국방부는 재무부, 민간 전문가, DERA 경영진 등으로 구성된 '각료운영단(ministerial steering group)'을 신설하여 관련 비판을 검토하고 정책방향의 적절성을 검토했다. 또한, 구조개혁의 직접적 대상인 DERA 직원들로 '민관 파트너십팀(DERA Partnering Team, 이하 DPT)'을 구성하여 각종 문제점에 대한 대응책을 마련하는데 주력하였다(John, 2007: 13; UK parliament, 1999).
국방부는 전문 컨설턴트 기관을 활용하여 PPP 모델을 구체화하였다. 국방부와 DERA 경영진은 정부연구소를 민영화하는 모델을 선호하였으나, DERA 직원, 방산업체와 학계의 조언에 따라 주요 분야는 공공에 남기고 나머지를 민영화하는 '핵심역량(Core Competence)' 모델이 선택되었다(James, 2005: 158). 해외 연구소와의 협업과 책임성 확보, 국가적 민감 분야의 연구개발 지속성 등이 고려되었다. DPT는 인사, 법, 재무 측면의 실제 위험요소를 분석하였으며, 국방부는 2001년 4월부터 3개월간 '핵심역량' 모델에 대한 시뮬레이션(Shadow operation)을 실시하였다.