La quinua se originó en la región andina del Perú, Bolivia, Ecuador, Colombia y Chile, y fue domesticada hace 3.000 a 4.000 años para el consumo humano en la cuenca del lago Titicaca del Perú y Bolivia, aunque la evidencia arqueológica muestra una asociación no domesticada con pastoreo hace 5.200 a 7.000 años.
La quinoa nunca fue domesticada.