संयुक्त सचिव के पद भारतीय प्रशासनिक सेवा (आईएएस), भारतीय पुलिस सेवा (आईपीएस), भारतीय वन सेवा (आईएफएस) और भारतीय राजस्व सेवा (आईआरएस) के अधिकारियों द्वारा संचालित किए जाते हैं, जिन्हें संघ लोक सेवा आयोग (यूपीएससी) द्वारा तीन चरणीय कठोर चयन प्रक्रिया के माध्यम से चुना जाता है.