소수당은 무소속 의원과 다르며, 비교섭단체인 소수당은 교섭단체와 동등하게 헌법의 보호를 받는 헌법기관이다. 비교섭단체에 비해 교섭단체의 다수당은 의제설정에서 유리한 지위를 점하였다. 교섭단체가 갖는 제도적 권한은 광범위하기 때문에, 국회는 다수당 중심으로 운영된다. 이들간의 협의가 부재한 경우, 국회는 교착상태에 빠지며 이들간의 합의는 특정 의제의 일괄타결로 이어지기도 한다. 이러한 문제는 국회 기능의 근본적인 문제이다.
이에 대해서 이 연구는 다음과 같은 개선방안을 제시한다. 첫째, 교섭단체 구성의 하한선을 하향 조정하는 것을 고려할 필요가 있다. 그 적정선이 어디인지에 대해서는 별도의 논의가 필요하겠지만, 그 하한선이 임의적인 설정이라는 측면에서 이에 대한 심도있는 논의가 필요하다. 둘째, 다수당 중심의 권한 행사는 소수당에 대한 배려를 확대하는 방향으로 개선하여야 한다. 교섭단체 권한 자체를 분산이나 축소하여야 한다는 것을 의미하는 것은 아니다. 교섭단체간 ‘협의’가 어떤 범주에서 허용되고, 비교섭단체의 소수당이 입장은 어느 정도까지 고려하여야 하는지 고민할 필요가 있다는 것이다. 셋째, 교섭단체간의 협의가 이루어지지 않는 장기적 교착상황에서 이를 조정할 수 있는 별도의 기구를 설정하는 방안을 고려할 수 있다. ‘일정 기간’ 국회 교착상태가 지속되는 경우, 의장단을 비롯한 교섭단체 이외의 의원들을 포함한 의사기구를 제도화하는 것을 하나의 대안으로 고려할 수 있다.