우리나라가 체결한 FTA의 분쟁해결절차의 단계별 시기나 절차, 방식이 기본적인 틀은 비슷하지만 세부적인 내용에 있어서 적지 않은 차이점이 있었다. 예를 들어 패널설치의 시기에 대해 살펴보면 한-칠레, 한-싱가포르 FTA의 경우 분쟁의 협의요청 전달 후 45일 이내(부패성 사안인 경우 30일 이내)이지만, 한-EFTA FTA의 경우는 사안이 협의요청 접수일 후 60일 이내(긴급한 사안인 경우에는 30일 이내), 한-미 FTA의 경우는 공동위원회에 회부된다는 통보가 전달된 후 60일 이내(부패성 사안인 경우 30일 이내)이다.
따라서 앞으로 체결할 FTA에서는 분쟁해결제도에 있어 각 절차별 기한을 명확하게 설정해야 할 것이다. 또한 다른 FTA와 기한을 같게 설정하여 국가별로 분쟁해결절차를 이용할 때 걸리는 시간이 비슷하게 해야 하고, 기한이 달라서 발생할 수 있는 혼란을 줄여야 할 것이다. 통일된 절차의 마련은 이와 관련된 업무를 수행하는 관련 공무원의 업무적 번거로움을 해결하고 나아가 전문성을 향상시켜 분쟁해결능력을 발전시키는 방안이 될 것이다. 따라서 분쟁해결에 있어서 가장 모범이 되는 양식을 찾으려는 노력이 필요하다(유재은, 2008).