이 당시 일본의 정치 양극화 현상은 오히려 자민당 내부에서 종종 나타났다. 자민당은 파벌들의 연합체였다. 파벌 간의 당의 노선이나 특정 이슈를 두고 종종 경쟁이 있었다. 이는 파벌의 규모와 조직력이 독립적인 정당에 준할 정도로 강력하며 독자적인 기능을 수행할 수 있었기 때문이었다. 자민당 내 파벌은 크게 보수우파와 보수리버럴로 구분된다. 보수우파는 기본적으로 미일동맹의 중요성에 대해서 동의하지만 미국의 안전보장 하에서의 일본의 안보 차원의 역할에 대한 입장 차이를 보인다. 보수리버럴은 기본적으로 안보적 역할은 미국에 맡기고 일본은 경제성장에 집중한다는 입장이다. 하지만 자민당 내 보수리버럴과 보수우파 사이의 정치노선의 차이는 파벌의 역할을 통해 당의 분열로 연결되지 않도록 관리되었다. 총재 선출이나 중요 포스트 배정에서 파벌 사이의 이해관계 과정을 통해, 보수리버럴과 보수우파 사이의 노선 대립을 넘어서는 이해 조정메커니즘이 작동했다. 따라서 1993년 정치개혁을 둘러싼 갈등으로 인해 당이 분열되기 전까지 파벌 간의 갈등으로 인해 당이 분열되는 양상은 없었다.
이후 일본의 정치적 균열은 소선거구제가 도입된 영향에 따라 우선 정당엘리트 사이의 대립과 갈등에서 크게 작용하였다. 예컨대 호소카와 비자민 연립내각에서 사회당이 이탈한 것, 통합 신당으로서 정권교체를 담당할 것으로 기대되면 거대 야당으로 출범했던 신진당이 해체된 것 등은 정당엘리트들의 당내 주도권 다툼과 정책노선의 대립이 가장 큰 요인이었다. 이후 새로운 정당의 등장과 뒤이은 분열 등의 현상도 정당엘리트들 사이의 갈등이 주요인이었다.