법에 따르면 교과부가 취할 수 있는 입지선정 방식은 2가지로 요약할 수 있다. 즉 공모에 의한 방식과 평가에 의한 지정방식이다. 여기서 공모는 지자체간의 과열경쟁으로 인한 예산낭비와 후유증 등 부작용을 고려해 피해야 하며, 정부도 공모는 고려하지 않고 있다.
더구나 과학벨트의 입지는 벨트 개념(면적, 사용가능 시기, 공급가격, 접근성, 발전 가능성 등 고려)의 적용이 가능해야 하기 때문에 입지 가능 지역이 한정되어 있다. 특히 벨트 구축과정에서 지방자치단체가 기여할 부분이 명확하지 않기 때문에 공모방식보다는 평가단에 의한 평가방식이 바람직할 것으로 보인다.
따라서 정부가 법에 따라 취할 수 있는 방법은 평가에 의한 지정방식이라고 할 수 있다.