일본의 암등록은 병원내 등록, 지역암등록, 전국 장기(臟器)암등록 및 국립암센터 내 암대책정보센터등록으로 이루어진다. 예컨대 환자가 A병원에서 암진단을 받고, B병원에서 암치료를 받은 경우에 A병원과 B병원은 각각 원내등록을 하고, 지역암등록기관 혹은 국립암센터 내 암대책정보센터에 이러한 사항을 보고한다. 지역암등록기관은 A병원과 B병원에서 보내온 정보가 동일인물 및 동일한 종류의 암으로 판단되면 1개의 암으로 등록하며, 환자의 생사여부와 같은 예후를 조사하여 국립암센터내의 암대책정보센터에 보고한다. 국립암센터 내의 암대책정보센터에서는 암등록 데이터를 수집하고, 일본전역에서의 5년간 발병률 및 생존율 등을 추산한다. 또한 암환자를 치료한 B병원은 환자의 예후를 조사하여 학회나 연구회에 설치된 장기(臟器)암등록 사무국에 보고한다.