그러나 직무재설계를 통한 직무분리는 2가지의 두드러진 문제점을 드러내었다. 첫째는 분리 노력이 불완전했다는 점이다. 예를 들어 은행 간 금융상품 판매 경쟁이 가열되자 정규직 업무로 간주되는 금융상품 판매를 비정규직 텔러에게도 부담시키는 등 직무 영역간 업무의 혼성이 발생한 경우가 그러하다. 또 다른 중요한 문제는 계약직 형태로 존재하는 대다수의 비정규 직무들이 관련 인력의 기업 내 장기 정착을 통해 숙련이 개발될 수 있는 ‘장기활용형’ 내지 기간(基幹)적 직무에 해당된다는 점이다(권현지, 2007; 김동배, 2004; 정이환, 2005). 따라서 은행 입장에서는 이들의 기업 내 장기 정착을 통한 조직몰입을 유도하는 것이 필요한데 이들의 비정규 고용형태는 이러한 몰입의 유도에 장애물이 되게끔 한다.