SDGs 이행에 있어서도 통합성이 확보되지 않고 있다(유웅조, 2015). 이로 인하여 국내적으로는 장기적인 ODA의 목표와 전략도 부재하고, 부처 간의 협조가 이루어지지 않아, 유사･중복의 문제가 발생한다. 국외적으로는 한국의 각 부처들이 경쟁적으로 원조수원국의 부처를 직접 접촉하다 보니, 원조수원국 정부의 피로감과 행정부담을 가중시키고 있다. 동일한 원조수원국에 대하여 한국의 각 부처 간에 정보를 단절한 채 경쟁하는 경우도 많다.
DAC 회원국 중 후발주자이고 원조규모도 상대적으로 적은 상황하에서, 현재와 같이 분절화된 체계로는 효율성을 추구하기 힘들 뿐만 아니라, 다른 원조공여국과 경쟁할 수 없다. 한국의 ODA 예산이 다른 원조공여국보다 적은 상황에서 비효율적인 운영이 이루어지고 있는 것이다.