그러나, 부동산투자신탁기구를 운용함으로써 자산운용회사에 귀속되는 운용수수료를 부가가치세 과세대상으로 볼 경우 투자신탁재산의 일부분만이 부동산 등에 운용될 경우에도 자산운용회사는 그 운용수수료 중 일부에 대하여 부가가치세법상 납세의무를 부담하게 됨으로써 사업자등록 등 제반 신고 및 납세의무를 이행해야하므로 자산운용업 자체를 본원적 금융·보험용역으로 규정함으로써 자산운용시장을 활성화시키는 데에 큰 걸림돌이 될 수 밖에 없다.