나. 결합전문기관의 역할
살펴본 바와 같이 가명정보 절차에서 결합전문기관의 역할은 크게 결합신청자가 결합 전에 가명처리를 제대로 하였는지 확인하는 역할, 결합키 연계정보에 따라 가명정보를 결합하는 역할, 가명처리 후 추가적인 가명처리가 제대로 되었는지 확인하는 반출심사위원회를 구성·운영하는 역할로 구분된다. 결합키 연계정보에 따라 가명정보를 결합하는 과정이 단순한 컴퓨팅 작업임을 고려하면, 결합전문기관은 결합 관련 사항을 확인하고 심의하는 역할에 가깝다.
가명정보 결합 구조를 설계하는 역할, 결합 전후에 가명처리를 하는 역할은 많은 전문성이 필요함에도 불구하고 원칙적으로 결합신청자가 직접 수행하도록 규정되어 있다. 이를 직접 처리하여야 하는 부담으로 인해 가명정보처리가 능숙하지 않은 기업과 기관은 가명정보 결합을 신청하기 어려웠고 신청하더라도 능숙하지 않은 처리로 인해 가명정보 결합 기간이 지연되는 문제점이 발생하였다. 이를 개선하기 위해 2021년 10월 5일 고시를 개정하여(제11조의2 신설) 현재는 결합전문기관이 결합 전 가명처리, 반출 전 추가 가명·익명 처리, 반출한 정보 분석 등을 지원할 수 있게 되었다.