(3) 제도의 유지와 인력의 전문성 단절 관련
일부 교육관계자는 학교전담경찰관 제도의 폐지에 대한 논의를 제기하고 있으며, 학교전담경찰관의 임무가 제한적이어서 제도의 운영에 따른 효과가 적다는 주장도 있다. 경찰청의 제도 개선방안은 학교전담경찰관이 학교폭력 대응 및 범죄예방 등 안전 관련 업무에 집중할 예정으로 학교전담경찰관을 지정하지 않아도 관련 업무의 수행이 가능할 수 있다. 따라서, 장기적으로는 제도의 지속 여부에 대한 논의가 필요하다.
학교폭력 관련 업무에 대한 전문성을 인정받아서 경력경쟁채용으로 선발된 학교전담경찰관은 5년을 근무하고 다른 부서에서 근무할 수 있다. 학교전담경찰관이 의무적으로 근무하는 기간이 지난 후에 다른 부서로 이동을 하면, 제도의 운영에 따라서 축적된 지식과 경험이 단절되는 문제가 발생할 수 있다.