재정준칙 하나만으로는 효과적으로 재정건전화를 확립하기 어렵다. 이런 이유 때문에 Wyplosz(2013)도 재정제도에 대한 전반적 개선을 함께 진행해야지만 재정준칙이 재정건전화에 기여할 가능성이 커진다고 강조한 바 있다. 유럽위원회는 일찍이 재정건전화를 위한 재정시스템 개혁의 3대 축으로 (ⅰ) 재정준칙의 강화, (ⅱ) 독립적 재정기구의 설립, (ⅲ) 중기예산계획의 수립을 정한 바 있다. 그렇다면 우리나라에서도 재정준칙의 효율적 운용을 위한 수단으로서의 독립적 재정기구 설립과 재정준칙과 연계된 중기예산계획의 수립이 필요하지 않을까?
재정준칙의 효율적 운용을 위해서 과연 독립적 재정기구 설립이 필요한지에 관해서는 관점에 따라 의견이 달라질 수 있다. 국가적으로는 국회예산정책처가 독립적 재정기구라고 할 수 있지만, 논의를 예산안을 수립하는 행정부 내의 기구로 한정한다면 독립적 재정기구는 없는 셈이다. 여러 선진국들은 재정건전성이 크게 훼손되었기 때문에 재정준칙을 도입하였고, 이를 효율적으로 운용하기 위해서 독립적 재정기구를 설립했지만, 우리나라에서는 아직 그런 목적의 재정기구는 존재하지 않는다.