그러나 현행 체계는 몇 가지 문제점과 한계를 가지고 있다. 우선 지능정보사회에서 나타나는 다양한 형태의 정보화기술 활용에 따른 청소년들의 발생 가능한 위협을 체계적으로 관리해 줄 수 있는 법과 제도가 부족한 것이 현실이다. 해외 사례에서 보는 바와 같이 청소년들의 디지털 위협을 예방해 줄 수 있는 종합적인 제도를 체계 적으로 운영하게 해줄 수 있는 기본법이 부재하여 정책사업의 중복과 이에 따른 학교 현장의 혼선이 나타나고 있는 것이 현실이다. 또한 앞선 개념논의에서 본 청소년 사이버폭력의 개념에 최근 문제시 되고 이는 사이버 불링의 개념이 빠지는 등의 문제점이 나타나고 있다.
따라서 청소년 사이버 폭력의 발생구조와 진행과정에 대한 연구를 통해 각 구조 요소별 요인들을 억제 또는 강화 시킬 수 있는 종합 적인 위협관리 방안 도출이 제시 운영되어야 할 것이다.