지구당 폐지의 중요한 이유 중 하나는 지구당이 공조직으로서 정당의 풀뿌리 조직이 아닌 지구당 위원장의 사조직으로 운영되었기 때문이다. 현재 당원협의회에 대한 비판도 마찬가지로 자발적 풀뿌리 조직이라는 원래 취지와 다르게 기존 지구당처럼 중앙당의 예속기구나 당원협의회장 중심 조직으로 운영된다는 데서 비롯된다. 따라서 지역 정당이 지역 당원, 지지자, 유권자와의 소통 역할을 담당하고 여론과 민의를 수렴하여 정책 개발에 반영하는 풀뿌리 조직으로서의 기능을 해야 한다는 지구당 폐지 당시의 요구는 아직도 유효한 것이다. 김용호(2009)는 현재 발생하고 있는 지역 정당 관련 문제는 지구당 폐지 자체의 문제가 아니라 폐지 이후 정당의 풀뿌리 조직을 어떻게 만들어 갈 것인지에 대한 구상이나 노력이 부족하여 발생하는 것으로 보았다. 그러므로 향후 가장 시급하게 논의되어야 할 사안은 지구당의 부활이냐 현재 당원협의회를 유지하느냐 보다 어떻게 지역 정당조직을 풀뿌리 민주주의의 정치적 가치를 구현하는 조직으로 개선 또는 개혁할 것인가에 초점이 맞추어져야 한다.