Según la versión oficial del Gobierno cubano, su muerte es debida a una pancreatitis, pero según la disidencia interna cubana, la muerte de Juan Soto fue debida a una paliza de la policía del régimen comunista castrista.
seɣˈun la βeɾsjˈon ˌofiθjˈal ðel ɣoβjˈeɾno kuβˈano, su mwˈeɾte ˈes ðeβˈiða a ˈuna pˌankɾeatˈitis, pˌeɾo seɣˈun la ðˌisiðˈɛnθja intˈeɾna kuβˈana, la mwˈeɾte ðe xwˈan sˈoto fwˈe ðeβˈiða a ˈuna palˈiθa ðe la pˌoliθˈia ðel ɾɾˈeximen kˌomunˈista kastɾˈista.