Cuando Ulysses S. Grant fue elegido Presidente en 1868, nombró a Fish como Secretario de Estado de los Estados Unidos en 1869. Ulysses S. Grant. Cuando Grant confió en su Secretario de Estado Hamilton Fish, su administración resolvió con éxito las reclamaciones de Alabama por el Tratado de Washington con Gran Bretaña, poniendo fin a las tensiones en tiempos de guerra. Además, Grant y Fish evitaron la guerra con España por el asunto Virginius.
Hamilton Fish trabajó con Ulysses S. Grant.