나토 공동 예산은 주로 나토의 운영 관리비로 사용된다. 구체적으로는 군사 인프라 구축을 위한 비용과 나토 사령부 운영비, 나토 본부의 인건비와 운영비 등으로 지출된다. 나토 공동 예산 분담금은 회원국의 총 국민소득(GNI)에 의해 결정되는데, 현재 미국이 22.144%, 독일 14.65%, 프랑스 10.63%, 영국 9.84%를 분담하고 있다. 탈냉전 이후 가입한 국가들은 대부분 1% 미만을 내고 있다. 2017년 나토 공동 예산은 약 14억 달러로서 회원국의 전체 국방예산에 비하면 미미한 액수이기 때문에 분담의 형평성 문제를 야기하지 않는다(Goodenough, 2017).