(3) 다양한 형태의 지역 갈등 해소
도시융합특구 조성은 다양한 형태의 지역 갈등을 유발하고 있어, 이를 해소하기 위한 중앙정부와 지방자치단체의 노력이 필요하다.
도심융합특구 조성 계획이 발표된 이후, 부산은 해운대구와 기장군이, 울산은 울주군과 중구가 유치경쟁을 벌이면서, 부산은 대상지 선정에 1년 이상의 기간이 소요되었으며, 울산은 아직까지도 미정인 상태이다. 이 같은 지방자치단체 간 갈등은 선도사업 시행 이후 대도시로 사업을 확대해 가는 과정에서 더 악화될 수 있기 때문에 도심융합특구의 지정기준을 명확하게 정하여야 할 것이다. 또한 각 지방자치단체의 특구 조성 이후 유치가능한 기업이 한정되어 있는 상황에서 각 도심융합특구만의 특색 있는 산업을 발굴하지 못한다면, 특구 간 갈등이 발생할 가능성이 있어 각 도심융합특구의 사업 내용이 차별화되어야 할 것이다.