Pertwee es más conocido por protagonizar como el Tercer Doctor en la serie de ciencia ficción Doctor Who entre 1970 y 1974. Pertwee también pasó 18 años (1959-1977) interpretando al suboficial jefe Pertwee en The Navy Lark en BBC Radio. Más tarde interpretó el personaje principal en la serie Worzel Gummidge de 1979 a 1981, y nuevamente de 1987 a 1989.
Jon Pertwee participó en una serie de televisión.