일부 지자체에서는 운영비 지원이 어렵다면 국비로 지은 시설물도 필요 없다고 발을 빼고 있는 경우도 있다고 한다. 시설물을 지으라고 했으니, 운영비까지 내어 놓으라는 지자체들도 있다. 막상 사업을 유치해지어놓고 보니 운영비 감당이 안 된다는 이유로 사업 유치 과정에서 적극성을 보인 지자체 및 정치인들이 사업 유치 후 사업 추진 및 운영 과정에서는 오히려 폭탄 돌리기 형태로 민간이나 출연기관으로 넘기고 있다. 향후 이러한 예타 면제사업의 추진으로 인한 지자체의 사업 운영에서의 문제점들을 막기 위해서는 예타 면제의 기준이 지금보다는 훨씬 엄격해져야 할 것이며, 지자체 입장에서는 국책사업 유치나 추진에 앞서 운영비 마련 대책 등이 반드시 선결돼야 할 것이다.