Because of his prudent and strict manner, the temple was still not completely restored when he died, more than 30 years after he began the project.
民國卅六年，也就是李梅樹四十六歲時，祖師廟董事會決定大規模重建此廟，並公推李梅樹負責此事。他基於熱愛桑梓的心情，接下了這個重任，於是，他開始以一個藝術家的嚴苛要求，重新設計規畫，期使它成為一座融合中國歷史、文化和寺廟藝術的殿堂。