한편, 학교 밖 청소년을 발굴하고 사례 관리하는 실적 위주의 사업운영으로 인하여 홍보, 연구, 네트워크, 인식개선 사업 등 대외협력 사업이 소홀히 다루어져 학교 밖 청소년 지원 사업의 전체적인 기반을 확고히 하는데 실패할 가능성이 있다. 또한 상담전문 인력에 의한 사례관리가 이루어진다는 측면에서는 긍정적이지만 실적이 강조되다 보니 학교 밖 청소년의 실태파악을 위한 기초데이터를 생성하는 것에 소홀하기 쉽고 일반시민 혹은 부모대상 교육을 위한 인력양성 사업 등 데이터 생성과 관리, 인프라를 구축하는 데 한계가 있다는 의견이다. 거점센터 운영을 통해 대외협력 업무를 강화할 수 있는 방안이 모색되어야 하며, 서비스 대상 인원 대비 적절한 상담 인력 확보, 처우개선, 보조 인력을 유연하게 사용할 수 있는 지침 마련 등의 대안이 필요하다는 지적이다.