Smith a reçu le prix de scientifique senior de l'ISCB et a été élu Fellow ISCB de la Société internationale de biologie computationnelle en 2009.
Smith a été élu au Prix du scientifique senior de l'ISCB par la Société internationale de biologie computationnelle en 2009 et a reçu le prix Fellow de l'ISCB.