Á efri hæð hússins er Hallsteinssalur þar sem settar eru upp tímabundnar sýningar , oft listsýningar en einnig byggðasýningar af ýmsum stærðum og gerðum . Ýmis minni verkefni er stuðla að miðlun menningararfs og safnfræðslu eru á dagskrá Safnahúss árlega . Má þar nefna þátttöku í sameiginlegum verkefnum safna á landsvísu , sumarlestur barna og ýmsar leiðir til kynningar á borgfirskum bókmenntaarfi . Safngeymslur eru á þremur stöðum , í geymsluhúsi við Sólbakka og í aðstöðu grófari muna í Brákarey auk geymslulofts í Safnahúsinu sjálfu .