2009년 1월 1일부터 건강기금에 속하는 질병금고들은 보험요율을 자율적 으로 결정할 수 없게 되고, 공적건강보험의 가입자들은 모두 동일한 보험요율을 적용받게 된다. 모든 보험료들이 건강기금으로 납입되고, 건강기금은 가입 자들의 연령, 성별 그리고 무엇보다도 건강상태에 따라 개별질병금고에 재원을 일괄 배분된다. 만약 특정 질병금고에 많은 비용이 소요되는 중대한 질병을 가지고 있는 가입자가 많을 경우, 해당 질병금고는 건강한 가입자가 많은 질병 금고 보다 더 많은 재원을 배분받게 된다.
보험료부과상한선(Beitrags-Bemessungsgrenze)을 초과하는 소득 부분에 대해서는 보험료를 더 이상 추가로 납부하지 않아도 되는데, 부과상한선이 2011년에 연 44,550유로(월 기준으로는 3,712.5유로)이다. 일반적으로 연 수입을 기본으로 계산된 보험료를 매월 분할해서 납부한다. 연금수급자의 보험료는 기본적으로 일반가입자와 같은 비율의 보험요율을 곱한 금액을 연금수 급자와 연금보험관리기관이 절반씩 부담한다. 325유로 이하의 임금을 받는 인턴의 경우에는 고용주가 보험료 전액을 부담한다.
연방정부의 보조는 조세수입을 통해 조달되며 역시 건강기금에 납입된다. 재정상황에 따라 질병금고들은 추가보험료를 직접 징수할 수 있으며, 이 같은 보험료는 건강기금으로 이체하지 않고 질병금고에서 보유·활용할 수 있다. 2011년 1월 1일부터 ‘의료보험재정법(GKV-Finanzierungsgesetz)’이 발효됨에 따라 추가보험료는 좀 더 확대되었다.