Được biết, ông sinh 1936, quê quán ở Bình Định. Ông tốt nghiệp ĐH ngành Nga văn tại Trường ĐH Sư phạm Hà Nội năm 1968.
Ngay sau khi có bằng cử nhân, ông trở thành cán bộ giảng dạy cho bộ môn ngôn ngữ học của khoa ngữ văn, Trường ĐH Tổng hợp Hà Nội. Đến năm 1977, ông được cử làm phó hiệu trưởng Trường ĐH Tổng hợp TP.HCM.
Ông nhận bằng tiến sĩ Ngữ văn tại Trường ĐH Tổng hợp Hà Nội năm 1981.
Năm 1984, nhà giáo Bùi Khánh Thế được công nhận chức danh Phó Giáo sư và Giáo sư năm 2004. Ông được phong tặng danh hiệu Nhà giáo Ưu tú năm 1995 và danh hiệu Nhà giáo Nhân dân năm 2000.
Ông cũng là người đã đặt nền móng đầu tiên cho Khoa Đông Phương Học của Trường ĐH KHXH & NV từ năm 1994. Cả một đời của ông luôn tận tụy cống hiến cho ngành Giáo dục và ngành Ngôn ngữ học Việt Nam. Các hướng nghiên cứu chính của ông là Ngôn ngữ học tiếp xúc, Ngôn ngữ các dân tộc thiểu số (ngôn ngữ các tộc người) Việt Nam.
Với nhiều thế hệ nhà giáo, học trò, ông luôn là người thầy đáng kính, tâm huyết, tinh thần tự học cao, có bản lĩnh nghề nghiệp với trình độ chuyên môn rộng và sâu. Ông luôn là tấm gương sáng với bốn chữ "khổ học thành tài" cho bao thế hệ học trò, đồng nghiệp.
Thông tin Lễ tang
Theo thông tin từ gia đình, sau khi mất, linh cữu của GS.TS, Nhà giáo nhân dân Bùi Khánh Thế được quàn tại Nhà tang lễ Bệnh viện Thống Nhất (số 1, đường Lý Thường Kiệt, quận Tân Bình, TP.HCM)
Lễ nhập quan vào lúc 16 giờ ngày 2-4. Lễ viếng sẽ từ 6 giờ sáng ngày 3-4.
Lễ động quan vào lúc 6 giờ ngày 5-4. Linh cữu sẽ được đưa đi hỏa táng tại Trung tâm hỏa táng Bình Hưng Hòa.