민주당 구주류는 강하게 반발했다. 동교동계 내부에서는 “이렇게 되면 당을 쪼개자는 것 아니냐”는 격앙된 반응이 터져 나왔다. 특히 김대중 전 대통령의 햇볕정책을 정면으로 건드렸다는 점에서 갈등의 골은 더욱 깊게 패였다. 여기에 4･24 재･보궐 선거 경기도 고양 덕양갑 공천을 둘러싸고 신주류는 개혁당의 유시민 후보를 연합 공천하자고 주장한 반면 구주류는 여당이 공천을 포기할 수는 없다고 맞서며 또다시 충돌하게 됐다. 결국 신주류 의지대로 유시민 후보가 연합 공천을 받아 당선됐지만 당초 민주당이 현역 의원이었던 서울 양천을과 의정부는 한나라당에 패하면서 선거 결과를 놓고 책임론 공방이 거세게 일었다. 신주류는 당 개혁이 지지부진한 데 대해 국민이 실망했기 때문이라며 패배의 책임을 구주류에 돌린 뒤 당 개혁에 더욱 박차를 가하라는 국민적 요구라고 주장한 반면, 구주류는 신주류가 덧셈정치가 아닌 뺄셈정치로 당을 분열시키고 독선적이고 반민주적인 태도를 보인 데 대한 국민의 실망감이 표출된 것이라고 반박했다.