축차적(recursive) 구조를 가정한 VAR 분석에서 제기되는 문제점의 하나는 변수의 순서에 따라 충격반응함수의 다르게 추정될 수 있다는 것이다.
본 분석에서 가정된 변수의 순서는 일반적인 관행을 따른 것이고 경제적으로 의미가 있는 것이지만 이론의 여지가 없는 것은 아니다.
부록 〈Figure A.1〉에는 주가지수와 환율의 순서를 바꾼 경우의 충격반응을 보고하고 있는데, VAR 모형의 내생변수들의 순서를 바꾸는 경우에도 국면에 따른 불확실성 증가 충격에 대한 금융시장의 반응은 유사하게 나타나고 있다.
또한 VAR 시차변수를 12월까지 증가시키면서 모형을 추정해 보았으나 유의미한 차이가 발견되지 않았으며, 따라서 본 분석결과는 시차변수의 선택에도 강건성을 보였다.
마지막으로 이미 언급된 바와 같이 임계변수의 선택이 추정결과에 영향을 미칠 수 있다.
자료의 사용가능성이라는 제약 하에서 신용 스프레드 이외에 고려할 만한 변수는 주가지수이다.
그러나 KOSPI 지수 증가율을 임계변수로 사용하는 경우, 음(-)의 분산-공분산(variance-covariance) 문제가 발생되는 등의 문제가 발생되었다(논문의 간결성을 위해 주가지수를 임계변수로 사용한 추정결과를 보고하지는 않았다).
이는 아마도 주가지수가 다양한 종류의 금융시장의 전반적인 스트레스를 반영할 만큼 충분히 포괄적인 지수는 아니기 때문에 발생한 문제로 판단된다.