LABORATORIO BIOINFORMÁTICA UNIVALLE - COLOMBIA
#julioprofe presenta un interesante proyecto que se apoya en las matemáticas y otras disciplinas relacionadas: el Laboratorio de Bioinformática y Biocomputación de la Universidad del Valle (en Cali, Colombia), cuyos integrantes trabajan en la caracterización de una enfermedad que afecta a muchas mujeres en el suroccidente colombiano, como es el cáncer de seno.

Sitio web del proyecto → http://eiscapp.univalle.edu.co/omicas/

En Facebook → https://www.facebook.com/LabBioinformaticaUnivalle/

Producción del video: octubre de 2018


REDES SOCIALES DE JULIOPROFE

Facebook → https://www.facebook.com/julioprofenet
Twitter → https://twitter.com/julioprofenet
Instagram → https://www.instagram.com/julioprofenet

SITIO OFICIAL → https://julioprofe.net/
 Hola, ¿qué tal? Con frecuencia nos hacemos la pregunta ¿para qué sirven las matemáticas? ¿En qué situaciones cotidianas o profesionales se aplica todo eso que aprendemos en el colegio o la universidad? Pues bien, en esta ocasión quiero ayudar a responder esa pregunta presentándoles un proyecto muy interesante que se apoya en las matemáticas y otras disciplinas relacionadas. Bienvenidos. Hoy visitamos el laboratorio de bioinformática de la Facultad de Engenerías de la Universidad del Valle, donde un grupo de expertos están utilizando las matemáticas y la computación para estudiar el genoma humano, el libro de la vida, y asimismo indagar sobre una terrible enfermedad que afecta a las mujeres en Colombia, como lo es el cáncer de mama. Bienvenidos. Hola, soy Pedro Moreno, el coordinador de este proyecto de investigación entre la Universidad del Valle y la Universidad del Cauca. Nosotros estamos trabajando en cáncer mamario. Este proyecto es financiado por la gobernación del Valle y por el sistema general de regalías. Es aproximadamente 3.2 millones de pesos, de los cuales nosotros nos dan aproximadamente 1.5 millones de pesos. Y el objetivo general del proyecto consiste básicamente en recopilar una muestra significativa de pacientes, más de 300 mujeres, que padecen cáncer mamario con sus respectivos controles y poder identificar en ellas mutaciones en su genoma y que puedan permitir llevarnos a nosotros a saber cuáles de estas son patogénicas y discriminarlas de aquellas que no lo son. Con estas mutaciones identificadas de patogénicas, nosotros lo que queremos hacer más adelante es un sistema de diagnóstico para que se convierta en una herramienta preventiva y poder entonces predecir a tiempo la presencia o ausencia de una mutación que pueda conducir a un cáncer mamario. Este es un problema de salud pública muy grave y nosotros hemos conformado un equipo de investigación que a lo largo de este video ustedes podrán observar. El objetivo principal del proyecto, como les decía, es identificar estas mutaciones en estas 300 y pico de pacientes. Básicamente lo que nosotros hacemos aquí en este trabajo es ir a las clínicas y a los hospitales, identificar a los pacientes y tomarse la información de la historia clínica a través de un consentimiento informado y avalado por un comité de ética y con base en esa información obtener las muestras ya sea de tumor mamario fresco, ya sea de las láminas de parafina que algunas de estas pacientes también puedan tener o estén en los bancos de patología. Una vez nosotros tengamos esas muestras lo que nosotros hacemos es traerlas al laboratorio, es traer el ADN, el ácido desoxiribonucleico y con base en unas técnicas de secuenciación secuenciado por tecnologías NGS, de lo cual más adelante va a hablar alguien más de nuestro equipo, y hacer un análisis bioinformático. El análisis bioinformático consiste básicamente en utilizar toda una serie de herramientas, de algoritmos, de matemática y de estadísticas y de computación al mismo tiempo, lo cual nos va a permitir a nosotros identificar esas mutaciones de las cuales estamos nosotros interesados en que sean las informativas y las diagnósticas de patogenicidad. Hola, mi nombre es Miguel Guevara, soy integrante del grupo de investigación en bioinformática y biología computacional de la Universidad del Valle. Cuando nos enfrentamos a un proyecto de secuenciación masiva, como el que estamos haciendo en la implementación de la plataforma en ciencias ómicas, nos damos cuenta que no es una tarea trivial