծերում առաջին քայլը  տեղեկատու տվյալների շտեմարանի կառուցումն է, որը գիտական ​​տեսակների անվանումները կապում է իրենց հետքանշված ԴՆԹ հաջորդականությունների հետ: Շտրիխ կոդերի տեղեկատու գրադարան կառուցելը աշխատատար գործընթաց է: Անհրաժեշտ է հավաքել անհատական ​​նմուշներ (մի քանի հատ ըստ տեսակների) և մանրակրկիտ ձևով հետազոտել ձևաբանորեն, նախքան դրանց ԴՆԹ-ի հաջորդականության վերծանումը և տվյալների բազայում ավելացումը: CaBOL-ի շրջանակներում մենք կատարում ենք առաջին քայլերը՝ տեսակների համար հատուկ ԴՆԹ շտրիխ կոդերի հաջորդականությունների համար Վրաստանում հանրային մատչելի տեղեկատվական շտեմարան կազմելու համար, որն օգնում է Գերմանիայի կյանքի շտրիխ կոդով ձեռք բերված փորձին: Հուսով ենք, որ լրացուցիչ գործընկերների հետ մենք կկարողանանք ընդլայնել այս ջանքերը Կովկասի տարածաշրջանի մյուս երկրներում: ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորումը շատ հարմար միջոց է առաջարկում Կովկասի կենսաբանական ժառանգությունը համակարգելու, հասկանալու, կատալոգ ստեղծելու և, ի վերջո, պահպանելու համար:
1.Նմուշառում. ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորման նախագծերը նմուշներ են ձեռք բերում տարբեր աղբյուրներից. Սիրողական կարգաբանների և թանգարանային հավաքածուների մասնավոր հավաքածուներից (օր.՝ բնագիտական թանգարաններ, կենդանաբանական այգիներ, բուսաբանական այգիներ և սերմերի բանկեր): Թանգարանի նմուշները մանրակրկիտ ստուգվելու են ԴՆԹ-ի որակի տեսակետից` ԴՆԹ-ի հուսալի կոդավորումն ապահովելու համար: Գիտնականների և քաղաքացի գիտնականների կողմից ոլորտում հավաքված թարմ նյութեր: CaBOL կարգաբանների հաջողությունները կախված են որակյալ քաղաքացի գիտնականների ակտիվ աջակցությունից: Դրանք էապես նպաստում են ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորման համար օրգանիզմների հավաքագրմանը, համապատասխան ձևով պահպանմանը և նույնականացմանը:
2.Տվյալների հավաք. Յուրաքանչյուր նմուշի համար կգրանցվեն տաքսոնոգրաֆիկ նույնականացման և հավաքագրման տվյալները (այսինքն ՝ նմուշառման վայրը և ամսաթիվը, աշխարհագրական կոորդինատները, հավաքման եղանակը, կոլեկտորների անունը և այլն):
3.Լուսանկարներ. Օրգանիզմները նկարվելու են իրենց բնական միջավայրում և լաբորատորիայում:
4.Հավաքածու. Ուղեգրերը կպահվեն համապատասխան CaBOL հաստատությունների հավաքածուներում:
5.DNA/ԴՆԹ  անջատում. Լաբորատոր տեխնիկայում յուրաքանչյուր նմուշից մեկուսացրեք մի փոքր կտոր հյուսվածք և արդյունահանեք ԴՆԹ:
6. PCR. ԴՆԹ շտրիխկոդի շրջանը մեկուսացված կլինի և բազմապատկվելու է `օգտագործելով PCR (պոլիմերազային շղթայական ռեակցիա) ուժեղացում:
7. Հաջորդականացում. ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդը կստեղծվի, որը բաղկացած է մի քանի հարյուր բազային զույգի երկար հաջորդականությունից՝ չորս տարբեր տառերից (օրինակ ՝ CAATCGGTAA): Այս տառերը ներկայացնում են ԴՆԹ-ն կազմող չորս նուկլեոտիդներից (Adenin, Guanin, Thymin և Cytosin):
8.Տվյալների վավերացում. CaBOL գիտնականների կողմից նմուշների հաջորդականությունները և մետատվյալները (հավաքածուի տվյալներ, տաքսոնոմիա, լուսանկարներ) կփորձարկվեն ամբողջականության և որակի համար:
9.NCBI. ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը ներառող տեսակների պրոֆիլը մուտքագրվում է ԴՆԹ-ի շտրիխ ծածկագրերի գլոբալ տեղեկատու տվյալների շտեմարաններ:
Ցուցադրված աշխատանքային գործընթացը համապատասխանում է գերմանական կյանքի շտրիխ կոդի աշխատանքային գործընթացին, CaBOL- ի նպատակներից մեկն է այդ աշխատանքային հոսքի իրականացումը Կովկասում:
Choose a language English ქართული Հայերեն
12:00 PM - CaBOL database meeting
3:00 PM - CaBOL meeting
12: 00 - 14: 00
We will meet at 12.00 Tbilisi time to discuss the server change from Bonn to ISU and Diversity Workbench update. Here is the zoom link: [...]
15: 00 - 16: 00
We will meet online at 15.00 Tbilisi time via zoom - here is the link: https://uni-bonn.zoom.us/j/69128362836?pwd=bjZweHl5VzUxMCtSclQ5bHQ2RDdCQT09 Here is the agenda: 1) reports from all [...]
© 2021-22 Caucasus Barcode of Life