여성의 육체와 남성정체성 사이에서 갈등하는 주체들을 FTM(여성에서 남성으로:Female To Male)그리고 그 역의 경우를 MTF(남성에서 여성으로: Male To Female)이라 부른다. 성전환증으로 확진되고 모든 조치(성기 수술 등)가 끝났고 지속적으로 호르몬 치료를 받아온 환자는 해부학적으로 MTF의 경우에는 퇴화된 상태이기는 하지만 잔존된 남성의 성적 장기(전립선, 정낭 등)가 남아 있고, 외형적인 체형 및 성기 구조는 여성화 되어 있어도 여성만의 독특한 체내 구조(자궁, 자궁 경부, 나팔관, 난소)는 없다. 따라서 남성과의 성교는 가능하지만 여성 특유의 생리와 임신은 불가능하다. 그래도 MTF는 육아를 원하는 경우가 많다. 따라서 가족관계등록부의 성별이 법적으로 수정되었고, 정식으로 혼인 신고가 끝난 MTF가 육아를 위한 입양을 위한 추천서를 병원에 원할 경우에는 불임으로 진단하여 입양 추천서를 발행하여 주기도 한다. 그러나 외국에서는 MTF의 남편은 정상 남성인 경우가 많고 정자 생산이 가능하기 때문에 아내인 MTF의 동의를 얻어서 대리모의 난자와 남편의 정자를 이용한 보조생식기법(Artificial Reproductive Technic, ART; 시험관 아기 기법 등)으로 남편의 유전 형질을 받은 아이를 대리모가 출산하도록 하고 MTF 부부가 이를 받아서 육아를 하도록 하기도 한다고 한다. 반대의 경우인 FTM의 경우에도 마찬가지이다. 다만, FTM의 배우자는 정상적인 여성인 경우가 많으므로 임신 능력을 갖고 있으며 또한 임신 경험을 갖기를 원하는 경우가 많다. 그러나 FTM은 정자를 생산하지 못하므로 부부간에 합의를 하면 비-배우자간 인공수정(Artificial Insemination from Donor, AID)를 권하기도 한다. 즉 의학계에서는 성전환증의 진단과 초기 관리과정에서는 여러 가지 갈등이 나타난다고 보지만, 반대의 성으로 이미 정신 및 외형적인 육체로 전환된 환자는 반대의 성에 해당하는 인간으로 보고 의학적 관리가 되고 있다고 하겠다(이무상, 2006; 537).