(3) 합리적 수질기준의 마련
첫째, 현행 지하 충전수에 대한 수질기준의 대상을 확대할 필요가 있다. 현재 하수·폐수 재처리수 및 온배수 재처리수로 지하수를 함양할 경우의 수질기준은 시·도지사가 관할 구역에 대하여 수립하는 ‘지역지하수관리계획’에 포함된 경우로만 되어 있어 그 범위가 제한적이다. 즉, 현행 규정에 따르면 시·도지사가 아닌 국가 또는 개인이 지하수를 함양할 경우에 적용되는 수질기준이 부재한 상태다. 따라서 국가와 개인까지 대상범위를 확대하여 지하수 함양에 따른 수질오염을 예방할 필요가 있다.
둘째, 함양 깊이별·지역별 세부기준의 마련을 고려할 필요가 있다. 지하수 함양은 지표(basin), 불포화대(vadose zone) 또는 지하수에 직접 주입하는 경우 등 충전 깊이에 따라 토양에서 발생하는 정화능력에 차이가 있으므로, 수질기준에 차등을 두어 합리적으로 적용할 필요가 있다.
또한 수막하우스(water curtain house) 시설 등의 농업용수로 지하수를 주로 사용하는 농촌지역과, 식수 등 상수로 지하수를 주로 사용하는 제주도의 경우에는 사용목적에 차이가 있기 때문에, 사용용도, 지하수 암반층 깊이, 지질 및 사용수량 등 지역별 특성을 고려하여 수질기준을 정할 필요가 있다.