일본회의는 과거 일본이 수행했던 전쟁을 침략전쟁이 아니라 아시아 국가들의 해방을 위한 정의로운 전쟁이었다고 정당화하고, 전전의 국가체제나 대외전쟁을 비판 적으로 보는 역사인식을 도쿄재판사관 혹은 자학사관이라고 비판한다. 일본회의는 도쿄재판은 승자에 의한 일방적인 단죄이며, 일본 국내법에 의해 단죄된 것이 아닌 A급 전범을 다른 전몰자처럼 ‘쇼와준난샤(昭和殉難者)’로 간주해 야스쿠니신사에 합사하고 애도의 뜻을 표해야 한다고 주장한다. 야스쿠니신사가 단순히 지난 전쟁에서 죽은 군인이나 군속들을 위령하는 신사가 아님에도 일본회의는 총리가 야스쿠니신사를 공식 참배하여 영령들에게 감사의 뜻을 표명할 것을 요구하고 있다.
일본회의에 관해서는 일본에서도 최근에 와서야 사회적 관심을 받고 관련 연구가 나오기 시작했을 뿐이라 국내에는 관련 연구가 거의 없다. 한국에서는 한일 간의 역사 갈등의 측면 혹은 일본 사회의 우경화과 아베 총리의 수정주의적 역사인식과 관련한 문맥 속에서 부분적으로 일본회의에 대해 주의를 환기시키고 있을 뿐이다(이면우, 2016 ; 이지원, 2015).