그러나, 현재의 기준으로 사용되는 영업수익은 금융기관의 규모를 전체적으로 반영하는 데 한계가 있다. 왜냐하면, 금융기관의 규모는 정태적인 측면과 활동적(동태적) 측면의 양 측면에서 측정되는데, 영업수익은 금융기관의 활동적 측면의 규모만을 반영하기 때문이다. 따라서, 금융기관의 정태적 측면의 규모를 반영하기 위해 금융기관의 총자산도 같이 고려하여 권역별 배분기준을 정하는 것이 보다 합리적이다. 외국의 사례를 보더라도 영국 FSA의 경우 총 자산을 반영하고 있으며, 미국 OCC의 경우에도 총 자산 등 규모를 금융기관에 부과하는 수수료의 부과 기준으로 삼고 있다. 따라서, 현행금융감독원의 금융 영역별 분담금 부과 기준을 현재의 투입인력 60% 영업수익 40% 기준을 투입인력 40% 총자산 30% 영업 수익 30% 기준으로 변경하는 것이 보다 합리적이라고 볼 수 있다.
그러나, 중장기적으로 보면 투입인력의 비중을 보다 줄이고, 금융기관의 규모 즉 리스크 유발 변수의 비중을 보다 높이는 것이 필요하다. 왜냐하면 상황에 따라 금융영역별 투입 인력 비중은 매년 바뀔 수 있고, 1년 중에도 상황에 따라 바뀔 수 있기 때문이다. 또한 선진 금융감독 기관의 추세 특히 영국의 금융감독청(FSA)와 미국의 통화감독청(OCC) 도 금융기관의 리스크를 유발하는 측정치로 금융기관의 규모를 사용하는 방향으로 가고 있다. 예를 들어, 미국의 OCC는 금융기관의 규모를 기준으로 감독분담금인 수수료를 부과하고 있으며, 영국의 FSA도 금융기관의 규모와 리스크를 기준으로 금융영역별 감독분담금을 부과하고 있다. 따라서, 장기적으로는 금융감독원의 금융 영역별 분담금 배분기준으로 전체적으로 금융기관의 규모를 나타내는 총자산과 영업수익을 사용하는 것이 보다 바람직할 것이다.