선진의료는 임플란트, 강도변조방사선치료, 인공중이, 항암제감수성시험 등 일반 의료수준을 넘어서는 최첨단 의료기술이며, 2011년 10월 1일 현재 94개 종류의 선진의료에 대해 해당 기술의 시설요건이 설정되어 있다. 선진의료를 받은 경우, 특별요금부분은 보험대상이 아니므로 환자가 전액 지불하며, 진찰·검사·투약·입원료 등의 기초 부분은 보험외 병용 요양비의 대상으로 보험 대상이 되어 건강보험에서 급부와 자기부담액이 적용된다.
선택요양을 받는 경우는 특별한 요양환경의 제공(차액 병상), 예약진료, 시간 외 진료, 200병상 이상 병원의 초진, 200병상 이상 병원의 재진, 제한 초과 의료행위, 180일 초과 입원, 전치부의 재료 차액, 금속상 총의치, 소아 우식치료 후 계속 관리가 포함된다.
일본의 보험급여 여부 결정은 중앙사회보험의료협의회가 주도적인 역할을 하고 있으며, 선진의료를 평가하는 기준은 ① 선진성 ② 유효성 ③ 안전성 ④ 효율성 ⑤ 사회적 수용성 ⑥ 검토의 필요성(보험진료로서의 유용성의 검 토)이다. 중앙사회보험의료협의회는 후생노동대신의 자문기구로 의료기관의 진료 및 약제 등에 대해 공적건강보험에서 지불하는 수가를 결정하는 권한도 가진다. 협의회 위원은 후생노동대신이 임명하고 위원회의 구성은 보험자, 피보험자, 사업주 등을 대표하는 위원(지불측), 의사, 치과의사, 약사 등을 대표 하는 위원(의료제공자측), 공익을 대표자로 구성된다.