法庭就47人初選案裁決後，特首李家超指這顯示法庭確定本案的罪行，旨在破壞、摧毀或推翻《基本法》和「一國兩制」方針確立的現行特區政治制度和架構，而45人被定罪亦顯示犯罪計劃的規模和嚴重性。他又稱，特區政府會全力防範、制止和懲治危害國家安全的行為和活動，「履行這天經地義的責任。」
保安局長鄧炳強昨午見傳媒時，批評犯罪者出賣香港，為達到個人政治目的而不理香港市民死活，「極其醜惡、醜陋和惡毒。」被問到今次是否政府勝利時，他表示案件中沒有「勝者」，只是避免了港人受害，又形容這是個悲傷的故事。
警方國安處總警司李桂華則在法院外回應案件，稱歡迎法庭的裁決，形容是對被告的當頭棒喝，又稱47人當中有45人成功被定罪，認為警方調查質素相當高。另外，他指根據《國安法》賦予的權力，需要待調查完結才可向各未遭起訴的被調查人士發還護照。