3. 한국문화원 운영의 문제점
(1) 이원적인 운영체계
현재 한국문화원의 신설과 운영을 위한 예산의 확보·편성·집행, 감사 및 회계의 책임은 문화체육관광부가 지고 있으나 문화원의 설치는 「외교부와 그 소속기관 직제」에 근거하여 재외공관의 부설기관으로 되어 있다. 또한 한국문화원의 원장은 외교부를 제외한 각 부처 소속 공무원을 대상으로 직위공모로 선발되지만, 현지에서는 외교관의 신분으로 재외공관장의 지휘·감독을 받고 있다.
이처럼 한국문화원은 최초 설립 이후 35년이 지난 현 시점에서도 여전히 재외공관의 부속 조직 정도로 인식되고 있다.
이에 한국문화원 운영의 자율성 강화를 위해 문화원의 법적 지위 개선이 필요하다는 의견이 대두되었다. 2013년도 정부 예산안 심의과정에서도 문화원의 분산된 운영체계에서 비롯된 비효율성에 대하여 문제가 제기되었으며, 한국문화원을 문화체육관광부로 이관, 통합·관리할 필요가 있다는 지적이 있었다.