근본적으로 성실수행이 인정된다고 해도 무기체계 전력화를 통한 군 전력증강이라는 1차적인 목표를 달성하는데 심각한 차질이 발생되고 수출을 통한 국가경제적 성과를 창출한다는 추가적인 목표 달성도 불가능하게 되는 등 당초 사업추진 목적을 충족시키지 못하게 되는 문제점은 해소되지 않는다.
결국 무기체계 연구개발사업에 대해 성실수행인정 제도를 적용하는 것은 좋은 의도와 달리 많은 부작용과 논란이 발생될 수 있기 때문에 본 제도의 취지를 살리되 앞서 제시한 쟁점사항이 해소될 수 있는 다른 대안을 강구하는 것이 합리적이다.