국민대타협기구는 여당 2명, 야당 2명, 정부 4명, 공무원단체 4명, 전문가 8명 등 총20명의 위원으로 구성하였다. 아울러 3개 분과위원회(공무원연금개혁분과위원회, 노후소득보장제도개선분과위원회, 재정추계검증분과 위원회)를 구성하여 운영하였다.
국민대타협기구는 총 39회의 전체 및 분과위원회 회의, 실무기구 회의와 3회의 공청회 등을 개최하였다. 2015년 3월 28일 국민대타협기구의 활동이 종료되었으나, 해당 기구의 합의문에 따라 공무원연금개혁특별위원회에 실무기구를 구성하여 논의를 계속한 결과 최종 공무원연금개혁안을 도출하였다.