군역 제도의 문란에 대한 기술도 문제가 있다. 이 시대 조선은 200년 동안의 장기적 평화로 인해 군역 제도를 초기와 같이 엄격하게 시행하지는 않았다. 이 시기 조선은 명나라와의 관계를 돈독하게 유지하고 있었기 때문에 강력한 정규군을 유지할 필요가 없었다. 또한 조선은 국왕이 절대적인 독재권을 행사하는 국가가 아니고, 국왕과 신하, 백성이 권력을 나누어 가지고 있던 국가였다. 조선 초기와 같이 큰 규모의 상비군을 유지하는 것을 조정과 신하, 백성들이 모두 필요하다고 생각하지 않았고, 백성의 부담을 덜어주기 위해 군역 제도를 엄격하게 시행하지 않고 있었을 뿐이다. 또한 조정은 지역방위를 중심으로 한 진관체제에서 유사시 지방군을 한 곳에 모아 중앙군에 편입하여 전투를 벌이는 제승방략체제로 전환하여 전쟁에 대비하였다(김구진･이현숙, 1999: 100-102).