토론회는 2005년 8월 20일 토요일 오전 9시 30분부터 오후 5시, 삼성동 코엑스 컨퍼런스 센터 313호에서 개최되었다. 전문가 패널 토론시 공신력 있고 신뢰할 수 있는 사회자를 섭외하고 전반적인 부동산 정책 추진 방향에 대한 찬반을 고려하여 전문가를 2명씩 패널로 참여시켰다. 1차 설문조사에 참여한 511명 중 토론회에 참석하지 않은 464명에게 전체 토론 과정을 담은 동영상을 보내주었다. 동영상은 CD, 비디오 제공, 홈페이지를 통한 다운로드 등 응답자가 편리한 형태로 선택할 수 있도록 하였다. 토론 참가자(47명)를 대상으로 전체 토론을 마친 직후 1차 조사와 동일한 설문지를 이용하여 2차 조사를 실시하였으며, 토론 미참여자들(464명)은 토론회 동영상물을 시청하도록 한 후 2차 조사를 하였다. 당초 1차 조사에서는 511명을 대상으로 하였으나, 해외출장, 입원 등 개인사정으로 인해 2차 조사에서는 486명(토론참여자 47명 포함)만 설문에 응답하였다(표본 마모율 5%). 응답자 분포에는 변화가 거의 없었다. 1, 2차 설문 모두에 응한 486명의 조사 결과를 비교 분석하여 부동산 정책에 대한 의견변화 정도를 측정하였다. 조사결과를 반영하여 종합부동산세를 인별로 부과하되 기준 금액을 대폭 낮추는 방안 대신, 세대별 합산에 긍정적인 여론 등을 고려하여 합산과세를 추진키고 최종 결정하였으며, 일정 규모 이하 1세대 1주택자는 종합부동산 과세 강화 대상에서 제외하는 방안 역시 공론조사 결과 1차 55.5%, 2차 67.9%의 적용 찬성 의견을 고려하여 부과하기로 하였다. 이와 함께 재개발·재건축 규제 완화를 통한 중대형 공급이 필요하다는 의견은 1차 49.4%에서 2차 63.8%로 높아져 공영 재개발 시 85평방미터 이하 의무비율을 현행 80%에서 60% 이상으로 완화하기로 정책 수립 과정에서 반영하기로 하였다.
본 공론조사는 1억8천만 원 예산이 소요되었으며, 당시 국무조정실에서는 공공정책 등을 원활한 추진을 위해 사회적 합의 형성이 중요하다고 판단되는 경우 이해당사자, 일반시민, 전문가 등이 참여하는 의사결정 방법을 활용하고, 그 결과를 정책추진 과정에 충분히 반영하도록 규정하는 ‘공공기관의 갈등관리에 관한 법률’을 입법을 추진하면서 공론조사를 포함한 ‘참여적 의사결정 방법’을 고려한 바 있으나, 입법화되지 못하였다.