1458 yilda shaharni turklar bosib olishdi va u Usmonli imperiyasining bir qismiga aylandi. Shahar aholisi imperiya qulaganidan so'ng, hayot sharoitlari yomonlashgani sababli kamaygan. Shaharning ko'pgina tumanlari (shu jumladan, qadimiy binolar) XVII-XIX asrlar davomida yo'q qilingan, shahar esa bir nechta guruhlar tomonidan nazorat qilingan. Bu davrda Turkiya va Venetsiya Respublikasi o'rtasidagi tez-tez bo'lib o'tgan urushlar ham Afinaga salbiy ta'sir ko'rsatdi. Masalan, Venetsiya generalining Franchesko Morozini qo'shinlari tomonidan shaharga hujum paytida 1687 yil 22 sentyabrda Venetsiya artilleriyasi Parfenonni vayron qildi.
Parfenonni vayron qilishda Venetsiyaning qaysi generali ishtirok etgan?
Franchesko Morozini