(2) 주거환경개선사업
2009년 4월 ‘포괄보조금’방식이 도입·시행됨에 따라 국토해양부에서 추진하던 주거환경개선사업의 일부가 2010년부터 농림수산식품부로 업무 이관되었다. 이에 따라 인구 50만 미만 120개 시·군의 주거환경개선사업을 농림수산식품부에서 담당하게 되었다.
이로 인하여 120개 시·군의 주거환경개선사업이 시행 도중에 담당부처가 변경되었다. 더욱이 이 사업들은 2013년 완료될 예정이다.
이처럼 담당부처의 변경 및 사업기간 부족 등으로 사업의 혼선 및 성과 부족 등이 우려되고 있는 실정이다.