기업규제비용의 감축을 위한 규제완화가 합리적 이유 없이 제3자의 부담으로 이어 지지 않도록 제3자가 부담하는 규제비용이 규제비용관리제의 규제비용 산출에 반영 되어야 한다. 예를 들어, 감축된 기업규제비용의 일정 비율 이상이 제3자에게 전가 되는 경우, 규제비용의 감축으로 인정하지 않거나 이해 관계자의 협의 과정 등을 거치도록 하는 방안도 생각해 볼 수 있다. 또한, 규제영향분석은 특정 규제를 대상으로 하여 규제의 연쇄효과에 대한 검토가 소홀할 수 있다. 규제의 연쇄효과에 대한 분석은 소관 부처에서 수행하는 규제영향분석만으로 미흡한 만큼 규제개혁위원회에서 규제의 연쇄효과를 별도로 분석하도록 하는 방안도 검토할 필요가 있다.