따라서 국가중요농업유산제도가 보다 원활하게 추진되고, 사업이 확대되면서 발생되는 문제를 사전에 차단하기 위해 법규와 지원정책의 양 측면에서 개선방안을 제안한다.
첫째, 국가중요농업유산제도의 법적근거를 마련하여야 한다.
둘째, 우리나라의 농업유산 개념 때문에 지정대상 범위가 매우 제약적이라는 주장이 제기되고 있어 지정 대상 문제에 대해 근본적인 논의가 필요하다.
셋째, 농림수산식품부와 해양수산부가 각각 별도로 농어업유산을 취급(해양수산부 2015년 실시 예정)하는 문제에 대한 검토가 필요하다.
넷째, 농업유산발굴과 지정신청 과정 등에 있어 전문가 그룹에 의한 자문이 제대로 이루어질 수 있도록 정부의 지원이 필요하다.
다섯째, 국가중요농업유산 지역들의 협의체(네트워크) 구성을 검토할 필요가 있다.
여섯째, 보전 및 활용에 있어서도 지역의 특성에 맞게 차별화된 콘텐츠, 스토리텔링 등이 개발되어 사업을 추진하는 것이 중요하다.
지역의 독특한 농업적 토지이용과 다양한 농경문화ㆍ경관, 생물다양성 등을 일체화된 농업시스템으로 보전하고, 이를 침체해 있는 농업ㆍ농촌의 활성화 방안의 하나로 활용하고자 하는 국가중요농업유산제도는 종전과는 다른 새로운 농업ㆍ농촌정책이다.
따라서 정책에 대한 당국의 정확한 인식 확립이 요구된다. 즉, 농업유산이란 열악한 환경 속에서 오랜 세월 농민들의 지혜가 모여 만들어지고 진화해온 농업생산시스템으로 식량공급 역할을 지속적으로 수행하고 있고, 또한 생물다양성의 유지에도 기여하고 있다는 점을 철저하게 인식하는 것이 중요하다.
그러므로 농업유산이 앞으로도 제대로 보전, 계승되기 위해서는 농업유산 자체에 대한 정책도 중요하지만, 지속가능한 농업생산ㆍ농촌사회가 유지될 수 있는 정책이 먼저 유기적으로 이루어지지 않으면 안 된다는 점을 제대로 인식하여야 한다. 이와 같은 기본적인 인식 없이 그저 농업유산을 지역 활성화에만 연결시켜 무리하게 사업을 추진할 경우 농업유산은 오히려 위기에 직면하게 된다.