(2) 반대하는 의견
이전공공기관 지역인재 채용의 의무화에 대해 반대하는 논거는 다음과 같다.
첫째, 이전공공기관이 이전한 지역의 지방대학 출신을 우선 고용하도록 하는 것은 수도권 지역 대학 출신 또는 타 지역 대학 출신들에 대한 역차별 논란을 야기할 수 있다.
둘째, 이전공공기관 지역인재 채용제도는 공공기관 입사시험 성적에 따라 선발하는 현행 채용 제도에 비하여 합격자의 질 저하로 업무의 전문성과 생산성을 저하시키고, 실적주의를 위협할 수 있다. 또한, 지역인재에 대한 우대는 특정 집단의 이익을 지나치게 우선시함으로써 개인의 권익을 지나치게 침해할 우려가 있으며, 지역인재 채용비율이 클 경우에는 위헌 여부에 대한 논란이 발생할 가능성도 있다.
셋째, 현재 시행되고 있는 이전공공기관 지역인재 채용제도는 지방대학 출신 채용을 장려하는 방식으로 운영되고 있어 해당 인재가 지역을 대표하는 지역인재라고 볼 수 있는지에 대한 논란이 발생할 우려가 있다.
예를 들어, 현행 제도에 따르면, 서울 등 수도권지역 출신이더라도 지방대학을 졸업하면 지역인재에 포함되어 제도의 혜택을 누릴 수 있지만, 이전지역 출신이 서울 소재 대학을 졸업한 후 귀향하는 경우에는 지역인재로 인정되지 않는다.