여기서 생산성 문제는 가격 경쟁력에 영향을 줄뿐만 아니라 농가의 경영 성패를 좌우하는 요인이다. 우리나라 양돈산업의 생산성 저하는 주로 고질적인 소모성 질병으로 인한 폐사율 때문이다. 2009년에는 11.4%로 비교적 높은 폐사율을 보이고 있어, 소모성 질병을 하락시킬 수 있도록 백신지원 및 시스템 개혁을 지원하는 것이 바람직할 것으로 보인다.
근래에는 식생활 기준 향상으로 고품질 냉장돈육을 선호하는 현상이 뚜렷해지고 있으므로 인증제도와 신선도의 확보는 국내산 돼지고기가 수입육과 차별될 수 있는 좋은 요인이 되고 있다. EU가 주로 수출하는 품목이 냉동삼겹살임을 고려하면, 생산성혁신에 성공할 경우 우리 양돈농가의 미래가 그리 어둡다고만 볼 수는 없다.