한편 중앙정부는 이러한 지방자치단체를 뒷받침하기 위한 재정관리제도를 정비해야 한다. 행정안전부는 위법·부당하게 예산을 집행한 지방자치단체에 대해서는 교부세 감액 등의 조치를 취하여야 한다. 또한 재정 상태가 심각한 지방자치단체에 대해서는 심층 재정진단을 실시하고 지방채발행한도 기준을 엄격하게 적용할 필요가 있다.
주민들이 이해하기 쉬운 재정정보공개기준을 마련하는 등 2011년 전면 도입된 주민참여예산제 활성화를 위한 방안도 검토할 수 있을 것이다.
마지막으로는 국세인 부가가치세의 5%에 불과한 지방소비세 이양 규모를 확대하고, 신규세원을 발굴하는 등 지방재정의 열악한 구조를 개선하기 위한 노력이 병행되어야 할 것이다. 결국 지방자치단체의 재정자율성과 책임성 강화 없이는 지방재정의 건전성 역시 담보되기 어렵기 때문이다.