There are also 114 species of birds, of which 14 are endemic, 250 species of butterfly, 27 reptiles and 13 amphibians.
玉山地區的鳥類有一一四種，其中有十四種是台灣特有鳥類，佔全台灣鳥類的 87.5 %，並且還有七種瀕臨滅絕的鳥種。此外，玉山還有四七八種蝴蝶、廿七種爬蟲類、十三種兩棲類…… 等，其中尤以鳥類中的帝雉、藍腹鷳、爬蟲類的台灣山椒魚、楚南氏山椒魚最為珍貴。