행정법 분야에도 전자화문서 규정이 도입되어 있다. 2010년 「전자정부법」 전면개정을 통하여 전자화문서의 정의, 전자적 민원처리 신청, 전자화문서의 성립 및 효력 등을 새로이 규정하였다. 「전자정부법」은 종이문서와 그 밖에 전자적 형태로 작성되지 아니한 문서를 정보시스템이 처리할 수 있는 형태로 변환한 문서를 전자화문서로 정의한다(제2조 제8호). 행정기관등의 장이 해당 기관에서 처리할 민원사항 등에 대하여 관계 법령에서 문서·서면·서류 등의 종이문서로 신청, 신고 또는 제출 등을 하도록 규정하고 있는 경우 또는 행정기관등의 장이 민원사항 등을 처리할 때 그 처리결과를 관계 법령에서 문서·서면·서류 등의 종이문서로 통지, 통보 또는 고지 등을 하도록 규정하고 있는 경우 전자문서로 할 수 있고, 전자문서에 첨부되는 서류는 전자화문서로도 할 수 있다(제7조 제3항). 특히 「전자정부법」에 따른 전자화문서는 다른 법률에 특별한 규정이 있는 경우를 제외하고는 종이문서와 동일한 효력을 갖는다고 명시하고 있다(제26조 제3항). 이 규정으로 전자화문서로 행정기관등의 장에게 신청, 신고 또는 제출 등을 하게 하거나 행정기관등의 장이 통지, 통보 또는 고지 등을 하는 경우 전자화문서와 원본 종이문서의 동일성 문제를 입법적으로 해결하고 있다. 실제 동일한지 여부와 관계없이 「전자정부법」에 따라 처리한 전자화문서는 원본 종이문서와 동일한 것으로 간주하고 있다. 전자문서법과 달리 전자화문서와 원본 종이문서가 동일한 효력을 갖는다고 보아 행정기관등의 장이 처리한 것 자체를 신뢰하고 증거능력을 부여한 것이다. 그리고 전자화문서의 활용 및 진본성 확인 등을 위하여 필요한 사항은 국회규칙, 대법원규칙, 헌법재판소규칙, 중앙선거관리위원회규칙 및 대통령령으로 정하도록 하고 있다(제7조 제6항). 「전자정부법」은 진본성의 의미에 대하여 구체적으로 기술하지 않고 있다. 단지 「전자정부법 시행령」의 ‘전자화문서의 진본성 확인’ 조항에서 “첨부되는 전자화문서가 중앙행정기관등이 보관하고 있는 전자화문서와 일치하는지에 대하여 확인을 요청한 경우에는 그 진본성을 확인하여 주어야 한다”고 규정한다(제6조). 그리고 ‘전자문서 진본확인 서비스 연계 기술 규격(행정안전부 고시 제2017-1호)’은 행정기관에서 전자문서 위·변조 여부 등 진본성 검증 서비스를 제공하기 위하여 정부 전자문서진본확인센터(GTSA, Government Time Stamp Authority)를 두도록 하고 있다. 특정 시점에 해당 데이터가 존재하였음을 제3의 신뢰기관(TTP, Trusted Third Party)이 제공해주는 시점확인 서비스(Time-Stamp Service)를 전자문서(PDF)에 적용하는 것을 주된 내용으로 한다. 이러한 진본성 규정은 원본 종이문서와 일치 여부 또는 위·변조 여부를 ‘진본성’을 확인하는 방법으로 보고 있다.