일본의 방송통신조직은 독립행정위원회 형태보다 정부부처 형태를 유지해 왔다(강만석, 2006). 방송통신융합을 적극적으로 촉진하고 경쟁력 있는 방송통신융합을 육성해야 하는 우리나라 입장에서 본다면, 합의제여서 책임소재가 불명확한 독립행정위원회보다 강력한 리더십 발휘가 가능한 일본의 모델이 시사하는 바가 크다고 할 수 있다. 일본의 방송통신 분야는 급속한 기술혁신을 배경으로 국가간 경쟁이 치열하고 국제적인 대책, 제도개선, 세계 표준을 목표로 한 연구개발 등 국가전략차원에서 종합적이고 전략적이며 신속한 대처가 요구되는 바, 정부부처의 단일조직으로 방송통신을 관할하고 있다. 또한 방송통신융합의 추진 및 관련 산업 육성을 위해서는 정부 관계 부처와의 협력이 절실하게 요구되고 있다. 하지만, 합의제 형태인 위원회 조직으로는 신속한 의사결정은 물론 정부의 관계 부처로부터 협력을 끌어내기 어려운 한계가 존재할 것으로 보인다.