El eminente Rafael Ayala Echávarri, considerado personaje ilustres del estado de Querétaro, destacó por sus aportes a la historiografía de la entidad. Nació en San Juan del Río el 19 de septiembre de 1909. Hijo del matrimonio formado por don Severino Ayala y doña María Echávarri. Sus primeros años de infancia los desarrollo en su ciudad natal en donde estudió la primaria hasta el cuarto año para seguirla en la Ciudad de México, a la que se trasladó con su familia, eso le permitió llegar a concluir sus estudios y convertirse en Cirujano Dentista, obteniendo el título de la Escuela Nacional de Odontología de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) en 1937.
A la edad de 30 años, el 20 de febrero de 1939, contrajo matrimonio con la señorita Guadalupe Valenzuela García en la parroquia de San Juan del Río. De dicho matrimonio se procrearon tres hijos: María Enriqueta, Rafael y José Manuel.
Entre 1945 y 1958, de esta escuela fue catedrático, director, consejero universitario y secretario.
En junio de 1963, el secretario general de la Escuela Nacional de Odontología le dirigió un memorándum con las siguientes palabras: "Por el presente me permito comunicarle que hemos tenido el honor de nombrarlo Asesor Técnico de la Biblioteca de la Escuela Nacional de Odontología, en reconocimiento a sus méritos que sobre esta materia ha demostrado usted durante su vida profesional (…)"
Durante los años 1966-1969, fue asesor técnico del Instituto Mexicano del Seguro Social y de la Secretaría de Educación Pública, Sección Higiene Escolar. Para 1968 fue nombrado Socio Fundador del Colegio Nacional de Cirujanos Dentistas.
Para mayo de 1970, recibió el maestro Ayala diploma de manos del Dr. Pablo González Casanova, Rector de la UNAM, por cumplir veinticinco años en el interior del cuerpo docente de las Facultades y Escuelas Universitarias. Su vida en el ámbito académico, no solamente se desarrolló en la Ciudad de México, sin no en varias universidades del país y del extranjero. Así lo hacen constar la Escuela de Odontología de Veracruz; la Escuela de Odontología de la Universidad de Mérida, Yucatán; la Escuela de Odontología de la Universidad Autónoma del Estado de México, con sede en Toluca; la Facultad de Humanidades de la Universidad de Texas, Dental Branch Houston, Texas; y la Escuela de Odontología de la Universidad de Oakland, California.
En su juventud decidió compaginar su vida profesional con el apasionado estudio de la historia, principalmente la del estado de Querétaro, enfocado a investigar sobre su terruño, San Juan del Río.
Como historiador, Rafael Ayala alcanzó alturas gigantescas. Ingresó a la Sociedad Mexicana de Geografía y Estadística como Socio Activo, el 9 de septiembre de 1941. Su pluma fue infatigable y acuciosa, es uno de los queretanos que se ha distinguido por su amor a la Patria Chica. Trabajó incansablemente durante años por reunir toda clase de materiales que se refieran a la historia y la geografía de su tierra natal. Fue un investigador acucioso, perseverante y sereno, lo que le permitió cubrir con sus estudios una etapa importante y desconocida de la historia de San Juan del Río. En 1971, presentó una breve historia de su tierra sanjuanense, escrita con la unción y el cariño que siempre le profesó. Dejó plasmado en su historia lo trascendental, los momentos de grandes vivencias sociales, su economía a través de los siglos, sus calles; en fin, la historia más completa que se haya escrito de San Juan del Río hasta ese momento. Este libro sigue siendo tan actual como cuando fue escrito. Tuvo dos ediciones más en 1981 y en 2006.
Rafael Ayala fue oficialmente nombrado primer cronista de San Juan del Río, y así lo fue también el primero en todo el estado de Querétaro.
Ayala, pasaba mayormente la vida en la Ciudad de México, aunque esporádicamente visitaba a familiares en San Juan del Río. En ocasiones comentaba que quería morir en su tierra natal. Así, el sábado 24 de marzo de 1973, durante un viaje corto a esta ciudad, el ilustre maestro y bondadoso amigo, Dr. Rafael Ayala Echávarri, falleció en San Juan del Río, de un infarto que le sobrevino en la esquina de Av. Juárez y 16 de Septiembre.