ルーペ（独: lupe）とは、いわゆる「虫めがね」などのことである。ルーペでは、決して太陽を見てはいけない。（目を痛めるので。）
ルーペの倍率は5倍～10倍程である。
thumb|タンポポの花。この図で表される部分が、1つの花である。
thumb|スケッチする場合、色はつけない。
タンポポなどの道端の植物など、肉眼で確認できる程度のものは、このルーペで見るのが効率的である。ちなみに、タンポポで、花びらのように見える物は、じつは一枚一枚が花全体である。それぞれの「花びらのような物」に、おしべ や めしべ が個別についており、独立した花なのである。
thumb|ルーペの使うときに、対象物が動かせる場合には、対象物のほうを動かす。
ルーペの使い方
ルーペを目の近くに近づけたら（眼鏡ぐらいの位置）、ルーペは動かさない。ピントがあわない場合などは、観察物を動かせる場合は対象物を動かす。観察物を動かせない場合には自分（観察者）が移動する。
双眼実体顕微鏡は、観察する物をプレパラートにする必要が無い。倍率は20倍～40倍ほどである。
ピント（焦点）合わせなどの調整は、以下のように行う。
まず、水平で直接日光の当たらない場所に、顕微鏡を置く。
ペトリ皿などに観察したい物を乗せ、その皿をステージの上に置く。けっしてペトリ皿などを使わずに、直接は乗っけてはいけない。
観察者の両目の間隔に合わせられるように、接眼鏡筒が左右に動かせるようになっている。
なので、取り付けた接眼レンズを使って両目でのぞきながら、接眼鏡筒を左右に動かして、調節する。
視野やピントのおおよその調整をするため、鏡筒を支えながら粗動ねじをゆるめて、取り付けた接眼レンズで両目でのぞきながら、鏡筒を上下して、視野やピントなどの、おおよその調整を行う。
最初に右目でピントの調整を行うため、調整ねじ（「調節ねじ」とも言う）をゆっくり回して、右目で見えるピントを合わせる。
thumb|200px|left|顕微鏡。中学校のとは違うが、仕組みは だいたい同じであるはず。
thumb|ステージ上下式顕微鏡の各部の解説用のイラスト。
thumb|鏡筒上下式顕微鏡の解説イラスト。
顕微鏡のレンズには、接眼レンズ（eyepiece）と対物レンズ（objective）の2種類が必要である。
顕微鏡の倍率は、
である。
たとえば接眼レンズの倍率が15倍であり、対物レンズの倍率が4倍なら、顕微鏡の倍率は60倍である。（15×4＝60より）
一般に中学校などで使うような形式の顕微鏡の倍率は、40倍から600倍までである。
ミジンコやミドリムシなど、いわゆる「微生物」と言われるものは、ルーペなどでは倍率が小さすぎて確認できない場合が多い。微生物などは、顕微鏡以上で観察しよう。
まず、プレパラート(ドイツ語: Präparat)の準備が必要である。鏡筒上下式顕微鏡と、ステージ上下式顕微鏡のどちらとも、プレパラートが必要にななる。このプレパラートの準備方法を、つぎに説明する。
顕微鏡で観察する時は、プレパラート(ドイツ語: Präparat)を使う必要がある。
うすい物しか観察できない。あつい物を観察したい場合は、うすい切片にする必要がある。
thumb|400px|プレパラートのつくりかた
スライドガラスの上に、観察したい対象を乗せる。必要に応じて、対象物に水をスポイトなどで1滴たらして、水分を補う。
柄付き針（えつきばり）やピンセットでカバーガラスを乗せ、このとき空気のあわが入らないようにする。
カバーガラスから、はみでた水を、ろ紙で吸い取る。
まず、水平で直接日光の当たらない場所に、顕微鏡を置く。
対物レンズを、もっとも低倍率の物にセットし、次に接眼レンズをのぞきながら、視野全体が明るく見えるように反射鏡と しぼり を調節する。
プレパラートをステージの上に乗せクリップで固定し、顕微鏡を横から見ながら、なるべく対物レンズとプレパラートを近づける。ピント合わせは、まだ行わない。なるべく近づける理由は、ピント合わせを行うとき、レンズとプレパラートとを離す方向でピント合わせを行うことで、ぶつからないようにするためである。
接眼レンズをのぞきながら、ピント合わせのため、対物レンズとプレパラートを離していくように、調節ねじ をゆっくり回して調整する。
以上の手順で、観察を始められる。さらに高倍率で観察したい場合には、対物レンズをレボルバーを回して、高倍率の対物レンズに替える。
400px|thumb|光学顕微鏡などでの、映像の動かしたい方向と、プレーパラートを動かす方向との関係を図示。
顕微鏡で見える像は、上下左右が反対に見える顕微鏡が普通である。なので、プレパラートを動かすと、像は反対方向に動いて見える。よって、プレパラートを動かしたい場合には、動かしたい方向とは反対の方向に動かす。
いきなり、高倍率の対物レンズで観察すると、視野がせまいので調整が難しくなる。そのため、まずは低倍率の対物レンズを使用する。
また、高倍率にするほど、明るさは暗くなる。
理科におけるスケッチのしかたは、美術スケッチとは、ことなる。
理科におけるスケッチのしかたを述べる。
影は、つけない。二度書きしない。線をかきまちがえた場合は、消しゴムで消す。
輪郭（りんかく）は、はっきりかく。線を、ぼかさない。そのため、エンピツは削っておく。細い線を描けるようにするため。
中学では、立体感の表現方法まで覚えなくてもよいが、もしスケッチで立体感をつける場合は、点の多い・少ないで表現する。（奥まっていて影になりそうなところほど、点が多くなる。）
立体感の表現は、やや難しいので、中学校では描かないほうが無難だろう。