Giải diễn ra gồm 12 CLB gồm Việt Nam, Thái Lan, Indonesia, Malaysia mỗi quốc gia có hai đội vô địch quốc gia và vô địch Cúp Quốc gia dự; Philippines, Singapore mỗi quốc gia có một đội vô địch quốc gia tham dự; còn lại hai đội sẽ là đại diện của Myanmar, Lào, Brunei, Campuchia đá vòng sơ loại để chọn ra hai suất tham dự.
Giải kéo dài từ ngày 14-7-2024 đến 21-5-2025, có tổng cộng 40 trận. 12 đội được chia làm hai bảng thi đấu vòng tròn hai lượt đi, về tính điểm mỗi bảng chọn hai đội nhất, nhì vào bán kết và chung kết cũng theo lượt đi và lượt về.
Trong quá khứ AFF cũng từng tổ chức giải Cúp C1 Đông Nam Á này rồi, cụ thể là từ năm 2003 đến 2005. Giải đầu tiên vào năm 2003 đá tập trung tại một quốc gia trên sân chính Bung Karno và vài sân phụ cận quanh thủ đô Jakarta của Indonesia. Lần đó khách mời là Đông Bengal của Ấn Độ và đội khách mời đã vô địch giải này. Đại diện Việt Nam năm đó là HA Gia Lai tham dự sau khi vô địch V-League 2003. Lần cuối giải này là năm 2005 diễn ra ở Brunei và đại diện Việt Nam dự là Đồng Tâm Long An.