「4대강 수계법」은 수변구역 지정 및 관리, 수질오염물질 총량관리 도입 등을 골자로 하고 있으며, 상류지역의 상수원 수질을 개선하고 규제로 인해 피해를 입고 있는 주민지원사업에 소요되는 4대강 수계기금의 확보를 위하여 물을 공급받는 하류지역 주민들로부터 ‘물이용부담금’을 부과하는 ‘물이용부담금’ 제도를 도입하였다. ‘물이용부담금’은 「4대강 수계법」에서 정한 공공수역으로부터 취수된 원수를 직접 또는 정수하여 공급받는 최종수요자에게 물 사용량에 비례하여 부과한다.
수계별 ‘물이용부담금’ 부과대상 공공수역을 보면, 한강수계의 경우 팔당호 및 팔당댐 하류의 한강 본류, 금강수계의 경우 금강 본류와 댐 수역으로 비슷하게 설정되어 있다. 반면, 낙동강수계는 낙동강 본류와 댐 수역뿐만 아니라 댐에서 본류까지의 지류지역도 포함하고 있으며, 영산강·섬진강수계는 강 본류를 포함하지 않고 주암호·동복호·상사호·이사천의 역조정지댐·수어호 및 탐진호 수역만을 포함하고 있다.