따라서 둔치 정비는 인위적 간섭을 배제한 이후의 자연 과정에 의해 변모하는 추이를 관찰하면서 점진적이고, 단계적이면서 장기적으로 진행되어야 한다. 둔치 정비는 단기간에 걸쳐 모든 구간을 완성하기보다는 종합적인 구간별 복원 계획에 의거 시행 하되, 전문가와 NGO 및 지역 주민 등 유역구성원 이해당사자 간의 사회적 합의가우선적이어야 한다.
둔치의 자연성 회복 이후 저비용 고효율, 친환경 유지관리 방안 수립 및 주민참여형 관리가 실현되어야 한다. 또한, 둔치 정비는 인간의 간섭을 최소화한 자연보전 지구를 확대하며, 이 공간은 야생동식물의 서식처가 되어야 하고 미래 세대가 판단할 수 있는 공간이 되어야 한다.