경제성 분석방법으로 비용-편익분석, 비용-효과분석, 부가가치를 편익으로 가정하는 방법이 사용되었으며, 주관부처가 제시한 분석결과에 대하여 시나리오 별로 결과값이 도출되었다. 미래환경보건 선도기술개발사업의 경우 편익 및 효과의 산출이 불가하다는 결과가 제시되었다.<br>사업주체가 제시한 편익항목들에 대한 분류 및 검토는 주로 편익을 구체적으로 세분화하여 편익의 인정여부를 판단하거나 개선방안을 제시하는 형태로 수행되었다.