한편, 정부는 선박금융 위축 보완 및 해운사의 참여 확대를 위해 해운산업 동향 및 대응방안(2009.11.10)을 발표하면서 구조조정기금의 투입비율을 기존 40%에서 60%까지로 상향 조정하고 매입대상을 운항중인 선박에서 건조중인 선박으로 확대하였다.
○2009년 인수
2개 선사 보유 선박 18척(선가 5,778억원)을 매입하면서 구조조정기금은 선박매입가격의 40%에 해당하는 2,311억원을 선박투자회사에 출자하였다.
○2010년 인수
4개 선사 보유 선박 8척(선가 2,513억원)을 매입하면서 구조조정기금은 선박매입가격의 29~60%에 해당하는 1,271억원을 선박투자회사에 출자하였다.
○2011년 인수
5개 선사 보유 선박 7척(선가 2,308억원)을 매입하면서 구조조정기금은 선박매입가격의 25~60%에 해당하는 1,084억원을 선박투자회사에 출자하였다.