반면 주민소환제 도입에 반대하는 측에서는 당시 짧은 우리의 지방자치의 역사와 중앙과 지방간의 불균형한 권력의 기능적 분배를 우려해 주민소환제 도입을 우려하였다. 당시 지방자치가 완전히 뿌리를 못 내리고 있는 시점에서 주민소환제 도입은 시기상조라는 주장이었다. 그 대표적인 이유로는 지방자치의 경험이 일천한 우리나라에서 모처럼 주민의 투표에 의해 선출된 단체장을 소환함으로써 그들의 정치적 입지를 흔들어 대는 악용의 소지가 있다는 점과 단체장의 소신 행정 추진을 가로 막을 수 있다는 점과 아울러 불순한 동기로 주민소환이 이루어지는 경우 해당 단체장은 주민투표에 의한 소환 여부를 떠나 소환발의 자체로 상당한 정치적 타격을 입을 수 있다는 주장이었다.