다만, 위 국회 의안정보시스템에 의하면(2010: 5-6) 당시에도 학부모가 자치위원회의 과반수를 차지할 경우 학생에 대한 평소의 친분이나 이해관계에 따른 조치를 할 가능성이 있어 공정성을 담보하기 어려운 측면이 있고, 자치위원회의 구성원은 학교폭력과 관련하여 전문성을 갖출 필요가 있으므로 학부모의 해당 분야에 대한 전문성 보장이 선행되어야 하는데, 위원장을 포함하여 5인 이상 10인 이하의 위원으로 구성되는 자치위원회의 특성상, 학부모대표가 전체위원의 과반수를 차지하도록 할 경우 교사, 판사·검사·변호사 등 학부모대표 외에 위원이 될 수 있는 전문가가 참여할 수 있는 여지가 적어지게 되므로, 파생될 수 있는 자치위원회의 공정성, 학부모의 전문성 등의 현실적 문제점을 고려하여야 한다는 비판이 있었다.