마지막으로 정부정책과의 연계가 부족했다. 투명사회협약을 통한 반부패정책 산출물 또는 성과물을 정부차원의 반부패관계기관협의회를 통해 정부정책에 반영하거나, 정부의 반부패정책을 투명사회협약 참여주체들과의 관계 속에서 정보를 공유·전파하기 위한 정책연계가 부족했다.
물론 반부패를 위한 시민사회가 노력해야 할 사안과 정부가 노력해야 할 사안은 다를 수 있다. 하지만 투명하고 깨끗한 사회를 만든다는 목적이 동일하기 때문에 상호간의 정책적 시너지 효과를 거둘 수 있는 부분을 공유하여 건전한 상생관계를 유지하기 위한 노력을 했어야 함에도 불구하고 이러한 부분이 부족했다고 볼 수 있다.