소방공무원 국가직화의 단점으로는 재난대응체계 측면에 있어서 자치단체장의 원활한 지휘·통솔에 기반한 지역사회 중심의 재난관리체계 구축이 어려울 수 있다는 점이다. 지역 재난대응 체계가 국가직인 소방과 지방직인 지자체 재난안전 부서로 이원화되어 효율적인 대응이 곤란해 질 수 있다.
그리고 지방 분권 및 지역 생활안전 서비스 제공의 측면에서 지역수준의 화재·재난 대응 기능은 해당 지역의 지리·경제·문화적 특성 및 인구구조 등에 따른 지역 특성을 반영해야 하는데, 국가직 전환시 소방서비스가 표준화·획일화될 우려가 있다. 또한 현재는 지역 소방조직의 최종 책임을 시·도지사가 가지고 주민들의 요구에 민감하게 반응하며 민주적 통제가 가능하나, 국가공무원으로 전환될 경우 지역주민보다는 중앙정부의 입장을 더 고려하게 되어 대형재난 이외에 주민의 생활안전 서비스에 대한 관심 및 대응이 저하될 가능성이 우려된다.