또한 「조세특례제한법」은 국세의 감면 등에 대하여 규정하는 법률이나, 예외적으로 제4장(제119조~제121조)에서 지방세 감면조항을 두고 있는데, 감면 목적별로 규정한 「지방세특례제한법」과는 달리 취득세·등록면허세·재산세 등 세목별로 구분하여 규정하고 있다.
한편 각 지방자치단체는 「지방세특례제한법」 제4조에 따라 서민생활 지원, 지역개발, 투자유치 등을 위하여 지방세의 감면이 필요하다고 인정될 때는 조례를 제정하여 지방세를 감면할 수 있다. 과거에는 자치단체장이 감면조례를 제정하기 위해서는 행정안전부장관의 허가를 받아야 했으나(감면조례 허가제), 2011년부터 이 제도가 폐지되어 지방자치단체의 비과세·감면정책의 자율성이 확대될 것으로 보인다.
다만 「지방세특례제한법」은 감면조례에 의한 비과세·감면액이 세수의 일정비율을 초과하지 못하도록 하여(감면조례 총량제), 감면조례 허가제 폐지에 따른 지방자치단체의 무분별한 비과세·감면을 예방하고 있다.