이러한 신뢰의 부족은 각군의 자군중심주의(parochialism)를 자극하여 상호이해의 폭을 계속적으로 제한해왔고, 이번 상부지휘구조 개편은 물론이고 합동성 강화라는 한국군의 과제를 제대로 구현하지 못하도록 만들고 있다. 예를 들면, 2010년 3월 26일 천안함 폭침 사태가 발생한 당일 합참의장 주재로 육군교육사령부에서 개최된 “합동성 강화를 위한 대토론회”에서 발표된 자료에 의하면 한국의 육군, 공군, 해군의 중령과 대령급 장교들의 대부분은 우리 군의 합동성이 매우 낮은 단계에 있는 것으로 인식하고 있고, 그들의 60-70%가 그 이유로 자군중심주의와 타군에 대한 이해부족을 거론하고 있다(합동참모본부, 2010). 이와 같이 각군 간의 신뢰가 형성되지 못한 상황에서는 전체 군대의 노력을 통합하기 위한 어떠한 노력도 의도된 성과를 달성하기가 어렵다. 특히 상부지휘구조와 같은 민감한 사안을 논의하게 되면 당연히 타군의 의도를 의심하게 되고, 따라서 그 이전보다 군 간의 신뢰를 더욱 떨어뜨릴 수밖에 없으며, 이것이 현재의 상부지휘구조 개편 추진에서 나타난 현상이다. 비록 시간이 소요되고 성과를 달성하기가 쉽지 않더라도 각군의 신뢰를 형성한 다음에 상부지휘구조 개편과 같은 근본적인 제도개선을 도모하는 것이 타당했다고 할 것이다.