These studies apply force field methods such as the Merck Molecular Force Field ( MMFF® ) and AMBER ® to molecular dynamics and free-energy calculations on explicitly solvated systems, as well as conventional gas-phase minimizations.
Lorsque la structure d’une cible thérapeutique est inconnue, des méthodes plus abstraites, telles la recherche par similarité/dissimilarité et la cartographie des pharmacophores, peuvent être utilisées. Un grand nombre de ces méthodes computationnelles a été mis de l’avant par les Laboratoires de recherche Merck à l’échelle mondiale.