농축임업의 경우, 주요 신선 농산물 대부분이 양허 제외되었으나 유지류(참깨, 들깨, 땅콩), 목재류 등에서 20년 평균 0.075억 불의 무역수지 악화가 예상된다. 한편 수산업의 경우, 발효 후 어패류 등을 중심으로 20년 평균 18.3백만 불의 수입증가와 연체류, 어류를 중심으로 수출이 증가할 수 있다.
결국 한·중 FTA에서 우리는 농축어업 및 경쟁력 취약 제품을 민감 및 초민감품목으로 보호하였으므로 한·중 FTA 체결 이전에 우려하였던 사회적 갈등이 적게 되었다. 반면 중국은 제조업 중심으로 민감 및 초민감품목을 구성하였으므로 한국은 석유화학, 자동차 등 주요 품목들에 대한 중국의 문턱을 낮추기 어려웠고 당초 업계의 기대치보다 낮은 수준의 이익이 예측되고 있다.
특별히, 고부가가치산업인 탄소산업의 경우 우리는 8%의 관세를 즉시 철폐하였으나 중국은 이를 초민감상품에 포함시켜 17.5%의 관세를 계속 부과하게 되어서 가서명 직후 업계의 반발이 거셌다. 최종적으로 한·중 FTA가 협상 기본 지침인 자유화율을 상회하여 체결되었음을 고려하면 고부가가치 상품의 보호 미흡은 문제라 할 수 있다.