이후 인구고령화에 따른 의료비 증가에 대응하고 국민의 질 높은 의료서비스 니즈에 부응하기 위하여 2006년부터 정부차원에서 실손의료보험의 활성화를 추진하였고 실손의료보험시장이 본격적으로 성장하기 시작하였다. 2012년 4월 기준으로 실손의료보험 가입자는 약 2,522만 명에 달하고 연간 수입보험료는 약 3.3조원(손해보험회사 2.5조원, 생명보험회사 0.8조원)으로 국민들의 상품인지도나 선호도가 가장 높은 보험상품이다.
하지만 시장의 성장과 함께 다음과 같은 문제점들이 지적되어졌다. 손해보험회사와 생명보험회사 간 실손의료보험의 보장률이 상이했고 특히 보장률이 100%였던 손해보험회사의 상품이 도덕적 해이(moral hazard)를 유발할 개연성이 높다는 지적이 지속되어졌다. 또한, 상품구조가 복잡하였으며 보상체계가 비례보장임에도 불구하고 실손의료보험에 중복가입하는 소비자들이 다수 발생하게 되었다. 소비자의 이해도를 제고시키고 중복가입을 최소화하기 위해 2009년 7월에는 중복가입확인 시스템을 마련하여 실손의료보험에 중복가입하여 필요 이상으로 보험료를 지불하지 않도록 개선하였으며, 2009년 10월 실손의료보험을 표준화하여 생명보험회사 및 손해보험회사 모두가 표준화된 상품을 판매하기 시작하였다.