2) 공소시효의 정지와 배제
공소시효 정지란 일정한 사유가 발생하는 경우, 그 사유가 존재하는 동안은 시효가 진행하지 않은 채 정지되고, 그 사유가 없어지면 나머지 기간을 진행시키는 제도이다. 현행법상 공소시효 정지사유로는 공소의 제기, 재정신청, 범인의 해외도피, 소년보호 사건의 심리개시 결정 등을 들 수 있다.
이러한 통상의 형사소송절차에 따른 공소시효 정지사유 외에도 「5·18민주화운동 등에 관한 특별법」 등과 같이 국가 소추권 행사의 장애 사유 존재를 이유로 공소시효의 진행이 정지되는 것으로 간주하는 경우가 있다.
공소시효 배제란 특정 범죄에 대하여 공소시효의 적용 자체를 배제하여 범죄자를 처벌하는 제도인 바, 현재 「헌정질서 파괴범죄의 공소시효 등에 관한 특례법」상 헌정질서 파괴범죄(「형법」상 내란, 외환의 죄)와 최근 국회를 통과한 「성폭력범죄의 처벌 등에 관한 특례법」상 장애인 여성과 아동을 대상으로 한 성폭력범죄(강간죄, 준강간죄)를 예로 들 수 있다.