다섯째, 아동보호전문기관의 기능과 역할에 대한 재정비가 필요하다. 특례법이 시행되면서 경찰동행 요청에 의한 현장출동 업무가 부과되었고, 고소･고발 등의 추가적인 업무도 늘어났다. 아동학대 수사진행, 아동보호조치 시 아동과 동행하여 보호자의 역할을 수행하는 등 현장조사 업무가 더해지는 상황으로 기관 본연의 사례관리업무에 지장을 초래하고 있다. 이에 대한 대안으로 아동보호전문기관 업무의 이원화를 고려해 볼 수 있는데, 특례법 위주의 현장조사팀과 기관 본연의 기능 수행을 위한 사례관리팀으로 구분하여 업무를 진행한다. 새롭게 발생하는 아동학대 사건의 현장조사 업무에 치중하여 기존에 관리하던 사례들이 방치되지 않도록 아동보호전문기관 본연의 기능과 역할에 충실할 수 있는 제도적 보완이 요구된다.