2008년에는 홍수 피해의 예방과 방지를 위해 내각에서 재해복구사업에 관련된 전력성, 농업성, 체신성, 철도성, 국토환경보호성 등 중앙기관의 재해관련 업무를 통합한 ‘큰물피해방지연합지휘부’를 구성하였고, 각 도, 시, 군에는 ‘큰물피해복구지휘부’를 설립했다(민족통신 2008/07/16; 이근영 2013, 13). 또한 국가적인 홍수 등 자연재해가 발생하면 피해복구 사업과 관련된 내각 조직과 연합하여 한시적으로 ‘큰물피해방지연합지휘부’를 구성하였다. 지역, 지방 단위의 소규모 자연재해와 관련해서는 ‘큰물 피해복구지휘부’ 혹은 ‘도연합지휘부’가 해당 지역의 재해 복구사업을 담당하였다. 2010년 7월 중순에 폭우로 인하여 신흥군을 비롯한 함경남도와 강원도 자강도 개성시 등에 큰 피해가 발생했을 당시 해당지역에서 한시적으로 ‘큰물피해대책지휘부’를 조직 하여 피해복구사업을 진행하였다. 자연재해로부터 입은 피해와 관련한 해외원조 등 외교적 업무를 주로 담당한 ‘큰물피해대책위원회’가 2005년 12월 공식적으로 해체 되었지만, 이후 해외원조보다는 북한의 내각 차원에서 유사한 명칭의 기구를 조직하여 자체적으로 재해복구사업을 진행하는 업무는 지속된 것으로 판단된다.