El tema musical de la serie, compuesto por Ramin Djawadi, fue nominado para un Premio Primetime Emmy en 2006. Prison Break fue nominado para varios premios de la industria, incluido el Globo de Oro 2005 a la Mejor Serie de Televisión Drama y el Premio People's Choice 2006 a Mejor Nuevo Drama de TV, que ganó.
Prison Break ganó un premio.