(3) 감사원과 선거관리위원회의 회계 검사 상호보완
국고보조금 회계조사의 실효성을 높이기 위해서는 감사원으로 하여금 선거관리위원회의 회계조사 기능을 보완하도록 할 필요가 있다.
정당의 회계조사와 관련하여 선거관리위원회는 정당으로부터 국고보조금의 집행내역을 제출받아 서면조사하고, 실지조사는 선택적으로 실시한다.
한편 감사원은 선거관리위원회에 대한 재무감사를 통해 국고보조금 지급내역을 파악하고 있지만, 실제 보조금의 집행내역에 대한 면밀한 조사를 수행하지는 못하고 있는 실정이다.
독일의 경우 연방감사원(Bundesrechnungshof)이 보조금의 산정과 배분, 그리고 연방하원의장의 회계보고서 심사에 따른 제반절차가 회계처리규정에 맞게 이루어졌는지 검사함으로써 회계검사의 실효성을 높이고 있다(독일 정당법 제21조). 따라서 선거관리위원회와 감사원의 유기적인 협력체계의 구축이 필요하다.
선거관리위원회가 현재 선택적으로 실시하는 실지조사를 감사원과 분담하여 모든 정당을 대상으로 전면적으로 실시하는 방안을 검토해 볼 필요가 있다. 이는 국고보조금에 대한 회계검사의 전문성과 효율성을 높이는 방안이 될 것이다.