현재 환경부의 소관법령 가운데 자연 환경 조사와 관련된 법률로는 환경관련 최상위법이라 할 수 있는 ｢환경정책기본법｣, 전국 자연환경 조사의 실시와 관련 자료의 정리를 법적 책무로 정하고 있는 ｢자연환경보전법｣, 독도 등 자연 환경의 보존상태가 탁월한 지역을 대상으로 자연환경에 대한 조사를 하고 보존업무를 수행할 수 있도록 한 ｢독도 등 도서지역의 생태계보전에 관한 특별법｣, 습지에 대한 조사와 습지보호구역 지정을 명시한 ｢습지보전법｣, 멸종위기에 처한 야생 동식물의 보호와 관리 그리고 서식지 조사를 의무화한 ｢야생동ㆍ식물보호법｣등이 있다. 이 가운데 ｢환경정책기본법｣은 국가와 지방자치단체의 책무로 자연환경에 대한 조사 수행을 명시하고 있는(법 제15조) 수준의 선언적 조항으로 볼 수 있어 분석의 대상에서는 배제하였다. 자연환경조사를 조사대상의 특성에 따라 일반적인 자연환경조사, 습지, 동굴, 해안사구, 도서 등 특수 환경에 대한 조사 그리고 특정 동물과 식물에 대한 조사로 구분하는 것이 일반적이나 본고에서는 근거법을 중심으로 논의하고자 한다.