وبالاضافة الى التحول الى مركز للتجارة الغربية , قدمت ناغازاكي موطئ قدم قوي في اليابان للكنيسة الكاثوليكية اليوم بعد 250 عاما من القمع الوحشي تحت قيادة توكوغاوا .
وتحول معظم السكان المحليين في ناغازاكي الى الكاثوليكية .