또한 합병시 은행과 지주회사 중 어느 법인을 존속법인으로 할 것인지에 대해서 우리금융지주 측은 존속법인 여하에 관계없이 합병 후 실체는 우리은행이 될 것이며 실질적으로 우리은행을 매각한다는 점에서 우리은행을 존속법인으로 하는 것이 바람직하다는 의견을 제시하였다. 우리금융지주가 보고한 내용에 따라, 후속 간담회에서 존속법인을 어디로 하는지에 따른 장단점을 면밀히 검토하였으며, 비상장법인인 우리은행이 존속법인이 될 경우, 합병 후 신규상장 과정에서 오랜기간 거래정지가 불가피하다는 문제가 유가증권 상장규정 개정으로 완화되고(거래정지기간 : 1년 → 2~3주), 합병주체인 우리금융지주와 우리은행 모두가 은행을 존속법인으로 하는 합병을 희망하고 있음을 감안하여 은행을 존속법인으로 합병하기로 하였다.