그러나 2017년 현재 법 시행 3년차를 맞이하여 현장에서는 몇 가지 개선점과 보완점이 제기되고 있다. 전국적인 인프라 구축을 통한 서비스의 양적인 확대에 치중 하여 대상자의 특성과 욕구를 반영한 프로그램의 차별화 및 질적 수준이 확보되지 못한 측면이 있다는 지적이다. 사업의 실질적인 성공여부는 프로그램 운영과 업무를 담당하는 실무 인력의 자질과 역할에 달려 있지만 예산상의 한계로 인하여 전문 인력 확보가 어려운 실정이다. 학교 밖 청소년 발생이 상대적으로 적은 지역의 경우 사례발굴에 상당한 어려움을 겪고 있으며, 학교 밖 청소년을 발굴하고 사례 관리하는 실적위주의 사업운영으로 정작 중요한 지역사회 네트워크 구축 및 사회적 인식개선 사업이 미흡하게 이루어지고 있다.