둘째, 2010년 5월 11일 민주노총을 제외한 노사정은 상급단체에서 활동 중인 노조전임자와 관련하여 근로시간면제제도의 원칙을 유지하면서도 ‘상급단체에 사업용역을 의뢰하는 방식 등으로 상급단체 활동 중인 노조전임자 임금을 지원하는 방안’에 합의하였다. 이에 대하여 경영계에서는 근로시간면제제도의 원칙을 훼손시키는 것이라고 비판하였고, 민주노총은 근로시간면제제도를 노조 길들이기 수단으로 삼겠다는 노동부의 의도라고 비판하고 있다.
셋째, 이미 조직대상을 달리하는 복수노조가 병존하는 사업장에서 단체협약을 통해 면제근로시간을 결정함에 있어, 각 노조의 조합원 수를 기초로 면제근로시간의 한도를 결정할 것인지, 사업 또는 사업장별 전체 조합원 수를 기초로 면제근로시간을 결정할 것인지 다툼이 발생할 수 있다. 따라서 이미 복수노조가 병존하는 사업장에서 근로시간 면제의 적용방식에 대한 명확한 정리가 필요하다고 판단된다.