하지만 인터넷전문은행이 신규계좌개설을 여타 금융회사에 위탁해야 한다면 자신의 장점을 충분히 발휘할 수 없다는 문제점이 있다. 인터넷전문은행은 온라인상에서 실명확인을 하고 신규계좌를 개설하기를 원한다. 구본성(2008)도 “제한된 영업망을 갖춘 인터넷전문은행의 경우 계좌개설을 위한 실명확인절차 및 방법, 법적 안정성 확보는 핵심과제에 해당”한다고 보고하고 있다.
구본성(2008)은 금융실명제법을 개정하지 않는 범위 내 수용할 수 있는 다양한 방안으로 다음을 제시하고 있다. 1안은 은행직원이 고객을 방문하여 계좌 개설하는 방식으로, 이 방식은 HSBC은행이 수행하였던 방안이다. 2안은 업무제휴 협약에 의해 실명확인을 대행하는 방식으로, 타 금융회사에 의해 실명확인된 은행계좌의 입출금(자계좌)은 근거계좌(모계좌)를 통해서만 허용된다는 조건하에서, 온라인증권사 등에 허용되었다. 3안은 공인인증서를 통한 계좌개설 방식인데, 이 방식은 “대면확인을 통한 실명확인 이후 계좌개설을 허용하고 있는 당시 실명법 취지에 위배될 소지”를 가지고 있다고 하였다. 4안은 인터넷 동영상을 통한 대면확인 방식이다. 공인인증서로 인터넷에 접속한 후 은행직원이 동영상 캡처하고 우편 또는 온라인으로 전송한 주민등록증 사본과 대면확인하는 방식인데, 주민등록증 위조 또는 대포통장 개선 등의 우려가 있어 사본을 이용한 대면확인은 허용하기 어려울 소지가 있다고 보고하고 있다.
1안은 많은 비용이 소요되는데 인터넷전문은행의 장점이 비용절감임을 고려한다면, 적절하지 않다고 보인다. 이 방법을 사용하였던 HSBC은행은 국내에서 영업을 중단하였다. 2안은 2014년 11월 25일 의결된 ‘금융실명거래 및 비밀보장에 관한 법률 시행령’ 개정안에 의해 가능하게 되었다. 비록 타금융회사에 의해 개설되었다고 할지라도 그 계좌를 통해 입출금이 가능하다고 보인다.