이 법률에 근거하여 지원을 희망하는 의료기관 또는 서비스 제공 업체는 매년 9월부터 10월말까지 ‘새로운 검사 및 치료 방법(NUB)’의 평가를 요청하는 신청서를 병원보상체계연구소(InEK, Institut für das Entgeltsystem im Krankenhaus)에 제출해야 한다. 병원보상체계연구소(InEK)에 제출된 신청서에는 신의료기술의 특징과 해당 의료기술을 제공받는 환자 그리고 해당 의료기술을 활용하기 위한 추가 인력과 비용 및 기존 의료기술에 소요되는 비용과 비교한 신의료기술의 비용 차이를 설명할 수 있는 내용이 포함되어야 한다. 병원보상체계연구소(InEK)는 제출된 신청서의 내용을 토대로 해당 의료기술의 혁신성, 기존기술과 비교한 비용의 차이, 비용의 타당성을 기준으로 비용지원 적정성을 평가하고 그 결과를 매년 1월 31일에 발표한다. 발표결과 비용지원의 필요성이 인정된 신의료기술은 4~6월에 시행되는 건강보험조합과 진료비 협상 기회를 갖고 계약을 통해 비용을 확정하게 된다. 다만, 계약을 통해 보상을 받을 수 있는 의료기관은 해당 신의료기술에 대한 ‘새로운 검사 및 치료 방법(NUB)’ 지원을 신청한 의료기관으로 제한된다. 따라서 해당 의료기술이 협상대상으로 선정되고 건강보험조합과 비용계약이 체결되었다고 하더라도 모든 의료기관에 적용되는 것은 아니다. 또한 계약이 체결된 의료기술을 활용하는 의료기관은 해당 의료기술의 사용량과 비용 등을 모니터링 할 수 있도록 관련 자료를 병원보상체계연구소(InEK)로 제출하고 제출된 자료는 향후 비용 산정의 기초자료로 활용된다(정설희 외, 2020: 171).