이로 인해 기업회계상으로는 유동화증권에서 발생한 평가손익과 통화스왑 계약의 평가손익이 상계되어 당기순이익에 미치는 영향이 없으나 법인세법상으로는 통화스왑계약에 대한 평가손익이 인정되지 않아 법인세가 과세되는 결과를 초래하게 되었다.
이러한 문제점을 해결하기 위해 2001년 12월 31일 시행령 개정시 유동화 전문회사가 화폐성 외화자산 및 부채의 환위험을 회피하기 위하여 체결하는 통화스왑 계약을 평가대상자산에 포함하였으며, 2006년 2월 9일 시행령 개정시에는 통화 스왑계약의 평가대상 법인을 유동화전문회사에서 모든 내국법인으로 확대하였으나 통화스왑을 제외한 파생상품의 경우에도 유사한 문제점을 내포하고 있는 바 근본적인 해결책이 되지 못하고 있다.
또한, 파생상품 거래손익을 결제기준으로 파악하는 것은 파생금융상품으로부터의 손익을 미실현된 자본이득으로 보는 사고에서 출발한 것이나, 이러한 파생상품 중에서도 선물 및 옵션 등의 일일정산제도가 있는 파생상품의 경우 파생거래로 인한 손익변동분이 실질적으로 회수만 안했을 뿐 즉각적인 증거금의 수수로 이어지므로 미실현된 평가손익으로 해석하기보다는 금전채권 및 채무의 변동이 수반된 실현손익으로 보는 것이 타당할 것이다.
이렇듯 세법상 권리의무확정주의에 의한 과세원칙만으로는 수많은 파생상품의 손익귀속시기와 관련된 문제를 해결하기는 어려울 것으로 보인다.