둘째, 대다수의 지자체들은 앞서 지적한 예산문제 등으로 공공관리제도를 운영하는 것이 어렵다고 느낀다는 점이다. 2010년 2월 개정된 「도시 및 주거환경정비법 일부개정법률안」에 대한 국회 국토해양위원회의 검토보고서에 따르면 대다수의 지자체들이 공공관리제도 운영에 필요한 재정부족 뿐 아니라, 전문 인력의 부족을 이유로 공공관리제도의 시행이 어렵다는 의견을 개진하고 있다. 예를 들어 2009년 2월에 개정된 「도시정비법」에 의해 지자체가 정비계획 수립비용과 재건축 사업의 안전진단 비용을 부담하도록 하고 있으나, 다수의 비수도권 도시들은 재원부족으로 이러한 비용을 부담하기 곤란한 실정이다. 지방자치단체가 한정된 인력과 재원으로 재건축 대상 아파트의 안전진단을 시행하는 것이 어렵기 때문이다.