여섯째, 1990년대에는 그간의 중등교원 임용 과정에 많은 변화가 나타나게 된다. 국·공립 교원양성기관 졸업생 우선 임용을 규정한 교육공무원법 제11조 1항에 대해 사립 사범대학생이 헌법소원을 내게 되고, 1990년 10월 헌법재판소는 그 조항이 평등권과 직업선택권을 보장하는 헌법에 위배된다는 판결을 내린다. 이로써 90학번 학생부터 적용되기로 했던 종합대책안이 바로 앞당겨져, 위헌 판결이 난 당해 12월부터 초·중등교원 임용고시제라는 개방형 공개경쟁시험제도가 시행되게 되었다. 이로써 국·사립 사범대학과 일반대학 교육과, 일반대학 교직과정, 교육대학원 등에서 무시험 검정으로 받게 되는 교원자격증을 소지한 사람이라면 그 누구나 임용고시를 통해 교사로 진출할 수 있게 되는 개방형 중등교원양성과 임용체제가 확립되게 된 것이다.
임용고시 실시 이후 정체되어왔던 중등교원양성과 임용체제에 대해 90년대 중반 교육개혁위원회의 교육개혁안과 함께 많은 학자들의 문제제기가 나오게 되고, 이후 지금까지 일반대학 교직과정 이수자를 학과정원 10%로 제한하는 작업과 함께 교원양성기관 평가, 임용고시 전형방법의 개선 등의 작업을 해왔다. 또한 교육개혁에 대한 시대적인 요청과 세계사적인 사회변화의 흐름으로 교원정책의 개혁이 크게 요구되었고, 그 과정에서 교원양성과 임용제도에 대한 비판적 문제제기가 계속되고 있다.