기존의 정책금융기관들 사이에서도 이미 업무 중복 및 이로 인한 비효율성 문제가 지속적으로 제기되어 왔기 때문에, “기후대응기금”도 동일한 비판으로 부터 자유로울 수 없다. 특히 정책 일관성이 필요한 녹색금융 업무의 경우, 소관 부처도 각기 다른 다수의 기관에 업무가 분산될 경우 업무 추진에 비효율적일 수 있다.
따라서 기후위기 대응을 위한 금융 촉진에 관하여 별도로 법률을 마련할 경우, 기존 기관들과의 업무 중복을 해결할 필요가 있다. 이와 관련하여 기관 간 업무를 효율적으로 조정하는 ‘협의체’를 마련하는 방안을 생각해 볼 수 있다. 금융위원회는 2021년 5월 24일 금융위원회와 산업은행, 수출입은행, 중소기업은행 등 8개 정책금융기관들의 ‘협의체’인 “그린금융협의회”를 출범한 바 있는데, 출범 이후 뚜렷한 활동을 하지 않고 있다. 녹색금융 업무를 수행하는 기관 간 ‘협의체’를 활성화하기 위해서는 ‘협의체’의 설치 및 역할, 운영 등에 관한 사항을 법률에 명시하는 방안을 검토해 볼 수 있다. 기관 간 ‘협의체’를 운영함으로써 각 기관의 정책 목표를 보다 구체화하거나 미국 코네티컷주의 사례와 같이 각 기관이 담당하는 분야 내지 프로젝트를 하위 법령에 세부적으로 명시하는 방안도 검토할 수 있다.
