이에 더해, 취업보호기간 동안 보호대상자를 고용한 기업에는 고용지원금을 지원할 수 있으며(북한이탈주민법 제17조 제3항), 이를 위한 구체적인 절차는 동법 시행령에 의해 구체화된다(북한이탈주민법 시행령 제34조의 2). 아울러 부정취득한 고용지원금에 대한 지급제한 및 반환 절차에 관해서도 구체적인 사항이 법령으로 명시 되어 있다(북한이탈주민법 시행규칙 제35조의 3). 지원금은 임금의 1/2 범위 내에서 지급되며(북한이탈주민법 제17조의 3항), 2014년부터는 고용지원금 지급기간을 3년에서 4년으로 연장 시행하고 있다. 단, 사업주가 고용지원금 혜택을 4년까지 받으려면 북한이탈주민이 해당 사업장에서 계속 근무해야 한다. 또한 보호대상자 고용 에서 모범이 되는 기업은 생산품 우선 구매 등의 지원을 받을 수도 있다(북한이탈주 민법 제17조 제5항).