1995년 개정된 신용보증기금법은 신용보증재원 조성의 루트를 다변화하기 위해 정부, 금융기관 뿐만아니라 그 밖의 자도 출연할 수 있도록 하고, 금융기관의 출연시한을 2000년말까지 연장하며, 운용배수를 20배 범위내로 확대하고, 지역신용보증조합의 설립 시 신용보증기금이 이에 대한 재보증할 수 있는 법적 근거를 마련하였으며, 보증요율의 최고한도를 폐지하는 내용을 핵심으로 하였다.
이 시기 신용보증기금의 내부적 변화 양상을 살펴보면 보증건전화를 위해 각종 심사지표를 전면 개정하였으며, 보증금액 사정한도와 보증심사운용기준을 대폭 강화하고, 보증심사의 전문성을 확보하기 위해 전문심사역제도를 도입하였다. 또한, 누적적 부실 증가에 따른 경영위기 국면을 타개하기 위해 구상권 회수활동 또한 대폭 강화되었다. 신용보증기금 내부적으로 직급 중심이 아닌 업무 중심으로 조직을 편재하기 위해 1995년 11월부터 전면적으로 팀제를 시행하는 등 안팎의 경영위기를 극복하기 위한 신용보증기관 내부의 제도변화가 지속하였다.