resolver el volumen de datos que tenemos que tratar. Para eso necesitamos una gran infraestructura de cómputo y unas capacidades técnicas importantes. Como vemos en el computador, generalmente para poder trabajar este tipo de problemas necesitamos una infraestructura de cómputo asociada a plataformas de supercomputación. La supercomputación y la bioinformática van de la mano para poder atender este tipo de problemas. Los flujos comunes que se utilizan en bioinformática para atender problemas de secuenciación masiva, responden a un modelo de datos sencillo, donde tú tienes un conjunto de datos de entrada, vas a hacer una serie de transformaciones sobre esos datos para luego obtener un resultado, una salida. Generalmente cada uno de esos pasos que vamos a llevar a cabo a nivel computacional, está fuertemente vinculado a un proceso matemático a diferentes tipos de niveles. En la entrada mas simple, por ejemplo podemos hacer desde un algoritmo de conteo para organizar los datos, o unos algoritmos de probabilidad para poder hacer estadísticas sobre los datos y obtener con ellos ciertos resultados tentativos, así como también otra serie de modelos matemáticos que nosotros implementamos en diferentes etapas, hasta obtener un resultado final. Además de eso, no solamente requerimos un conjunto de modelos que nos permita tratar de descifrar la información con la que contamos allí, sino que también requerimos otra serie de modelos computacionales y matemáticamente robustos para poder también hacer procesos de visualización y análisis de estos datos. Hola, soy Carolina Cortés y quiero contarles que el cáncer mamario es un problema de salud pública a nivel mundial. Para Colombia esta patología pasó de ser la tercera causa de muerte femenina a ser la primera, diagnosticándose 6700 casos anuales y falleciendo de esas pacientes 2.600. Es importante aclarar que este alto número de fallecimientos se debe a que las personas acuden a los médicos, a las instituciones médicas a una etapa avanzada, no cuando empiezan a sentir los síntomas. El cáncer mamario es una enfermedad muy compleja, es una enfermedad multifactorial y dentro de los factores que pueden predisponer a esta, están la obesidad, el sedentarismo, la nulliparidad, el consumo alto de alcohol y hay otro porcentaje que es el factor genético. El cáncer mamario tiene dos manifestaciones, uno que es la manifestación familiar y otra la explorádica. Para las manifestaciones familiares, ustedes han escuchado los genes BRCA1 y BRCA2 que son muy famosos, estos genes responden solo por el 25% de los casos pero el resto es desconocido. Para el 85% de los casos que es la manifestación explorádica aún hay un universo de genes que no conocemos, por eso es importante que apoyen y se vinculen a este tipo de proyectos de investigación ya que el análisis completo del exoma es la estrategia que es más versátil para llegar a entender mejor esa patología. Hola, soy Patricia Vélez, trabajo en el proyecto de implementación de la plataforma de ciencia sónica y salud del cáncer mamario en el sur occidente. Nosotros estamos ayudando a cabo un proyecto que pretende hacer una innovación utilizando lo que se llama medicina MP4 que es preventiva, personalizada, de precisión y participativa. Queremos que las personas que están interesadas en hacer diagnósticos en el cáncer de mamar pues puedan entender que hay una nueva visión para hacer este tipo de abordajes para el cáncer de mamar y que se puedan tener más historias de éxito porque con estos nuevos enlinamientos que están haciendo las pacientes y las personas que de pronto no tienen antecedentes y que es la mayoría de las personas, el 85% de las pacientes que tienen cáncer en este momento son de factores desconocidos. Ahí es donde nosotros queremos hacer una intervención importante, analizando los datos, haciendo una unión de muchos datos y presentando una nueva alternativa de precisión utilizando herramientas computacionales. Nosotros analizamos el genoma humano hace unos años y tenemos un modelo interesante con multifractales que es un modelo matemático que puede ayudar a enfocar más en la precisión del diagnóstico. Nosotros estamos haciendo copia de las muestras con el apoyo del Clínica de Hospitales del subresidente. En la ciudad de Cali estamos trabajando con hematocólogos, con la Clínica