다음으로 군 기능의 진화와 관련하여 신임 김관진 국방부장관의 언급에서도 보이듯이 그동안 우리 군의 상부구조는 조직구조 면에서 국방부, 합참, 각군본부 등 상부 지휘조직의 임무 및 역할이 애매하고, 조직의 관료성이 심화되고 있다는 지적을 지속적으로 받아왔다.
지휘관계와 관련하여 최근 미군의 사례에 대한 교훈 분석과 지휘구조에 대한 많은 논의들은 단일 전구(戰區)의 경우 단일 지휘관이 군사력 운용에 대하여 책임을 지고 통제한다는 개념을 강조하고 있다.
이는 미군이 수행했던 다수의 성공적인 군사작전 성공사례를 통해 도출되었으며, 이 같은 지휘관계의 정립은 합동 또는 연합된 팀을 조직하여 일관성 있고 효과적인 군사력활용이 가능하도록 하는 것이 궁극적인 목적이라고 할 수 있다.