4) 식중독균
수련원, 집단급식소 등에서 빈발하는 노로바이러스 식중독의 주요 발병원인이 지하수로 추정된다는 보건당국의 보고가 이어지고 있다. 노로바이러스는 장내바이러스(Enteric virus)이며, 현재 이와 관련된 정량적 제한사항과 수질기준이 없다. 매몰지에서 발생하는 침출수가 유출되어 지하수를 오염시킬 경우 이를 단순한 지하수오염으로 인식하는 것보다 농촌지역 간이상수도와 관련하여 먹는물 개선문제로 접근하는 것이 타당하다.
5) 소독약 등 방역시 사용된 물질
현재 구제역에 사용되는 소독제는 총 166종이다. 가축사체 매몰시 사용하는 소독약은 강우시 비점오염원 형태로 수체(水体)로 유입된다. 이는 지하수와 지표수가 오염된다는 것인데, 특히 소하천 퇴적물에 농축될 수 있으므로 매몰지 인근 소하천 퇴적물에 잔류되어 있는 소독약 성분 모니터링이 필요하다.