Thời gian qua, quá trình lựa chọn nhà thầu còn kéo dài, do thành viên tổ chuyên gia và tổ thẩm định còn sai sót dẫn tới phải kiểm tra và chỉnh sửa hồ sơ nhiều lần. Các cá nhân trực tiếp tham gia hoạt động đấu thầu tại các đơn vị (đặc biệt là các đơn vị trường học, bệnh viện) còn hạn chế về kinh nghiệm và kỹ năng xử lý các tình huống.
Năm 2023, TPHCM thực hiện 5.833 gói thầu thuộc các dự án sử dụng vốn nhà nước, tiết kiệm được cho ngân sách hơn 472 tỷ đồng. Trong đó, 4.552 gói thầu tổ chức không qua mạng, 1.281 gói thầu tổ chức qua mạng. Hiện nay, TPHCM đang thực hiện đấu thầu qua mạng theo lộ trình.
Tuy nhiên việc này có nhiều vướng mắc, chủ yếu do hệ thống mạng đấu thầu quốc gia còn nhiều bất cập. Tới đây, TPHCM tập trung hoàn thiện, nâng cấp hệ thống hạ tầng kỹ thuật, phấn đấu đảm bảo 100% các đơn vị có đủ điều kiện áp dụng phương thức đấu thầu qua mạng.