셋째, 감면제도 개편 정책을 실행할 경우에는 기존의 이해관계와 제도의 파급효과를 고려하여 단계적으로 추진할 필요가 있다. 특히 연간 통행료 할인금액의 절반 이상을 차지할 정도로 감면대상이 많은 경차 할인과 출퇴근 할인의 폐지는 혜택 축소에 따른 이용자들의 반발을 충분히 예상할 수 있다. 이를 감안하여 한국교통연구원도 충분한 유예기간을 거쳐 경차 할인은 2대 이상의 차량을 소유한 가구의 경차부터 단계적으로 개선하고, 출퇴근시간 할인은 혼잡시간 할인부터 우선 개선 후 비혼잡시간 할인을 단계적으로 개선하는 방안을 제안하였다. 따라서 기존 수혜대상들이 받을 수 있는 영향을 고려하여 충분한 유예기간과 단계적인 감면대상 축소를 통하여 사회적 수용성을 높일 수 있는 방안을 고민해야 할 것이다.