最も一般的なメタボローム解析技術には、核磁気共鳴分光法（NMR）、質量分析（MS）、液体クロマトグラフィ（LC）が含まれます。ただし、使用される手法は、分析しているサンプルのタイプ、必要な詳細レベル、および分析を実行するために必要な機器と専門家の可用性にも依存します。したがって、最も適切な分析手法の選択は、問題のケースの一連の特定の要因に依存します。
Le tecniche d'analisi metabolomiche più comuni includono la spettroscopia di risonanza magnetica nucleare (NMR), la spettrometria di massa (MS) e la cromatografia liquida (LC). Tuttavia, le tecniche utilizzate dipendono anche dal tipo di campione che si sta analizzando, dal livello di dettaglio richiesto e dalla disponibilità delle strumentazioni e degli esperti necessari per effettuare le analisi. Pertanto, la scelta della tecnica d'analisi più indicata dipende da una serie di fattori specifici del caso in questione.