주민투표 사유를 보면, 시･군 통합이나 행정체제 개편 관련 사항이 많았다. 2005년 제주도의 시･군을 폐지한 행정구조개편, 2005년과 2012년의 청주･청원통합, 2013년 전주･완주 통합 관련 등 4건이다. 그리고 중앙정부의 시설 유치에 관련 사항이 3건이다. 2005년 군산, 포항, 영덕, 경주에서 실시된 방사성폐기물처리시설 유치와 2012년 남해화력발전소 유치, 2019년 거창군구치소 위치 선정이다. 그동안 사례를 보면 ｢주민투표법｣제8조에 의해 실시되는 사안이 많은 반면, 동 법 제7조에 의해 실시되는 지자체 자치사무 관련 사안은 적었다.
그동안 제도의 활용 실적이 적은 이유로는 국가사무나 국가위임사무에 대한 투표제한과 투표 금지 대상이 많다는 점과 더불어 주민투표 청구요건과 결과의 개표요건이 너무 엄격히 규정되어 있다는 점 등이다.