둘째, 과수화상병 방제 체계의 실효성을 높이기 위해서는 농림축산식품부 내 동물방역 총괄 조직과 같이 식물방역 총괄조직의 신설을 검토할 필요가 있다. 지난 2월 감사원이 주의･통보･징계 조치한 미발생지역의 예찰활동 부실문제, 검역과 방제로 이원화된 운영체계의 문제 등을 개선하기 위해서는 총괄기능과 현장 방제기능의 강화가 필수적이기 때문이다. 그리고 중앙정부와 지자체, 정부기관과 지역 대학, 전문가, 민간 방제업체, 그리고 과수농가 간 책임과 협력 체계를 강화하는 거버넌스를 구축하여야 한다.
셋째, 지금까지 소극적으로 연구되었던 과수화상병 예측모형 개발, 확산경로 저지, 저항성 품종개발을 위한 기초연구기반을 조성할 필요가 있다. 고위험식물병해충 격리연구시설인 생물안전 3등급의 차폐시설(BL3급) 신축 등 관련 연구 기반 조성과 연구･개발의 우선순위를 정하여 이를 단계적으로 수행할 로드맵을 작성하여야 할 것이다.