2. 부실금융회사에 대한 조사
예금보험공사는 ｢예금자보호법｣ 제21조의2에 따라 부실금융회사에 대한 부실책임조사를 실시하고 해당 금융회사에 위법·위규행위로써 손실을 초래한 관련 임·직원에게 손해배상을 청구하여 법적인 책임을 묻고 있다. 부실책임추궁 대상자는 부실금융회사의 임·직원과 대주주이며, 대주주의 경우에는 상법제401조의2에서 규정한 부당한 업무집행 지시 등에 의하여 해당 금융회사에 손실을 초래한 경우이다. 이러한 기준에 따라 예금보험공사는 2016년 6월말까지 공적자금이 투입된 15개 은행, 6개 증권사, 18개 보험사, 22개 종금사, 86개 상호저축은행, 325개 신협 등 총 472개의 금융회사에 대해 부실책임조사를 실시하여, 파산관재인 등 해당 금융회사에게 손해배상청구소송을 제기하도록 요구하였다.
특히, 전문적이고 효율적인 부실책임조사를 실시하기 위해 2005년부터는 부실책임조사 인력풀(Pool)을 구성하고 탄력적으로 운용함으로써 시의적절하게 조사가 이뤄지도록 하였다. 또한 부실책임추궁이 일회성에 그치는 것이 아니라 부실책임조사 이후 새롭게 발견되는 위법·위규 사항에 대하여도 추가 조사를 실시함으로써 철저하게 부실책임을 추궁하고 있다. 2008년부터는 조사기능을 전문화하고 강화하기 위하여 부실책임조사를 조사국으로 일원화하였다.