재개된 선거구획정위는 9월 29일 제15회 회의에서 10월 20일까지 제주도 내 정당과 도의회, 제주도에 지역구획정과 관련한 의견진술을 요청하는 한편, 2017년 9월 30일을 선거구획정을 위한 인구기준일로 결정했다. 그러나 각 정당들의 제주도당 간에 극심한 의견차가 노정되는 등 또다시 난항을 거듭했다. 민주당과 한국당 제주도당이 지역구 의석 2명 증원에 대해 적극적인 입장을 개진한 반면, 국민의당과 정의당은 정당명부식 연동형 비례대표제 도입을 촉구했다. 심지어 정의당의 경우 9월 25일 이미 심상정 국회의원이 연동형 비례대표제를 도입하는 내용의 제주특별법 개정안을 발의한 상태였다. 아울러 10월 25일 민주당의 위성곤 의원도 도의원 증원과 연동형 비례제 도입을 골자로 한 제주특별법 개정안을 발의했다.
이는 선거구획정위가 재가동되었지만 국회가 해결책을 쥐고 있는 국면을 조성했다. 실제 11월 23일 국회 행정안전위원회는 3당 간사협의 끝에 심상정 의원과 위성곤 의원이 발의한 제주특별법 개정안을 국회 정개특위로 회부하기로 결정했다. 이에 따라 선거구획정위는 국회의 제주특별법 개정안 처리결과를 지켜볼 수밖에 없는 처지가 되었다. 그러나 국회 정개특위는 12월 수차례 회의(14, 15, 19일)에도 불구하고 연동형 비례대표제 도입을 놓고 여야 간 종래의 입장차를 좁히지 못하고 공회전을 거듭하다 12월 19일 결국 연내 심사를 하지 않기로 했다(제주신보, 2017.12.24).