국가인권위원회의 성희롱 기각 결정을 취소한 판결도 주목할 필요가 있다(디딤돌, 2006). 이 사건은 대형유통업체에서 일어난 성희롱 사건에 대해 국가인권위가 성희롱 기각결정을 내렸다. 그러나 재판부는 “인권위가 회식 내에서의 000 씨의 성적 언동을 성희롱에 해당하지 않는다고 판단한 것은 위법하다”고 원고 일부 승소 판결을 내렸다. 이 판결은 국가인권위가 출범한 후 인권위 의결사항에 대한 첫 취소 판결이자, 성희롱 관련 시정 업무가 인권위로 일원화된 후, 인권위의 부실한 조사와 잘못된 시각에 대해 재성찰해야 한다는 의미를 갖는다(상담소협의회, 2007: 15).