군 상부지휘구조 개편은 2010년 3월의 천안함 폭침과 11월의 연평도 포격으로 군의 대대적인 개혁이 요구되는 분위기에서 핵심적인 개혁과제로 등장하였다. 그의 핵심 내용은 크게 두 가지로 요약할 수 있다. 첫째는 군령권(軍令權, 공식적으로는 “작전지휘권”이라고 하는데 군사작전에서 부대를 운용하는 데 관한 권한이다)만 보유하고 있는 합참의장에게 군정권의 일부까지 부여함으로써 합동성(jointness)을 강화한다는 것이었다. 둘째는 군정권(軍政權, 공식적으로는 “작전지원권”이라고 하는 데 인사, 군수, 동원을 중심으로 하는 군사력 건설과 관리에 관한 권한)만 보유하고 있는 각군참모총장에게 군령권을 추가함으로써 군령과 군정의 통합성을 강화하고 각군참모총장이 자군에서 발생하는 모든 일을 책임지도록 한다는 내용이었다.