이처럼 농업환경자원은 지속가능한 농업과 환경보전을 위해 매우 중요한 공공재로서 국가 관리의 필요성이 날로 높아지고 있다. 전통적으로 농업환경자원은 대기, 강우, 토양과 같이 시장에서 구매할 수 없는 비시장산출물로 인식되어 과거에는 농업생산에 투입되는 자연자원이나 비료, 농약 등 투입재의 과잉 사용으로 인한 직접적인 환경오염 관리에 관한 논의가 주를 이루었다. 그러나 최근에는 유럽연합을 비롯한 농업 선진국들이 농업환경자원을 농업 생산활동과 직접적으로 관련된 자원뿐만 아니라 농촌지역의 다양한 사회적, 문화적, 역사적, 환경적 자원을 포괄하는 개념으로 확장하고 있는 추세를 보이고 있다. 국제적으로 농업환경자원의 범위가 농업생산에 투입되는 요소뿐 아니라 농업 생산활동으로 유발되는 긍정적·부정적 환경자원까지 확대되면서 관리정보의 범위도 확대되고 있는 것이다.
이러한 추세 속에서 농림축산식품부는 농업환경자원을 농업생산에 활용되는 환경요소와 농업생산에 따라 인공적으로 조성되는 유무형의 요소를 모두 포괄하는 개념으로 확대하고자 2019년부터 2021년 현재까지 25개 지역에서 농업환경보전프로그램사업을 시행하고 있다. 이 프로그램은 농업환경자원인 토양, 물, 공기, 생태계를 이용하여 농업 생산활동을 증대하는 과정에서 환경오염을 최소화하고, 결과적으로 긍정적인 비시장 산출물인 생물다양성 유지, 농촌 경관 개선, 농업유산 및 문화유산보전 등의 공익적 기능을 확대하는 것을 목표로 하고 있으나, 동 프로그램은 농업환경자원 정보의 관리범위에 대한 목표가 확대되는 긍정적인 결과를 얻은 반면, 현실적으로는 여전히 국가 전반의 농업환경자원 정보 관리체계를 갖추지 못하고 있다는 지적을 받고 있다.