(2) 운영 현황
국립현대미술관은 서로 다른 지역에 서로 다른 특성을 가진 3관 1센터를 두고 있지만, 운영조직은 단일 조직이다. 문화체육관광부 장관이 임명하는 관장(고위공무원 나급) 아래, 기획운영단장(고위공무원 나급)과 학예연구실장(전문임기제 가급)이 있다. 학예연구실에는 전시1과와 전시2팀, 전시3팀이 있어 3관 1센터의 전시 업무를 나눠 맡고 있다. 핵심 보직의 직급 서열이 불확실하고 과 조직과 팀 조직이 혼재해있다는 점에서 조직 개선의 필요성이 확인된다.
국립현대미술관의 정원은 30년간 동결 또는 감축되다 최근에서야 약간 늘어, 현재 119명이다. 다만 전문임기제 공무원을 위한 별도 정원 40명이 있다. 정원 기준 연구직 공무원은 36명, 전문임기제 학예연구 분야 공무원은 32명이다. 이외에 현재 공무직 근로자가 353명 근무중이다. 서울관 개관 당시 학예연구 분야 공무원 전부를 전문임기제로 충원하여, 미술관 운영의 핵심이 되는 학예연구 인력의 고용 안정성이 떨어진다는 지적이 많다.