방통위의 문제를 해결하기 위한 대안으로 제기되는 공영방송위원회(공방위) 설립 안은 이 점에서 한계를 지닌다고 할 것이다. 이 안의 요지인즉, 공영방송 거버넌스가 행정부(방통위)의 직접적인 통제권 하에 놓여 있는 문제해결 차원에서 방송통신위원회와 별도로 행정부로부터 독립적인 공영방송 지배구조를 설치하자는 것이다. 이 경우 공영방송위원회와 방송통신위원회와의 관계가 애매해지는 문제가 있다. 공영방송위에 주요 방송관련 정책 권한을 이양할 경우, 방통위는 방송에 대한 정책 권한을 잃게 되면서 종래 정통부에 진배없는 기구로 위상과 역할이 축소된다. 방통위가 독임제 정부부처로 전환할 경우 방통위-공방위 체제는 종래 방송위-정통부 시스템으로 회귀하는 꼴이 된다. 이러한 맥락에서 조직 형태상 독임제 정부부처와 완전히 분리된 독립적인 합의제 기구의 설립은 바람직하지 않다고 할 것이다.