지방자치의 문제점으로 제시된 것은 낮은 주민참여, 지역 이기주의, 부패와 부조리(김동욱, 2010), 주민들의 지방자치에 대한 이해 및 관심의 부족과 비정상적인 선거관행, 지방정치인의 부패와 자치역량 미흡(육동일, 2010), 중앙-지방 간 권력 및 재원의 불균형, 선심성･전시성 행정, 자치역량의 미흡(이용환, 송상훈, 이현우, 2013), 지역 기득권 구도의 강화, 지역주의의 심화, 강력한 중앙통제(이상선, 2011), 낮은 주민의 참여와 관심, 부정과 부패, 지역정치의 부재(하승수, 2010), 지방자치 관련제도의 미비(최상한, 2011), 지방의회의 전문성과 책임성, 주민에 대한 책임성 부족(김순은, 2011), 예산배정의 갈등과 지방의원의 재량권 부족, 지방의회의 정당 공천제 및 지방의회 사무기구의 인사권(김성호, 2011), 준비가 미흡한 지방자치의 부활(심대평, 2014) 등이다.