다른 한 가지 문제점은 천연보호구역 지정 등에 있어서 심의를 진행하는 ‘문화재위원회’ 위원 가운데 천연기념물 분야의 광물·지질 분야 중 지형 또는 천연보호구역 가운데 지형과 관련된 분야를 심의할 전문가가 2009년 현재 전무하다는 것이다. 2009년 7월 31일 현재의 문화재위원회 위원은 80명이며 건축문화재분과위원회, 동산문화재분과위원회, 사적분과위원회, 무형문화재분과위원회, 천연기념물분과위원회, 매장문화재분과위원회, 근대문화재분과위원회, 민속문화재분과위원회, 세계유산분과위원회 등 분과위원회를 구성하여 운영하고 있다. 그러나 2009년 3월 이후 천연기념물중 광물 분야 그리고 천연 보호구역중 지형 분야의 전문 인력은 전무한 상태에서 각종 심의와 조사가 이뤄지고 있다. 또한 문화재위원회에 전문적인 판단을 제공하는 전문위원들의 경우 문화재위원회 규정 제11조에 따라 자격 여건 자체가 ｢고등교육법｣에 따른 대학에서 문화재의 보존·관리 및 활용과 관련된 학과의 조교수 분야에 재직하거나 재직하였던 자 또는 문화재의 보존·관리 및 활용과 관련된 업무에 5년 분야 종사한 자로 규정되어 있다. 물론 기관장의 재량에 따라 관련 전문가들이 위촉될 수는 있으며, 지형분야의 경우 전체 전문위원 19명 중 1명이 참여하고 있다. 그러나 이러한 비중은 천연기념물에서 지형분야가 차지하는 비중에 비하면 상당히 낮은 비율로 판단된다. 결국 특정 분야의 경우 전문 인력이 없는 정부 기관이 보호구역을 지정하고 조사 업무를 사실상 지방자치단체에 넘기면서 소관하는 기형적인 관리 구조가 정착되어 있고 볼 수 도 있으며 이에 대한 개선 노력이 필요하다.