제4차 계획은 국민의 신뢰에 기반한 지속가능한 친환경식품산업 육성을 위해 △인증제도 개선, △유통체계 확충 및 소비 확대, △생산기반 확충, △유기농업자재의 안정적 공급, △농업환경 보전 강화 등 5대 분야 21개 과제로 구성되어 있다. 주요내용을 요약하면 다음과 같다.
첫째, 인증제도 개선을 위한 사업으로 친환경 인증 및 관리기관을 2017년부터 민간기관으로 일원화하고 인증기관등급제를 실시한다. 또한 국립농산물품질관리원(이하 농관원)과 농촌진흥청으로 이원화되어 있던 유기농업자재 관리체계도 통합하며, 가축용 사료에 한정된 비식용유기가공품 인증 제도를 확대하여 반려동물 사료 인증제를 도입하고, 세제·섬유 등 비식용유기가공품인증제를 마련한다.
둘째, 유통체계 확충 및 소비 확대를 위한 사업으로 생산자단체 중심의 ‘광역 친환경농산물 전문 유통조직’을 설립하여 소규모로 분산 유통되고 있는 문제점을 개선한다. 또한, 생협 및 전문유통업체 등 기존 소비지 유통체계와 온라인(홈쇼핑)·직거래·로컬푸드 등 친환경농산물의 신규시장을 확대한다.
셋째, 친환경가공식품의 산업기반 확충과 외식·수출 등 국내외 소비시장을 확대하기 위한 사업으로 가공-외식-수출-관광 등 전방산업과의 연계를 확대하며, 기존 친환경 생산단지(48개소)·지구(1,159개소)에 가공·판매·체험 등을 연계한 6차 산업화를 추진한다. 재원 마련을 위해 친환경 농산물 의무자조금제도를 도입하고, 기술 확보를 위해 ‘친환경농업 실용화 연구단(가칭)’을 구성, 2018년까지 한국형 친환경 생산모델(벼, 사과, 배, 고추 등 10개 품목) 및 표준 재배기술 메뉴얼, 토양관리모델 등을 개발한다. 친환경농산물 중 무농약농산물을 사용한 가공식품의 인증·표시기준을 마련하고, 친환경농산물 재배에 사용되는 허용물질(90종)에 대한 안전성을 재검증한다.
넷째, 농업 환경 보존 강화를 위한 사업으로 농업 환경보존을 위한 직불금(친환경, 경관, 조건불리, 쌀변동) 차등화 지원, 자재 지원, 분뇨자원화, 수질 개선사업을 시행한다. 직불금 지원제도는 논, 밭농사 외 과수농업을 추가하여 운영하고, 한국형 농업환경보전 프로그램 모델을 개발하여 농업환경 보전사항을 구체화하고, 중장기적으로 친환경농업단지·지구의 프로그램으로 유도한다. 또한 여러 기관에서 분산 추진 중에 있는 농업환경조사 통합 관리 체계를 구축하고, 정책효과와 연계시킬 수 있도록 농업환경 조사시스템을 개선·보완한다.