이후 10·4 남북공동선언 이행에 관한 제1차 남북총리회담에서는 전문가가 참여하는 분야별 실무접촉 진행 의제로서 서해평화협력특별지대, 조선협력단지, 철도-도로 개보수, 개성공단 활성화, 자원개발·환경보호·농협·보건협력 등이 제시되었으며, 이에 대한 분야별 접촉을 위한 파트너로 북측은 박호영 국토환경보건성 부장과 박정민 보건성 국장이 참석하고 남측은 김정석 보건복지부 국제협력관이 참석하였다(2007남북정상선언이행 종합기획단, 2007a: 3). 제1차 남북총리회담 합의문을 보면, “3. 민족경제의 균형적 발전과 공동번영을 위한 경제협력 추진의 4) 자원개발, 농업, 보건의료 등 분야별 협력”에서 “③ 남과 북은 병원, 의료기구, 제약공장 현대화 및 건설, 원료지원 등을 추진하고 전염병 통제와 한의학 발전을 위해 적극 협력하기로 하였다”고 명시되어 있다. 구체적으로는 “긴급구호 중심으로 추진되었던 당국 차원의 체계적 보건의료 협력을 적극 추진하기로 합의”하고 “당국간 병원, 의료기구, 제약공장 현대화, 원료지원, 전염병 통제, 한의학 발전 협력 등을 통해 남북 보건의료 협력 확대 계기 마련”을 언급하였다(2007남북정상선언이행 종합기획단, 2007b: 17). 또한 합의문에서는 “⑥ 남과 북은 지하자원개발, 농업, 보건의료, 수산, 환경보호 분야의 협력을 위해 「남북경제협력공동위원회」 산하에 분과위원회들을 구성·운영하기로 하였다”고 명시되어 있다. 기존의 긴급구호 보건의료 지원을 넘어 남북 보건의료 협력으로 질적 전환할 것을 합의한 것이다.