2) 도축단계
소를 도축할 경우 도축업자는 먼저 귀표의 부착 여부와 개체식별확인증명서나 브루셀라병 검사증명서를 이용하거나, 또는 쇠고기이력추적시스템(www.mtrace.go.kr)을 통해 개체식별번호가 일치하는지 확인하여야 한다. 만일 귀표가 부착되어 있지 않은 소, 또는 귀표가 훼손되어 개체식별이 곤란하거나 소 개체식별대장에 등록되어 있지 않은 소는 즉시 도축장 검사관에게 신고하여야 한다.
소가 도축되면 도체의 갈비 내부 등에 해당 소의 개체식별번호가 표시된 라벨을 부착하고, 쇠고기이력추적시스템에 도축현황, 위생검사결과, 등급 등을 입력한다.
그리고 도체를 출고할 때 축산물공급명세서 등에 개체식별번호를 기재하여 교부한다.