동법 제17조에서는 자치위원회를 통한 가해학생에 대한 조치를 규정하고 있다. 자치위원회는 피해학생의 보호와 가해학생의 선도‧교육을 위하여 가해학생에 대하여 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 조치(수 개의 조치를 병과하는 경우를 포함한다)를 할 것을 학교의 장에게 요청하여야 한다. 각 조치의 적용 기준은 시행령으로 규정되어 있다. 퇴학처분의 경우, 의무교육과정에 있는 가해학생에 대해서는 적용하지 않는다.
자치위원회가 학교의 장에게 가해학생에 대한 조치를 요청할 때 그 이유가 피해학생이나 신고‧고발 학생에 대한 협박 또는 보복 행위일 경우에는 같은 조치를 병과하거나 조치 내용을 가중할 수 있다. 또한 일부 조치를 부과받은 가해학생은 교육감이 정한 기관에서 특별교육을 이수하거나 심리치료를 받아야 하며, 그 기간은 자치위원회에서 정하고 있다. 학교의 장은 가해학생에 대한 선도가 긴급하다고 인정할 경우 우선 제1호부터 제3호까지, 제5호 및 제6호의 조치를 할 수 있으며, 제5호와 제6호는 병과조치할 수 있다. 이 경우 자치위원회에 즉시 보고하여 추인을 받아야 한다.