특히, 중증장애인의 경우 동 사업의 시행 전부터 주장애 및 장애 관련 만성질환, 기타 합병증 등을 관리하기 위해서 상급종합병원을 이용해 옴에 따라, 현재 상급종합병원이 동 사업에 참여할 수 없음에도 불구하고 담당 의사와의 신뢰, 의료이용의 편의성 등을 이유로 장애인 건강주치의 의료기관을 활용하지 않고 있다.
「2017년 장애인 실태조사」를 살펴보면, ‘장애인의 건강 수준 향상을 위한 강화정책’에 대해 장애관리 및 재활서비스가 1순위로 뽑힐 정도로 그 필요성이 크지만, 현재 장애인 건강주치의는 질병·건강·장애관리에 대한 교육 및 상담 외에 제공하는 서비스가 없어 장애인의 참여 유인이 떨어지는 것으로 보인다.