(3) 평가대상사업 과소
추적평가결과의 활용을 가로막는 주요 요인 중 하나는 추적평가의 대상이 되는 사업이 거의 없다는 점이다. 지난 5년간(2008~2012년) 연구개발사업은 총 2,474개인데, 이 중 사업이 종료되어 평가의 대상이 되는 연구개발사업은 35개로 1.4%에 불과하다.
게다가 정부는 보안이 요구되는 사업뿐만 아니라, 평가분야, 대상규모, 실효성 등을 고려하여 추적평가 대상사업 범위를 더욱 한정하는 방향으로 추진 중이다. 추적평가 대상 사업이 과소할 경우 평가결과를 사업 간에 비교하는 의미가 퇴색되며, 이에 따라 평가결과가 미흡한 사업에 대한 불이익은 물론이고 우수한 사업에 포상을 부여할 근거도 약화될 수 있다.