그러나 노동조합이 만들어지고 4월 중순 불법파견 진정에 대해 불법파견이라는 판정이 내려지자 회사는 3~6개월 단기계약직들에 대해 계약을 해지하기 시작하였다. 한편 불법파견 판정이 나자 GM대우자동차 노동조합 본조와 창원지부는 ‘불법파견대책위원회’를 구성, 불법파견 판정을 받은 비정규직 노동자 전원 정규직화, 3~6개월 단기계약직 고용안정 유지, 동일노동 동일임금 요구, 불법파견 완전 근절, 비정규직 노조활동 보장, GM대우자동차 최고경영자 공식사과, GM대우자동차 창원공장 조합원 고용안정에 대한 중장기 계획 등 7개 요구를 제시했으나 회사측은 거부했다. 또한 사내하청업체 대표자들과의 교섭도 20여 차례가 진행되는 동안 진전되지 않았다. 결국 비정규직지회는 파업에 돌입하였고 굴뚝농성 등 강경한 투쟁을 전개하였으나 이 과정에서 회사의 지속적인 계약해지, 정규직 집행부의 불신임 등으로 인해 노동조합이 무력화되는 결과를 낳게 되었다. 그 후 2006년 5월 GM대우 창원공장 비정규직 복직을 요구하면서 경남지역 노동자 5천여명이 연대총파업을 선언하자 GM대우 노사가 특별교섭을 진행해 ▲해고자 35명 재입사(28명은 7월 1일 이전 입사, 7명은 11월 1일까지 입사완료) ▲고소 철회 ▲손해배상·가압류 철회 등에 합의했다.