교섭창구단일화제도의 시행이 당장 눈앞에 있지만, 교섭창구단일화제도는 다수의 관련규정을 두고 있고, 절차가 복잡하여 많은 쟁점을 내포하고 있다. 또한 교섭창구단일화제도의 적용과정에서 더 많은 쟁점들이 추가로 나타날 가능성 또한 배제할 수 없다.
더욱이 복수노조 교섭창구단일화제도 자체의 삭제를 주요 내용으로 하고 있는 개정법률안이 국회 계류중이고, 한국노총이 지난 6월 24일 헌법재판소에 복수노조 교섭창구단일화제도에 대한 헌법소원 청구서를 제출하였기 때문에 향후 복수노조 교섭창구단일화제도에 관한 다양한 논의가 이루어질 것으로 예상된다.