Su trabajo cinematográfico incluye la escritura y dirección de la película de animación de Pixar A Bug's Life (1998) (como co-director), Buscando a Nemo (2003), y WALL-E (2008), y la película de acción en vivo, John Carter (2012) de Disney. También fue nominado a tres premios de la Academia de Juguetes por Mejor Guión Original, por Buscando a Nemo, WALL-E.
Andrew Stanton trabajó en más de una película de Disney.