정부는 보도자료에서 1981년 확립된 현행 직종 체계는 변화된 행정환경에 부합하지 않을 뿐만 아니라, 지나치게 세분화되어 있어 공직 내 인력흐름에 칸막이로 작용하고, 인력관리의 비효율을 초래하는 등 문제점이 꾸준히 제기되어 왔다고 지적하고, 공무원 직종체계를 일반직 중심으로 통합·간소화한다고 밝히면서 이 같은 조치를 단행했다. 그러나 문제는 이러한 직종 개편이 행정환경의 변화 및 행정수요에 대응하는 인사운영체제를 갖추고, 공직사회를 통합함으로써 정부와 자치단체의 경쟁력을 높이는 계기가 될 수는 있을 것이나, 그나마 형식적이었던 지방의회 사무직원의 인사권 독립문제는 더 멀어진 느낌마저 든다.
견제와 균형은 지방의회의 조직과 구성은 물론 업무수행에 있어서 단체장의 간섭을 배제시킬 수 있는 의회자율권이 인정될 때 가능하다는 점에서, 정부와 정치권이 이를 개선하지 않는 한 지속적인 인사권 독립문제가 제기될 수밖에 없을 것이며, 지방의회 사무기구는 지방의회의 소속기관으로서 독자적인 인적자원관리체계를 구축하여 집행기관과 인사관리를 달리할 필요성이 있으나, 정부의 법 개정으로 지방의회 사무직원에 대한 보직인사권 전체를 단체장이 다시 전유하게 된 셈이다.