이에 반하여 성과를 평가하기에는 시기상조라는 주장도 있다. 2003년의 1차 지정 때 경제자유구역으로 지정된 인천경제자유구역의 경우, 3단계로 구분하여 사업을 추진하고 있는데, 2009년에 종료된 1단계는 기반조성단계이며, 2010년부터 2014년까지 5년간은 성장/성숙단계로서 이 5년간이 사업의 성패를 가늠할 중요한 시기라고 판단하고 있다.
따라서 현재와 같이 개발사업이 본궤도에 오르지 않은데다가 규제완화나, 인센티브도 경쟁국에 비해 미흡한 상황에서 성과를 평가하고 해제를 고려하는 것은 시기상조라고 판단하는 것도 타당성을 지닌다. 2008년에 2차로 경제자유구역이 된 3개 광역권의 경우에는 지정 후 2년 정도밖에 경과하지 않았기 때문에 평가가 시기상조라는 주장은 더욱 무게를 지닌다.
또한 해제가 실제로 이루어 진다면 해제대상지역 주민 및 지방자치단체의 손실에 관한 문제도 진지하게 고려해야 한다. 경제자유구역으로 지정된 이후로 현재까지 길게는 7년이 흘렀으나 토지수용은 아직 이루어지지 않고 있는 실정이다. 이 때문에 해당 지역 주민들은 재산권을 행사 할 수 없어 투자의 기회비용이 초래되며, 특히 대출가구의 경우 매매가 금지되어 수년간 상당한 이자부담에 시달리는 등 여러 가지 문제가 발생했다.