相同性モデリングはアミノ酸配列の比較に基づいていますが、アルファフォールドアルゴリズムはタンパク質構造に関するデータで訓練された人工ニューロンネットワークに基づいています。どちらの方法にも利点と制限がありますが、Alphafoldは、タンパク質の3次元構造を予測するための非常に強力で正確なツールであることが証明されています。
El modelado por homología se basa en la comparación de secuencias de aminoácidos, mientras que el algoritmo de AlphaFold se basa en una red neuronal artificial entrenada con datos sobre estructuras de proteínas. Ambos métodos tienen sus ventajas y limitaciones, pero AlphaFold ha demostrado ser una herramienta muy potente y precisa para predecir la estructura tridimensional de las proteínas.