이러한 상태가 지속되자 전국의 지방의회와 그 협의체에서 개선요구가 빗발치자 2006년 4월 28일의 개정 시에는 기존 조항(제83조제2항)에 단서를 신설하여 "지방자치단체의 장은 사무직원 중 기능직 등에 대한 임용권을 지방의회 사무처장 등에게 위임하여야 한다."고 규정함으로써 일반직을 제외한 하위직 직원에 대한 부분적인 변경조치를 취한 바 있다. 그 후 2007년 5월 11일에 「지방자치법」이 재차 전부 개정되었으나, 이 조항과 관련해서는 내용상 변화가 없는 채 조항 번호만 제83조에서 제91조로 옮겨져 오늘에 이르고 있다.
「지방자치법」 제91조의 위헌성 검토에 있어 제일 먼저 고려되어야 할 점은 권력분립의 원칙이다. 앞에서 검토한 바와 같이 우리 헌법은 권력분립의 원칙을 특정조항에서 명시하고 있지는 않지만, 헌법기관 간에 국가권력을 분할하고 있으며, 상호간에 견제와 균형을 도모하도록 규정하고 있다. 그래서 각각 별도의 장(章)에서 각 기관의 권력내용 및 관계를 규정하고 있으며, 이 같은 중앙정부 간의 권력관계는 지방정부 내에서도 그대로 적용된다는 것이 학계의 정설이다.
다시 말해, 지방정부인 지방자치단체장과 지방의회 간에는 헌법과 법률이 허용하는 범위 내에서 상호간에 수평적 권력분할과 권력분립의 관계가 당연히 성립된다고 보아야 한다는 것이다. 아울러 이와 같은 관계는 지방의회의 일부를 구성하며, 그 보조기관인 의회사무기구에도 적용되어야 마땅하다고 본다.