헌법이 개정되는 경우 국회의 재정통제기능을 강화하기 위하여 감사원의 회계검사기능을 국회로 이관하는 것을 적극적으로 고려할 수 있을 것이다. 그러나 만약 헌법개정이 이루어지지 않을 경우라도 감사원의 독립성 확보와 그에 대한 헌법기관들의 존중이 정착될 수 있도록 현재의 시스템을 개선할 필요가 있다. 여기에는 국가재정에 대한 중립적 통제를 민주성과 함께 성취하기 위한 고민이 전제되어야 하고, 감사원에 대한 독립성의 근거를 헌법에 마련하여 상세한 사항이 법률로 규정되도록 해야 할 것이다. 이와 함께 감사원 스스로도 외부의 압력이나 영향력을 배제하면서 국민들이 수긍할 수 있는 독립성과 전문성을 확보하려는 노력을 경주해야 할 것이다.