2004년 9월 중앙대학교를 시작으로 전문대학원 또는 특수대학원 형태로 기존 대학교 내에 창업대학원을 개설하여 4학기제(예원예술대는 5학기제) 과정의 창업학 석사학위 과정이 운영되고 있다. 예원예술대학교를 제외한 나머지 대학은 기존 특수대학원의 명칭을 변경하여 창업관련 학과(전공)를 개설하였다.
2004년 도입 당시 매년 대학 당 4억 원 가량을 지원하여 총 20억 원을 2008년까지(5년간) 지원한 이후 자립화를 유도한다는 계획을 마련하였으나 2014년까지 추가 지원하기로 재협약을 체결하였다. 지원예산은 2009년 18억 원, 2011년 12억 원, 2012년 9억 원, 2014년 9억 원으로 대학의 자립도가 높아짐에 따라 단계적으로 감소하였다. 현재 5개 대학의 재정자립도는 평균 81%로 가시적 성과를 보이고 있다. 사업비 지원 내용은 강사료, 교육지원비, 교육개발비, 일반운영비 등이다.