[표]에서 보는 바와 같이 2006년 이후 일본의 독자적 대북제재가 UN 안보리의 대북제재에 비해 선제적이고, 강력한 형태로 이루어지고 있다. 다만, 주목할 점은 북한의 대북제재의 정책목표가 납치피해자문제 해결이라는 국내적 현안을 포함하고 있기 때문에 핵·미사일 문제에 대한 제재와는 별개로 납치피해자 문제의 진전에 따라 독자적 대북제재가 탄력적으로 이루어지고 있는 점이다. 실제로 2014년 5월 스톡홀름에서 개최된 북일 국장급 회의의 합의는 북한의 일본인 납치피해자에 대한 전면 재조사 및 일본에 결과 통보, 생존자귀국 및 유골처리 조치, 일본의 독자적 대북제재인 송금제한 및 인도적 목적의 북한 입항금지 해제 등의 내용을 담고 있다. 또한, 적절한 시기에 북한에 대한 인도적 지원제공을 검토한다는 내용을 포함하고 있다. 하지만, 북한의 조사보고서 제출 연기, 2016년 1월 북한의 제4차 핵실험 및 미사일발사에 따라 일본의 독자적 제재는 재개되었다.