물론 예산안 자동부의제는 예산안을 본회의에 부의하는 것까지만 보장할 뿐이지, 본회의 부의 자체가 의결을 보장하는 것은 아니다. 특히 집권여당이 원내에서 다수당 지위를 차지하지 못할 경우에는, 예산안이 자동부의된다고 하더라도 본회의 의결을 위해서는 야당의 협력이 반드시 필요하다. 이런 점에서 볼 때 특히 제20대 국회와 같은 다당제 환경에서 원내교섭단체간의 협치는 예산심사에서도 필수불가결하다고 할 수 있다.
또한 국회가 헌법에서 규정하고 있는 예산안 심사기한을 준수하는 것도 중요하지만, 그것 못지않게 국회에서 예산안 심사가 내실있게 이루어져서 정부에 대한 국회의 재정통제 기능이 효율적으로 작동하는 것 역시 중요하다. 국회가 예산안 의결기한은 지킨다 하더라도 시간적 압박으로 인해 오히려 예산안 심사가 이전보다 부실해 진다면 예산안 자동부의제의 도입 취지가 제대로 구현되었다고 보기 어려울 것이다.