기업들의 혁신적인 지식재산활동은 국민경제 전체의 장기적이고 안정적 성장･발전을 위해 필수적인 반면 소규모의 개별 기업이 이러한 활동에 불가피하게 부수되는 잠재적인 거액의 쟁송위험에 개별적으로 대응하는 것은 매우 어려운 실정인데, 이와 같이 우리나라 경제의 미래 성장잠재력을 지속적으로 개척하기 위한 거시적 국정운영의 측면에서도 적절한 조세지원을 통해 지식재산공제의 가입기업을 충분히 확대시킬 수 있는 경제적 유인을 제공하는 것이 필요한 것이다. 이상과 같은 지식재산공제 가입 확대를 위한 조세지원의 필요성에 대한 인식과 함께 포괄적인 제도적 검토를 바탕으로 본 연구는 지식재산공제의 조기 정착과 안정적 운영에 공헌할 수 있는 구체적인 조세제도의 개편방안을 제시하고, 이를 통해 발생하는 세수변동을 포함한 다양한 경제적 효과를 확인함으로써 관련된 조세체계의 개편에 종합적으로 활용할 수 있는 분석결과를 제시하였다.