지원방식은 다음과 같다.
① 일반담보대출
일반담보대출의 절차는 먼저 동 사업을 관리하는 정보통신연구진흥원이 주관하는 1차 심의(정책목적 부합성, 기술성, 사업성 등을 심의)를 통해 선정된 과제와 기업을 취급 금융기관들(주로 은행들)에 추천한다. 그 다음 은행들은 추천받은 기업들에 대한 담보설정 및 여신심사(2차 심의)를 거쳐 대출 여부 및 대출한도액을 최종 확정한다.
이 때 융자금리는 직전분기 재특금리의 -0. 75%(중소기업), 융자기간은 최대 5년(거치기간 최대 2년)이며, 지원범위는 소요자금의 최대 90%, 지원한도는 과제당 최대20억원, 업체당 50억원으로 과학기술진흥기금의 그것과 크게 차이나지 않는다.
② 기술담보대출
일반담보대출이 담보력이 취약한 기술혁신형 IT기업들의 접근을 막는다는 비판에 따라 2002년 9월부터 기술담보대출이 도입되었다. 그 절차는 기술보증기금의 기술평가센터에서 수행하는 1차 심의와 그리고 신용보증 제공여부 심사를 위한 정밀심의(2차 심의)를 거쳐 선정된 기업들에 대하여 기술보증기금이 기술평가보증(기술담보)을 제공하고, 은행들은 이 보증서를 담보로 융자를 제공하는 방식이다.
하지만 정보통신진흥기금 측은 과학기술진흥기금과는 달리 기술보증기금에 보험료 방식의 위험분담을 하지 않고 있으며, 그렇기 때문에 여전히 동 사업은 100% 기술담보대출 방식으로 전환되지 않고 일반담보대출 방식을 여전히 부분적으로 시행하고 있다.