(4) 이월과 차입
배출권을 초과 보유한 업체는 계획기간 내의 다음 이행연도로 이월하여 사용하도록 승인 받을 수 있다. 그리고 이행연도 말에 배출량에 상응하는 배출권을 제출할 수 없을 것으로 예상되는 경우, 계획기간 내의 다른 이행연도의 배출권을 당해 이행연도에 대한 배출권의 제출을 위해 차입할 수 있다(제14조).
(5) 과징금 및 과태료
업체가 제출한 배출권이 온실가스 배출량 보다 부족한 경우 정부는 부족분의 CO₂ 1톤당 100만원 범위 내에서 당해 배출권 평균 시장 가격의 5배 이하의 과징금을 부과하고(제31조), 미제출 및 허위보고 등의 행위에 대해서 5천만원 이하의 과태료를 부과하도록 하고 있다(제33조).