이러한 추진실태에서는 정비사업의 다양한 문제점이 제시되었으며, 대부분의 문제점은 정비사업을 진행하는 각 주체들 간의 갈등과 능력 부족, 재정착률 저하 등에 의해서 발생되었다. 따라서 효율적인 정비사업의 진행을 위해서는 행정기관, 조합 및 추진위원회, 원주민(주민), 정비사업 관련정비업자 등 이해관계자의 인식개선과 원활한 의사소통이 필요하며, 이에 대한 각 주체간의 역할수행이 가장 중요하게 요구된다.
또한 원주민의 재정착률 저하, 주민참여 부족 등 기존의 원주민들이 참여하지 않는 것이 가장 큰 문제점으로 제시할 수 있으며, 이를 위해서는 주민참여를 활성화할 수 있는 공청회, 정비사업의 이해를 도울 수 있는 정책 등이 구성되어야 할 것이다.
정부에서도 적극적으로 지방 중소도시에 대한 현황파악이 시급히 필요하며, 수도권에 치우친 법안의 개선이 필요하다. 특히, 입법과정에서 지방 중소도시는 「도시 및 주거환경정비법」에 근거하여 정비사업을 시행하고 있으나 사업기간 지연과 행정기관의 문제 등으로 주민들의 불만과 함께 정비사업이 비효율적으로 진행되고 있으며, 현재 정부는 물론 행정기관 등이 주민들의 신뢰를 얻지 못하고 있는 실정이다. 또한 사업성이 매우 부족한 실정으로 나타났으며, 일부 조합 및 추진위원회와 시공사에서 불법적인 행위가 이루어지기도 한다. 이로 인하여 원주민들의 재정착할 의지가 부족하게 나타났으며, 원주민들이 이주를 결정함으로서 미분양이라는 문제점 또한 발생하게 된다.