(2) 미등록 사적지 관리문제
현충시설은 매년 그 수가 지속적으로 증가하여 2014년말 현재 1,915개소에 이르고 있다. 그러나 2007년부터 2010년까지 4년간에 걸쳐 실시한 현충시설에 대한 실태조사에 의하면, 미등록 국내사적지가 1,666개소에 달하고 있으며, 이 중 332개소는 역사적·교육적으로 매우 중요한 시설로 조사되었다.
이 중 일부 사적지의 경우 재개발 등으로 인해 멸실되거나 변형되어 역사적 고증이 어렵고, 개인소유 사적지의 경우 소유주 확인이 곤란하거나 소유주가 재산권침해 등의 이유로 현충시설 지정에 반대하는 경우도 있어 사적지의 훼손이 우려되고 있는 실정이다.