둘째, 농장집단화에 따른 생산성 저하 문제가 있다. 농지의 개인 소유를 금지한 농장집단화는 농작물 생산 저하로 연결되었으며, 이러한 문제를 타개하기 위해 북한은 “포전(圃田)담당제”와 “6개월 농사제”를 실험적으로 도입하기도 했다. 그러나 2006년 이후 이를 폐지하였고, 식량증산의 돌파구를 찾지 못한 상태이다.
셋째, 원자재와 에너지 부족에 따른 농업지원 체제의 붕괴이다. 북한의 원자재와 에너지난이 장기화됨에 따라 농업 및 농업관련 산업에 사용되는 자원과 전력 공급이 원활하지 못하였을 것으로 추론 볼 수 있는데, 이러한 점도 북한의 농업생산에 악영향을 주었을 것이다.
예컨대, 비료 공장에 원료와 전원공급이 안정적으로 이루어지지 못함으로써 필요한 시기에 비료를 공급하기 곤란하고, 그것은 바로 생산에 영향을 주고 있다. 이러한 상황이 반복되자 북한은 남한에 비료지원을 요청하기도 했으며, 남한의 대규모 비료지원이 있었던 시기에는 어느 정도 상황이 완화되기도 하였다.
그러나 2008년 이후 비료지원이 중단되었고, 북한의 비료 공급은 큰 타격을 받게 되었다. 언론보도에 따르면 현재 북한의 연간 비료생산 능력은 필요량(58만 톤)의 10~20% 수준에 머물고 있다.
원자재와 에너지의 원활하지 못한 공급은 비료뿐만 아니라 각종 농기계, 농약 등을 생산하는 공장들에 대해서도 나타났으며, 원자재와 에너지 공급이 제대로 이루어지지 못한 결과 농업생산이 큰 피해를 입고 있다.