이러한 시스템의 중심에 방통위가 존재한다. 방통위는 미디어 융합추세에도 불구하고 미디어 관할권을 두고 사사건건 맞서던 정보통신부와 방송위원회의 부처이기주의적 갈등을 해소하고, 동시에 미디어 거버넌스 차원에서 합의제 시스템과 관료제 시스템의 장점들을 결합시키고자한 나름 획기적인 실험이었다. 외양만 보자면 미디어 융합시대의 추세를 반영하는 동시에 사회문화적 패러다임과 시장 패러다임, 정치와 정책이 어우러진 기구를 만들고자 한 것이다.
하지만 방통위는 세부적으로 많은 문제를 내포했다. 첫째, 방통위를 대통령 직속 합의제 행정기구로 두는 것에 대해 시비가 일었다. 방통위는 실질적으로 정부의 한 부처이므로 방통위 설립에 따라 방송 거버넌스가 행정부의 직접적인 통제 하에 놓이게 된다는 문제제기였다.