혁신기금은 의료기술 제조업체가 직접 신청해야 한다. 신청 대상 의료기술은 기존 기술을 발전시킨 것이 아닌 새로운 의료기술이며 프랑스에 최초 출시된 의료기술이어야 한다. 또한 환자 안전과 임상적 유효성 그리고 비용효과성을 검증할 수 있는 자료 또는 이러한 내용을 확인하기 위해 추가적으로 제출할 자료의 내용과 근거 확보를 위한 연구계획 그리고 연구의 타당성을 입증할 수 있는 프로토콜과 예산이 포함된 신청서를 제출해야 한다. 신의료기술의 임상근거 마련을 위한 혁신기금의 지원기간은 보통 2~5년이며 비용지원 범위는 대상 환자의 입원비용과 일부 의료기기 비용이다. 따라서 임상시험 비용은 제조업체나 의료기관이 부담한다(Martelli H, Brink H. 2014: 1-5). 2019년말 기준 ‘전립선암에 대한 고강도 초음파 치료’를 포함해 총 9개 의료기술이 혁신기금의 지원을 받고 있다.