셋째, 독일과 유사하게 사이버안보를 전담하는 별도의 대응 기구를 설치하는 안으로, 현재 정치권에서 제기되는 ‘사이버안전청’의 설립 문제가 이러한 제도개선안의 범주에 포함된다. 사이버안전의 위기는 침해범위가 광범위하다는 점에서 분산관리체계보다는 통합관리체계가 효율적이며, 이에 따라 독립적 위상을 갖는 별도의 조직인 ‘사이버안전청’의 설립이 필요하다는 주장이 제기되어왔다. 다만, 독립적 기관에 사이버보안 기능을 통합시킬 경우 타 부처의 반발을 초래하여 긴밀한 협조를 얻기 어렵고, 각 부처가 고유의 기능을 갖고 정보보안 업무를 수행하고 있는 현실에서 통합이 불가능한 업무도 존재한다는 비판도 있다.