일본은 의료분야의 연구개발 예산을 일원화하여 관리하고, 기초연구에서 제품화까지 지속적으로 지원하는 일본의료연구개발기구(AMED)가 선정한 9개 집중 연구지원 분야에 맞춤 및 게놈의료를 포함하였다. 맞춤의학 구현을 목표로 2003년 동경대학 의과학연구소에 정부 주도로 대규모 질환 기반 바이오뱅크인 Biobank Japan(BBJ)을 구축하고 60여 개 이상의 지역병원으로부터 약 20만 명의 환자, 51개 질환군에 해당하는 임상정보 및 인체시료를 수집ㆍ보유하고 있다. 2015년에는 ‘게놈의료실현추진협의회’를 구성하여 게놈의료 실용화를 결정하고, 기존의 3개 바이오뱅크에 축적되어 있는 유전자 정보를 취합하여 연구에 활용하고 2016년 1월부터 기존 치료방법의 효과가 미미한 암환자를 대상으로 게놈진료를 본격적으로 추진하고 있다.