Белоктардың қабатталу принциптерін зерттеу екінші құрылым деңгейі мен атомдық кеңістіктік құрылым арасында тағы бір деңгейді - қабатталу мотивін (архитектура, құрылымдық мотив) бөліп көрсетуге ыңғайлы екенін көрсетті. Қабатталу мотиві екінші құрылым элементтерінің (α-спиральдер мен β-ауырлықтар) компактті глобуланың  ақуыз доменінің шегінде өзара орналасуымен анықталады, ол өздігінен немесе басқа домендермен бірге үлкен ақуыз құрамына кіруі мүмкін. Мысалы, белоктардың құрылысының бір ерекшелігін қарастырайық. Оң жақтағы суретте бейнеленген глобулярлы белок, триозофосфатизомераза, α/β-цилиндр деп аталатын қабаттау мотиві бар: 8 параллель β-теңге тағы бір цилиндрдің ішінде β-цилиндрін құрайды, ол 8 α-спиральден тұрады. Бұл үлгі ақуыздардың шамамен 10%-ында кездеседі.
Қосалқы құрылымның қандай элементтері және олардың орналасуы қабаттау мотивін анықтайды?
α-спиральдер мен β-ауырлықтар