한편 일부 재정이 풍족한 곳을 제외하면, 공무원 인건비나 사회복지비 등 의무적으로 지출하여야 하는 법정 필수경비를 제외하고 지방자치단체가 자체사업을 추진할 수 있는 예산은 그리 많지 않다. 결국 지방자치단체는 재정의 상당부분을 중앙정부로부터의 이전재원에 의존하고, 그렇게 확보한 예산 역시 자유롭게 쓰지 못한다.
이 같은 열악한 재정구조는 지방자치단체가 자율적으로 책임을 지고 재정을 운용해 나가는데 걸림돌로 작용할 수밖에 없다.