행정안전부는 사전협의 신청 시에 제출한 정보화사업의 성과를 관리하고, 그 결과를 환류하는 선순환 구조의 통합적 성과관리체계를 기획하였다. 즉, 정보화사업으로 구축된 정보시스템 및 모바일 서비스앱의 성과를 측정하고, 그 결과를 다음 해의 정보화사업을 기획하는 데에 반영해야 한다는 것이다. 그러기 위해서는 정보화사업과 정보시스템, 모바일 서비스앱의 성과지표가 일관성 있게 관리되어야 할 것이다.
기본적으로는 정보시스템과 모바일 서비스앱 모두 정해진 측정지표가 있다. 다만, 모바일 서비스앱이 지침상 정해둔 다운로드, 이용자수, 만족도, 업데이트 최신성 등의 고정된 지표를 측정하는 데 반해, 정보시스템은 정보화사업과 마찬가지로 정보시스템이 갖는 본래의 성과목표를 달성하였는지를 확인하는 별도의 지표를 선정하여 측정하도록 하고 있다.