또한, ④-2와 같은 기준은 소위 기저질환을 가진 환자가 백신 접종 후 이상 반응이 나타났을 때 적용되는데, 이러한 경우 개별 기저질환자들의 경우로 분석하여, 이상반응이 백신으로 인하여 발생 가능성을 앞당기거나 악화시킬 수 있는 가능성이 과학적으로 판단된다면 일반적인 사례로 평가하는 것으로 인과성을 배제하는 것이 과연 옳은 판단인지에 대한 논란이 발생할 소지가 있다.
마지막으로 백신접종과 부작용 간의 인과관계 입증부담에 대한 엄격성 문제이다. 민법상 손해배상책임의 관점에서 입증책임의 부담은 피해자에게 있는 것이나 정보의 비대칭성이 발생하게 되는 의료사고 등의 손해배상과 관련하여 입증책임의 경감 또는 완화 법리가 판례로 형성되어 있다. 다만, 코로나19는 의학적으로 충분한 과학적 자료가 축적되지 않은 상태이므로 입증부담이 완화되었다고 하더라도 피해자가 인과성을 입증하는 것은 매우 어려울 수밖에 없다.