2015년 5월 18일 충남도지사, 당진시장, 아산시장은 행정자치부 장관을 피고로 ‘평택당진항매립지일부구간귀속지방자치단체결정취소’ 소를 대법원에 제기하였다. 또한 2015년 6월 30일에는 헌법재판소에 충남도지사, 당진시장, 아산시장이 행정 자치부장관, 평택시, 교통부장관을 대상으로 ‘충청남도 등과 행정자치부 장관 등 간의 권한쟁의 심판’을 청구하였다. 대법원과 헌재를 통한 소송은 2018년 10월 31일 현재까지 진행 중에 있다.