그러나 충주기업도시와 거의 같은 시기에 공사에 착공한 원주기업도시의 경우, 부지 조성공사가 전체 공정대비 8.3% 밖에 진행되지 않아 사업추진이 극히 부진한 상황이다. 더욱이 전남 무안과 전남 영암ㆍ해남기업도시는 아직 공사 착공조차 하지 못하고 있다.
이번에 개발구역지정이 해제된 무주기업도시 이외에 전남 무안기업도시 국내단지의 경우에도 사업시행자가 법정자본금을 확보하지 못해 사업이 보류되었으며, 사업시행자도 곧 청산절차를 밟을 예정이다. 또한 전남의 영암ㆍ해남 기업도시의 경우, 개발계획이 확정되지 못하고 사업이 보류되는 등 사업 추진에 난항을 겪고 있다.