우선, 핀테크사업 내지 혁신의 장애요인으로 제일 먼저 제시되는 것으로 (i)금융규제를 들고 있다. 기본적으로 ICT회사들은 카드나 은행간 거래에 참여하기 위해서는 금융회사들과 연계해서 모바일지급서비스를 제공할 수밖에 없다. 그러나 이들 사업자들은 금융규제를 준수할 의지도, 능력도 없는 경우가 대부분이다. 지급결제분야의 경우 특히 상인들의 거래처 기반과 연계되어야 하고 카드거래와 연계되어야 한다. (ii) 둘째, 안전에 대한 수요가 높다는 점이다. 금융시스템은 기술산업과 달리 안전을 중요시하고 시스템위험을 중시하기 때문에 파괴적 혁신이나 기술발전을 쉽게 채택하지 못하는 단점이 있지만 이는 반대로 보면 안전에 대한 수요가 높기 때문이다. (iii) 세 번째는 네트워크효과 및 규모의 경제문제이다. 대표적으로 지급시스템에 참여하는 신생기업은 상인과 소비자의 수요와 상인들의 참여 제한시 네트워크효과를 기대하기 어렵다. 즉 현재 사업자들만이 혜택을 받게 되는 결과를 초래한다. (iv) 넷째, 여기에 장래 규제에 대한 불확실성도 큰 장애요인으로 손꼽아지고 있다. 때문에 핀테크와 관련하여 정부가 육성을 표방하고 있지만, 금융산업이나 ICT산업 모두 어느 정도 이 분야에 투자해야 할지 불확실하다는 문제에서는 자유롭지 못한 상황이다. 아울러 장래규제나 기술수준에 대해서도 불투명한 상태이다. (v) 마지막으로 금융산업, 소비자, 상거래기업, ICT기업들의 이해관계가 모두 일치하지는 않는다는 점도 혁신의 큰 장애로 꼽히고 있다.