일본에서도 미국에서와 마찬가지로 독점금지법위반의 방지에 관해서 컴플라이언스 프로그램(compliance program)의 발전이 가시화되었다. 1989년 이래 일본에서는 독점금지법의 집행이 강화되고 독점금지법에 대한 사회적 인식이 고조된 한편, 공정거래위원회로부터 독점금지법의 적용에 관한 다수의 가이드라인이 공표되면서 독점금지위반의 방지에 관한 컴플라이언스 프로그램의 중요성이 재차 지적되었다. 그와 같은 상황에서 1991년에 잇달아 공간(公刊)된 컴플라이언스 프로그램에 관한 지침서도 독점금지법위반의 방지를 위해서 실시되어야 할 컴플라이언스 프로그램에 관한 기본적인 사항을 설명함으로써 많은 기업들이 컴플라이언스 프로그램을 도입하는 데에 기여했으며, 그 후 그 영역도 내부자거래방지, 이익공여방지 및 환경보호 등으로 확대되었다. 당시 일본에서는 업계마다 컴플라이언스 프로그램에 관한 통일적인 지침서가 작성된 후에 그것이 각 기업에 일제히 도입되었는데, 그와 같은 환경을 조성한 것으로서 이른바 <기업관리(corporate governance)이론>이다. <기업관리(corporate governance)이론>은 기업의 실적을 높이기 위한 효율적인 경영방식과 아울러 법규를 준수하기 위한 경영방식을 대상으로 삼는 것인데, 단순히 기업윤리강령의 채택과 같은 형식적인 조치뿐만 아니라 실질적이고 효과적인 준법대책에 주목하는 것이다. 그러한 논의의 과정에서 컴플라이언스 프로그램의 중요성도 폭넓게 인식되었다고 볼 수 있다.