Under førstebehandlingen af dette direktiv krævede Parlamentet en række ændringer, som omfattede ovennævnte to målsætninger, det vil sige en anvendelig ramme af regler om hensigtsmæssig frigivelse af og handel med genetisk modificerede organismer ledsaget af sikkerhedsforanstaltninger til beskyttelse af folkesundheden og miljøet, samtidig med at man sørger for information af offentligheden og forbrugerne.