셋째, 통합공사의 대규모 부채가 결국 국민부담으로 이어질 수 있다는 우려가 있다. 2009년 4월 발표된 공정거래위원회의 ‘상호출자제한기업집단자료’에 의하면 통합공사의 규모는 자산 105조, 부채 86조, 직원수 7,000여명에 달함을 알 수 있다. 그간 통합을 반대해온 토공측에서는 통합 이후 2011년에는 부채가 129조원으로 증가하게 되며 이러한 부채에 대한 이자비용만 하더라도 매일 114억원에 달한다고 주장한 바 있다. 이에 대해 주공은 토공의 개발이익(2007년 기준 당기순이익 9,692억원)을 활용하면 부채문제는 해결된다는 입장을 견지해 왔다.