2) 신고자 보호·보상 제도의 분산
각종 신고자 보호·보상 제도가 여러 법에 나뉘어 각기 규정되어 있어, 신고자가 보호 내용을 용이하게 파악하기 어렵다는 지적이 있다. 현재 유사한 신고자 보호·보상 제도들이 「공익신고자 보호법」, 「부패방지 및 국민권익위원회의 설치와 운영에 관한 법률」, 「공공재정환수법」 등에 각기 규정되어 있다. 이에 신고자는 어느 법에 근거하여 어느 만큼의 보호·보상을 받는지 파악하기 쉽지 않다는 지적이 제기된다. 보호·보상 내용에 대한 파악이 쉽지 않은 만큼 신고의 동기도 저하될 수 있다.
또 유사한 취지의 보호·보상 제도임에도 보호 내용에 차이가 발생할 수 있다. 공익신고제도, 부패행위 신고제도, 부정청구 신고제도는 적어도 신고자 보호·보상에 있어서는 제도의 목적이 유사하다고 지적된다. 그럼에도 입법시차 등으로 인해 각 제도의 보호·보상내용에 차이가 존재한다. 예컨대 「공익신고자 보호법」상 공익신고자는 비실명 대리신고가 가능하지만, 부정청구 신고자·부패행위 신고자는 기명으로 신고를 해야 한다.