시스템통합(SI)기업에 소속된 근로자의 경우 임금을 근로소득으로 신고하고 매월 급여에서 근로소득세와 사회보험료 근로자부담금을 공제한 차액을 지급 받는다. 반면에 프리랜서들은 용역의 대가를 사업소득으로 신고하고 3. 3%의 사업소득세만 공제한 차액을 지급 받는다. 프리랜서의 보수를 사업소득 처리하게 되면 기업입장에서는 근로소득세 산정과 연말정산의 번거로운 절차를 거치지 않아도 되고, 사회보험 사업장부담금과 기타 관리비용이 발생하지 않아 사업장의 간접비용이 감소하는 이점이 있다. 프리랜서 입장에서도 사업소득으로 처리 시 공제액이 적고 세금액을 손쉽게 계산하여 수령액을 확인할 수 있다는 편리성이 있어 사업소득방식을 선호하였다.
용역계약을 체결한 프리랜서는 업무의 독립성을 인정해주고 지휘·감독을 하지 않아야 하지만, 형식적 프리랜서형은 근로자와 함께 혼재되어 근무하면서 동일한 출퇴근 시간을 적용받고 있었다. 다만, 프리랜서는 사업장에 전속된 근로자가 아니므로 상대적으로 지각, 조퇴, 휴가사용 등에 대해 눈치를 덜 본다는 정도였다. 그럼에도 불구하고 프리랜서들은 업무를 수주하는데 있어 주변 인적 네트워크나 평판이 중요하기 때문에 실질적으로는 근태관리에서 자유로울 수 없다고 하였다.
한국정보통신산업노동조합이 2013년에 조사한 바에 따르면 IT근로자들의 주당 평균 근로시간은 57. 3시간으로 법에서 정한 연장근로의 한도 12시간을 상회하는 수준이었다. 더욱이 주당 70시간 이상 한다는 근로자의 비율이 19. 4%에 달하여 장시간근로의 문제가 심각한 것으로 나타났다. 한국노동사회연구소가 2014년 소프트웨어 산업종사자 875명을 설문조사한 결과에 따르면 이들의 하루 평균 노동시간은 9. 9시간(9시간 54분) , 연장노동은 2. 7시간(2시간 42분) 으로 집계됐다. 한 달에 1. 8회 휴일근무를 하고, 2. 1회 철야근무를 했다. 회사에 상주한 시간은 하루 평균 11시간42분이나 됐다. 조사결과에 다소 차이는 있으나 소프트웨어 산업 종사자들의 근로시간이 긴 것은 부인하기 어려울 것이다. 프리랜서를 대상으로 근로시간과 초과근로시간 현황을 구체적으로 조사한 결과는 없었으나, 프리랜서의 근로시간도 이와 크게 다르지 않을 것으로 보인다.