충남 자동차산업 혁신을 위해 지원되는 국가연구개발비는 다른 지역에 비해 높은 편이며 점차 증가하고 있다. 2015년 기준 자동차 및 운송장비 관련 전체 국가연구개발비 투자액은 6,321억원이며, 충남에는 이 중 463억원이 투자되었다. 2009년에는 전체 투자액의 4%를 차지하였으나 2015년에는 7.3%로 점차 증가하고 있다. 이는 수도권을 제외하고 경남, 대전에 이어 세 번째로 높은 비중으로 충남 자동차산업의 혁신을 위한 지원 여건은 타 지역에 비해 상대적으로 우수하다고 볼 수 있다.