우리나라는 또한 2002년부터 2008년까지 남북 철도·도로 연결사업을 위해 남북협력기금 5,852억원을 집행했다. 이 중 북측 구간에 대해 우리 측이 차관 형태로 제공한 자재와 장비가 1,494억원어치다. 북한은 이 돈 역시 10년 거치 20년 상환, 연리 1%의 조건으로 갚아야 한다.
다만, 이 차관의 상환조건이 ‘공사 완료후 10년 거치 20년 분할 상환’이었는바, 현 정부 출범 이후 공사 자체가 중단되었기 때문에, 정확한 상환일정은 현재 나와있지 않은 상태다.
위 금액들에 대한 상환문제도 앞서 식량차관 문제와 같이 남북관계가 경색되어 있는 상황에서 해법이 난망한 실정이다.