G.I. Joe: Ninja Battles es una película que fue lanzada en DVD a finales de 2004, como parte del conjunto de figuras de Ninja Battles. En ella, la historia del Clan Arashikage, así como la historia de la rivalidad de Snake Eyes y Storm Shadow, se examinan a través de una serie de pruebas. Se utilizan escenas de "" y "", con un breve período de nueva animación al final de la película.
G.I. Joe: Ninja Battles fue un DVD muy popular.