Vazari Rafael odatdagidan ham ko'proq axloqsiz vaqt o'tkazgandan so'ng vafot etganini yozgan, ammo zamonaviy tadqiqotchilar uning o'limining sababi rassom qazilmalarni ziyorat qilish paytida yuqtirgan Rim isitmasi bo'lgan deb taxmin qilishadi. Raffael Rimda 6 aprel 1520 yil 37 yoshida vafot etdi. Pantteonda dafn etilgan. Uning qabrida epitafiya mavjud: Bu erda buyuk Rafael xotirlanadi, uning hayotida tabiat mag'lub bo'lishdan qo'rqardi, uning o'limidan so'ng esa o'lishdan qo'rqardi (lat. Ille hic est Raffael, timuit quo sospite vinci, rerum magna parens et moriente mori) - bu Raffaelning "Qo'rqib qo'yilgan, o'lgan, katta ota-onasini ko'rgan va o'lganini ko'rgan" (Rafaelning "Qo'rqib qo'yilgan, katta ota-onasini ko'rgan va o'lganini ko'rgan") kitobi.
Rafael Santi vafot etgan sana.
6 aprel 1520 yil