네 번째 원인은 조직심리적 요인으로서 전자정부 개념에 대한 행자부와 정통부간의 인식차이를 들 수 있다. 전자정부기능을 이관받은 행자부는 전자정부의 개념을 최광의로 해석하여 최대한 많은 기능을 확보하려는 시도를 하는 반면 정통부는 전자정부를 국가정보화의 하위개념으로 취급함으로서 행자부의 기능 확대 시도를 견제함과 동시에 여전히 정통부의 업무범위 내에 두려 한다는 것이다. 보다 구체적으로, 행자부는 ‘중앙정부와 지방정부가 추진하는 모든 정보화’를 전자정부로 인식한다. 여기에는 전자정부의 기획·집행·관리뿐만 아니라 전자정부 평가 및 인프라 구축까지도 포함하고 있다. 반면 정통부는 ‘정부 공통행정업무정보화 및 대국민서비스 정보화’만을 전자정부로 인식하는 한편 보건복지·문화·농림·교통 등 각 분야별 공공정보화는 전자정부가 아닌 국가정보화의 영역으로 보고 있다. 따라서 이러한 양 기관의 전자정부의 개념과 범위에 대한 인식차이가 갈등을 유발한다.