셋째, 획득인력의 새로운 인사관리 시스템에 대한 지속적인 점검 및 관리를 통해 획득사업의 전문성과 투명성을 제고할 필요가 있다. 이와 관련, 일각에서는 방산비리 근절을 위해서는 방위사업청 직원들의 전문성 제고가 시급하다는 주장이 제기되어 왔다. 즉 방위사업청의 투명성보다도 전문성이 부족해 사업관리에 부실이 생겨 결국 예산 낭비와 직결된다는 것이다. 이에 따라 국방부는 방위사업청 근무 획득전문인력(현역 군인)의 전문성을 높이고 방위사업청 장기 근무로 인한 폐단을 해소하기 위해 그동안 유지해온 폐쇄형 인사관리를 개방형 인사관리로 전환하였다. 그러나 이를 놓고서도 각 군의 무기도입사업 과정에서 방위사업청에 영향력 행사가 용이하도록 순환보직제로 전환한 것이 아니냐는 지적이 제기되고 있기도 하다. 따라서 새로운 인사관리 시스템이 획득사업의 전문성과 투명성 강화에 부합할 수 있도록 지속적인 점검과 관리가 요구된다고 할 것이다.
한편 당초 방위사업청 내에 설립할 예정이었던 방위사업교육원을 국방부 산하에 두는 것이 방위사업 비리 근절과 민간 획득전문가 양성기관의 설립이라는 기본 취지에 부합하는지에 대해서는 향후 논란이 제기될 가능성이 있다. 동 교육원을 국방부 산하에 두는 데에 국방부와 방위사업청 간의 상호 협의가 있었던 것으로 알려지고 있지만 구체적인 결정과정에 대해서는 공개된 바가 없다. 따라서 방위사업교육원의 설립에 앞서 공청회 등을 통해 동 교육원의 설립 취지에 부합할 수 있는 보완책의 마련이 필요할 것이다.