그런데, 이러한 4·3 지방공휴일 조례 제정에 대해 위법성과 한계가 함께 지적되고 있다.
현행 규정상 지방자치단체는 「대한민국 헌법」(제117조)과 「지방자치법」(제22조)에 따라, 법령의 범위 안에서 자치에 관한 규정을 제정할 수 있으나, 주민의 권리 제한 또는 의무 부과, 벌칙과 관련한 사항을 정할 때에는 반드시 법률의 위임이 있어야 한다.
이와 관련하여 정부(인사혁신처)는 지난 1월 8일, 제주특별자치도에 관련 조례에 대해 재의요구를 요청하였다. 요청 근거로는, 조례로 공휴일을 별도 지정하기 위해서는 「지방자치법」 또는 공휴일 규정 등 개별 법령에 법적 근거가 필요한 점, 공휴일 규정에서 공휴일 지정을 정부의 권한으로 하고 있는 점, 공휴일을 조례로 지자체마다 달리 정할 경우 국민불편과 혼란이 야기되고 국가사무 처리의 어려움이 초래될 우려가 있는 점 등을 들고 있다.
한편, 조례안 발의 취지가 제주도민 모두가 4·3희생자를 추념하고 도민화합과 통합을 도모하려는 것임에도 불구하고, 통과된 조례안의 경우 적용 대상이 제주특별자치도 소속 공무원및 산하기관 근로자로 한정하고 있어 입안 취지에 부합하지 않다는 지적도 있다. 즉, 지자체 공무원만 쉬는 휴일이 하루 늘어난 것에 불과하다는 것이다.