(3) 국회와의 관계
국회소속이라 하더라도 감사원은 독립적으로 직무를 수행할 수 있어야 하므로, 예산과 인사에 대해서 일반적인 국회 행정조직과 별도로 취급되어야 한다. 감사원규칙은 국회규칙과 별도의 범주에서 자체적으로 제정되어야 할 것이다.
감사원의 결산검사 보고 이외에 국회에 개별사안마다 보고할 업무는 국회본회의나 위원회 의결로 위임하거나 요청한 임무에 국한하여야 할 것이다.
국정조사나 국정감사와의 관계에서 중복되는 기능에 대해서는 체계적으로 정리하는 것을 검토할 수 있다.