이와 함께 동법 제99조 제1항은 보건복지부장관은 요양기관에 대하여 업무정지처분을 하여야 하는 경우로서 그 업무정지 처분이 해당 요양기관을 이용하는 사람에게 심한 불편을 주거나 보건복지부장관이 정하는 특별한 사유가 있다고 인정되면 업무정지 처분을 갈음하여 속임수나 그 밖의 부당한 방법으로 부담하게 한 금액의 5배 이하의 금액을 과징금으로 부과･징수할 수 있다고 규정하였다(과징금).
이 밖에 동법 제100조 제1항은 보건복지부장관은 관련 서류의 위조･변조로 요양급여비용을 거짓으로 청구하여 업무정지 또는 과징금에 따른 행정처분을 받은 요양기관이 1. 거짓으로 청구한 금액이 1,500만원 이상인 경우 또는 2. 요양급여비용 총액 중 거짓으로 청구한 금액의 비율이 20% 이상인 경우에 해당하면 그 위반 행위, 처분 내용, 해당 요양기관의 명칭･주소 및 대표자 성명, 그 밖에 다른 요양기관과의 구별에 필요한 사항으로서 대통령령으로 정하는 사항을 공표할 수 있다고 규정하였다(명단공개).