그러나 영국, 일본 등 단일 보유세 부과체제를 유지하고 있는 해외사례에서 살펴 본 바와 같이 부동산 보유세의 중복문제가 있을 수 있으며, 종합부동산세 세수입을 교부세와 같이 적절한 배분을 유지할 수 있을 지에 대한 문제도 심도 있게 고려해 볼 필요가 있다. 종합부동산세는 부동산 과다 보유자에 대한 과세 강화와 부동산 경기 과열로 인한 부동산 투기 억제를 위해 도입한 제도이므로 지금과 같은 부동산 경기 정체기나 침체기에는 일본과 같이 잠시 정지하거나 폐지하는 것도 하나의 대안일 수 있다. 특히 2018년 이후에 우리나라의 부동산 침체를 걱정하는 상황에서 종합부동산세의 존폐문제를 다시 한 번 고려해 볼 필요가 있다.