한편, 제주도 투자진흥지구의 경우 다음과 같은 관련 쟁점이 있다. 첫째, 각종 세제혜택 등 인센티브를 받게 되지만 실질적으로는 지역경제에 미치는 영향은 그다지 크지 않다. 둘째, 투자진흥지구 지정 후 사후관리 시스템이 없다. 셋째, 업종에 관계없이 투자금액이 획일적으로 운영되고 있어 대부분 전문휴양업(40.8%)이나 관광호텔업(24.5%)에 집중되고 있다. 넷째, 우리나라의 해당지역 경관에 어울리지 않는 복합리조트와 초고층빌딩이 계획ㆍ추진 중이어서 주민과 시민단체, 시의회 등의 반발이 발생하고 있다는 점을 들 수 있다.
한편 해외 사례를 살펴 본 결과, 외국인 토지소유를 금지하는 국가에서는 외국인에게 지나치게 배타적이어서 외국인의 투자 유치에 장애가 된다는 지적이 있었고, 외국인 토지소유총량제, 비거주자에 대한 토지취득 규모제한, 처분기간 제한 등 다양한 방법을 활용하여 외국인 토지소유가 공익을 침해하지 않도록 운용하고 있음을 알 수 있었다.