금융회사의 주식소유를 엄격하게 제한하는 조치도 있었다. 금융기관이 다른 회사의 의결권 있는 주식을 일정 비율 이상 소유하는 경우 금융위원회의 승인을 받도록 되어 있으나 종전 기준 하에서는 다른 회사의 주식을 5% 이상 소유하게 되면 20%까지는 추가 승인 없이 동 회사의 주식을 소유할 수 있으므로, 10%이상 및 15%이상 기준을 추가하여 금융기관의 주식소유를 보다 엄격하게 제한하고자 하였다(「금융산업의 구조개선에 관한 법률」 시행 2016.9.30). 
예금보험제도 적용 관련 규정 정비도 있었다. 부보금융회사의 범위에 증권금융회사를 추가하고 예금 등이 없는 투자매매업자·투자중개업자는 제외하도록 하는 내용의 개정 「예금자보호법」(공포 2015.12.22, 시행 2016.6.23)이 시행되었다. 이에 따라 증권금융회사의 예탁금 중 파생상품예탁금 등은 예금보호 대상에서 제외하고 부보금융회사에서 제외되는 투자매매업자·투자중개업자의 범위를 명확히 하였다. 한편 금융회사의 설립 및 인·허가시 납부하는 예금보험기금 출연금 산정기준을 현행 납입자본금에서 금융회사의 영업 또는 설립 인가에 필요한 최저자본금으로 개선하고, 부보금융회사가 아니었던 회사가 부보금융회사가 되는 경우의 출연금 납부기준을 구체화하였다(「예금자보호법 시행령」 시행 2016.6.21).