설치류를 매개로 하는 질병은 모기에 의한 질병보다 기후에 의해 영향을 받는 정도가 약하다. 그러나 쥐를 매개로 하는 랩토스피라증, 한타바이러스, 쯔쯔가무시 역시 계절적 패턴과 기후에 민감하게 영향을 받는다. 설치류에 의한 질병은 설치류의 개체 수나 그 배설물에 접촉하는 횟수와 관계가 있는데 기후의 변화는 특히 접촉횟수에 더 큰 영향을 미친다, 강수량이 감소하면 개체수가 감소하지만 사람이 사는 곳 주변으로 이동하여 접촉의 기회가 증가할 수 있으며 홍수는 동물의 배설물에 접촉할 기회가 많아져 질병을 유발할 기회가 증가하기도 한다.