국회예산정책처의 경우, 기획재정부의 「국가재정운용계획」 추세를 장기재정전망의 초기 5년에 반영하고 있다. 국회가 행정부 재정기조를 판단함에 있어 중기계획을 반영한 시나리오 분석을 별도로 수행하는 것은 바람직할 수 있다. 그러나 장기재정전망의 기준선(baseline) 전망은 추가적인 세제개편이나 지출관련 제도의 변화가 향후에 발생하지 않는다는 가정 하에 전망인데, 현재의 재정제도 상 구속력이 없는 「국가재정운용계획」 상의 수치를 장기재정전망에 반영하는 것은 기준선(baseline) 전망의 취지에 맞지 않는다고 할 것이다.
또한 중기시계에 대한 「국가재정운용계획」(기재부) 및 중기재정전망(예정처)과 장기시계에 대한 장기재정전망은 추계 상의 주요 가정 및 모형이 상이함에도 불구하고, 양 전망을 임의적으로 연결하거나, 조정하는 것 역시 이론적·실증적 근거 측면에서 문제점으로 파악된다. 아래 표에서 보이듯 정부 장기재정전망 상의 주요 거시경제지표가 전망시점 중 중기계획 기간 동안 낙관적인 「국가재정운용계획」을 반영한 뒤, 그 이후에 급격히 성장률이 하락하는 모습을 보이는 것은 이러한 점을 반영하는 결과로 보인다.