de Manaco y el Hospital Universitario del Valle. En el departamento de Cauca estamos trabajando con patólogos de Cauca, Clínica de Telestancia, Hospital San José y en el Iño con patólogos de S.A. Con eso queremos hacer un aporte a la salud pública en Colombia y hemos recibido un gran apoyo de estas clínicas hospitales para hacer este objetivo. Hola, mi nombre es Joan Grisales, soy estudiante de ingeniería de sistemas e integrante de grupo de informática en la Universidad del Valle. Una de las fuentes que tiene el grupo de investigación es utilizar herramientas computacionales y informáticas para atacar problemas de la vida cotidiana, como puede ser en este caso el cáncer de mama. Nos podemos apoyar de herramientas tales como la minería de datos para sacar ciertas muestras, una colección de datos que en este caso serían todas las muestras que tenemos de los pacientes y sacar datos estadísticos para poder ayudar a la prevención de esa enfermedad. Las herramientas de minería de datos por dentro tienen mucha matemática. Por ejemplo, escoge todo, uno puede hacer cierto tipo de previsiones, por ejemplo, una paciente mayor de 50 años que fue expuesta 40 veces a rayos X tiene una probabilidad de 30% de sufrir cáncer de mama. Entonces es muy interesante este proyecto porque gracias a nuestra expertise podemos ayudar a la comunidad colombiana y mundial. Hola, mi nombre es Eric López, estudiante de ingeniería de sistemas y miembro del grupo de bioinformática de la Universidad del Valle. Sobre la aplicación de las matemáticas en la bioinformática es mucho ya que por medio de las matemáticas nosotros logramos identificar los problemas por medio de sus variables, así mismo como formular las ecuaciones y modelarlas por medio de funciones. Como este proyecto está reuniendo tanta información de la población que padece cáncer, es muy necesario utilizar la computación fundamentándose en las ecuaciones para así encontrar las soluciones a este problema. Hola, soy Alejandro Valencia y también hago parte del grupo de bioinformática de la escuela de ingeniería de sistemas y computación de la Universidad del Valle como estudiante de pregrado de último semestre. Anteriormente se mencionó que para abordar el volumen de datos y analizar esos datos se requiere una infraestructura computacional. ¿Qué a grandes rasgos es una entrada de datos, unas transformaciones o procesos sobre esos datos y unos resultados que serían la salida? Esas transformaciones pueden ser algoritmos, programas, matemáticas asociadas, ecuaciones diferenciales, matemáticas discretas, entre otros. Nosotros como estudiantes como podemos apoyar estos proyectos en el transcurso de nuestra carrera sería desarrollando estas transformaciones. Se requieren muchos programas, muchos algoritmos, nosotros podemos entender las necesidades del problema que se requiere abordar y desarrollar los algoritmos o los programas que se requieren para la resolución de los mismos. Por ejemplo, una anécdota, cuando estaba aproximadamente en octavo semestre, me tocó hacer un programa de reconocimiento de rostros en el ámbito de reconocimiento facial que tenía una base de datos de personas, de aproximadamente unas diez personas, de cada una de esas personas tenía unas cincuenta fotos y tenía que ante una entrada nueva saber si esa persona estaba en esa base de datos o no. Para eso tuve que desarrollar un programa en Java que usaba álgebra lineal, transformaciones de matrices transpuestas, SVD, valores singulares, entre otros, que me permitían lo que se requería hacer que era identificar esas personas en la base de datos. De esa forma, con esa anécdota, lo que quiero decir es que nosotros como estudiantes, a pesar de que los proyectos están entre doctorado y postgrado, también podemos participar y dejar una huella en esos proyectos. Si quieres participar y colaborar con el proyecto de investigación, por favor, contácanos. Cuéntales a tus amigos, amigas y familiares más cercanos de este proyecto. Con tu ayuda, podemos caracterizar mejor esa terrible enfermedad que afecta a muchas mujeres en el suroccidente colombiano y en el mundo entero. Para conocer más acerca de este importante proyecto, por favor visiten estos enlaces que también les dejo acá abajo en la descripción del video. Muchas gracias por su amable atención y hasta la próxima.
