첨단기술개발프로그램(ATP)의 프로젝트 추진체제는 다음과 같다.
중소기업의 경우 프로젝트 직접비 100%를 지원받을 수 있으며, 신생창업기업의 경우 개념적으로 총 프로젝트 비용이 프로젝트 직접비라고 볼 수 있기 때문에 총 프로젝트 비용의 100%를 ATP자금으로부터 지원받을 수 있다. ATP사업의 기본개념이 기업의 연구개발활동을 보조하는 개념이 아니라 정부가 공공재라고 할 수 있는 원천기술 개발을 민간부문의 자원을 활용하여 개발 확산하는 개념에 입각하고 있다. 즉, 정부가 해야 할 일을 민간부문의 자원을 활용하여 수행하는 개념이다.
이하에서는 ATP 연구개발(R&D) 여러 추진체제의 대표적 성공사례를 살펴본다.
1)연구개발형 창업중소기업 단독 연구체제
2인 창업기업이 대기업의 후원을 얻어 이온증착기술(broad-beam ion implanting technology)의 수요와 다양한 응용가능분야를 입증시킴으로써 ATP 과제로 선정되고 이후 사업화에 성공한 사례이다. 이 사례의 구조를 그림으로 표현하면 다음과 같다.
2)중견 중소기업 단독 연구체제
새로운 화학물질 및 의약개발분야의 시간과 비용을 획기적으로 단축시킬 수 있는 Density Functional Theory를 개발한 MolecularSimulationInc. (MSI)사가 동 이론은 소프트웨어화 하여 사업화 할 경우 기반기술로 산학연 각계의 커다란 파급효과를 가져올 수 있을 것이라는 사실을 정당화 시켜 ATP의 지원을 받아 성공한 사례이다.