III. 환경부 소관의 자연환경관련 조사
자연 환경의 주된 소관부서라고 할 수 있는 환경부가 실제 자연 환경 분야에 대한 조사와 관리를 담당하게된 것은 환경부가 환경처의 형태로 출범(1990년 1월)하고 환경부로 독립한(1994년 12월) 이후의 일이며, 그 뒤로도 자연환경에 대한 조사와 관리 업무는 여러 차례의 변화를 겪었다. 먼저 1996년 해양수산부가 출범함에 따라 해양 환경 관련 업무가 당시의 해양수산부로 이관되었으며, 이 기능은 2009년 11월 현재도 국토해양부의 소관업무로 남아있다. 산림청이 담당하던 야생조수 보호 및 수렵에 관한 업무는 1999년 환경부로 이관되었으나, 산림과 관련된 환경 관리 업무는 산림청의 업무로 남아 있다. 또한 우리나라의 산악 지역 상당부분을 포괄하는 백두대간의 경우 그 관리 책임 등은 산림청의 업무로 남아있다. 국립공원 지역 경우에는 1998년에는 당시까지 내무부(현 행정안 전부)가 담당하던 관리 기능을 이관 받아 환경부가 관리하고 있다.