1728 жылдың тамызында Линней Юхан Ротманның кеңесімен 1474 жылы құрылған үлкен және ескі Уппсаль университетінің қатарына ауысады. Бұл жерде медицинаны зерттеуге мүмкіндіктер көп, бұл ретте дәрістерді медицинаның екі танымал профессоры, Улоф Рудбек-кіші (1660-1740) және Ларс Руберг (1664-1742) оқыды. Линнейдің үй ішіндегілердің оған көмектесуге мүмкіндігі болмағандықтан, оның оқудың алғашқы кезеңіндегі материалдық жағдайы өте ауыр болды. Оқыту деңгейіне келсек, ол Лунд және Уппсал университеттерінде де өте жоғары емес еді, студенттер көп уақытты өз бетінше білім алумен айналысты. Уппсаль университетінде Линней өзінің теңдесі, студент Петеро Артедимен (17051735) танысады, олар сол кездегі табиғи-тарихи жіктелімдерді сыни қайта қарау бойынша жұмысты бастады. Линней негізінен өсімдіктермен, Артеди  балықтармен, су-жер амфибияларымен және шатыр өсімдіктерімен айналысты.
Балық, су асты амфибиялары мен қосалқы өсімдіктермен айналысқан.
Артеди