산업 연관성의 정도를 측정하기 위한 유사성 측정은 마셜이 제시한 3가지 집적경제의 원천과 Delgado et al.(2015)의 사례를 따라 투입산출 관계, 직업군의 연관성, 입지적 연관성(고용, 사업체수) 등 세 가지 부문에 주목하되, 데이터의 형태인 유사성 행렬은 다섯 가지를 측정하였다. 우선 투입산출 관계는 산업 간 거래관계나 지식거래에 있어서의 산업간 연관정도를 나타내는 것으로, 산업 간 투입 또는 배분 비중 중 가장 큰 값을 이용하였다. 직업군의 연관성은 마셜의 3가지 집적경제의 원천 중 노동 풀링(labor pooling)을 반영한 것이다. 인력이 기업과 산업 간에 원활하게 이동할 수 있다면 근로자와 사용자 모두 관련비용을 절감할 수 있고 이러한 이득은 노동의 수요와 공급이 특정한 공간에 집적하는 데 중요하게 작용하므로  인력의 산업 간 이동 정도를 측정하여 산업 간의 집적 연관성을 파악한다. 인력의 산업 간 이동 정도는 여러 집적경제 관련 문헌을 참고하여 산업 간 직업군의 유사성을 측정한다. 산업별로 직업군 비중을 알 수 있는 지역고용조사를 이용하여 산업 간 직업군 비중의 상관계수로 이를 측정할 수 있다. 끝으로 입지 연관성은 산업이 특정 공간에 동반 입지하는 데 영향을 끼친 공간적 요인을 반영한 것이며, 실제 현실에서 구현된 입지 패턴을 고려한 것으로도 볼 수 있다. 고용과 사업체수가 다를 수 있으므로 입지 연관성 부문은 각각에 대해 측정하여 이용한다. 한편 개별적인 산업 간 연관성을 측정하기보다는 입지 유사성, 산업 간 거래 유사성, 산업 간 고용 유사성을 평균하여 다차원으로 고려하는 유사성 행렬도 존재할 수 있다. 다차원(multidimensional) 유사성 행렬은 특정 요인의 과다한 개입을 배제하고 관찰되지 않는 산업 간 관련성 등 클러스터 식별에서 나타날 수 있는 편이(bias) 요인을 완화시키기 위해 열거한 유사성 행렬을 평균한 것이다.