우리나라는 2010년부터 2018년까지 조류독감·구제역· 돼지열병 등의 가축 전염병 예방을 위한 가축 살처분 비용으로 3조 7천억원을 지출했다. 살처분은 농가와 정부의 경제적 부담이 될 뿐만 아니라, 환경오염과 살처분에 참여한 사람들의 극심한 정신적 스트레스를 유발하는 부작용도 수반한다. 이러한 부작용을 예방하기 위해서 일각에서는 가축전염병이 발생할 때마다 반복적으로 대형살처분을 하기 보다는 예방적 살처분기준 (전염병 발생 반경 3㎞ 범위) 을 처음부터 축사 이격거리 조건으로 허가해 대규모 살처분을 애초에 예방하는 방식이 도입되어야 한다는 의견도 있다.
친환경 축산으로의 전환과 함께 가축의 유전적 다양성을 높이는 정책도 강화될 필요가 있다. 가축의 유전적 다양성 보존이 우리 생존과도 직결되는 문제이기 때문이다.