2010년 상반기에 신청한 36개 R&D사업 중 국과위가 23개를 추천으로 13개를 비추천으로 기재부에 제시했고, 기재부는 국과위 추천(23개) 사업 중 15개, 비추천(13개) 사업 중 5개를 최종 선정했다.
여기서 흥미로운 것은, 국과위가 추천하고 기재부가 비선정한 8개(교과부 6, 지경부 1, 국토부 1)는 주로 기초기술관련 사업들이고, 국과위가 비추천하고 기재부가 선정한 5개(교과부 1, 지경부 3, 기상청 1)는 주로 산업기술관련 사업들이라는 점이다.
이러한 결과는 기재부의 재정건전성 강화정책과 국가총예산 조정 등의 변수가 있었다 하더라도, 기초원천성 사업이 현 기재부의 예타에 상대적으로 불리함을 입증하고 있다고 볼 수 있다. 2012년 50%(2010년 42.7%)까지 확대될 기초원천 R&D의 비중을 고려하면 현 예타 기준의 개선은 시급하며, 국과위가 예타의 중심에 있지 않는 것은 적합하지 않아 보인다.