59) GTTG ( 34) GTGTT ( 22) AGGGTT ( 9) AG ( 480) CAC ( 52) CAAC ( 30) TAGCG ( 21) GGGTTA ( 9) GA ( 327) CAA ( 50) TACA ( 14) CGCTA ( 15) AACCCT ( 7) AT ( 322) TGG ( 37) AAAC ( 9) CTACG ( 7) CCCTAA ( 6) CT ( 297) TGT ( 37) ATGT ( 8) GTTGT ( 7) CCTAAC ( 6) 
P. graminis tritici AG ( 604) CAA ( 145) TTTC ( 9) AACAA ( 22) TGTTGG ( 9) TC ( 568) GTT ( 107) AAAG ( 6) TTTTG ( 14) AT ( 409) TGT ( 99) GAAA ( 6) AAAAG ( 8) CT ( 397) TGA ( 84) ACAAC ( 8) GA (391) AAC ( 82) TGTGT (8) *Number in parenthesis represents the occurrence of repeat motifs. 44) AAAC ( 99) ATTGT ( 63) GGGTTA ( 55) CA ( 174) TAC ( 41) CGTA ( 86) ACACA ( 51) TTAGGG ( 45) AC ( 172) ACA (37) GAAA ( 81) GTGTT ( 50) GGGTTA ( 43) AC ( 168) TAG (37) TACA ( 77) AAAAT ( 46) GGGTTA ( 42) GT ( 135) CTC ( 36) ACGT ( 75) TGTGT ( 41) GGGTTA ( 40) 
P. graminis tritici TG (62) AAC ( 48) AGAA ( 78) TTGTT ( 70) TTTTTC ( 45) TC ( 48) TGT ( 45) CAAT ( 72) AATAA ( 67) CCAGCA (34) GT ( 48) ATC ( 36) TGAT ( 66) AGAAA ( 59) AACCCT (34) GT ( 40) AAG ( 35) AGAA ( 64) TTTTG ( 58) TTTCTT ( 33) CT ( 39) AAT ( 30) GAAA ( 49) CTTTT ( 54) AAAACA (28) *Number in parenthesis represents the number of repeats in longest SSR 

Table 2 :

 2 Relative abundance and density* of SSRs in genome of P. triticina and P. graminis tritici 


	Organism	Di	Tri	Tetra	Penta	Hexa	Total
	P. triticina	19.17 (310) 7.21 (163) 1.18 (62) 1.08 (73) 0.72 (66) 29.36 (674)
	P. graminis tritici 40.46 (618) 21.42 (456) 1.50 (62) 1.85 (152) 0.53 (34) 65.76 (1322)
	*Relative density of SSR (in paranthesis)				

Table 3 :

 3 Most frequent SSR motifs* in genome of P. triticina and P. graminis tritici 


	Organism	Di	Tri	Tetra	Penta	Hexa
		TC (517)	CAG (			
	P. triticina					

Table 4 :

 4 Longest SSR motifs* in genome of P. triticina and P. graminis tritici 


	Organism	Di	Tri	Tetra	Penta	Hexa
		CA (232) TAC (			
	P. triticina