또한 고가장비 중 하나인 MRI(자기공명 영상장치) 촬영 건수가 2006년 44만 건에서 2010년 73만 건으로 66% 늘어난 것은, 제공되는 서비스 양에 따라 건강보험공단과 환자가 의료기관에 지불하는 비용이 증가하도록 설계된 행위별수가제와 관련이 있다.
건강보험심평가원에 따르면, 지난 3년 동안 진료비청구 심사에서 과잉진료로 판정된 비율이 60% 증가한 것으로 밝혀졌다.
이러한 문제로 인해 정부는 건강보험제도 유지·존속을 위한 재정건전성 달성을 정책 목표로 설정하였다. 질병별로 비용이 정해진 포괄수가제를 시행함으로써 제도의 지속 가능성을 달성하고, 아울러 질병별 진료표준화로 효율성을 높이고자 한 것이다.