공정위는 두 정책을 체계적으로 연계하고 규제개혁과 소비자보호업무를 모두 관할하고자 1998년부터 약 10년 동안 소비자정책 이관을 주장했다. 재경부는 규제기관(공정위)의 과도한 권한 행사를 우려, 거래 규제기관에서 종합행정인 소비자정책을 담당하는 것에는 무리가 있다는 등 반대하였다(백병성, 2011; 하태수, 2004). 그러나 2005년 정기국회를 기점으로 공정위로의 소비자정책 이관이 확정되었고, 이로써 재경부가 관할하던 소비자기본법, 제조물책임법, 생협법과 한국소비자원, 소비자단체에 대한 관할권 역시 공정위로 이관되었다(백병성, 2011: 375-376; 서희석, 2011: 96).
생협은 소비자의 후생에 바탕을 두되 일반 소비자단체와 달리 구매, 판매 및 공급을 통해 직접적으로 경제활동에 참여한다. 제품 및 서비스의 유통망에 참여해 소비자들의 선택권을 직접 창출하는 것이다(오승한, 2007: 286). 당시 김동수 공정거래 위원장은 2010년도 생협법 개정을 통해 소비자의 경제주체화를 도모하고 시장에서 공정한 경쟁을 할 수 있도록 정책적 지원을 해주는 것이 공정위의 책무라고 설명했다(김동수, 2013: 274-278). 공정위는 경쟁촉진기관으로서의 위상을 정립하되, 독과점 및 경제력 집중억제와 같은 규제적 기능보다 경쟁촉진과 소비자정책 관련 기능 확대를 꾀했다(정부혁신지방분권위원회, 2008: 122-124).