Mozaik ve fresklerin korunması, kiliseden camiye dönüştürülmesi sırasında, içindeki Hristiyanlık sembolleri, yazılar, freskolar ve mozaikler ince bir boya ve kireç badanası ile örtülerek yapıyı tahrip etmeden korunmuştur. Bu sayede, bu eşsiz sanat eserleri günümüze kadar ulaşabilmiştir.