지역문화재단은 지방자치단체의 고유 사업을 수행할 뿐만 아니라 문화체육관광부의 지역 단위 사업도 수행하고 있다. 가령, 2019년 문화체육관광부는 문화다양성을 높이기 위해 ‘무지개다리 사업’을 한국문화예술위원회를 통해 민간경상보조 방식으로 진행하기로 하고 지역별 주관기관 공모를 실시했다. 지역문화재단과 유관 공공기관에 신청 자격이 부여됐고 대부분 지역문화재단이 선정됐다. 지역문화재단의 경우, 광역문화재단이 선정되기도 하고 기초지역문화재단이 선정되기도 했다.
지역문화재단과 유사한 역할을 하는 조직으로 지방문화원이 있다. 지방문화원은 ｢지방문화원진흥법｣에 따라 지방자치단체장의 인가를 받아 특별자치시ㆍ특별자치도ㆍ시ㆍ군ㆍ자치구별로 한 개씩 두는 법인이다. 일제 강점기 때부터 자생적으로 설립되기 시작한 지방문화원은 그 역할이 계속 변모해왔는데, ｢지방문화원진흥법｣은 지방문화원을 “지역문화의 진흥을 위한 지역문화사업을 수행하기 위하여” 설립된 법인으로 정의하고 있어 법률상의 정의만으로는 기초지역문화재단과 지방문화원의 역할 구분이 쉽지 않다.