한편 자연 환경조사 등을 수행하는 국가차원의 전문적인 통합 연구 조직의 신설 또는 기존 연구 및 조사 조직의 확대 재개편을 고려해야 할 필요가 있다. 우리나라의 상당 지역에 대해서는 전국자연환경조사를 통하여 상당한 정보가 구축되어있는 상황이다. 그러나 해당 조사가 ‘생태자연도’상에서 보존이 필요한 지역을 선별해 내는데 상당한 강조점을 둔 것이 사실이다. 또한 조사 기간 역시 1년 이내의 기간으로 정밀한 분석 등이 이뤄지기 상당히 어려운 한계점이 있다. 물론 조사기간의 한계는 예산 편성과 집행이 매 회계연도에 따라 이뤄지게 되며, 조사의 내용 분량 등이 지역마다 달라지는 문제가 있기 때문이다. 특히 정부가 직접 조사하는 것이 아닌 외부 전문가를 섭외하여 조사를 대행하도록 하는 현행의 방식에서 외부 전문가들의 일정을 조율하고 섭외하는 데에는 상당한 문제점이 있다. 따라서 다수의 전문 인력이 상시적으로 근무하는 독립적인 전문연구기관으로의 확장을 고려하는 것이 필요할 것으로 보인다.