(1) 제도의 운영방식
현행 규제샌드박스 제도 운영방식은 개별 사업자의 신청을 기반으로 하는 Bottom-up 방식으로 운영되고 있어, 제도의 확장성 및 지속성 측면에서 한계점이 지적되고 있다. 이에 대한 개선방안으로는 정부가 신산업으로 발굴하고자 하는 업종을 선정해 규제를 완화해주어 기업들의 사업진출을 유도하는 Top-down의 강화 또는 Bottom-up 방식과의 혼용 등이 있다. 원소연 외(2021)도 하나의 책임부처로 통합(제1안), 신청접수의 사전단계만 통합(제2안), 컨트롤타워 역할 및 협업강화(제3안), 그리고 현재와 같이 각 주관부처의 책임하에 운영하되 적용 분야를 확대하는 방안(제4안)을 제시하고 있다. 그들은 다양한 판단기준을 고려해 보았을 때, 현행 체계를 유지하되 컨트롤 기능과 협업을 강화하는 방안을 가장 타당하다고 보고 있다.