이명박 정부가 출범하면서부터 지속적으로 나타난 문제가 소통의 부재였다는 점을 고려한다면 특임장관제도는 갈등이 발생할 수 있는 기관들 사이에서 서로간의 소통의 통로가 될 수 있다는 점에서 순기능을 발휘할 수 있을 것이며, 이를 통하여 통합을 이루어낼 수 있을 것이다. 이와 더불어 현 정부에서 운영하는 대규모 국책사업에 대한 자문, 권고, 협의, 조정, 정보의 수집과 분석, 연구의 업무를 수행함으로써 각각의 사업을 관할하고 있는 부처가 정책을 원활히 추진할 수 있도록 하는데 도움을 줄 것으로 기대되고 있다. 국무총리실이 방대한 정부전체의 업무들에 대한 총괄조정 및 평가기능을 수행하고 있으나, 주요 국책사업에 대한 세밀한 분석·협의·조정에 한계가 있다는 문제점을 특임장관실에서 적극적으로 해결해 나갈 수 있을 것이다.