Gromacs, Molecular Dynamics, Life Sciences, Google Cloud Platform, Bioinformatics.
GROMACSは、分子動力学(MD)のためのオープンソースのソフトウェアです。主に研究機関や創薬などの分野で、原子や分子の動きをシミュレーションして分析することができるとても人気のあるツールです。ただ、GROMACSを動かすためにリッチなスペックのサーバを使い続けるのはコストがかかります。一度だけGROMACSのコンテナイメージを作成しておけば、あとは、必要な時に瞬時に実行できるようになり、MDの重い処理を高速化し、ムダなコストを削減することもできます。 なお、本記事は完全な操作手順の記録ではなく、一部の手順については省略しています。 Steps