당시 여당이던 새천년민주당은 김대중 정부와 노무현 정부에서 이룩해 놓은 남북한 관계의 발전을 법률적으로 뒷받침함으로써 정권의 성과와 업적들을 공고화하는 방안에 주목했던 반면, 야당인 보수 성향의 한나라당은 비록 입법안의 취지에 공감 한다 하더라도, 해당 입법안을 지지하는 것은 진보 성향 집권세력의 성과를 지원하는 결과를 초래한다는 입장에서 반대 또는 소극적 입장을 피력하고 있었다.