이런 점들을 감안하면 총액인건비제도는 공무원들로 하여금 자기 역량계발에 힘쓰도록 자극을 주는 한편 업무성과 향상에 기여하는 측면이 있다. 또한 매년 인건비의 총액은 올리지 않거나 동결한 상태에서 소속 공무원의 인건비를 배정할 수 있게 함으로써 세출예산을 축소시키는 효과를 제공하게 된다. 반면 동 제도는 동일한 직급·직렬에 속하는 공무원들 간에 지나친 경쟁을 유발함으로써 업무협조 분위기를 저해하고, 상호 견제와 불신을 심화시키는 부작용을 수반할 수 있음을 간과해서는 안 된다.
총액인건비제도는 1997년 말에 도래한 IMF 외환위기 이후 모든 분야에 걸쳐 긴축과 구조조정 요구가 거세지면서 자연발생적으로 태동한 부산물이라고 할 수 있다. 동 제도는 2005년 2월 행정자치부의 「지방자치단체 총액인건비제 시범사업 추진지침」을 통해 그 최초로 근거가 마련되었다. 이어 동년 3월 총액인건비제도 도입에 대한 법적 근거를 마련하기 위하여 관계 법규가 개정되었다. 구체적으로 「행정기관의 조직과 정원에 관한 통칙」의 개정을 통해 과장급 이하 정원규모, 계급별·직급별 정원관리에 대해 각 기관이 자율권을 갖도록 하였으며, 성과향상항목 수당의 지급대상, 지급요건결정 및 수당간 지급액 조정을 대상으로 각 기관에 재량권을 부여하는 방식으로 「공무원수당규정」이 변경되었다. 이러한 법령의 개정을 거쳐 법적 근거를 마련한 총액인건비제도는 2005년과 2006년의 시범실시가 이루어졌고, 2007년부터 전면시행되고 있다.