상호성과 유연성이라는 관점에서 파악해 보면, 정부, 연구회, 출연(연)은 장기간에 걸치는 복잡한 거래 관계를 통해서 상호적인 이익을 실현하는 특징이 있고 당사자 사이의 신뢰관계에 근거하는 상호 협력을 위한 유연성을 가지고 있다. 관계적 계약에서는 계약의 내용을 결정하는 것이 중요한 것이 아니라 그것들을 결정하는 프로세스가 중요하며 이를 통해 계약의 유연성이 생기게 된다. 국가연구개발사업이 추구하는 목표는 추상적이며 ‘계약’이 성립하는 시점에 그 내용을 확정하기 어렵다. 기술환경의 변화가 빠르고 사회의 트렌드가 급변하는 상황에서 국가가 추구하는 과학기술 연구의 내용과 발전방향은 수시로 변화한다. 따라서 그러한 공통의 목표와 방향을 설정하는 과정이 무엇보다 중요하며 국가, 연구회, 출연(연)은 이를 통해 새로운 그들의 권리와 의무 및 공통의 목표를 설정하고 실천하게 된다.