재임용제도의 운영 효과에 있어서는, 재임용된 직원들의 노후의 삶을 충실히 준비하는 동시에 공직생활 중 쌓은 지식과 경험을 활용할 수 있도록 하고 재정문제를 해소할 수 있도록 하였고, 재임용제도에 대한 재임용공무원들의 만족도 또한 높으며, 일본 관료사회의 아마쿠다리(天下り) 폐단 해소에 일부 기여하였다는 해석이 있다.
한편, 관리감독직(국장·심의관·과장)으로 근무하던 직원들이 실무를 수행하는 과장보·계장급으로 재임용되는 경우가 많고 2018년 신규로 재임용된 직원의 경우 풀타임근무는 31.3%에 불과한 등, 재임용된 직원이 그 능력과 경험을 충분히 살리지 못하고 있어 직원의 사기 저하 등에 따른 공직능률의 저하가 우려된다는 의견도 있다.