[{"start": 0.0, "end": 8.4, "text": " Hola, \u00bfqu\u00e9 tal? Con frecuencia nos hacemos la pregunta \u00bfpara qu\u00e9 sirven las matem\u00e1ticas?"}, {"start": 8.4, "end": 14.32, "text": " \u00bfEn qu\u00e9 situaciones cotidianas o profesionales se aplica todo eso que aprendemos en el colegio"}, {"start": 14.32, "end": 20.580000000000002, "text": " o la universidad? Pues bien, en esta ocasi\u00f3n quiero ayudar a responder esa pregunta present\u00e1ndoles"}, {"start": 20.580000000000002, "end": 27.28, "text": " un proyecto muy interesante que se apoya en las matem\u00e1ticas y otras disciplinas relacionadas."}, {"start": 27.28, "end": 33.4, "text": " Bienvenidos. Hoy visitamos el laboratorio de bioinform\u00e1tica de la Facultad de Engener\u00edas"}, {"start": 33.4, "end": 38.84, "text": " de la Universidad del Valle, donde un grupo de expertos est\u00e1n utilizando las matem\u00e1ticas"}, {"start": 38.84, "end": 45.36, "text": " y la computaci\u00f3n para estudiar el genoma humano, el libro de la vida, y asimismo indagar"}, {"start": 45.36, "end": 51.32, "text": " sobre una terrible enfermedad que afecta a las mujeres en Colombia, como lo es el c\u00e1ncer"}, {"start": 51.32, "end": 57.64, "text": " de mama. Bienvenidos. Hola, soy Pedro Moreno, el coordinador de este proyecto de investigaci\u00f3n"}, {"start": 57.64, "end": 61.24, "text": " entre la Universidad del Valle y la Universidad del Cauca. Nosotros estamos trabajando en"}, {"start": 61.24, "end": 67.36, "text": " c\u00e1ncer mamario. Este proyecto es financiado por la gobernaci\u00f3n del Valle y por el sistema"}, {"start": 67.36, "end": 72.88, "text": " general de regal\u00edas. Es aproximadamente 3.2 millones de pesos, de los cuales nosotros"}, {"start": 72.88, "end": 78.48, "text": " nos dan aproximadamente 1.5 millones de pesos. Y el objetivo general del proyecto consiste"}, {"start": 78.48, "end": 85.0, "text": " b\u00e1sicamente en recopilar una muestra significativa de pacientes, m\u00e1s de 300 mujeres, que padecen"}, {"start": 85.0, "end": 90.64, "text": " c\u00e1ncer mamario con sus respectivos controles y poder identificar en ellas mutaciones en"}, {"start": 90.64, "end": 97.4, "text": " su genoma y que puedan permitir llevarnos a nosotros a saber cu\u00e1les de estas son patog\u00e9nicas"}, {"start": 97.4, "end": 102.76, "text": " y discriminarlas de aquellas que no lo son. Con estas mutaciones identificadas de patog\u00e9nicas,"}, {"start": 102.76, "end": 106.76, "text": " nosotros lo que queremos hacer m\u00e1s adelante es un sistema de diagn\u00f3stico para que se"}, {"start": 106.76, "end": 113.36, "text": " convierta en una herramienta preventiva y poder entonces predecir a tiempo la presencia"}, {"start": 113.36, "end": 118.56, "text": " o ausencia de una mutaci\u00f3n que pueda conducir a un c\u00e1ncer mamario. Este es un problema"}, {"start": 118.56, "end": 123.16, "text": " de salud p\u00fablica muy grave y nosotros hemos conformado un equipo de investigaci\u00f3n que"}, {"start": 123.16, "end": 129.48000000000002, "text": " a lo largo de este video ustedes podr\u00e1n observar. El objetivo principal del proyecto, como les"}, {"start": 129.48000000000002, "end": 135.64000000000001, "text": " dec\u00eda, es identificar estas mutaciones en estas 300 y pico de pacientes. B\u00e1sicamente"}, {"start": 135.64, "end": 142.27999999999997, "text": " lo que nosotros hacemos aqu\u00ed en este trabajo es ir a las cl\u00ednicas y a los hospitales,"}, {"start": 142.27999999999997, "end": 148.48, "text": " identificar a los pacientes y tomarse la informaci\u00f3n de la historia cl\u00ednica a trav\u00e9s de un consentimiento"}, {"start": 148.48, "end": 154.45999999999998, "text": " informado y avalado por un comit\u00e9 de \u00e9tica y con base en esa informaci\u00f3n obtener las"}, {"start": 154.45999999999998, "end": 160.88, "text": " muestras ya sea de tumor mamario fresco, ya sea de las l\u00e1minas de parafina que algunas"}, {"start": 160.88, "end": 165.88, "text": " de