한국의 당정협의 제도가 가지는 문제점은 단순히 당정협의 관련 제도적 설계의 문제는 아니라고 판단된다. 미국의 경우에 비추어보았을 때 당정청 관계가 원만히 작동하기 위해서 중요한 것은 참가자들의 정치적 지위 고하에 따른 구분이 아니라 구체적인 정책 영역별로 유연하고 효율적으로 실무 수준의 당정협의가 일상적으로 이루어지는 것이라고 할 수 있다. 혹은 프랑스의 행정 총괄처의 사례에서도 알 수 있듯이 국무총리의 역할과 권한을 강화하고 행정부 내의 정책조율과 행정부와 의회 사이의 정무적 조정이 유기적으로 결합된 컨트롤 타워를 총리 산하에 설치하는 것 또한 고려할 수 있는 방안이라고 할 수 있다. 또한 입법과정에서 “대통령과 여당 vs. 야당”이라는 고질적인 정치적 대결 구도가 나타나는 상황을 고려한다면 상임위원회 수준에서 이루어지는 실무 중심의 당정협의를 통해 야당의 적극적인 참여를 유도하는 것 또한 고려할 수 있다. 물론 마지막으로 무엇보다 중요한 것은 대통령과 청와대가 국회를 대하는 태도라고 할 수 있다.