Dopo la buona esperienza in Formula Opel il tedesco passò alla Formula 3 nel 1989, in cui si dovette misurare con l'austriaco Karl Wendlinger e Michael Schumacher, terminando poi secondo a pari punti con il connazionale tedesco. ###>However, Schumacher did not get the Formula One test drive anyway; Karl Wendlinger won the German Formula 3 Championship and Frentzen became joint runner-up with Schumacher (the two finishing on identical points totals).