(5) 출연연 선진화의 조속한 결론
민간의 전문성을 최대한 살린 국과위의 출범과 함께, 부처(지경부ㆍ교과부) 소속이던 출연연구기관들은 국과위로의 이관을 희망했다. 강압적이고 관료적인 연구관리에서 보다 창의적이고 자율성인 연구환경으로 변화시킬 것을 기대했기 때문이다.
그러나 관련부처는 출연연의 문제제기에 대안은 제시하지 않고 연구기관의 소유에만 집착(지경부ㆍ교과부의 출연연에 대한 국과위 이관 반대)하는 모습을 보여, 만약 출연연이 국과위로 이관하더라도 과연 국과위가 기존 관료적 체제를 답습하지 않을 수 있을지에 대하여 출연연 과학기술자들은 의문을 제기하고 있는 상황이다. 국과위가 변화된 모습으로 이들에게 신뢰를 보이지 못한다면, 과학기술계의 실망감은 적지 않을 것으로 예상된다.