Ikkinchi jahon urushi yillarida ham ko'plab qiyinchiliklarga qaramay, Fassmer o'z faoliyatini to'xtatmadi. Bu vaqt ichida Fassmer lug'at maqolalarini tayyorlashdan tashqari, slavistika bo'yicha ishlarni yozishni va kafedrada o'qishni davom ettirdi (1945 yil fevral oyigacha mashg'ulotlar olib borildi). Uning shu davrdagi asarlari orasida Gretsiyadagi slavyanlar (Die Slaven in Griechenland, 1941), Rossiya aholisining eski o'zaro munosabatlari (Die alten Bevölkerungsverhältnisse Russlands, 1941), Serb-xorvat tilida yunoncha o'zlashtirishlar (Griechische Lehnwörter im Serbokroatischen, 1944) va boshqalar mavjud.
Fassmer qaysi yilda o'z asarini yozgan: Slavlar Gretsiyada?
1941