La Copa FA de Irak de 1988-89 fue la 12a edición de la Copa FA de Irak. El torneo fue ganado por Al-Zawraa por quinta vez, superando a Al-Tayaran por 3-0 en la final. Las dos primeras rondas fueron entre equipos de la división inferior, antes de que los clubes de primer nivel ingresaran en la ronda de 32.
La Copa FA de Irak de 1988-89 fue el único torneo en el que Al-Tayaran fue derrotado.