이는 공채 입사로 평생직장을 택하는 인력들과는 다른 방식으로 기금운용본부의 채용조건을 마련해야 할 필요가 있다는 것을 의미한다. 기금운용본부의 충원 대상자들에게 명시적인 보상뿐만 아니라 묵시적으로 발생하는 비용까지 적절하게 보상하지 않고서는 우수한 전문인력을 확보하는 데 어려움을 겪을 가능성이 높다. 현재 기금운용본부 운용역들의 이탈을 막기 위해서도 보상체계의 변화가 꼭 필요하다. 사실 이는 기금운용본부의 전북 이전이 논의되던 때부터 지속적으로 제기되어 온 문제이다. 정부 역시 이 점을 인지하고 있는 것으로 보인다. 보건복지부 장관이 위원장인 기금운용위원회는 2017년 2월 말 기금운용본부의 이전과 관련해 기금 운용직 보수 인상 등의 처우 개선과 근무 여건 개선, 조직 개편과 인력 운영 개선 등의 대책을 추진하기로 하였다. 그러나 이와 같은 대책이 앞에서 제시한 문제점들을 해소하고 있는지에 대해서는 아직 명확하지 않다. 도리어 2017년의 높은 수익률 달성에도 불구하고 기금운용위원회가 성과를 바탕으로 지급하기로 한 보상안에 따른 성과급조차도 제때에 지급하지 않은 상황이 벌어졌다.