한편, 납세자보호관이 납세자의 세무민원을 해결하고 세무상담을 진행하면서 납세자로부터 정보를 취득할 수 있는데, 납세자보호관은 세무공무원에 해당되지 않으므로 비밀유지 의무가 없는 상황이다. 현행 「지방세기본법」 제86조 제1항에는 세무공무원의 비밀유지 의무만 있기 때문이다. 또한, 납세자가 납세자보호관에게 제공하는 정보는 “납세의무를 이행하기 위해 제출한 자료”라고 보기 어렵고, 납세자보호관이 취득한 정보는 “지방세의 부과 또는 징수 목적으로 취득한 자료”라고 보기 어렵기 때문에, 비밀유지 자료에서 제외되고 있다.