창조경제 실현을 위한 출연(연) 발전전략 보고서에 따르면 60년대 후반에서 90년대 중반을 출연(연) 1.0 시대로 규정하고 해외 선진기술을 도입하여 소화하고, 산업성장의 핵심전략기술 개발을 선도하며, 기업 및 산업 이전을 위한 목적형 R&D를 수행한 시기로 규정한다. 이후 출연(연) 2.0시대인 90년대 중반부터 현재에는 연구개발 효율 증대를 위해 PBS 방식을 도입하고, 연구회 체제를 출범시키는 등 운영시스템이 갖추어졌으며, 선진국 추격형 R&D를 수행한 시기로 규정한다. 출연(연) 3.0 시대는 2013년 이후 혁신주체(산･학･연)간 협력을 통해 산업의 미래 비전을 제시하고, 국가적 문제를 해결하는 창조적･선도적 R&D로 창조경제를 구현하는 시기로 규정하고 있다.