estas pacientes tambi\u00e9n puedan tener o est\u00e9n en los bancos de patolog\u00eda. Una vez"}, {"start": 165.88, "end": 169.68, "text": " nosotros tengamos esas muestras lo que nosotros hacemos es traerlas al laboratorio, es traer"}, {"start": 169.68, "end": 176.44, "text": " el ADN, el \u00e1cido desoxiribonucleico y con base en unas t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n secuenciado"}, {"start": 176.44, "end": 182.12, "text": " por tecnolog\u00edas NGS, de lo cual m\u00e1s adelante va a hablar alguien m\u00e1s de nuestro equipo,"}, {"start": 182.12, "end": 187.68, "text": " y hacer un an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico. El an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico consiste b\u00e1sicamente en utilizar"}, {"start": 187.68, "end": 194.24, "text": " toda una serie de herramientas, de algoritmos, de matem\u00e1tica y de estad\u00edsticas y de computaci\u00f3n"}, {"start": 194.24, "end": 198.4, "text": " al mismo tiempo, lo cual nos va a permitir a nosotros identificar esas mutaciones de"}, {"start": 198.4, "end": 203.44, "text": " las cuales estamos nosotros interesados en que sean las informativas y las diagn\u00f3sticas"}, {"start": 203.44, "end": 210.92000000000002, "text": " de patogenicidad. Hola, mi nombre es Miguel Guevara, soy integrante del grupo de investigaci\u00f3n"}, {"start": 210.92000000000002, "end": 216.36, "text": " en bioinform\u00e1tica y biolog\u00eda computacional de la Universidad del Valle. Cuando nos enfrentamos"}, {"start": 216.36, "end": 220.64000000000001, "text": " a un proyecto de secuenciaci\u00f3n masiva, como el que estamos haciendo en la implementaci\u00f3n"}, {"start": 220.64000000000001, "end": 228.02, "text": " de la plataforma en ciencias \u00f3micas, nos damos cuenta que no es una tarea trivial resolver"}, {"start": 228.02, "end": 233.20000000000002, "text": " el volumen de datos que tenemos que tratar. Para eso necesitamos una gran infraestructura"}, {"start": 233.20000000000002, "end": 240.44000000000003, "text": " de c\u00f3mputo y unas capacidades t\u00e9cnicas importantes. Como vemos en el computador, generalmente"}, {"start": 240.44000000000003, "end": 244.48000000000002, "text": " para poder trabajar este tipo de problemas necesitamos una infraestructura de c\u00f3mputo"}, {"start": 244.48, "end": 249.64, "text": " asociada a plataformas de supercomputaci\u00f3n. La supercomputaci\u00f3n y la bioinform\u00e1tica"}, {"start": 249.64, "end": 255.51999999999998, "text": " van de la mano para poder atender este tipo de problemas. Los flujos comunes que se utilizan"}, {"start": 255.51999999999998, "end": 261.2, "text": " en bioinform\u00e1tica para atender problemas de secuenciaci\u00f3n masiva, responden a un modelo"}, {"start": 261.2, "end": 266.0, "text": " de datos sencillo, donde t\u00fa tienes un conjunto de datos de entrada, vas a hacer una serie"}, {"start": 266.0, "end": 271.36, "text": " de transformaciones sobre esos datos para luego obtener un resultado, una salida. Generalmente"}, {"start": 271.36, "end": 276.72, "text": " cada uno de esos pasos que vamos a llevar a cabo a nivel computacional, est\u00e1 fuertemente"}, {"start": 276.72, "end": 283.32, "text": " vinculado a un proceso matem\u00e1tico a diferentes tipos de niveles. En la entrada mas simple,"}, {"start": 283.32, "end": 289.56, "text": " por ejemplo podemos hacer desde un algoritmo de conteo para organizar los datos, o unos"}, {"start": 289.56, "end": 295.52000000000004, "text": " algoritmos de probabilidad para poder hacer estad\u00edsticas sobre los datos y obtener con"}, {"start": 295.52000000000004, "end": 301.2, "text": " ellos ciertos resultados tentativos, as\u00ed como tambi\u00e9n otra serie de modelos matem\u00e1ticos"}, {"start": 301.2, "end": 306.92, "text": " que nosotros implementamos en diferentes etapas, hasta obtener un resultado final. Adem\u00e1s"}, {"start": 306.92, "end": 311.8, "text": " de eso, no solamente requerimos un conjunto de modelos