이들 후보의 추천보조금이 정치적 소수인 여성과 장애인의 정치권 진입을 용이하게 한다는 취지에서 도입된 만큼 배분방식도 합목적적이어야 한다. 따라서 이 경우 정당이 실제로 추천한 후보자의 수를 기준으로 보조금을 배분하는 것이 타당하다고 할 것이다.
기탁금의 배분방식도 변경할 필요가 있다. 현행 방식은 지지하는 정당에 기탁하는 방식이 아니라, 선거관리위원회에 기탁하면 각 정당에 국고보조금 배분방식과 동일한 방식으로 지급되는 방식이다.
이러한 방식은 국고보조금과 마찬가지로 의석수가 많은 정당에 일방적으로 유리하다. 득표수를 고려한 방식으로 변경하든가, 아니면 지지하는 정당에게만 배분될 수 있도록 개선할 필요가 있다.