Stuart Murdoch (nacido el 2 de septiembre de 1955) es un entrenador de fútbol. Es quizás mejor conocido por su período como entrenador de Wimbledon entre mayo de 2002 y junio de 2004, tiempo durante el cual el equipo se mudó a Milton Keynes en 2003. Wimbledon pasó a llamarse Milton Keynes Dons por el nuevo propietario en 2004 y Murdoch permaneció a cargo hasta noviembre de ese año.
El nuevo propietario del Wibledon mantuvo el nombre tal como estaba.