입법부·사법부·행정부 중에서 연방공무원의 수와 예산규모가 가장 큰 것이 행정부인데, 행정부 공무원 중 일부는 강제휴가의 영향을 받지 않는다. 대통령을 비롯하여 ‘예외적’ 연방공무원이 여기에 속한다.
사법부의 경우, 펀딩갭이 발생하더라도 일정기간동안은 법원 수수료 등으로 조성한 기금을 이용하여 법원운영이 가능하다. 예를 들어서 2014회계연도의 셧다운을 준비할 때 사법부는 법원기금으로 10일 정도는 법원기능을 유지할 수 있다고 추산한 바 있다. 연방대법관과 연방법원 판사의 급여삭감은 헌법이 금지하고 있기 때문에, 이들의 급여는 강제휴가 기간에도 지급되어야 한다.
입법부(의회)의 경우 연방정부 셧다운이 발생하는 경우에도 정상적으로 운영되었다. 1996회계연도 첫 번째 셧다운과 2014회계연도 셧다운이 발생했을 때 상·하원은 법안발의와 청문회 개최, 세목심사와 위원회 보고 등 입법활동을 정상적으로 운영하였다. 상·하원의 의사규칙은 연방정부 셧다운 사태와 관련된 규정을 명문화하고 있지 않다.