한편 한국정치학회는 해당 조항을 삭제할 것을 제안하였는데, 이는 정당 난립의 부작용보다는 정당 설립의 자유를 강조한 취지로 보인다. 하지만 헌법재판소가 판결문에서실질적으로 국민의 정치적 의사형성에 참여할 의사나 능력이 없는 정당을 정치적 의사 형성과정에서 배제하기 위한 방안으로서 일정 수준 득표에 실패한 정당의 등록취소에 대해서는 입법목적의 정당성을 인정했다는 점에서 해당 조항의 취소에 대해서는 좀 더 신중할 필요가 있다. 등록취소 요건을 어느 정도 완화할 것인지에 대해서는 정당 설립의 자유와 정당 난립에 대한 우려 등을 고려하여 조화를 찾는 고민이 필요하다.