다. 시설
결합전문기관은 결합, 가명처리, 반출심사 등을 위한 공간과 시설을 갖추고, 해당 공간과 시설에 대한 물리적 안전조치를 취해야 한다.
대표적으로 한 결합전문기관은 공간을 ① 가명정보 송수신 업무, 가명정보 기술 컨설팅 지원 업무를 수행하는 결합지원실, ② 가명정보 결합 처리 업무를 수행하는 결합실, ③ 결합 후 추가 가명처리를 진행하는 가명처리실, ④ 반출 요청에 따른 결합데이터를 검토하고 심사 업무를 수행하는 반출심사실로 구분하여 운영하고 있다. 가명정보를 송수신하는 업무와 결합처리 업무를 분리하여 데이터 송수신을 위한 인터넷 연결로부터 오는 침해를 차단하고, 모든 실을 출입통제구역으로 지정하여 24시간 CCTV를 운영하며 가명처리실과 반출심사실은 휴대전화와 이동저장매체 소지를 통제하는 등 보안을 강화하고 있다.
다른 결합전문기관 또한 결합신청자들이 출입하는 추가처리실에는 보안을 위하여 CCTV를 설치하고 출입관리대장을 작성하도록 하고 있다.