이후 2008년 2월 29일에는 이들 협의체의 연합체 구성 요구에 따른 허용 내용과 정부조직법의 개정에 의한 소관 중앙부처의 명칭 변경사항을 정리했었다. 그러나 이때의 법정화는 협의체의 빈발하는 건의와 의견을 정부가 소극적으로 처리하거나, 백안시함으로써 자치입법권의 신장을 비롯한 지방정부의 기능이 쇠퇴해지자 협의체에서는 국회에 이의 개선책으로 협의체나 연합체가 지방자치와 관련된 법률의 제정·개정 또는 폐지가 필요하다고 인정하는 경우에는 바로 국회에 서면으로 의견을 제출할 수 있도록 하는 개선을 촉구하였고, 이에 지난 2011년 7월 14일, 국회에서 의원발의로 제출된 관련규정의 개정으로 협의체의 법률 제·개정의견 제출제도를 신설하게 되었다.
그러나 여기에서도 문제가 있기는 마찬가지였다. 제18대 국회의 경우 협의체의 자치입법권 등의 신장을 위한 관련 법률의 제·개정 의견을 수용하지도 않았고, [표21]에서와 같이 자신들이 발의한 자치입법권 확대를 위한 관련 법률의 개정안마저 소관위원회 법안심사소위원회에 계류시키다가 임기만료로 폐기되고 말았다.