역학적으로 보고된 바에 의하면 뇌염은 기후변화와 더불어 숲의 파괴 등 생태계의 변화, 인구밀도와 모기나 새와 같은 숙주의 변화, 바이러스의 유전적 변화에 의하여 영향을 받는다. 뇌염발생의 경우 거의 모두 기후에 민감하다고 알려져 있지만 얼마만큼, 어디에, 어떻게 영향을 미치는지는 규명되지 않았다. 그러나 오스트레일리아에서 기후의 변화가 뇌염발생에 역학적으로 영향을 미쳤다는 보고가 있으며, 기온의 증가가 매개모기의 생육속도를 단축시켜 개체수의 증가를 가져올 수도 있다. 이에 대한 연구나 역학조사는 더 진행되어야 하는 부분이다.