시민감시단의 수사･재판 모니터링은 상담소협의회에서 제작한 체크리스트에 기반해 운영되며, 다음과 같은 판단 기준을 두고 있다. 형사사법절차 담당자들의 피해자 권리 및 수사･재판과정에 대한 정보제공 여부, 법정증인보호를 위한 조치의 이행 여부(신뢰관계인의 동석제도, 비공개심리 및 피고인 배제 등), 신문의 내용 및 과정에서 인권침해적 요소 발생 여부(경어사용, 위협적 태도, 수치심 유발질문 등), 수사 및 재판과정 중 피해사실의 외부 누출여부, 고소한 사건의 수사나 재판 종결 후 처분 결과 통지 여부, 합의종용 여부 등이다.