두 번째 저원가 전략의 실행 방안으로 공정자동화에 대한 개발이 필요하다. 일본의 경우 부족한 인력에 대한 보완책으로 높은 자동화율을 보유하고 있다. 한국 역시 대형 조선소들의 경우 용접자동화를 비롯한 공정자동화에 개발투자를 하고 있다. 한국과 일본의 개별 조선소의 자동화율은 기업마다 상황이 다르고 자동화율 자체가 기업의 기밀이어서 이를 비교하기 위한 데이터 확보는 어려우나 분명한 것은 조선소들이 industry 4.0의 흐름 속에서 공정자동화를 위해 경쟁적인 노력을 기울이고 있다는 점이다. 
그런데 한국 중형조선소의 경우는 문제가 심각하다. R&D 조직도 갖추지 못하고 있어 개별 조선소별 공정자동화를 연구한다는 것은 현실적으로 불가능하다. 이러한 현실은 업계 공동으로 대응하고 있는 일본의 사례와 비교해보면 미래의 전망이 어둡기까지 하다. 현재 중형 탱커시장을 일본에 잠식당하며 타격을 받은 한국 중형조선산업은 엔화가치 상승에 따라 단기적으로 시장을 회복할 가능성이 높지만, 이러한 경쟁에서 뒤처지게 되면 다시 시장을 잠식당할 우려가 높다. 자동화에 의한 저원가 전략을 일본 조선소들이 더욱 강하게 추진할 것으로 예상되기 때문이다. 
결과적으로 조선업의 공정자동화 개발은 정부가 개발을 지원할 필요가 있을 것이다. 현재 대형조선소가 가진 기술을 중형 조선소들을 위해 파급하거나 활용하는 것은 쉽지 않을 것으로 보인다. 대형조선소들의 협조를 기대할 수 없기 때문이다. 그러므로 이 문제는 국내 공정자동화 기술을 가진 기관과 조선소들이 협력을 통하여 개발할 수밖에 없을 것이다. 그리고 이러한 개발은 재무적 여력이 부족한 중형 조선소들의 상황을 고려하여 정부의 개발비 지원이 불가피할 것으로 보인다.