지방자치의 부정적 요인 중의 하나는 끊이지 않고 속출하는 각종 부조리와 부패 및 비리이다. 지방정부의 장의 비리는 1995년 이후 현재까지 끊이지 않고 반복되고 있다. 2010년 임기를 마친 제4대 지방정부의 장의 경우 15%인 34명이 금품수수와 횡령 등으로 기속되었으며 각종 인･허가, 공무원의 채용과 승진 및 전보 등과 관련하여 금품을 받은 것으로 나타났다. 34%인 79명은 선거법 위반으로 기소되었다. 지역별로는 각종 개발 인･허가 과정에서 비리가 발생한 거제시, 군수의 선거비리로 얼룩진 임실군과 가평군 및 청도군 등이 대표적인 예이다(중앙선데이, 2013). 이러한 비리들이 단체장이 수행하는 지방행정을 철저하게 견제할 수 있는 장치가 필요한 근거가 되고 있다. 지방행정의 발전이 시대적 요구에 부응하지 못하는 것도 지방정부의 효율성을 저하시키는 요소이다. 많은 노력에도 불구하고 전반적으로 지방공무원의 경쟁력, 즉 지방공무원의 자치역량이 크게 미흡한 것으로 각종 연구에서 지적되고 있다(육동일, 2010; 최봉기, 2011).