(3) 평가의 객관성 확보
보조사업 운용평가는 2011년 시범 평가를 거쳐, 사실상 2012년 처음으로 정식 평가가 실시되었기 때문에 아직 평가 지표 등이 정립되지 않은 측면이 있다. 보조사업 운용평가가 보조사업 존치를 판단하는 절차로 자리잡기 위해서는, 피평가자가 평가 결과를 수용할 수 있도록 평가과정의 객관성과 신뢰성을 확보할 필요가 있다.
이러한 측면에서 우선 계량적 지표 등 객관적 기준을 마련하기 위한 지속적 노력이 필요하다. 특히 국가적 추진의 필요성, 중앙정부 재정지원의 필요성과 관련하여 보조사업의 공공성과 외부성 정도를 판단하는 객관적 기준을 고안함으로써 이를 국가의 지원수준 결정과 연계시키는 시스템의 마련도 검토할 필요가 있을 것으로 본다.
또한 보조사업평가단 구성시 행정학, 경제학, 경영학 뿐 아니라 여러 분야의 전문가가 포함되도록 하여, 보조사업에 대한 전문적 분석 및 평가가 이루어질 수 있도록 할 필요가 있다. 이에 더하여 평가단 구성의 공정성과 객관성을 확보하기 위한 방안도 지속적으로 모색할 필요가 있다.