b'\n_START_ARTICLE_\nDynamika molekularna\n_START_PARAGRAPH_\nDynamika molekularna (MD) - numeryczne rozwi\xc4\x85zywanie i komputerowa symulacja przestrzeni fazowej dla modelu uk\xc5\x82adu moleku\xc5\x82. Elementarne poprzez ca\xc5\x82kowanie r\xc3\xb3wna\xc5\x84 ruchu Newtona lub kompleksowo z uwzgl\xc4\x99dnieniem licznych oddzia\xc5\x82ywa\xc5\x84 w celu uzyskania informacji o w\xc5\x82a\xc5\x9bciwo\xc5\x9bciach zale\xc5\xbcnych od czasu. Oddzia\xc5\x82ywania mi\xc4\x99dzy elementami uk\xc5\x82adu s\xc4\x85 opisywane przez pewn\xc4\x85 funkcj\xc4\x99 oraz zesp\xc3\xb3\xc5\x82 parametr\xc3\xb3w dla tej funkcji._NEWLINE_Dynamika molekularna znajduje zastosowanie mi\xc4\x99dzy innymi w biochemii jako narz\xc4\x99dzie do poznawania struktury i oddzia\xc5\x82ywa\xc5\x84 w bia\xc5\x82kach, kwasach nukleinowych i innych biomoleku\xc5\x82ach._NEWLINE_Istnieje szereg pakiet\xc3\xb3w oprogramowania do prowadzenia symulacji dynamik\xc4\x85 molekularn\xc4\x85, najpopularniejsze to ABINIT (DFT), AMBER (model klasyczny), CHARMM, GROMACS, GROMOS, Materials Explorer oraz NAMD.'