□ 한편, 과학기술정보통신부장관은 특정 사유에 해당하는 경우 일련의 절차를 거쳐 연구개발특구의 지정을 해제할 수 있고, 광역지방자치단체의 장도 지정의 해제를 요청할 수 있음(연구개발특구법 제5조)
○ 과학기술정보통신부장관은 △연구개발특구 지정의 목적 달성이 불가능하다고 인정되거나 지정 요건에 미달하게 되는 경우, △타 법령에 따른 개발행위의 제한이나 특구개발사업 시행자의 사업 참여 기피 등으로 상당한 기간 내에 연구개발특구를 개발할 수 없게 된 경우 등에 해당할 때에는 연구개발특구의 전부 또는 일부의 지정을 해제할 수 있음
- 광역지방자치단체의 장이 지정 해제를 요청하는 경우 미리 공청회를 열어 주민과 관계 전문가 등으로부터 의견을 들어야 함
○ 과학기술정보통신부장관은 연구개발특구 지정 해제가 필요한 경우, 관할 광역지방자치단체의 장의 의견청취, 관계 중앙행정기관의 장과의 협의, 연구개발특구위원회의 심의·의결을 거쳐 연구개발특구 지정을 해제할 수 있음
- 과학기술정보통신부장관은 연구개발특구의 지정을 해제했을 때에는 그 내용을 관보에 고시하고 광역지방자치단체의 장에게 통지해야 하며, 14일 이상 일반인이 열람할 수 있도록 해야 함