과거에는 범정부 차원의 사이버 침해 대응 기능이 국정원, 국방부, 정통부로 분산되어 있었고, 사이버 침해 대비 위기관리 대응 매뉴얼 미비하였으며, 보안 프로그램 및 전문 인력과 장비 등이 취약하였다. 이러한 과제를 해결하기 위하여 2008년 8월 18일,「국가사이버안전관리규정」(대통령 훈령)을 수립하여, 국가사이버안전에 관한 조직체계 및 운영에 대한 사항을 규정하고 사이버안전업무를 수행하는 기관간 협력을 강화하고, 국가안보를 위협하는 사이버공격으로부터 국가정보통신망을 보호하기 위하여 국가사이버안전략회의, 국가사이버안전대책회의를 두고, 아울러 국정원에 국가사이버안전센터를 마련할 수 있도록 관련 법령을 정비하였다. 그러나, 국가사이버안전관리규정은 훈령의 성격이기 때문에 관련 정보통신기반 보호법(법률제8852호), 정보통신망 이용촉진 및 정보보호 등에 관한 법률(법률 제8867호), 산업기술의 유출방지 및 보호에 관한 법률(법률 제8900호), 소프트웨어산업 진흥법(법률 제8852호) 등과 상충하게 되고, 각 개별 법령 등이 사이버 위기 보호대상이 제각각 다르고, 각 개별법 하의 조직체계 및 기능과 업무가 중복되는 등의 문제점들이 있다.