임시보호의 체류 허가 기간은 1년이며, 임시보호 상황이 종료되지 않을 경우에는 6개월씩 최장 1년까지 연장이 가능하다. 임시보호는 최장 기간이 도래하거나 유럽연합 의회가 본국 귀환 상황이 안전하고 안정적이 되었음을 인정하는 경우 종료된다(지침 제4조). 임시보호 대상자도 언제든지 난민신청을 할 수 있으며, 임시보호가 종료되기 전까지 난민 심사가 완료되지 못하더라도 그 이후에 심사를 완료할 수 있다(지침 제17조).
임시보호의 대상이 되는 국가는 개별 국가에서 정하는 것이 아니라 유럽집행위원회(European Commission) 추천으로 유럽연합이사회(Council of the European Union)가 결정한다(지침 제5조). 2001년 임시보호지침이 채택된 이후 유럽 인근 지역에서는 여러 차례 유민 상황이 발생해 이들 중 다수가 유럽으로 유입되었으나, 지금까지 지침에 근거하여 임시보호 대상 국가를 선정한 사례는 없었다. 이는 임시보호 국가를 결정함에 있어 복잡한 심사와 정치적 논의가 필요하고, 회원국 간 합의 도달이 어려우며, 이 과정에 지나치게 많은 시간이 투입되고, 지침에 서술된 ‘대량 유입’(mass influx)에 대한 정의가 모호하기 때문이다(Genc & Öner, 2019). 특히 임시보호를 제공하는 순간 더 많은 난민의 유입을 촉발할 것이라는 공포로 인해 임시보호 결정을꺼리며(Genc & Öner, 2019), 분쟁 발생지 인접국과 그 외의 국가들 간 입장차가 서사태에 대한 책임 분담에 있어 합의가 이루어지기 어렵다(European Commission, 2016; Genc & Öner, 2019). 이로 인해 임시보호 제도는 유럽에서 실질적으로 활용되는 제도라고 보기는 어렵다.