(2) 단점
반면, 결선투표제는 두 번에 걸쳐 투표를 실시하므로 선거비용의 증가와 선거관리의 어려움이 단점으로 대두된다. 정당의 이합집산이 잦은 국가나 정당체제의 유동성이 높은 국가의 경우 1차 투표에서 후보난립으로 정국불안과 혼란이 야기될 수 있다.
결선투표제에서는 유권자의 정치적 선택의 적실성에 대한 비판이 제기될 수도 있다. 유권자는 1차 투표에서 선택한 후보자를 2차 투표에서 찾지 못하면 1차 투표에서 선택한 후보자와 정치적 성향이 유사한 후보자에게 투표할 수밖에 없다. 유권자가 처음에 선택했던 후보자가 아닌 다른 후보자를 선택할 수밖에 없다는 점에서 유권자의 의사가 적실성있게 반영된다고 보기 어려운 측면이 있다.