2023年2月の12日目まで、サンマルコス国立大学の最高の地位は、ジェリグロリアラモンラフナーデベガ（学長）、カルロスカブレラカランザ（学部副学長）、ジョセニニョモンテロ（研究と研究のための副首相）によって占有されています。大学院）。つまり、彼らは大学内の決定力の多くを処理します。しかし、学生は、自分の権利を擁護し、大学の生活に影響を与える力を与える学生のさまざまな連合と会衆を自由に自由に利用しています。これらの学生組織の例は、サンマルコス大学連盟です。
A día doce de febrero de 2023 los cargos más altos de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos son ocupados por Jeri Gloria Ramón Ruffner de Vega (rectora), Carlos Cabrera Carranza (vicerrector de pregrado) y José Niño Montero (vicerrector de investigación y posgrado). Esto es, ellos manejan gran parte del poder de decisión dentro de la universidad. Sin embargo, los estudiantes tienen a su disposición diversas federaciones y congregaciones de alumnos que defienden sus derechos y les otorgan el poder para influir en la vida universitaria. Un ejemplo de estas organizaciones estudiantiles es la Federación Universitaria de San Marcos.