אמצעי האבטחה של Samsung Pay מבוססים על טכנולוגיות Samsung Knox ו־ARM TrustZone; פרטי כרטיס האשראי מאוחסנים באסימון מאובטח. יש לאמת את התשלומים באמצעות סריקת טביעות אצבע או קוד סיסמה.באוגוסט 2016 חשף חוקר האבטחה סלבדור מנדוסה פגם אפשרי ב־Samsung Pay, וטען כי אסימוני האבטחה שלה לא היו אקראיים מספיק ויכולים להפוך לחזויים. הוא גם תכנן מכשיר כף יד שיכול לשמש לרפרוף אסימוני שידור מאובטחים מגנטיים, ואחד אחר שיכול לזייף פסים מגנטיים על קוראי כרטיסים בפועל באמצעות האסימון. סמסונג הגיבה לדו"ח וקבעה כי "אם בכל עת קיימת פגיעות אפשרית, אנו נפעל מייד לחקירת הבעיה ופתרונה".סמסונג פיי לא תעבוד עם מכשירים שמעט האחריות שלהם על ידי Knox נשללה.
היכן וכיצד מאוחסנים פרטי האשראי במערכת?
פרטי כרטיס האשראי מאוחסנים באסימון מאובטח