अलगाववादी नेता सैयद अली शाह गिलानी, मीरवाइज़ उमर फ़ारूक़ और मोहम्मद यासीन मलिक ने भी शुजात बुख़ारी की हत्या की निंदा की है. राइज़िंग कश्मीर की रिपोर्ट के अनुसार, हुर्रियत कॉन्फ्रेंस (जी) के अध्यक्ष सैयद अली शाह गिलानी ने एक बयान जारी कर हत्या की निंदा की है.