한편 신규 블록 형성시 비트코인을 발행하여 보상으로 지급함으로써 다수의 참가자가 거래검증에 참여할 인센티브를 부여한다.
이같은 특성을 고려하여 신규 블록을 형성하기 위한 거래검증 작업을 채굴(Mining)이라고 지칭하는데, 이를 통해 다수의 참가자가 거래 검증에 참여함으로써 악의적인 공격자가 조작에 성공할 확률을 낮은 수준으로 유지할 수 있게 된다.
비트코인에 적용된 블록체인은 다음과 같은 한계를 가진다고 알려져 있다.
우선 신뢰를 형성하는 과정에서 과도한 자원이 투입되고, 처리할 수 있는 거래건수가 제한적이다.
또한 기술적인 오류 등 문제 발생시 참가자간 이견을 조정하는 메커니즘이 없어 의사결정이 지연될 가능성이 높다.
우발적 거래에 대한 취소가 불가능하다는 점도 문제로 지적된다.
이에 따라 최근에는 금융기관들을 중심으로 비트코인 방식의 공개형 블록체인보다는 네트워크 참여를 제한(Private)하거나 신규 블록 형성 권한을 일부 참가자에 집중(Permissioned)하는 폐쇄형 블록체인을 개발하는 데 대한 관심이 높아지고 있다.
참가자간 신뢰를 전제로 기존 비트코인 블록체인의 문제점을 우회하여 효율적이고 안전한 정보처리 및 공동의 거래 메커니즘을 구축할 수 있을 것으로 기대하고 있다.
다만 작업증명이 생략된 경우에도 거래기록의 신뢰성을 확보할 수 있을지에 대한 논란이 여전히 지속되고 있다.