둘째, 지방자치단체의 사업 관리 역량 및 운영을 위한 재원 마련에 대한 구체적 검토가 필요하다. 지방자치단체가 국책사업으로 추진하는 사업이 완료된 이후에 이 사업을 제대로 운영할 수 있는 재정적 기반이 마련이 되어 있는지 사전 검토 필요성이 제기된다. 즉, 사업 완료 후, 지자체의 사업에 대한 운영 가능성 검토가 필요한 것이다. 기초 자치단체의 재정 자립도를 살펴보면, 일부 지자체를 제외하고 재정자립도가 20% 내외 수준으로 매우 취약한 실정이다. 그러나 이러한 자신들의 지자체의 재정상황은 감안하지 않고, 예타 면제된 사업을 받고자 하는 노력들을 기울이게 되나, 결국 국책사업 시행으로 중앙으로부터 지원만을 환영하다가 그에 따른 지방비의 부담을 사전에 분석하지 않고 있는 지자체에게는 독이 든 성배와 같이 작용할 수 있음을 인식해야 한다. 토지매입비 등을 고려하면 특정 사업에서는 지방비의 부담이 국고보다 더 클 수 있다. 이러한 지방비를 효율적이고 지속적으로 조달하기 위해서는 시군별로 자체적인 예산 확보 노력이 필수적이다(김윤영, 2010). 사업 추진을 위해서는 각 지자체에서는 초기 상당 규모의 재원을 투입하여야 할 뿐만 아니라 시설이 건립된 이후에 각 시설을 운영할 수 있는 재원을 충당할 수 있어야 한다. 각 지자체의 재정상황에 대한 검토를 통해 사업 운영 능력을 확보하여 중앙 정부의 지원 없이 각 지자체에서 독자적으로 시설을 운영할 수 있는지에 대한 검토가 예타 면제라는 혜택을 받기 전에 우선적으로 수반되어야 하는 사안일 것이다.