둘째, 기존 직불제에 일대 변화를 가져오는 등 파급력이 매우 큰 정책이기에, 정부와 농업계가 제도에 대한 이해와 목표를 공유하는 가운데 세부적인 시행방안을 마련해가야 할 것이다. 법률명에서도 드러나듯 정부가 향후 공익기능의 증진에 초점을 맞추고 있다면, 농업계는 이 법을 통해 농업·농촌의 공익기능을 인정받았다는 측면에 좀 더 주목하는 차이가 있어 보인다. 또한 정부가 주로 '특정 품목', 즉 쌀의 생산을 유도하지 않는 것에 강조점을 두는 반면, 농민단체는 ‘허용보조’가 갖는 ‘예산 증액’ 가능성에 대한 기대가 상대적으로 더 큰 데서도 인식차가 느껴진다. ‘공익직불제에 관한 기본계획’(법 제4조)이나 세부시행방안의 수립에 앞서, 혹은 이를 수립하는 과정에서 정부와 농업계 상호간 공통된 인식을 정리하여야 향후 혼선이 없을 것이다.