둘째, 지역가입자 중 연소득 500만원 이하 세대의 경우 ‘재산’과 ‘자동차’에 대해 중복 부과되고 있다. 이들의 경우, 공적 소득 자료가 없는 세대로 보고 소득추정을 위해 가구원의 성 및 연령·재산·자동차 점수를 합산하여 ‘생활수준 및 경제활동참가율 등급’을 매기고, 여기에 재산등급과 자동차등급별 점수를 부과하기 때문이다.
셋째, 자동차도 재산과 마찬가지로 소득대리지표로 지역 건강보험료 산정에 고려되고 있는 바, 자동차 소유 가입자에게 자동차 배기량 기준으로 부과하는 현행 방식이 불합리하다는 지적이 있다. 같은 배기량 내에서도 차량 가격의 차가 크기 때문에 동일한 보험료를 부과하는 것은 형평에 맞지 않기 때문이다.
이에 국민권익위원회는 보험개발원이 제공하는 ‘차량기준가액’이나 지방자치단체에서 공시하는 ‘차량시가표준액’ 등을 기준으로 보험료를 부과할 것을 제안한 바 있다.