다만 증권시장의 안정성 및 공정한 가격형성을 위하여 일정한 경우에 한하여 공매도를 허용하는 것이다. 실제 과거 구「증권거래법」에서는 공매도를 거래소 규정으로 규제하고 있었다. 이로 인하여 증권회사가 공매도 규정을 위반한 경우에 한하여 거래소는 증권회사에 대해서만 제재를 할 수 있을 뿐이었다. 그러나 최근 「자본시장법」에서는 규제대상이 한정되지 않아 투자자들을 직접적인 규제대상으로 확대할 수 있게 되었다.
또한 2012년 8월부터 보고제도 근거가 반영된 「자본시장법 시행령」 개정이 완료되어 공매도 포지션 보고제도를 시행하고 있다.
그러나 공매도의 규모와 종목에 대한 사항만이 공시되고 있는 한계가 있다.