(2) 코넥스시장의 문제점
이러한 거래부진과 관련해 코넥스시장이 지닌 구조적인 문제점으로 지적되고 있는 것은 크게 다음의 세 가지다.
첫째, 국내투자시장이 이미 침체되어 있는 상황에서, 전문투자자 위주의 운영은 코넥스시장의 수요기반을 더욱 빈약하게 만들 가능성이 있다는 점이다.
둘째, 유가증권시장이나 코스닥시장과는 달리, 코넥스시장은 30분마다 매도자와 매수자가 제시한 수량과 가격을 모아 단일가격으로 매매를 체결하는 방식을 취하고 있어, 주가의 안정성과 신뢰성이 떨어진다는 점이다.
셋째, 재무정보 등이 부족한 초기 창업기업을 대상으로 하는 코넥스시장의 특성상 기업 가치평가가 제대로 이루어지기 어렵고, 그로 인해 우수한 창업기업이 시장으로 유입되기 어렵다는 점이다. 물론 중소기업의 상장지원을 위해 지정자문인제도를 도입하였으나, 현행 제도 하에서는 코넥스 상장에 소요되는 책임과 비용은 큰 반면, 성공에 따른 인센티브는 부족해 지정자문인으로 지정된 증권사들의 적극적인 기업발굴과 상장노력을 유도하기 어렵다는 지적이 제기되고 있다.