구체적인 도입안이 논의되기 시작한 것은 2018년 5월 대통령 직속 정책기획위원회 산하에 농정개혁 T/F가 발족한 이후로, 여기서 기존 직불제를 ‘기본형 직불제’와 ‘가산형 직불제’로 통폐합하여 ‘농업기여지불제’로 개편하는 안이 제안되었으며, 이는 다시 당정협의(’18.11.)와 비공개 고위 당정청회의(’19.8.) 등을 거치며 2020년 정부 예산안에 공익직불제 예산이 포함되는 결과로 이어졌다.
국회에서는 2019년 9월 9일 「농업소득의 보전에 관한 법률 전부개정법률안」이 예산부수법안으로 발의되어 농림축산식품해양수산위원회의 심사를 거친 끝에, 작년 12월 본회의 수정안이 국회 본회의를 통과하기에 이르렀다. 2019년 4월에 출범한 대통령직속 농어업·농어촌특별위원회에서도 ‘공익형 직불제’는 핵심 의제 중 하나로 다뤄지고 있는 바, 구체적 안이 올 상반기 중에 직불제 전환을 위한 농업예산 구조개편 방안 등과 함께 발표될 예정이다.