하지만 1997년 연말 동아시아 외환위기가 발생하면서 국제통화기금(IMF)으로부터 구제기금을 지급받게 되면서, 감세정책을 추진하기 어려운 상황이 되었다. 세입 기반을 늘리는 것이 중요한 과제로 등장하였고 김대중 후보는 법인세의 경우 비과세 감면 대상을 축소하겠다는 입장을 밝혔다.
1998년 취임한 김대중 대통령을 비롯한 여당과 야당은 외환위기 극복에 집중하였고 법인세 정책은 조세 정책의 차원에서 기업 구조조정을 원활하게 하도록 지원하는 데에 초점이 맞춰졌다. 2000년 치러진 16대 총선에서 한나라당은 총 273석 중 133석을 얻어 과반수 의석을 차지하는 데에는 실패하였으나 다수당의 지위를 유지하였다. 여당인 새천년민주당은 115석을 얻었고, 정책공조의 파트너인 김종필의 자민련은 17석을 얻었다. 새천년 민주당과 자민련의 의석을 합치면 132석으로 133석의 한나라당과 균형을 형성할 수 있었다. 2001년에 접어들면서 한국은 외환위기의 충격에서 벗어나기 시작하였다. 하지만 새천년민주당과 자민련의 정책공조가 붕괴되면서 보수적 이념 지향을 가진 자민련은 한나라당과 법인세율 인하를 위한 정책 공조를 실시하였다.