(2) 행정중심복합도시와 혁신도시 건설을 통한 국토의 수평적 공간구조 형성 
신행정수도 후속대책은 12부 4처 2청을 수용하는 행정중심복합도시로 이전하기로 결정하였으며, 현재 예정지역과 주변지역에 대한 토지보상 등의 절차가 진행 중에 있다. 행정중심복합도시 건설과 아울러 국가 공공기관을 전략적으로 배치하여 권역별 특성화에 기여할 수 있도록 추진 중이며, 지방의 성장잠재력을 강화하기 위해 수도권과 대전·충남을 제외한 광역시도에 176개의 공공기관을 이전하여 혁신도시를 건설하기 위한 원칙적인 합의를 본 상태이며, 현재 시도별 이전기관이 확정되었으며, 해당 시도별 집단이전을 원칙으로 한 혁신도시 입지 후보지역 선정작업(전북 완주로 확정, 경남은 준혁신도시 선정 관련 도와 균형발전위원회간의 입장차로 혼선)이 진행 중에 있다. 정부의 당초발표는 2005년 9월말 혁신도시 후보지를 발표하고 금년 하반기부터 부지조사, 설계 등 준비 작업에 착수하고, 2007년경 부지공사를 본격화하고, 신행정수도 입주시기인 2012년까지는 이전을 완료한다는 계획이다. 여기서 혁신도시는 이들 공공기관 이전을 촉매로 지역대학, 산업단지, 기존도시 등과 연계하여 혁신환경을 조성하여 새로운 거점을 형성하는 것이다.
이 밖에 기업의 투자의욕 고취와 일자리 창출을 위하여 민간기업 주도로 개발되는 기업도시 건설을 계획하고 있다. 지난해 12월 ‘기업도시개발특별법’을 제정한데 이어, 6개의 기업도시가 기업과 지자체간의 협약체결에 의해 기 지정되어 조성절차를 추진하고 있다. 기업도시란 산업시설은 물론 종사원의 정주에 필요한 주택, 의료, 문화 등 자족적 기능을 가진 도시로서 민간기업의 국내투자 촉진과 국가경쟁력 강화라는 차원에서, 그리고 지역혁신역량 강화와 지역발전을 통한 국가균형발전의 견인차로 활용한다는 차원에서 추진하고 있는 것이다.