셋째, 매몰된 가축이 미생물 등에 의하여 분해되기 어려운 구조로 되어 있어 이의 개선이 요구된다. 가스분출이 어렵도록 가스배관의 위치가 설계되어 있고, 3년 이내 개봉이 허용되지 않아 3년 동안은 내부상황을 파악할 수 없다.
넷째, 매몰지 조성시 생석회를 넣으면 발열반응이 일어나 병원균을 사멸시킬 수 있으나, 한편으로는 부패가 지연되는 부작용이 발생한다. 이와 같은 점을 고려하여 보면 현행 매몰지침은 전염병 확산예방에는 비교적 적합하지만, 환경보전을 위해서는 적합하지 않은 것으로 보인다.