<h2>Indel marker의 활용</h2><p>핵 DNA의 유전정보는 Mendelian inheritance를 따르는 유전양상을 나타냄으로, 대립인자의 유무에 따라 선친과 후대의 직접적인 혈연관계를 추정할 수 있는 매우 중요한 분자적 증거가 된다. 축산분야에서 핵 DNA의 유전정보는 다형성이 높은 marker의 조합을 통해 유전자 분석체계는 대규모 축군 내에서 개체식별뿐만 아니라 대부분 부분육으로 유통되는 축산물의 동일성검사를 통한 원산지 추적이 가능한 단계에 접어들었다. 특히 한우의 경우 우리나라에서 전면적인 DNA 기반 생산이력추적제와 도체에 대한 동일성검사의 정착으로 국내산 한우에 대한 유통 질서가 정착하는 데 크게 기여하였으며, 부가적으로 해외에서 수입된 수육과의 구분도 가능해졌다. 본 연구에서 발견된 Indel_15의 조사결과와 같이 특정 품종에서 어느 한 대립인자가 완전히 상실된 형태의 marker들을 조합한다면, 유전자 분석을 통한 품종의 식별이 훨씬 더 수월해 질 것으로 예상된다.</p><p>1990 년대 멸종위기 이후 복원된 제주흑우는 농촌진홍청 국립축산과학원 난지축산시험장과 제주도 축산진흥원에서만 보존되고 있으며, 최근 산업화에 농가의 강력한 요구에 따라 제주혹우 정액과 수정란을 농가에 보급하고 있다. Han 등은 제주흑우 유래의 ET, AI 후대우의 검출에서 한우의 생산이력추적제에 이용되고 있는 국제동물유전학회(International Society of Animal Genetics, ISAG) 권장 11종의 MS marker에 대한 정보만으로는 상대적으로 폐쇄축군인 제주흑우 집단에서는 다형성 빈도가 상대적으로 낮아 친자감별이나 개체식별의 효율성이 낮아 추가적인 marker 도입의 필요성을 언급하였고, 이에 따라 한우 생산이력추적제 marker 11 종외에 MS 11 종과 제주흑우 특이적 모색을 결정하는 MC1R와 ASIP의 SNP를 추가한 24 종의 유전자 marker 체계를 제안한 바 있다. Lim등은 MS 분석체계에서 marker의 구성이 한우 집단에서 정보력에 차이를 보여, 한우 생산이력추적제를 위한 분석체계의 도입에 적절한 구성이 필요함을 제안하였다.</p><p>본 연구에서 고안한 indel marker의 경우 제주흑우 집단에서 이형접합율, PIC 등이 상대적으로 높다는 점에서 향후 기존의 MS marker 위주의 유전자 검사 체계를 보완하거나 유전자형 판독에 있어 기술적인 어려움을 나타내는 MS marker를 대처할 수 있는 체계도 가능 하리라 판단된다. MS marker에 비해 indel marker가 비록 대립인자의 수가 한정되어 있어 기본적으로 PIC가 상대적으로 낮은 점은 없지 않지만, 친자감별 등에서 요구되는 명확한 유전자형의 판독 등에는 훨씬 더 유리하며, PCR 산물에 대한 agarose gel 전기영동만으로도 marker의 유전자형을 명확하게 판독할 수 있어, 표지된 형광분자를 확인하게 위해 이용되는 고가의 검사장비를 갖추지 않아도 된다는 장점이 있다고 하겠다. 향후 본 연구에서 고안된 indel marker들을 단독으로 또는 MS marker들과 조합하여 다량의 시료들을 신속하고 명확하게 분석할 수 있는 multi-plex PCR 기법 등이 개발된다면, 친자검정, 개체식별 등 혈통정립 사업뿐만 아니라, 제주흑우 생산이력추적제나 품종인증검사체계 등의 기틀을 마련하는 데 기여할 것으로 사료된다.</p>
DNA 기반 생산이력추적제는 국내산 한우의 유통 질서를 방해하고 한우와 수입육과의 구분을 모호하게 하는가?
NO