따라서 공기연장에 따른 간접비를 산출함에 있어 설계변경에 수반한 공사량 증가로 인한 간접비 반영 부분을 공제한다는 원칙을 확립하여 분쟁의 요소를 줄이는 것이 필요하다. 다만, 그 공제가 공기연장 중 공사량 증가로 인한 실제 기여분보다 커 부당하게 계약상대자의 이익을 침해해서도 안 될 것이다. 그러므로 설계변경이 발생한 후 계약상대자가 공기연장을 신청할 때에는 공정분석결과를 바탕으로 설계변경 결정이 나오기까지 지연된 시간, 설계서의 오류 등으로 작업 진행이 지체된 시간 등 비효율성으로 인한 연장기간과 설계변경 후 추가공사 등에 소요된 시간 등을 구분하여 신청하도록 공사계약 일반조건을 수정할 필요가 있다. 구체적으로는 공사계약 일반조건 제23조 제6항을 신설하여 계약상대자에게 전체 공사기간 연장에서 설계변경에 따른 공사물량 증감에 의해 연장된 기간을 구분하여 계약금액 조정을 신청하도록 하여야 할 것이다.
이를 통해서 계약상대자의 입장에서는 설계변경 간접비 증액으로 전체 공기연장 간접비 지급을 갈음하려는 시도를 차단하고 설계변경 수반 공사량 증가가 그 원인인 공기연장을 제외한 공기연장에 대해 간접비 보상을 보장받고, 발주기관의 입장에서는 설계변경 수반 공사량 증가에 대해 직접비 변경에 따른 요율로 연동된 간접비를 지급하고 전체 공기연장에 대한 간접비를 산정하면서 이를 다시 반영하는 오류를 시정할 수 있다. 다만, 설계변경 수반 공사량 증가와 다른 사유가 시기상 중첩적으로 공기연장에 영향을 준 경우 그 기여분을 보다 정확히 파악하기 위한 공정분석의 작업은 여전히 필요할 것이다.