Indonesiens Armee wurde oft der Menschenrechtsverletzung während des Kampfes für die Unabhängigkeit der GAM vorgeworfen, Anklagen, die sie generell verweigert hat, während sie die Separatisten beschuldigt hat, Rechtsverletzungen zu begehen.
Indonesiens Armee wurde wegen Menschenrechtsverletzungen während ihrer früheren Kämpfe mit GAM beschuldigt, Anklagen, die sie generell abgelehnt hat.