ב-9 בנובמבר 2019 סוקולוב נעצר על ידי משטרת סנקט פטרבורג בגין רצח תלמידתו לשעבר, אנסטסיה ישצ'נקו, שעבדה איתו על כמה מחקרים אקדמיים על תולדות צרפת, אנסטסיה הייתה בוגרת אוניברסיטת סנקט פטרבורג. לדברי החוקרים, ב-8 בנובמבר, סוקולוב ירה בה בדירתו 4 פעמים. למחרת ניסר את גופתה וניסה להטביע את חלקי הגופה בנהר המויקה.לדברי סנגורו אלכסנדר פוצ'וייב, סוקולוב הסגיר את עצמו ומוכן לעבור הסתכלות פסיכיאטרית. בנוסף טען כי סוקולוב פעל תחת לחץ גדול.ב-11 בנובמבר סוקולוב נידון בפני בית הדין האזורי של אוקטיאברסקי והואשם בביצוע פשע חמור. הוסכם כי יש להשימו במעצר בית לחודשיים עד ל-8 בינואר 2020 בכלא קרסטי הידוע לשמצה. בשל חומרת הפשיעה, לחקירה הצטרפו גם חוקרים פדרליים של ועדת החקירות.לאחר שהושם במעצר בית, באוניברסיטת סנקט פטרבורג הודיעו על פיטוריו מתפקיד ראש המכון להיסטוריה. ב-25 בדצמבר 2020 נמצא אשם, ובית משפט ברוסיה גזר עליו 12.5 שנות מאסר בגין רצח תלמידתו ובתירת גופתה.
איזה הרג סוקולוב את אנסטסיה?
 ירה בה בדירתו 4 פעמים