또한 2000년 9월 유엔의 새천년정상회의에서 21세기 유엔의 역할과 향후 인류가 직면할 새로운 도전에 대한 국제사회의 대처 방안을 논의하고, 이를 토대로 2001년 유엔의 가치와 원칙, 평화·안보군축, 개발·빈곤퇴치, 환경보호, 인권과 민주주의 등 8개 분야에 대한 새천년개발목표(MDGs: Millennium Development Goals)를 마련하였다.
그러나 OECD와 유엔이 제시한 개발 목표와 해당분야의 구체적 사항이 상이함에 따라 유엔, IMF, OECD, 세계은행 간의 협의를 통해 MDGs와 IDGs를 일원화된 체계로 조정·통합하게 되었다.
이후 MDGs 달성을 위한 국제사회의 노력은 개발재원 확보, 개발원조의 효과성 제고, 다자개발기구의 체제일관성을 위한 노력 등으로 진행되었다.
이러한 맥락에서 「원조효과 고위급회의」는 장관급 회의로서, MDGs 달성을 위한 국제사회의 노력 중에서 개발원조의 효과성을 제고하기 위한 방안을 마련하고 점검하는 회의로서 출범하게 되었다.
이후 동 회의는 2003년에 출범한 DAC 원조효과 작업반이 세계은행과 공동 주관하는 개발원조 분야의 최대 규모 회의 중의 하나로 자리매김하게 되었다.