이후 냉전의 종식이라는 국제환경의 변화와 중국의 개혁개방 및 한중수교 등 실용주의 외교노선의 추구, 이후 북한의 핵개발의 심화로 인해 북중간 상호 불신은 더욱 심화되었다고 할 수 있다. 북한은 더 이상 과거의 동맹관계를 토대로 하는 신뢰의 대상으로 중국을 대할 수 없게 되었다는 주장도 있다. 중국도 북한을 점차 ‘불편한 존재(a thorn in its side)’로 인식하기 시작하면서 북한과의 관계 재검토에 대한 중국 내 논쟁이 확산되기 시작했다.
이에 따라 북한과 중국의 유대관계를 유지시켰던 역사적 경험의 공유와 이데올로기적 동질의식은 점차 약화되었으며, 실용주의적인 전략적 이해관계가 북한과 중국의 관계를 규정하는 핵심적 요소가 되기 시작했다. 이에 따라 냉전 이후 북중 간 혈맹의 특수관계는 사실상 와해되고 ‘애매한’ 동맹관계가 이어져온 것으로 평가되는 경우도 있다.