부적합 판정을 받은 농가 52곳 중 친환경 인증 농가는 31곳(59.6%)으로 일반 농가 21곳(40.4%)보다 높아 친환경 인증 농가 중 무항생제 인증농가의 살충제 사용문제가 심각한 것으로 나타났다. 살충제 성분이 기준치 이하로 검출되었지만 살충제를 사용한 무항생제 인증 농가 37곳의 친환경 인증이 취소되어 민간인증기관의 부실 인증에 대한 문제도 제기되고 있다.