2015년 10월, 중재재판소는 관할권 인용에 관한 159쪽 분량의 판정문을 발표했는데, 재판부는 판정문에서 절차상의 문제를 분석하고 중재재판소가 법률적으로 이러한 문제에 대해 관할권을 가진다고 판단하였다. 중재재판소는 관할권 문제를 매듭지은 후 9개월 동안 필리핀으로부터 변론서와 증거서류를 제출받았다. 중재재판소는 중재절차 내내 중국에게 서면 제출과 소송기록 검토 기회를 부여하였지만, 중국은 중재절차 개시단계부터 본안 판정이 내려질 때까지 재판에 참석하지 않았고, 어떠한 소송기록도 제출하지 않았다. 이에 중재재판소는 궐석재판을 인정하고 있는 유엔 해양법협약 제28조에 따라 중국의 불참에도 불구하고 중재절차를 계속 진행하였다. 중재재판소는 중국 정부가 발표한 성명서와 외교서한 등의 문건을 근거로 중국 측의 주장을 도출하는 한편, 필리핀 측만 참석한 구두심리를 계속 진행하였다. 구두변론이 종결한 후 중재재판소는 필리핀과 중국에 대해 추가 질의서를 송부하고, 답변과 이에 대한 근거자료를 요청하였다. 이러한 요청에 대해 필리핀은 성실하게 응하였지만, 중국은 중재재판을 수락할 수 없다는 원론적인 답변을 제출하였다.