또한 '대기업 계열사 부당내부거래' 부과과징금액이 충분치 않아, 부당내부거래를 부추기는 주요 요인으로 작용하고 있다는 비난도 있다.
공정거래법 제24조의2에 의하면, 대기업 계열사 부당내부거래에 대해서는 관련매출액에 100분의 5를 곱한 금액을 초과하지 않는 범위 안에서 과징금을 부과할 수 있다. 다만, 동법은 매출액이 없는 경우 등에는 5억원을 초과하지 않는 범위 안에서 과징금을 부과할 수 있다고 규정하고 있다.
이러한 문제들을 시정하기 위해 국회에서는 공정거래법에 불공정내부거래행위 규정의 신설과 함께 경제력집중과 관련하여 부당지원행위를 규제하는 방안을 다음의 법안에 제시했다.