상부지휘구조 개편 이외에도 한미연합사를 존속시켜야할 이유는 적지 않게 발생하고 있다. 2006년 한미 양국이 한미연합사를 해체하는 것으로 합의했을 당시에는 앞으로 북한의 위협이 점점 감소될 것이라고 예상했다. 그러나 2010년의 천안함 폭침 이후 2015년 12월 1일로 한미연합사 해체 시기를 연기할 수밖에 없었듯이 북한의 위협은 전혀 감소되지 않았고, 최근에는 핵미사일 위협이 추가된 상태이다. 북한은 2006년의 시험 이후 2009년 두 번째의 핵실험을 실시하였을 뿐만 아니라 김관진 국방장관이 2011년 6월 13일 국회 증언에서 언급하였듯이 이미 미사일에 탑재할 정도로 소형화했을 가능성도 존재하고(연합뉴스, 2011년 6월 13일자), 이에 대하여 한국은 효과적인 방어책을 전혀 보유하고 있지 못하다. 상황이 이러함에도 예전에 합의하였다고 하여 한반도의 전쟁억제와 유사시 승리보장에 필수적인 존재로 기능해온 한미 양국의 단일사령부를 재검토 없이 해체한다는 것은 합리적이지 않다.