<h1>서론</h1><p>벼는 세계인의 주곡이며 게놈의 크기가 작아 유전자기능을 연구하기 위한 모델 작물로 이용되고 있다. 국제 벼 염색체 완전해독연구 (IRGSP 2005)가 2004년에 완료됨과 동시에 국제적으로 벼 유용유전자 기능분석과 활용기반 기술 확보를 위하여 염색체 구조해석 및 비교유전체연구 (Ammiraju et al. 2008; Paterson et al. 2008)와 대량 유전자 기능분석연구 (Jung et al. 2008; Nakamura et al. 2007)가 경쟁적으로 이루어지고 있다. 벼의 주요 농업형질관련 유전자의 기능을 해석하기 위하여 발현유전자 분리 및 확보가 필수적이므로 다양한 품종에서 대량발현 유전자 염기서열분석 및 완전장 유전자 분리 연구가 수행되고 있다. 벼의 대량발현유전자 염기서열분석 및 완전장 cDNA 분리에 관한 연구를 일본 농업생물자원연구소의 Kikuchi 박사그룹 (Kikuchi et al. 2007)에서 수행하였다. 완전장 cDNA 분리는 벼 염색체 염기서열 완전 해독 연구에 된 사용된 품종인 Nipponbare를 이용하여 조직부위별 및 발현시기별로 완전장 cDNA 를 합성하고. 581,446 개 cDNA 를 분석하여 32,127개의 완전장 cDNA 를 분리하였으며 KOME DB (http://cdna01.dna.affrc.go.jp/cDNA)를 통하여 연구자들에게 발현유전자 정보를 공개하고 있다. 일본은 이러한 완전장 cDNA 정보를 이용하여 벼 염색체의 유전자구조 해석과 유전자 발현조절부위인 cis-element 탐색(Doi et al. 2008) 및 전사체의 발현유전자 annotation 분석 (The Rice annotation Project 2008) 등에 적극 활용하고 있으며 RAP-DB (http://rapdb.lab.nig.ac.jp)를 통해 유전자 해석정보를 공개하고 있다. 아울러 대량 기능분석 연구를 위한 벼 및 애기장대의 과발현체 작성 등의 연구 재료로 사용하고 있다. 미국의 게놈연구소에서는 벼 염색체 염기서열분석 정보와 발현유전자 정보를 기반으로 2006년 TIGR Pseudomolecules ver. 4 를 작성하고 벼 유전자 명명을 행하여 24,799 개의 유전자를 분석 (31,737 개 유전자 모델)하여 정보를 웹사이트 (http://rice.plantbiology.msu.edu)에 공개하고 있으며 (Ouyanget al. 2007) 이후 TIGR Pseudomolecules ver. 5 에서는 28,706개의 유전자분석 (33,882개 유전자 model) 정보를 공개하고 있다. 중국의 Bin Han 박사그룹 (Bin Han et al. 2008)은 indica 품종인 Guangluai 4 와 Minghui 63 을 이용하여 40,000 개의 발현유전자를 분석하였으며 20,000 여개의 완전장 cDNA를 분리하여 RICD DB를 통해 정보를 공개하고 있다 (http://www.ncgr.ac/ricd). 최근까지 GenBank에 1,248,660 개의 벼 발현유전자가 등록되어있으며 unigene으로는 40,739 개의 유전자를 포함하고 있다. 이러한 벼 발현유전자 정보와 유전자들을 이용하여 세계각국은 농업상 중요한 형질 유전자의 대량기능분석 (Nakamura et al. 2007) 및 유전자분리에 적극 활용하고 있다. 특히 벼의 종자는 인간에게는 영양원으로서 벼 자체로서는 생장을 위한 저장원으로 사용되어지므로 종자 형질관련 유전자 발현분석과 유전자분리 (Shomura et al. 2008; Song et al. 2007)에 많은 연구가 이루어지고 있다. 그러나 실제 벼 종자 발현 유전자 분석 및 정보 종합화 연구는 미흡한 실정이다.</p><p>본 연구는 미숙종자 발달단계의 cDNA 합성과 미숙종자내 발현유전자의 대량 염기서열 분석을 통하여 종자 내 발현유전자의 분석과 발현유전자 정보종합화를 목적으로 수행 하였다. 이러한 발현정보의 종합화는 벼 및 식물전반의 기능유전체를 연구하는 연구자들에게 보다 유익한 정보를 제공할 수 있을 것으로 기대한다.</p>
벼는 무엇의 크기가 작지?
게놈