이에 기획예산위원회와 행정자치부는 1998년 많은 위원회가 행정의 책임성 저하와 행정낭비를 초래하고 있다고 보고, 모든 위원회의 존치여부를 제로베이스(Zero Base)에서 전면재검토 하였고, 그리하여 설립목적을 이미 달성하였거나 경제사회여건 변화로 필요성이 감소 또는 소멸한 위원회, 운영실적이 미미하여 존치의 실효성이 낮은 위원회, 소속부처의 기능으로 흡수하거나 관련부처간 협의회로 대체가능한 위원회, 현 정부 출범 이전에 법령상 근거가 마련되었으나 위원이 위촉되어 있지 않은 위원회는 폐지대상으로 하고 주요 기능이나 위원구성이 유사한 위원회는 통합하며, 부처별 순수자문기능을 수행하는 위원회는 정책자문위원회로 통합하거나 정책자문위원회의 분과위원회로 축소·운영함으로써 전문가 인력풀(pool)을 확대하여 필요에 따라 위원회의 설치와 폐지가 유연하게 되도록 하였다.