Ella es principalmente conocida por sus papeles protagónicos en Phoebe in Wonderland, Somewhere, We Bought a Zoo, Ginger and Rosa, Maléfica, y The Neon Demon. Ginger & Rosa es una película dramática de 2012 escrita y dirigida por Sally Potter y distribuida por Artificial Eye. Maléfica es una película de fantasía oscura estadounidense de 2014 dirigida por Robert Stromberg en un guión de Linda Fan Woolverton.
Elle Fanning protagonizó una película dirigida por Abraham Lincoln.