सीबीआई द्वारा मुजफ्फरपुर शेल्टर होम मामले की जांच की जा रही है। इसकी मॉनीटरिंग पटना हाईकोर्ट द्वारा की जा रही है। सीबीआई द्वारा एसपी जेपी मिश्रा के ट्रांसफर संबंधी मामले को लेकर पटना हाईकोर्ट ने जांच के संबंध में सीबीआई को कड़ी फटकार लगाई थी। यहीं नहीं, हाईकोर्ट ने मीडिया रिपोर्टिंग पर भी रोक लगा दी थी।