초등 통합교육 실제에서는 특수 학급교사가 개별 학생의 담임교사와 1:1 협의를 하면 되지만, 중학교 특수교육 대상 학생 통합교육을 위해서는 담임교사 1인 외에 다수 교과교사와의 협의가 요구된다. 또 교과별 통합수업에 특수교육 대상 학생의 의미 있는 참여를 위해 특수 학급교사와 교과교사 사이의 협력적 자문이 필요한데, 실제로 중등 교사들은 가중된 업무로 인해 협의할 시간조차 내기가 쉽지 않은 것으로 나타났다. 구체적인 협력적 방법으로는 협력교수, 협동학습, 페어활동, 또래교수 등이 여러 가지 제한적 상황에도 불구하고 실행한 경우에는 효과적인 것으로 나타났다.