마)산업자원부의 출자 지원
산업자원부는 산업기반자금을 통해 부품소재전문 투자조합에 출자지원하고 있는데 실제의 자금지원은 중소기업진흥공단(중산기금)에서 담당하고 지원대상(투자조합)심사 및 선별 작업은 산업기술평가원에서 담당하고 있다. 부품소재전문 투자조합에 대한 출자지원은 2002년에 시작되었으며, 2002년에는 2개의 투자조합에 각각 50억원, 그리고 2003년과 2004년에는 매년 1개의 투자조합에 50억원씩을 출자하여 총 200억원을 지원하였으며, 이 기간 중 민간자금 500억을 합쳐 총결성금 700억원을 달성하였다. 그리고 2005년 이후부터는 매년 1개의 부품소재전문 투자조합에 30억원을 지원하고 있다.
또한 산업자원부는 기술사업화전문 투자조합에 출자 지원하고 있으며, 이를 위한 자금지원은 산업단지공단에서 담당하고 지원대상(투자조합)의 심사 및 선별 작업은 기술거래소에서 담당하고 있다. 기술사업화 투자조합은 산업자원부가 추진하는 지식기반산업(나노, 생명공학, 항공우주 등)육성을 위한 신기술 사업화라는 정책목적을 가지고 추진하는 것이며, 산업자원부는 2002년과 2003년에 각각 1개의 기술사업화 투자조합 결성을 위해 각각 100억원을 출자 지원하였다. 하지만 2004년과 2005년에는 지원 실적이 전무했다. 그러다가 2006년 6월 들어 산업자원부는 한국전력 등의 민간자금을 합쳐 총 400억원 규모로 2개의 전력산업 기술사업화 투자조합 설립 계획을 발표하였는데, 하지만 모태조합으로의 출자지원 일원화 정책에 따라 이를 위한 재원은 과거처럼 산업단지공단이 담당하는 것이 아니라 모태조합이 담당하게 될 예정이다.