Luego de la polémica y repudio generalizado que despertó con su apoyo al aumento de sueldos de los senadores y su posterior justificación, Martin Lousteau recibió una nueva mala noticia: junto al entonces diputado Emiliano Yacobitti, actual vicerrector de la UBA fue denunciado en los tribunales de Comodoro Py.
En abril de 2023, desde El Disenso expusieron la polémica contratación de la consultora LCG SA para la venta de informes y proyecciones, que habrían sido solicitados por la Oficina de Presupuesto del Congreso.
La causa, donde se investiga a ambos funcionarios por "negociaciones incompatibles con la función pública", quedó registrada bajo el número 1508/2024 siendo asignada al Juzgado Federal 11, subrogado por el juez Julián Ercolini, con la investigación a cargo de la fiscalía 6 subrogada por el Dr Rívolo.