que nos permita tratar de descifrar"}, {"start": 311.8, "end": 315.86, "text": " la informaci\u00f3n con la que contamos all\u00ed, sino que tambi\u00e9n requerimos otra serie de"}, {"start": 315.86, "end": 321.52, "text": " modelos computacionales y matem\u00e1ticamente robustos para poder tambi\u00e9n hacer procesos"}, {"start": 321.52, "end": 327.76, "text": " de visualizaci\u00f3n y an\u00e1lisis de estos datos. Hola, soy Carolina Cort\u00e9s y quiero contarles"}, {"start": 327.76, "end": 333.84, "text": " que el c\u00e1ncer mamario es un problema de salud p\u00fablica a nivel mundial. Para Colombia esta"}, {"start": 333.84, "end": 340.48, "text": " patolog\u00eda pas\u00f3 de ser la tercera causa de muerte femenina a ser la primera, diagnostic\u00e1ndose"}, {"start": 340.48, "end": 348.65999999999997, "text": " 6700 casos anuales y falleciendo de esas pacientes 2.600. Es importante aclarar que este alto"}, {"start": 348.65999999999997, "end": 354.48, "text": " n\u00famero de fallecimientos se debe a que las personas acuden a los m\u00e9dicos, a las instituciones"}, {"start": 354.48, "end": 360.20000000000005, "text": " m\u00e9dicas a una etapa avanzada, no cuando empiezan a sentir los s\u00edntomas. El c\u00e1ncer mamario"}, {"start": 360.20000000000005, "end": 366.04, "text": " es una enfermedad muy compleja, es una enfermedad multifactorial y dentro de los factores que"}, {"start": 366.04, "end": 371.76, "text": " pueden predisponer a esta, est\u00e1n la obesidad, el sedentarismo, la nulliparidad, el consumo"}, {"start": 371.76, "end": 377.08000000000004, "text": " alto de alcohol y hay otro porcentaje que es el factor gen\u00e9tico. El c\u00e1ncer mamario"}, {"start": 377.08000000000004, "end": 383.76, "text": " tiene dos manifestaciones, uno que es la manifestaci\u00f3n familiar y otra la explor\u00e1dica. Para las"}, {"start": 383.76, "end": 390.84, "text": " manifestaciones familiares, ustedes han escuchado los genes BRCA1 y BRCA2 que son muy famosos,"}, {"start": 390.84, "end": 397.08, "text": " estos genes responden solo por el 25% de los casos pero el resto es desconocido. Para el"}, {"start": 397.08, "end": 404.8, "text": " 85% de los casos que es la manifestaci\u00f3n explor\u00e1dica a\u00fan hay un universo de genes que no conocemos,"}, {"start": 404.8, "end": 410.59999999999997, "text": " por eso es importante que apoyen y se vinculen a este tipo de proyectos de investigaci\u00f3n"}, {"start": 410.6, "end": 417.6, "text": " ya que el an\u00e1lisis completo del exoma es la estrategia que es m\u00e1s vers\u00e1til para llegar"}, {"start": 417.6, "end": 423.36, "text": " a entender mejor esa patolog\u00eda. Hola, soy Patricia V\u00e9lez, trabajo en el proyecto de"}, {"start": 423.36, "end": 428.52000000000004, "text": " implementaci\u00f3n de la plataforma de ciencia s\u00f3nica y salud del c\u00e1ncer mamario en el"}, {"start": 428.52000000000004, "end": 434.36, "text": " sur occidente. Nosotros estamos ayudando a cabo un proyecto que pretende hacer una innovaci\u00f3n"}, {"start": 434.36, "end": 441.44, "text": " utilizando lo que se llama medicina MP4 que es preventiva, personalizada, de precisi\u00f3n"}, {"start": 441.44, "end": 446.68, "text": " y participativa. Queremos que las personas que est\u00e1n interesadas en hacer diagn\u00f3sticos"}, {"start": 446.68, "end": 452.04, "text": " en el c\u00e1ncer de mamar pues puedan entender que hay una nueva visi\u00f3n para hacer este"}, {"start": 452.04, "end": 456.72, "text": " tipo de abordajes para el c\u00e1ncer de mamar y que se puedan tener m\u00e1s historias de \u00e9xito"}, {"start": 456.72, "end": 462.24, "text": " porque con estos nuevos enlinamientos que est\u00e1n haciendo las pacientes y las personas"}, {"start": 462.24, "end": 468.88, "text": " que de pronto no tienen antecedentes y que es la mayor\u00eda de las personas, el 85% de"}, {"start": 468.88, "end": 473.08, "text": " las pacientes que tienen c\u00e1ncer en este momento son de factores desconocidos. Ah\u00ed