이처럼 난임사업은 이미 국가중장기 계획을 통해 앞으로의 시술대상범위 확대까지 계획하면서 2006년 465억원의 예산규모로 야심차게 시작됐지만, 시작과 동시에 지원대상 확보의 어려움에 직면했는데, 이 또한 시술대상자의 선정 및 건강보호에 대한 엄밀한 기준을 유보한 원인으로 사료된다. 2006년 난임(불임)사업은 불임시술 지정기관 113개 기관을 지정하고, 16,426명의 체외수정지원을 목표로 제1차 신청(06.3.6~4.28)을 접수받았지만(류정아, 2007), 1차신청마감시까지 신청률은 목표대비 45.6%에 불과했다. 이에 보건복지부는 추가접수부터(06.5.1~5.31) 지원대상 자격의 소득기준 완화(도시근로자가구 월평균소득 80% 이하에서 130% 이하로 변경)를 통한 지원대상 확대를 결정했고(보건복지부, 2006), 그 결과 원래 지원계획의 16.5% 상회하는 19,137명을 모집한다. 하지만 아래 표를 보면 지원대상자의 모집은 해마다 변동이 크며, 특히 2008년과 2013년은 지원계획에도 미치지 못함을 알 수 있다.