둘째, 정부가 총지출 효과를 극대화하기 위해 제시한 이차보전 방식에 대해 재정수지의 유지를 위해 공기업, 민간에게 부채를 전가한다는 비판과 함께 효과성이 제한적일 수 있다는 지적이 있다.
정부가 이차보전 대출에 보증을 서지 않는다고 하지만 대출이 부실로 이어지게 되는 경우 손실에 대한 보전을 정부가 짊어질 수밖에 없어 향후 예산안 심의 과정에서 논란이 예상된다.
또한 정부는 이차보전이 재정에 부담을 주지 않으면서도 민간자금을 활용하여 경기부양의 효과를 극대화할 수 있다고 하나, 정책자금 집행기관이 정부에서 은행으로 바뀌게 됨에 따라 발생하는 부작용을 고려해야 할 것이다.