이후 2009년에 FAO는 항만국조치협정을 채택하여 항만국은 자국 항구에 자발적으로 입항하는 외국적 선박에 대해 지정한 항만을 이용하도록 하고, 사전 정보를 제공하도록 해야 하며, 정보 분석결과 불법어업과 연관된 선박인 경우 입항을 금지하거나 항만 서비스 제공을 거부하는 등 최소한의 기준을 정해 강제적인 조치를 취하도록 강제하고 있다. 이 협정은 강행규범으로서, 불법어업 통제조치의 실효성 제고를 위해 통제권 행사 주체를 기존의 기국에서 항만국으로 확대하는 획기적인 조치로서 의의가 있다. 또한, 동 조치는 불법어업 선박 또는 연루 선박이 적재한 수산물을 항만에 반입하지 못하도록 금지함으로서 불법 어획물의 시장 진입 및 유통을 사전적으로 차단하고 불법어업자의 수익을 통제하는 효과가 있다(FAO, 2009). 이와 관련하여 현재 FAO에서는 불법 수산물의 시장 유통을 통제하기 위해 어획증명제도에 관한 국제규범 제정을 추진하고 있다(FAO, 2016).