① 일반담보대출
일반담보대출의 경우 정책목적 부합 여부, 기술성 평가 등을 심의하는 1차 심사는 과학재단의 책임 하에 기술신용보증기금과 한국과학기술원, 한국과학기술기획평가원 등 7개 기술력(성)평가기관이 수행하고 그 결과 선정된 과제와 기업을 동 사업취급금융기관들에게 추천한다. 취급 금융기관들(주로 은행들)은 물적담보(부동산, 동산, 유가증권, 지급보증서 등)를 제공할 수 있는지 여부에 대한 심사(2차심사)를 거쳐 융자제공 여부를 확정한다. 취급금융기관들(주로 은행들)은 이러한 이 사업을 취급하는 대가로 융자액의 1.0%의 수수료를 획득한다.
일반담보대출은 하지만 담보력이 취약한 기술혁신형 중소·벤처기업의 접근이 힘들기 때문에 점차 비중이 줄어들어 2005년의 경우 총 880억원의 지원규모 중 일반 담보대출은 350억원, 기술담보대출은 530억원이었으며, 그리고 2006년도에는 완전히 폐지되었다.