IMF 직후 출범한 김대중 정부의 경제정책은 IMF 체제로부터 신속하게 벗어나는 것을 주된 목표로 하였기 때문에, 집권세력의 정책이념 반영이 상대적으로 적었다고 볼 수 있다. 그러나 2003년 출범한 노무현 정부는 ‘보호와 육성’, 혹은 ‘성장’ 보다는 ‘선택과 집중’, ‘분배’등에 보다 역점을 둠으로써 정책이념을 이전 정부에 비해 강하게 관철하고자 하였다. 2004년 7월 정부는 ‘중소기업 경쟁력 강화 대책’을 통해 보호와 육성 위주가 아닌 혁신역량의 제고, 글로벌 경쟁력강화에 중점을 둔 중소기업정책을 발표하였으며 2005년 6월에는 신용보증 개편방안 및 기술평가금융 활성화 방안 발표를 통해 신용보증기관간 업무영역 특화 및 중복보증 해소를 위한 정책을 추진하였다. P-CBO 보증의 부실증가에 따라 기술신용보증기금이 유동성 위기에 직면하자 정부는 신용보증기금에 출연해야할 금융기관 출연금 일부를 기술 신용보증기금에 출연하도록 하였는데, 이는 신용보증제도에 포함되어 있는 신용보증기관들이 결코 다른 신용보증기관의 정책이나 경영상태로부터 자유롭지 못함을 시사하는 것으로 이후 전개된 보증기관 간 통폐합 논의와도 연관성을 맺는 정책판단이라 할 수 있었다.