또한 존치의 필요성은 인정되나 설립목적에 부합하는 역할을 제대로 수행하지 못하고 있는 위원회의 경우 그 핵심기능을 보다 강화하기 위하여 위원수 및 직급을 합리적으로 조정하는 등 운영의 효율성을 제고하도록 하고, 위원 구성시 여성전문가의 위촉을 확대해 나가도록 하였다.
그리고 위원회 설립의 제어장치 필요성이 제기됨에 따라 정부위원회운영지침을 통해 실효성이 없는 위원회의 난립을 미연에 방지하도록 하였는데 필요성이 인정되는 위원회도 신설시에 그 존속기한을 명시하도록 하는 일몰제를 도입하도록 하였으며, 부처별로도 위원회 설립의 타당성 및 운영효과를 정기적으로 평가하도록 하였다.