본 연구는 예타 면제 사업 중에서도 3대 문화권 사업에 국한되었고, 사업이 완료된 이후 실제로 지자체에서 운영을 시작한 지 2-3년밖에 되지 않은 두 개의 지자체의 사례에 제한한 분석이라는 점에서 일반화의 한계가 있으리라고 생각된다. 또한 본 연구에서는 사업 시행 후 몇 년이 지나지 않은 현재의 시점에서 예타 면제된 사업이 지자체의 재정운영에 미치는 문제점을 제기함으로써, 장기적으로 예타 면제사업에 대한 평가가 아닌 단기적 시점에서의 문제점을 제기하는데 그쳐 예타 면제사업이 지역발전에 미친 효과와 함께 예타 면제로 인한 문제점을 비교하는 분석이 이루어지지 못한 점은 연구의 한계로 볼 수 있다.
그러나 분석 과정에서 아직 3대 문화권 사업 중 사업완료가 안된 안동시 및 군위군과 같은 경우도 오픈 이전단계에서 운영비 마련과 관련한 고심들을 하고 있는 자료들을 찾을 수 있었다. 이후 더 큰 규모의 다른 지자체의 사업들이 오픈된 이후 이들 지자체의 운영현황과 비교적 장기적인 자료가 분석된다면, 예타 면제 이후의 지자체의 사업 운영과 관련된 영향을 보다 포괄적으로 분석할 수 있을 것으로 본다.