정부부처 혹은 정부연구기관, 연구자별 FTA 파급영향과 대책에 대한 상이한 견해와 입장표명은 해당 경제주체들의 합리적 의사결정을 저해하는 결과를 유도할 수 있으므로 사전적으로 연구결과에 대한 철저한 검토와 조율 등 상당한 주의가 요구된다. 예를 들어 과수산업은 한·칠레 FTA 발표 이후 농업부문 중 가장 큰 부정적 영향이 예상되었다. 이에 정부는 한·칠레 FTA 협정 체결 이후 가장 많은 피해가 예상되는 것으로 나타난 시설포도와 복숭아, 참다래(키위) 재배 농가들을 대상으로 과수산업 구조조정을 위한 폐원 신청을 받았다. 그런데 농민들이 신청한 폐원면적은 정부의 당초 계획보다 50% 이상 늘어난 6,400ha에 달하였다. 상대적으로 다른 과일에 비해 경쟁력도 있다고 판단되고 현재 식물검역 상 수입이 금지된 복숭아에 대한 폐원신청비율이 가장 높았다는 것은 예상 영향에 대한 오류, 그리고 정부의 정책수립 및 정책홍보 과정에서의 종합적 판단부족에서 비롯된 농업생산자들의 오도된 기대 현상도 일정한 역할을 했다고 여겨진다.