그러나 앞으로 기존 금융기관과 핀테크 기업 간 경쟁이 더욱 심화될 것으로 예상되는 만큼 핀테크 기업의 시장 지배력 확대, 데이터 독점 등과 같은 불공정한 경쟁 행위 방지, 지급결제시스템 안전성 제고 등을 위한 제도적 장치를 강화할 필요성은 더욱 높아지고 있다. 
특히 2020년 6월에는 독일 최대의 핀테크 기업인 와이어카드가 회계부정으로 파산을 신청함에 따라 핀테크 기업에 대한 우려가 증대되기도 하였다. 
한편, 핀테크 기업이 소액결제시스템에 참가하더라도 지급결제업무는 발권력을 보유한 중앙은행의 고유업무이기 때문에 소액결제시스템과 관련된 중앙은행의 역할이 변하는 것은 아니다. 
이는 ‘지급-청산-결제’로 이어지는 과정에서 중앙은행의 결제리스크 관리 및 유동성 지원이 핵심이므로 중앙은행이 지급결제시스템 운영·관리의 중추적 역할을 수행할 수밖에 없기 때문이다. 
한국은행도 한국은행법 및 이에 근거한 금융통화위원회 규정을 통해 소액결제시스템에 대하여 차액결제 승인 및 대상거래 결정, 참가기준 결정, 결제 불이행 시 처리방법 등 결제리스크 관리장치를 마련하여 운영하고 있다.