한편 2013년 EDCF결산 심사에서는 기금 재원의 안정성을 확보할 필요가 있다는 의견이 가장 중요하게 제기되었다. 2007년 이후 승인액은 급속도로 늘어난 반면 집행액은 상대적으로 서서히 증가하였기 때문에 향후 기금의 재원부족 상태가 지속될 가능성이 있다는 것이다. 대안으로는 민간자본 활용 등 정부출연금 외에 다양한 재원조달 방안 마련과 공공자금관리기금에서 예수를 가급적 줄일 필요가 있다는 의견을 제시했다. 또한 2012년에 이어 2013년에도 대개도국 차관사업의 집행계획이 철저하게 이루어질 것을 촉구했다. 2012년에 비해 불용액이 44.2%나 증가했기 때문이다. 특히 2013년에 집행 예정된 98개 차관사업 중 계획 대비 집행실적이 부진한 사업이 48개로 전체 사업의 49.0%를 차지하며, 집행 실적이 미비한 원인으로는 수원국의 행정처리 지연이 꼽히고 있다. 그러나 보다 본질적으로는 수원국과의 긴밀한 협력체계 구축이 미비한 점이 원인이라고 할 수 있다.