(2) 소득종류의 변경
앞서 현행 과세제도에서 살펴본 바와 같이 법인의 임직원이 근무기간 중 주식매수선택권을 행사하여 얻은 이익은 ｢소득세법｣ 상 근로소득에 해당한다. 이는 주식매수선택권이 근로와 일정한 상관관계 내지 경제적 합리성에 기한 대가관계에 있다고 보는 견지에 의한 분류이나, 벤처기업의 경우에는 인식을 달리 할 필요가 있다는 주장이 있다. 상장법인의 경우 보수 외에 성과에 따라 지급되는 인센티브의 성격이 강하지만, 비상장법인은 적은 보수로 우수 인력을 확보하기 위한 유인책이자 주인 의식과 책임감을 바탕으로 회사를 유지하기 위한 절대적인 수단이므로 근로의 대가라기보다는 회사에 대한 투자로 보는 것이 적합하다는 것이다. 이러한 관점에서는 근로소득으로 과세하기 보다는 기타소득으로 분리과세하거나, 미국이나 일본의 경우와 같이 자본이득으로 보아 처분 시 양도차익에 대해서만 과세하자는 대안 등이 제시되고 있다.
우리나라의 자본이득 과세체계가 미국 등과는 다른 점을 고려하여 현행과 같이 주식매수 선택권의 행사이익을 근로소득으로 보는 체계를 유지해야 한다면 해당 소득의 성질에 부합하는 보완장치를 고려해 볼 필요도 있다. 주식매수선택권의 행사가 일정한 근로기간을 충족해야 가능한 것이므로, 행사에 따른 이익도 그 기간 동안의 과세소득으로 나누어 인식할 필요가 있다는 지적을 반영하는 것이다. 기간(期間)과세이면서 초과누진세율구조를 가진 소득과세의 특성상 행사하는 해의 소득으로 종합하여 과세하는 경우 부당히 과중한 세금이 발생할 수 있으므로, 이를 근로기간만큼 나누어 각 년도 소득에 합산하도록 하는 것이다.