안전성평가연구소는 1988년 6월 국내 최초로 ‘GLP 적격시험기관’ 인증을 획득하였고, 1999년 11월 아시아 최초로 AAALAC동물실험 적격기관 인증을 받았으며, 2005년 미국 FDA의 현지 실태조사를 거쳐 2013년 FDA의 적격기관 인증을 획득함으로써 명실공히 한국의 최고의 독성 및 유해성 화학물질 관련 연구기관으로서의 명성을 유지하고 있다. 그 외에도 국내적으로는 식약처, 농림수산식품부, 환경부 등의 안전성평가업무를 수행하고 있으며, 세계적으로는 EMEA(유럽의약청), EFSA(유럽식품안전청), EPA(미국환경청)으로부터 승인을 받아 관련 연구를 수행하고 있다.
2014년에 안전성평가연구소는 임무 재정립을 통해 고유업무로 ‘안전성·약리연구 및 평가기술개발’, ‘환경독성연구 및 위해성 평가기술 개발’, ‘산업계 기술지원, 인력양성, 공공인프라 구축 및 운영’을 설정하고 중점강화사업으로 ① 차세대 안전성평가기술 개발, ② 인체·환경 유해물질에 대한 안전성평가 연구, ③ 산업계 수요 대응형 안전성평가기술 개발, ④ 중소기업 협력사업(강화)로 설정하여 추진하고 있다. 특히 네번째 중소기업협력사업의 경우 중소기업 안전성평가 연구지원, 민간 CRO 글로벌 성장지원, 중소기업 기술협력(기술지원, 인력양성, 인프라 활용)에 중점을 두고 있다. 
안전성평가연구소의 중소기업 지원 활동은 기술협력본부에 의해 수행되고 있다. 기술협력본부는 안전성평가연구소(KIT) 중소기업협력센터(전담인력 7인)를 중심으로 산업지원 2팀의 지원에 의해 수행되고 있다. 산업지원 2팀은 중소기업 R&D 기획 및 코디 전담부서로서 기능을 담당하고 있다.