Aynı zamanda, farklı inançların dindar takipçilerinden oluşan Fransiskanlar, Augustinians, Dominikliler ve Cizvitler tarafından, özellikle 1542 yılında Goa'ya gelen Francis Xavier'in liderliğindeki titiz bir Engizisyon ile aynı hizada tuttuğu misyonerlik faaliyetleri için bir temel haline geldi.
Engizisyon, farklı inançları hizada tutan Francis Xavier tarafından yönetiliyordu.
Cizvitler aslında çok az dindar takipçileri vardı.