그러나 지방의회의 자주성 회복은 달리 해석될 여지가 많다. 일본은 지방자치의 기본원리로서 이원대표제를 채택하고 있다. 즉 지방의회의원도 주민이 직접 선출하고 자치단체장도 주민이 직접 선출한다. 결국 두 대표기관간의 상호 견제와 균형을 강조하는 원리이다. 그러나 최근의 자치단체장 주도의 지역정당이 강세를 띠면서 지방의회의 기능이 약화되는 경향이 있다. 자치단체장은 자신이 주장하는 정책이나 개혁을 위하여 의회의 다수파 형성에 주력하고 있다. 오사카시, 나고야시, 시가현의 경우에서 보는 바와 같이 의회는 자치단체장이 추천, 지원하는 후보가 당선되어 다수파를 구성하게 된다. 결국 이러한 상황은 이원대표제를 무력화시키게 되고 단체장의 일방독주를 일부 지원하는 형태가 될 우려가 크다. 그리고 쟁점추구형 지역정당 의원들이 의회내에서 소수파에 불과한 경우가 많으므로 자치단체장 지지파와 통일정책집단을 형성하는 경우가 많아지게 되면서 의회의 행정부 견제기능은 약화될 수 밖에 없다.