그러나 위원회의 설치만으로 국회의원의 윤리와 특권남용의 문제가 완화될 수는 없었다. 14대부터 16대까지 윤리특위는 다수의 징계요구안을 접수했으나(14대 3건, 15대 44건, 16대 13건), 부결되거나 폐기 또는 철회, 당사자들의 사직 등의 이유로 처리된 것 외에는 모두 임기만료와 함께 자동 폐기되었다(박석희, 2006: 116). 이는 무엇보다 징계안의 처리가 동료의원들에 대한 불이익을 결정하는 것이기 때문에 사회적 공감대가 형성되어 어쩔 수 없는 경우를 제외하고는 의원들의 적극적 대응을 기대하기 어렵다는 것을 의미한다. 국회법상 시간을 보내면 결국 임기 만료와 함께 폐기될 수밖에 없는데 굳이 동료의원을 징계하여 서로 불편한 관계를 가질 이유가 없다는 점도 한몫을 했다. 하지만 예외적으로 윤리특위가 적극적인 역할을 수행한 경우도 있었다. 2004년 17대 국회의 개원 직후 활발히 이루어진 윤리 특위의 활동이 그것이다. 2004년 6월 개원한 17대 국회에서는 12월 말까지 불과 7개월 동안 윤리심사 요구 3건, 징계요구 14건 등 총 17건이 특위에 상정되어 그중 6건이 가결 처리되었다.