마. 등록절차 운영상의 문제
비영리민간단체지원법시행령은 등록 신청서류 및 절차를 규정하고 있지만, 실제 운영에서는 지원 단체들의 편법적 지원과 서류 미비 등의 문제점이 발생하고 있다. 이에 공익활동 지원이라는 법의 목적에 배치되는 단체들의 사업 신청을 방지하도록 시행령을 개선할 필요가 있다. 당해연도 지원사업의 유형에 맞추어 단체명을 변경하는 편법을 방지하기 위해서는 시행령 제3조6항으로 "당해연도에 단체의 명칭을 변경한 경우나 주된 사업을 변경한 경우에는 등록증을 교부하지 않는다"는 항목을 추가하는 방안이 있다.