더불어 전자화고시의 개선도 필요하다. 우선 전자화 과정의 주체는 종이문서 보관자가 아닌 신뢰할 수 있는 제3자가 수행하는 것이 바람직하다. 전자화 과정의 신뢰성은 자기 문서를 스스로 처리하지 않을 때 높아진다. 전자화 과정을 통해 전자화문서를 생성한 후 공인전자문서센터에 보관할 때까지 무결성의 추정은 종이문서의 보관자가 아닌 신뢰할 수 있는 제3자가 담당하는 경우에만 가능하다는 의견도 같은 취지라고 본다(이응세, 2006). 둘째, 각종 명칭 변경에 따른 전자화고시의 현행화가 필요하다. 전자화문서관리규정을 등록받는 “「전자문서 및 전자거래 기본법」 제22조에 따른 전자문서·전자거래 진흥 전담기관”은 법에서 명칭이 삭제되었고 다른 기관으로 변경되었음에도 종전 기관 명칭이 표기되어 있다(전자화고시 제6조 제2항 및 제4항). 전자화기록부의 분기별 기록내용과 조치결과를 보고받는 기관, 과학기술정보통신부장관이 전자화전문교육과정을 위탁하는 기관, 정기점검 기관, 기술자료의 임치 기관의 명칭도 동일하게 모두 변경하여야 한다(전자화고시 제8조 제3항, 제13조 제3항, 제24조 제2항 및 제3항, 제27조, 제34조 제2항, 제35조 제2항). 셋째, 제도 변경에 따른 전자화고시의 현행화도 필요하다. 2017년 전자화고시 인증제도가 폐지되었다. 원고대와 물리적으로 연결되어 있지 않은 스캐너는 예외적으로 인증을 받은 경우 사용할 수 있도록 되어 있는 규정은 삭제하거나 수정하여야 한다(전자화고시 제15조 제2항). 2020년 전자서명법 개정으로 공인전자서명 제도가 폐지되었으므로 공인전자서명 규정은 삭제하거나 수정하여야 한다(전자화고시 제28조 제1항).