प्रसंग: कपास का एक सार्वजनिक जीनोम अनुक्रमण प्रयास 2007 में सार्वजनिक शोधकर्ताओं के एक संघ द्वारा शुरू किया गया था। वे खेती किए गए, टेट्राप्लॉइड कपास के जीनोम को अनुक्रमित करने की रणनीति पर सहमत हुए। "टेट्राप्लॉइड" का अर्थ है कि खेती की गई कपास के नाभिक के भीतर वास्तव में दो अलग-अलग जीनोम होते हैं, जिन्हें ए और डी जीनोम के रूप में संदर्भित किया जाता है। सीक्वेंसिंग कंसोर्टियम पहले खेती की गई कपास (जी. रायमोंडी, एक जंगली मध्य अमेरिकी कपास प्रजाति) के डी-जीनोम सापेक्ष को इसके छोटे आकार और सीमित संख्या में दोहराए जाने वाले तत्वों के कारण अनुक्रम करने के लिए सहमत हुआ। यह टेट्राप्लॉइड कपास (एडी) के आधारों की संख्या का लगभग एक तिहाई है, और प्रत्येक गुणसूत्र केवल एक बार मौजूद होता है। [स्पष्टीकरण की आवश्यकता] जी. अर्बोरियम के ए जीनोम को अगले क्रम में अनुक्रमित किया जाएगा। इसका जीनोम जी. रायमोंडी के आकार से लगभग दोगुना है। दो जीनोम के बीच आकार में अंतर का एक हिस्सा रेट्रोट्रांसपोसन (जी. ओ. आर. जी. ई.) का प्रवर्धन है। एक बार जब दोनों द्विगुणित जीनोम इकट्ठा हो जाते हैं, तो शोध खेती की गई कपास की किस्मों के वास्तविक जीनोम का अनुक्रमण शुरू कर सकता है। यह रणनीति आवश्यकता से बाहर है; यदि कोई मॉडल द्विगुणित जीनोम के बिना टेट्राप्लॉइड जीनोम का अनुक्रम करता है, तो एडी जीनोम के यूक्रोमेटिक डीएनए अनुक्रम सह-इकट्ठा होंगे और एडी जीनोम के दोहराए जाने वाले तत्व स्वतंत्र रूप से इकट्ठा होंगे। ए और डी अनुक्रम क्रमशः। दो जीनोम के बीच आकार में अंतर का एक हिस्सा रेट्रोट्रांसपोसन (जी. ओ. आर. जी. ई.) का प्रवर्धन है। एक बार जब दोनों द्विगुणित जीनोम इकट्ठा हो जाते हैं, तो शोध खेती की गई कपास की किस्मों के वास्तविक जीनोम का अनुक्रमण शुरू कर सकता है। फिर एडी अनुक्रमों की गड़बड़ को उनके द्विगुणित समकक्षों से तुलना किए बिना उजागर करने का कोई तरीका नहीं होगा।

सवाल: टेट्राप्लॉइड रूपों को समझने के लिए, कपास जीन अनुक्रमण में तुलना के रूप में क्या उपयोग किया जाना चाहिए?

उत्तर: द्विगुणित समकक्ष