그러나 이 같은 외무고시제도의 존속은 외무고시제도로 인해 발생하는 근본적인 문제점을 해결하는데 미흡하다는 지적이 뒤따랐다. 이에 따라 외무고시를 완전히 폐지하고, 신규 외무공무원(5급) 전원을 '외교아카데미'(1년제 비학위과정)를 통해 충원하기로 바꾸었다.
구체적으로 '외교아카데미'의 신입생 규모를 55명으로 하고, 이 중 5명을 탈락시키고 50명을 외무공무원 5급으로 채용하는 방식이다. 그리고 2012년 7월 첫 신입생을 선발하여 2013년 8월에 외무공무원으로 임용할 예정이었다.
이와 같이 외무고시를 폐지하고 외교아카데미제도를 도입하는 방식은 우리나라 외교관의 전문성을 강화하는데 기여할 것으로 기대된다. 그러나 그로 인해 초래될 문제들에 대한 심도 있는 검토와 보완이 필요하다.