es donde"}, {"start": 473.08, "end": 478.32, "text": " nosotros queremos hacer una intervenci\u00f3n importante, analizando los datos, haciendo"}, {"start": 478.32, "end": 483.6, "text": " una uni\u00f3n de muchos datos y presentando una nueva alternativa de precisi\u00f3n utilizando"}, {"start": 483.6, "end": 489.0, "text": " herramientas computacionales. Nosotros analizamos el genoma humano hace unos a\u00f1os y tenemos"}, {"start": 489.0, "end": 493.56, "text": " un modelo interesante con multifractales que es un modelo matem\u00e1tico que puede ayudar"}, {"start": 493.56, "end": 498.92, "text": " a enfocar m\u00e1s en la precisi\u00f3n del diagn\u00f3stico. Nosotros estamos haciendo copia de las muestras"}, {"start": 498.92, "end": 503.84, "text": " con el apoyo del Cl\u00ednica de Hospitales del subresidente. En la ciudad de Cali estamos"}, {"start": 503.84, "end": 509.32, "text": " trabajando con hematoc\u00f3logos, con la Cl\u00ednica de Manaco y el Hospital Universitario del"}, {"start": 509.32, "end": 514.12, "text": " Valle. En el departamento de Cauca estamos trabajando con pat\u00f3logos de Cauca, Cl\u00ednica"}, {"start": 514.12, "end": 519.32, "text": " de Telestancia, Hospital San Jos\u00e9 y en el I\u00f1o con pat\u00f3logos de S.A. Con eso queremos"}, {"start": 519.32, "end": 524.24, "text": " hacer un aporte a la salud p\u00fablica en Colombia y hemos recibido un gran apoyo de estas cl\u00ednicas"}, {"start": 524.24, "end": 530.12, "text": " hospitales para hacer este objetivo. Hola, mi nombre es Joan Grisales, soy estudiante"}, {"start": 530.12, "end": 534.6, "text": " de ingenier\u00eda de sistemas e integrante de grupo de inform\u00e1tica en la Universidad del"}, {"start": 534.6, "end": 540.6800000000001, "text": " Valle. Una de las fuentes que tiene el grupo de investigaci\u00f3n es utilizar herramientas"}, {"start": 540.68, "end": 546.3199999999999, "text": " computacionales y inform\u00e1ticas para atacar problemas de la vida cotidiana, como puede"}, {"start": 546.3199999999999, "end": 552.1999999999999, "text": " ser en este caso el c\u00e1ncer de mama. Nos podemos apoyar de herramientas tales como la miner\u00eda"}, {"start": 552.1999999999999, "end": 558.8399999999999, "text": " de datos para sacar ciertas muestras, una colecci\u00f3n de datos que en este caso ser\u00edan todas las"}, {"start": 558.8399999999999, "end": 564.52, "text": " muestras que tenemos de los pacientes y sacar datos estad\u00edsticos para poder ayudar a la"}, {"start": 564.52, "end": 569.4799999999999, "text": " prevenci\u00f3n de esa enfermedad. Las herramientas de miner\u00eda de datos por dentro tienen mucha"}, {"start": 569.48, "end": 573.6, "text": " matem\u00e1tica. Por ejemplo, escoge todo, uno puede hacer"}, {"start": 573.6, "end": 579.76, "text": " cierto tipo de previsiones, por ejemplo, una paciente mayor de 50 a\u00f1os que fue expuesta"}, {"start": 579.76, "end": 587.16, "text": " 40 veces a rayos X tiene una probabilidad de 30% de sufrir c\u00e1ncer de mama. Entonces"}, {"start": 587.16, "end": 594.76, "text": " es muy interesante este proyecto porque gracias a nuestra expertise podemos ayudar a la comunidad"}, {"start": 594.76, "end": 599.76, "text": " colombiana y mundial. Hola, mi nombre es Eric L\u00f3pez, estudiante de ingenier\u00eda de sistemas"}, {"start": 599.76, "end": 603.3199999999999, "text": " y miembro del grupo de bioinform\u00e1tica de la Universidad del Valle. Sobre la aplicaci\u00f3n"}, {"start": 603.3199999999999, "end": 607.16, "text": " de las matem\u00e1ticas en la bioinform\u00e1tica es mucho ya que por medio de las matem\u00e1ticas"}, {"start": 607.16, "end": 611.84, "text": " nosotros logramos identificar los problemas por medio de sus variables, as\u00ed mismo como"}, {"start": 611.84, "end": 616.4, "text": " formular las ecuaciones y modelarlas por medio de funciones. Como este proyecto est\u00e1 reuniendo"}, {"start": 616.4, "end": 621.64, "text": " tanta informaci\u00f3n de la poblaci\u00f3n que padece c\u00e1ncer, es muy necesario utilizar la computaci\u00f3n"}, {"start": 621.64, "end": 625.52, "text": " fundament\u00e1ndose en las ecuaciones para as\u00ed encontrar las soluciones a este problema."