Til að uppfylla markmið grunnskólalaga og Aðalnámskrár þurfa kennsluhættir að vera fjölbreyttir og sífellt þarf að hafa í huga að mæta þörfum hvers og eins nemenda . Í Vatnsendaskóla er lögð rík áhersla á fjölbreytta kennsluhætti og einstaklingsmiðað nám . Áhersla er lögð á umhverfis - , rannsóknar - og vettvangsnám . Kennarar árgangsins bera sameiginlega ábyrgð á nemendum og vinna saman að því að skipuleggja nám nemenda . Þetta fyrirkomulag stuðlar að sveigjanleika og býður upp á möguleika að breyta hópum í samræmi við viðfangsefni og aukna samkennslu þar sem það á við . Ýmsar leiðir eru færar til að þjálfa nemendur í þessum þáttum en farsælast teljum við að starfið í skólanum bjóði upp á það mikla samvinnu nemenda að þau þjálfist í þessum þætti í gegnum raunveruleg viðfangsefni . Sameiginleg ábyrgð á námi og líðan nemenda er grunnurinn í stefnu skólans . Vatnsendaskóli leggur áherslu á mikilvægi heimanáms sem í upphafi skólagöngu felst aðallega í aukinni þjálfun í lestri . Skráning á heimalestri í Mentor Umsjónarkennari fylgist með ástundun nemenda í heimalestri og vinnur eftir ákveðnum verklagsreglum í því sambandi . Ef ástundun batnar ekki þrátt fyrir samtal við foreldra boðar umsjónarkennari til fundar . Ef ástundun batnar ekki þrátt fyrir ítrekuð tilmæli boðar umsjónarkennari til fundar með skólastjórnendum .