그러다가 2001년 9·11테러 이후에는 테러리스트 조직에 의한 핵물질 및 핵시설 악용가능성이 현실적인 위협으로 대두되기 시작하였으며, 이러한 핵테러에 대응하기 위한 조치로서 핵안보를 강조하게 되었다.
이 같은 배경 하에서 핵안보정상회의가 개최되게 된 직접적인 계기는 2009년 4월 5일 오바마 대통령의 ‘프라하 선언’이다.
당시 오바마 대통령은 “향후 4년 내에 전 세계 모든 취약 핵물질을 안전하게 방호하기 위한 새로운 국제적 노력을 추진하겠다”고 천명하고, 이를 위한 구체적인 노력으로 핵안보정상회의 개최를 언급했었다.
이후 오바마 대통령은 2009년 7월 8일 ‘G8 정상회담’에서 ‘핵안보정상회의’ 계획을 발표하면서, 이를 공식적으로 출범시키게 된 것이다.