(3) 한계
자동차부품 자기인증제도가 오히려 역효과를 낳을 수 있다는 부정적 의견도 있다.
우선 저가 중국산 제품을 정부가 인증해줌으로써 국내 부품 산업의 경쟁력이 오히려 약화될 수 있다는 주장이 제기된다. 자동차부품 자기인증제를 도입함으로써 정부가 정한 최저 안전기준을 간신히 통과한 안전도 낮은 부품을 정부가 양성화해주어, 품질 면에서 우위를 지키고 있는 국내 중소 부품업체의 시장경쟁력 약화를 초래할 수 있다는 것이다.
둘째, ｢품질경영 및 공산품안전관리법｣ 및 같은 법 시행규칙에서 일부 자동차 부품·장치 등에 대하여 안전인증 또는 자율안전확인제도를 규정하고 있고, ｢자동차관리법｣에 완성차 자기인증제도가 이미 존재하는 바, 부품에 대한 자기인증제도를 도입할 경우 업체의 과도한 부담을 발생시킬 수 있다는 주장이다. 하지만 ｢품질경영 및 공산품안전관리법｣에서 인증표시를 의무화 하는 부품은 자동차용 재생타이어, 안전유리, 브레이크액 등 몇 가지 품목으로 제한되어 있다는 점을 고려하여야 할 것이다.
셋째, 자동차 부품 검증은 현행처럼 완성차에 실제로 부품이 장착된 상태에서 검사를 하는 것이 효과적인데, 한 부품이 안전기준을 통과했어도 자동차 설계·구조에 따라 심각한 문제를 발생시킬 수 있다는 주장이 있다. 그러나 A/S 시장에서 거래되는 부품의 안전성 측면을 고려하였을 때, A/S 시장에서도 최소한의 안전 기준이 도입된다면 의미가 있을 것으로 판단된다.