(2) 행정위원회의 증가 및 행정기구화
정부위원회들의 증가 자체는 ‘작은 정부’를 지향해왔던 정부의 방침과는 어긋나는 것이다. 일단 생기고 나면, 별도 사무실과 공무원들을 파견 받아 행정기구화 하는 예가 많기 때문이다. 이와 같이 위원회가 늘어나게 되면 위원회 업무를 뒷받침하기 위한 사무국 인력이 늘어나 공무원 총정원제와도 배치된다.
특히 이는 행정관청의 성격을 지니면서 사무기구를 필요로 하는 행정위원회의 경우에 문제가 된다. 우리나라에 있어서의 행정위원회는 어떤 특수한 행정에 관련하여 발생하는 분쟁 등을 재결하는 일을 주로하고 있는데, 정비 때마다 증감을 반복하면서도 비슷한 수준을 유지하고 있는 자문위원회와는 달리 행정위원회는 지속적으로 늘어났다. 이와 같이 2000년대 들어서서 급증하는 양상을 보이고 있고 다른 부처나 기관의 역할에 대한 관심에 비해 상대적으로 많은 관심이 쏟아지고 있는 행정위원회는, 사무국을 유지하여야 하므로 실제로 정부부처가 비공식적으로 확대되는 통로가 되고 있다는 점에서, 특히 정치권과 관료들의 합작품으로 주로 정치적 고려에서 설치된 경우가 많아 기관간 기능 혼선, 옥상옥 기관화의 우려를 낳는다는 점에서 그 증가에 대한 논의가 필요하다. 또한 행정위원회는 수시로 그 임무가 변하며, 위원의 임기가 상당히 짧아서 사업 계획의 연속성과 그 일관성에 대한 문제가 발생하고 있기 때문에, 사업 집행뿐만 아니라 사업 평가나 환류기능까지도 위원회의 결정과는 별 관계도 없는 공무원들에 의해 이루어질 위험이 있다.