아울러 현재 도입되어 있는 지정자문인제도의 보다 내실 있는 운영이 필요하다. 이를 위해 비상장기업 투자에 보다 익숙한 창업투자회사도 지정자문인이 될 수 있도록 허용하는 한편, 지정자문인이 신규 상장기업 발굴에 적극 참여할 수 있도록 충분한 인센티브를 부여해야 한다.
지정자문인들의 정보생산기능 강화와 더불어, 정보공개에 적극적인 기업에 대한 세제지원 확대 등을 통해 코넥스시장 내 정보 비대칭성의 문제를 완화해 나가는 것 역시 중요하다.
중장기적으로는 코넥스시장에서 코스닥시장으로의 성공적인 상장사례를 누적시켜 나감으로써 우량기업들이 자발적으로 코넥스시장에 진입할 유인구조를 형성할 필요가 있다.
개장 초기에 거래가 뜸한 것은 어쩌면 당연한 것일 수도 있다. 시장의 수익성과 신뢰성에 대한 평판이 형성되면 기업과 투자자들은 자연히 시장에 뛰어들기 마련이다. 따라서 지금은 단기적으로 거래 규모를 늘리는데 치중하기 보다는, 프리보드시장 등 과거 제3시장의 실패원인이 무엇이었는지에 대해 깊은 재성찰이 필요한 시점이다.