김정일의 군우대정책은 군장성의 승진인사와 주석단서열에서 군부 인사의 급격한 수직상승으로 구체화되었다. 군부의 위상과 역할이 강화되었으나 당우위의 당·군관계는 변화가 없는 것으로 파악된다. 전통적으로 북한은 당이 당중앙위원회 내의 군사위원회와 군대내의 당조직을 통해 군부를 통제해왔다. 개정헌법(1999. 9. 5.) 제11조에서도 "조선민주주의 인민공화국은 조선로동당의 영도밑에 모든 활동을 진행한다"고 규정하고 있다. 선군정치 하에서 북한의 당·군 관계를 다음과 같이 평가할 수 있다. 첫째, 당·정·군 관계에서 당이 가장 막강하다는 것을 알 수 있다. 김정일이 군중시정책을 빈번히 강조하지만 김정일은 역시 당을 군보다 중시하며 그 다음으로 군을 중시하는 것을 알 수 있다. 그러나 선군정치 하에서 군이 예전보다 모든 분야에서 지대한 영향력을 행사하고 있는 것은 사실이다. 둘째, 군이 당보다는 약하지만 군도 선군정치의 영향으로 군사부문에만 한정되어 영향력을 발휘하는 것이 아니라 모든 분야에 참여하면서 활동범위를 확대해왔다.