한편, 조세특례제한법 제97조의3(장기일반임대주택등에 대한 양도소득세 과세특례; 장기보유특별공제율)이 등록된 임대사업자에 대한 혜택으로 본 제도와 유사하다. 그런데 양도소득세 과세특례 역시 본 제도와 동일한 시점에서 시행되었기 때문에 이를 통제할 필요성이 있다. 양도소득세 과세특례는 임대주택 중 장기 임대에 해당되기 때문에 임대주택을 장기와 단기로 구분하여, 단기 임대주택 역시 본 제도의 영향이 있는 것으로 나타난다면 본 제도의 도입 효과를 명확하게 분석한 것이라 할 수 있다. 이에 단기 건설임대주택과 단기 매입임대주택에 대해 (수식 3)를 추정한다.
단기 건설임대주택과 단기 매임임대주택의 등록 건수를 추정한 결과, r의 부호가 0보다 큰 것으로 나타났고 이는 본 제도가 등록 건수를 증가시켰다는 것을 의미한다. 특히, 추정치의 크기를 살펴보면 2015년 이후 더미보다는 2016년 이후 더미가, 2016년 이후 더미보다는 2017년 이후 더미가 더 큰 것으로 나타났다. 이는 2016년부터 감면율을 최대 75%로 인상한 효과로 판단된다.
추정 결과를 살펴보면, 감면 시행 후 더미(D₂)에 대한 추정치(v)의 부호가 0보다 작은 것으로 나타났고, 이는 투자수요 감소 등의 다양한 원인이 있지만, 데이터의 한계로 이에 대한 분석은 시도하지 못했다.