}, {"start": 625.52, "end": 629.6, "text": " Hola, soy Alejandro Valencia y tambi\u00e9n hago parte del grupo de bioinform\u00e1tica de la escuela"}, {"start": 629.6, "end": 632.92, "text": " de ingenier\u00eda de sistemas y computaci\u00f3n de la Universidad del Valle como estudiante"}, {"start": 632.92, "end": 639.04, "text": " de pregrado de \u00faltimo semestre. Anteriormente se mencion\u00f3 que para abordar el volumen de"}, {"start": 639.04, "end": 645.1999999999999, "text": " datos y analizar esos datos se requiere una infraestructura computacional. \u00bfQu\u00e9 a grandes"}, {"start": 645.1999999999999, "end": 651.12, "text": " rasgos es una entrada de datos, unas transformaciones o procesos sobre esos datos y unos resultados"}, {"start": 651.12, "end": 657.2, "text": " que ser\u00edan la salida? Esas transformaciones pueden ser algoritmos, programas, matem\u00e1ticas"}, {"start": 657.2, "end": 662.64, "text": " asociadas, ecuaciones diferenciales, matem\u00e1ticas discretas, entre otros. Nosotros como estudiantes"}, {"start": 662.64, "end": 667.6, "text": " como podemos apoyar estos proyectos en el transcurso de nuestra carrera ser\u00eda desarrollando"}, {"start": 667.6, "end": 672.16, "text": " estas transformaciones. Se requieren muchos programas, muchos algoritmos, nosotros podemos"}, {"start": 672.16, "end": 677.98, "text": " entender las necesidades del problema que se requiere abordar y desarrollar los algoritmos"}, {"start": 677.98, "end": 683.24, "text": " o los programas que se requieren para la resoluci\u00f3n de los mismos. Por ejemplo, una an\u00e9cdota,"}, {"start": 683.24, "end": 690.04, "text": " cuando estaba aproximadamente en octavo semestre, me toc\u00f3 hacer un programa de reconocimiento"}, {"start": 690.04, "end": 695.28, "text": " de rostros en el \u00e1mbito de reconocimiento facial que ten\u00eda una base de datos de personas,"}, {"start": 695.28, "end": 699.6800000000001, "text": " de aproximadamente unas diez personas, de cada una de esas personas ten\u00eda unas cincuenta"}, {"start": 699.6800000000001, "end": 706.12, "text": " fotos y ten\u00eda que ante una entrada nueva saber si esa persona estaba en esa base de"}, {"start": 706.12, "end": 712.44, "text": " datos o no. Para eso tuve que desarrollar un programa en Java que usaba \u00e1lgebra lineal,"}, {"start": 712.44, "end": 718.12, "text": " transformaciones de matrices transpuestas, SVD, valores singulares, entre otros, que"}, {"start": 718.12, "end": 722.4, "text": " me permit\u00edan lo que se requer\u00eda hacer que era identificar esas personas en la base de"}, {"start": 722.4, "end": 727.76, "text": " datos. De esa forma, con esa an\u00e9cdota, lo que quiero decir es que nosotros como estudiantes,"}, {"start": 727.76, "end": 733.0, "text": " a pesar de que los proyectos est\u00e1n entre doctorado y postgrado, tambi\u00e9n podemos participar"}, {"start": 733.0, "end": 738.04, "text": " y dejar una huella en esos proyectos. Si quieres participar y colaborar con el proyecto de"}, {"start": 738.04, "end": 743.04, "text": " investigaci\u00f3n, por favor, cont\u00e1canos. Cu\u00e9ntales a tus amigos, amigas y familiares m\u00e1s cercanos"}, {"start": 743.04, "end": 748.54, "text": " de este proyecto. Con tu ayuda, podemos caracterizar mejor esa terrible enfermedad que afecta a"}, {"start": 748.54, "end": 753.2, "text": " muchas mujeres en el suroccidente colombiano y en el mundo entero."}, {"start": 753.2, "end": 762.42, "text": " Para conocer m\u00e1s acerca de este importante proyecto, por favor visiten estos enlaces que"}, {"start": 762.42, "end": 768.78, "text": " tambi\u00e9n les dejo ac\u00e1 abajo en la descripci\u00f3n del video. Muchas gracias por su amable atenci\u00f3n"}, {"start": 768.78, "end": 792.92, "text": " y hasta la pr\u00f3xima."}]