현행 제도에 따르면 경영평가단은 매년 2~3월에 구성되어 3월 초에 평가단 위촉식 및 워크숍을 개최하고 3월 20일까지 기획재정부장관과 주무기관의 장에게 제출받은 경영실적보고서의 평가 결과를 6월 초까지 완료해야 하므로 경영평가위원이 각 기관 사업의 세부적인 사항을 파악·검토, 현장실사 및 관계자 면담 등을 통해 경영평가 결과를 검증할 수 있는 시간이 상대적으로 부족한 실정이다.
이와 관련하여 현행 3개월의 경영평가 심사 기간을 연장하여 단기간에 집중된 업무 부담을 완화하는 방안과 경영평가단 내에 오류 검증 기관 등 기술적인 부분만을 담당하는 조직을 별도로 설치하여 경영평가위원이 각 기관 사업의 검토·현장실사 등에 집중할 수 있도록 환경을 조성해주는 방안에 대해서도 충분한 논의가 필요할 것으로 보인다.