그러나 현 정부들어 전 산업의 IT화를 통한 국가 경쟁력 강화를 목표로 정보통신부를 폐지하게 되면서 기존의 정보통신부의 기능은 방송통신위원회(방송ㆍ통신ㆍ인터넷ㆍ네트워크), 지식경제부(IT산업ㆍ소프트웨어), 행정안전부(전자정부ㆍ정보화ㆍ정보보호), 문화체육관광부(디지털콘텐츠)의 4개 정부부처로 이관되었다.
이 과정에서 정보통신부 해체 이후 분산된 ICT관련 정책의 조정 역할로서 대통령 직속의 IT특보를 신설하였으나 콘트롤타워의 역할을 수행하기에는 한계가 있었다. 이후 2009년 11월 국무총리실 산하에 국가정보화전략위원회가 출범하였으나, 이 역시 국가정보화 기본계획 및 시행계획의 심의, 정보화 정책의 조정, 정보문화 창달 및 정보격차 해소사업 심의 등의 역할에 국한되었다.
따라서 정부부처 개편이후 IT 콘트롤타워의 필요성에 대한 논의는 IT관련 기능분산의 문제점이 현실적으로 구체화되면서 더욱 힘을 얻으면서 제기되어왔다.