급여의 산출과 관련해서는 최저생계비의 다른 항목이 전물량 방식으로 계측되는 반면에 주거급여는 상이한 정책수단 - 저소득층 전세융자지원제도의 금리와 상한액 -을 적용함으로써 동일한 마켓바스켓식 산정이 이루어지지 않고 있으며, 비계측년도에는 물가상승분을 단순 반영하고 있는 실정이다.
무엇보다 중요한 것은 급여수준의 산정시에 주거욕구의 정확한 반영을 기하기 어렵다. 즉 주거욕구의 특성을 나타내는 지표들인 주거지역, 가구규모, 점유형태 등에 대한 고려 없이 생계급여의 일정비율을 획일적으로 제공하기 때문에 자가 가구, 대규모 가구, 그리고 농어촌인 경우는 과잉급여인 반면에 소규모 가구나 대도시의 경우는 과소급여인 경우가 나타난다. 그 원인은 급여 최대 액인 현행 최저주구비가 중소도시 전세 아파트 4인 가구 기준으로 계측되고, 생계급여와 동일하게 가구균등화 적용을 통해 지급되기 때문이다.