<h1>서 론</h1><p>두 개 이상의 유전자가 융합이 되는 유전자 융합(gene fusion)에 관한 연구는 이미 오래전부터 이뤄지고 있었다. 이러한 유전자 융합을 일으키는 기작으로 염색체의 재배열(chromosomal rearrangement)과 트랜스 스플라이싱(transsplicing), 유전자간 스플라이싱(intergenic splicing) 등이 있다.</p><p>가장 많은 연구가 이뤄진 염색체의 재배열에 의한 유전자 융합은 암과 밀접한 연관을 가진다. 염색체 전좌(translocation)로 인해 Burkitt 림프종이 야기되는데, 그러한 이유는 c-MYC과 BCL2의 발현 조절의 변화에 의한 것이 다. 비슷한 전좌가 만성 골수성 백혈병에서 일어났는데, 여기서 BCL-ABL의 융합 단백질이 발견되었다. 고형암의 경우에는 염색체의 이상에 의해서 retinoblastoma의 RB, Wilms 종양의 WT1, 결장암의 DCC처럼 암억제 유전자의 발현이 변화됨을 알 수 있었다. 1번 염색체의 TPR에 의해서 7번 염색체의 c-MET이 활성화에 의해 융합 전사체(chimeric transcripts)가 만들어진다. 이후에 갑상선 암에서 염색체의 재배열에 의해서 RET/PTC 융합 전사체가 발견되는 등 많은 융합 전사체가 발견되었다.</p><p>반면에 인간에서의 트랜스 스플라이싱 연구는 상대적으로 적게 진행되었다. 스플라이싱은 전사기작 과정 중에 인트론 영역을 제거하고 필요한 엑손 영역만을 골라내는 중요한 기작이다. 하나의 pre-mRNA을 이용한 기작을 시스 스플라이싱(cis-splicing)이라고 부르며, 스플라이세오좀(spliceosome)에 의해서 형성된다. 트랜스 스플라이싱은 두개의 pre-mRNA을 이용하여 성숙한 mRNA를 만드는 기작이다. 주로 트리파노소마, 선충, 식물과 조류의 엽록체, 식물의 미토콘드리아에서 발견되었다. 선충과 simaian virus 40의 RNA를 COS 세포에 트랜스펙션을 시키는 실험을 통해서, 진핵생물과 포유동물에서 트랜스 스플라이싱 기작이 보존되어 있음을 알게 되었다. 이후에 포유동물 세포에서도 트랜스 스플라이싱 현상이 탐지되었다. 그리고 생쥐의 간 COT유전자에서 트랜스 스플라이싱의 결과 중 하나인 엑손 반복(exon repetition)을 확인하고, 이를 in vitro 상에서 증명하는 실험도 진행되었다.</p><p>정상적인 조직에서는 적은 양의 융합 전사체의 발현이 관찰된다. 정상 조직에서는 염색체의 재배열이 적기 때문이다. 따라서 트랜스 스플라싱을 연구하는 과학자들은 정상적인 조직에서 발현되는 전사체에 대하여 주목하게 되었다. 그 중 하나로 자궁 기질 암(human endometrial stromal sarcomas, ESSs)의 7번 염색체와 17번 염색체의 전좌에 의해서 형성된 JAZF1-JJAZ1의 융합 전사체와 유사한 전사체가 전좌가 전혀 일어나지 않은 정상의 인간 자궁 내막 기질 세포(human endometrial stromal cell line, HESC)에서 발견되었다. 이러한 사실을 고려해 볼 때, 정상조직에서 발견되는 융합 전사체는 트랜스 스플라이싱에 의해 형성될 가능성이 높다는 것을 시사한다. 따라서 우리는 현재 등록된 mRNA 데이터에서 배아줄기세포에서 발견되는 융합 전사체를 통해 트랜스 스플라이싱 전사체에 대한 분석을 하였다.</p>
염색체 전좌와 비슷한 전좌가 일어난 병은 무엇인가?
골수성 백혈병