The museum wrapped up its work on the ship and published a paper on it in 1998. It followed this in 2000 with a cross-strait underwater archaeology conference and General No.
史博館於 1998 年完成任務、出版考古報告，並於 2000 年在澎湖當地舉辦兩岸水下考古研討會及將軍一號沉船文物展。2002 年，馬公港內也傳出疑似埋有沉船，史博館擬訂計畫呈報教育部申請水下考古核准，但遭到擱置。