농식품부 주관의 전북 완주군 덕암마을의 경우에는 바이오가스플랜트 도입계획이 아예 무산되었다. 핵심 사업인 바이오가스플랜트를 포기하면서 기존의 농촌개발사업과 차별성이 없게 되었고, 녹색마을센터와 게스트 하우스를 중심으로 한 관광 상품화로 사업내용이 변질되고 말았다.<br>2011년 환경부 시범사업 대상지로 선정된 경남 거창군 양기·음기 마을도 도비 부족에 따라 사업을 자체 포기하였다.<br>결국 2013년에는 환경부만이 강원 홍천군 소매곡리 1개 마을을 조성한다는 계획이고, 2020년까지의 목표 마을 개수도 600개에서 40개로 대폭 축소되었다.<br>결과적으로 성과를 내는 것에만 몰두해 단기간에 예산을 투입하여 마을에 신재생에너지시설을 설치하는 것에만 관심을 두었지, 실제 가장 중요한 주민들이 어떤 역할을 해야 하는지에 대한 고려가 부족하였다. 또한, 운영주체인 주민역량 강화를 위한 투자가 미흡한 실정이고, 하드웨어 중심의 투자로 에너지 생산시설의 효율 및 유지·관리와 같은 소프트웨어가 부재하다는 점 등이 문제점으로 지적되고 있다.