가. 인프라 비용
철도부문의 인프라 비용은 크게 자본비용과 관리비용으로 구분되며, 자본비용은 도로부문과 마찬가지로 김명수(2011)의 연구결과 중 마지막 추정연도인 2007년의 순자산스톡 자료를 기준연도 순자산스톡 자료로 설정하고, 여기에 기준연도 접속법을 적용하여 도로 인프라시설의 순자산스톡의 화폐가치를 추정하고, 여기에 공공기관사업 예비타당성조사 세부 시행계획(기획재정부)에서 현재 적용하고 있는 재무적 할인율(실질 사회적 할인율) 5.5%를 적용하여 자본비용을 추정하였다.
그리고 철도부문의 관리비용은 중앙정부가 기간망 철도와 도시철도 운영을 위해 지출한 비용을 이용하여 산정하였다. 단, 2005년 자료는 기획재정부에서 제공하지 않아 국토교통부 자료를 활용하여 추정하였다.