두 번째이자 광역자치단체장을 대상으로 한 사상 첫 주민소환투표는 2009년 8월 26일 제주특별자치도 서귀포시 대천동 강정마을에 들어서는 민･군 복합형 관광미항(제주해군기지) 건설 사업을 주민동의 없이 무리하게 밀어붙였다는 이유로 촉발된 김태환 제주특별자치도지사를 대상으로 치러졌다. 김지사의 경우 제주지역 해군기지 유치에 따른 정책 불복종의 일환으로 일종의 ‘정치적 탄핵’을 추진한 것이다. 결과는 투표율 11%로 법정 투표율 1/3에 크게 미달해 개표 없이 자동 부결 처리됐다(<표 1> 참조). 하남시의 경우처럼 국책사업에 대한 지자체장의 정책적 판단까지 주민소환대상이 되느냐하는 논란을 남겼다.