It is also charged with setting up a national system of marine protected areas, the National Marine Conservation Areas Program, to represent the full range of marine ecosystems found in Canada's Atlantic, Arctic and Pacific oceans, and the Great Lakes.
Cette agence a aussi le mandat de mettre sur pied un système national d'aires marines protégées : le Programme des aires marines nationales de conservation dont le but est de représenter la diversité des milieux marins du Canada dans les océans Atlantique, Arctique et Pacifique, et les Grands Lacs.