이러한 사업계획에 따라 중앙암등록본부는 국민건강보험공단 암수진자 청구자료, 중증질환등록자료와 통계청 암사망자료 및 암등록·통계사업에 활용할 수 있는 자료를 구득하고, 이 중 해당지역의 암등록 데이터베이스와 국민건강보험공단 암수진자료, 중증질환자료 및 통계청 사망자료 및 해당지역 등록병원에서 구득한 자료를 지역암등록본부에 배포한다. 지역암등록본부는 중앙암등록본부에서 선정한 조사대상자를 포함하여 암발생 통계를 조사하며, 암등록병원 역시 중앙암등록본부에서 선정한 조사대상자 중 암등록 대상자를 확인하여 암발생 통계를 조사하고, 그 결과를 중앙암등록본부로 송부한다. 중앙암등록본부는 암등록의료기관과 지역암등록본부로부터 등록된 자료 및 타자료원의 암발생 관련 정보를 취합하고, 질 관리 및 주민등록주소지를 확인한 후 지역암등록본부로 해당지역의 자료를 환류한다.