지방자치단체가 지급하는 지방보조금의 예산편성 및 교부 절차, 보조사업 수행 및 관리 등에 관한 사항을 별도의 법률로 정해서 지방보조금의 운영체계를 정비하고 운영성과를 높여야 한다는 필요성이 제기되어 왔다. 이에 따라, 제21대 국회에서는 이명수 의원 등이 지방보조사업 회계의 신뢰성과 투명성을 높이도록 외부감사를 신설하는 내용의 「지방재정법」 일부개정법률안을 발의하였다. 또한, 이형석 의원 등이 지방보조금의 특수성을 반영하고 지방보조금 관리·운영 등에 관한 사항을 종합적으로 규정하는 「지방자치단체 보조금 관리에 관한 법률안」을 발의하였으며, 최종적으로 행정안전위원회 위원장이 「지방자치단체 보조금 관리에 관한 법률안」을 대안 발의하였다. 종합하면, 2021년 1월 12일에 「지방자치단체 보조금 관리에 관한 법률(법률 제17892호)」이 제정되어 2021년 7월 13일부터 시행 중이다.