2. 대법원장의 헌법재판관 지명권의 문제점
3부에 의한 선출방식의 문제에 있어서 가장 많은 비판을 받는 것 중의 하나는 대법원장의 지명권에 관한 것이며, 이와 관련된 내용은 다음과 같다.
우선, 대법원장은 국민에 의하여 직접 선출되지 않는다는 점에서 대법원장에 의한 헌법재판소 재판관 지명은 대통령의 지명과 국회에 의한 선출에 비해 국민적 정당성이 약하다는 견해가 있다.
또한, 대법원장의 지명권행사는 절대적 권력이므로, 대법원장이 직접 재판관 3인을 지명하는 것은 지나친 권력집중이라는 견해도 있다.
한편, 대법원장이 대통령과 국회다수파의 결합에 의해 임명되는 상황에서 대법원장의 지명 몫도 대통령과 국회다수파의 영향력으로부터 자유롭지 못할 수 있다. 따라서 대통령 소속정파에 유리할 수 있는 국면은 더욱 강화되고 구성에 있어서의 다원성은 더욱 약화될 것이라는 의견도 제시된다.