이어서 증권의 발행·유통 및 권리행사를 원활하게 하기 위해 실물증권 기반의 예탁제도를 전자증권제도로 전환하는 내용의 「주식·사채 등의 전자등록에 관한 법률」이 제정되었다. 주식, 사채, 국채, 지방채 등의 증권에 관한 권리에 대해서는 실물증권 또는 증서의 발행 없이도 그 권리의 발생·변경·소멸을 장부에 전자등록하도록 하였으며, 증권시장에 상장된 주식·사채 등은 전자증권제도를 통해서만 유통될 수 있도록 하였다. 또한 전자증권제도 운영을 위해 전자등록 내역과 거래내역을 관리하는 전자등록기관과 투자자별 고객계좌를 관리하는 계좌관리기관의 운영과 관련된 사항을 규정하였고, 전자증권 시스템 운영상 오류 등에 대비한 투자자 보호 장치 및 정보 보호를 위한 장치도 마련하였다(「주식·사채 등의 전자등록에 관한 법률」 시행 예정).
끝으로 유망 중소기업 등에 대한 자본시장의 자금공급기능을 강화하기 위한 제도 개선도 있었다. 증권형 크라우드펀딩(Crowdfunding) 제도가 도입되고 하위 규정도 마련되었다. 크라우드펀딩을 이용할 수 있는 기업의 범위를 원칙적으로 업력 7년 이하의 창업·중소기업으로 정하되, 벤처기업과 기술혁신형 중소기업 등의 경우 업력요건에 제한을 두지 않았다. 크라우드펀딩만을 전문으로 취급하는 중개업인 온라인소액투자중개업의 등록 요건으로 5억원 이상의 자기자본과 함께 적절한 내부통제장치, 인력 및 전산설비 등을 규정하였다. 투자자 보호를 위해 크라우드펀딩을 통한 모집 시 증권의 발행한도를 기업당 연간 7억원으로 정하고, 투자자의 전문성·위험감수능력 등에 따라 투자한도를 차등화 하였다(「자본시장법 시행령」 시행 2016.1.25). 또한 창업·벤처기업의 성장기반 조성과 건전한 발전을 위하여 창업·벤처기업에 50% 이상 투자·운용이 의무화된 창업·벤처전문PEF 제도를 도입하였다(「자본시장법」 시행 2016.12.20, 2017.1.1).