2009년 들어 기업형 슈퍼마켓(SSM) 관련 사업 조정 신청이 급증하면서 사업조정제도에 대한 관심이 높아지긴 했지만, 그 이전까지 사업조정이 진행된 경우는 그리 많지 않았다. 실제로 1997년부터 2009년 8월까지 SSM 관련 건수를 제외하면 사업조정이 신청된 건수는 37건에 불과하다. 최근 제도의 실효성을 확보하기 위한 대책이 제시되었으나, 사후적 조정수단에 불과한 사업조정제도는 중소기업의 사업영역을 보호하는데 근본적인 한계가 있다.
사업이양 권고업종 지정제도의 경우, 현재 582개 품목이 권고업종으로 지정되어 있다. 그리고 지정된 업종에서의 사업 이양에 대해서는 ｢대ㆍ중소기업 상생협력에 관한 법률｣(이하 ｢상생협력법｣)에 따라 대기업과 중소기업 모두에게 금융ㆍ세제상의 지원을 할 수 있게 되어있으나, 이 역시 실효성은 거의 없었던 것으로 평가되고 있다.
대기업에서 중소기업으로의 사업이양이 법률에 의해 강제되는 것이 아니라, 단순한 권고에 그치고 있다는 것이 동 제도의 결정적인 한계라고 할 수 있다.
이러한 상황에서 정부는 대기업과 중소기업의 동반성장을 위해 대기업의 무차별적인 사업확장으로부터 중소기업의 사업영역을 보호할 필요성에 주목하였고, 이를 위해 대기업 사업이양 권고업종 지정제도를 전면 개편하여 ‘중소기업 적합업종 지정제도’를 도입하게 된 것이다.