<h1>서 론</h1><p>과거부터 혈액형이나 혈액단백질의 동위효소에 대한 정보뿐만 아니라 최근에는 법의학적 검증에서 DNA 분석기법, 특히 초위성체(microsatellite marker, MS) DNA 표지인자의 반복양상에 따른 유전자형 자료를 기반으로 가축 품종들의 유연관계, 혈통 증명, 집단 식별 및 개체추적과 친자확인 등에 광범위하게 이용되고 있다. 또한 한우의 황모색, 제주흑우의 흑모색 등 품종 특이적 특성을 반영하는 유전자의 단일염기변이(single nucleotide polymorphism, SNP)와 부계(Y 염색체)나 모계(mtDNA) 유전을 통해 자손으로 전달되는 유전자의 다형성들은 검증 대상에서 특이적으로 중요한 정보의 보유여부를 판독할 수 있는 자료로써 활용 가능성이 제기되었다.</p><p>현재 우리나라에서 적용되고 있는 한우의 생산이력추적제나 품종식별 역시 이들 유전자 표지인자의 다형성을 근거로 적용되고 있다. Lim 등은 한우 생산이력추적제용 MS체계에서 marker의 구성에 따라 집단의 정보력에 차이가 있어 적정 집단의 다양성 정보를 보다 효율적으로 분석할 수 있는 체계의 구축을 제안한 바 있다. Han 등의 수정란이식과 인공수정 후손을 추적한 연구보고에서도 MS 이외의 marker들과의 적절한 조합이 필요함을 제안하였다. 현재 개체의 동일성검사나 친자감별 등에 활용되고 있는 MS marker의 경우는 상대적으로 높은 돌연변이율을 보이며, 암(cancer)이나 유전질환과 관련된 유전자의 구조적 돌연변이와 불안정성(MSinstability), 이형접합성의 획득/상실(gain/loss of hetero-geneity) 등을 나타내기도 한다. 특히 두개의 염기가 반복되는 di-nucleotide (nt) repeat MS의 경우는 실험과정에서 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR) 증폭 시 주형 DNA 서열의 단순반복에 의한 효소의 slip-page 현상에 의해 stutter band들이 형성되고 이는 유전자형의 결정에서 false positive를 나타낼 수 있는 원인이 된다. 또한 여러 개의 유전자들을 동시에 증폭하는 다중 증폭(multi-plex PCR) 시험은 효소의 차등 증폭양상을 나타내어 data의 일부가 상대적으로 낮은 수준으로 검출되거나 관찰되지 않는 결과를 초래하기도 한다. 이와 같은 문제점들의 보완을 위해 di-nt repeat MS marker set 분석에서의 문제점들을 해결하기 위해 상대적으로 다형정보량은 적으나, 돌연변이율이 낮은 tri-, tetra-nt repeat나 minisatellite, variable num-ber of tandem repeat (VNTR), SNP, indel marker 등에 의한 보완의 필요성이 제안되고 있다.<p><p>소에서는 전체 유전체 서열이 보고된 이후 next generation sequencing 등을 통해 다량의 유전체 정보들이 지속적으로 보고되고 있으며, 유전 정보들과 표현형의 상관관계의 분석이 진행되고 있다. 본 연구에서는 Bovine Genome Project에서 보고한 소의 유전체 서열과 발현서열표식(expressed se-quence tag, EST) database의 서열들을 비교하여 얻어낸 삽입/결실 다형을 나타내는 표지인자들을 한우와 제주흑우를 포함한 소 품종들에서 평가하여 다형성의 유형과 대립인자의 분포를 확인하고자 수행하였다.</p>
가축 계통의 집단 식별 및 개체추적과 유연관계, 혈통 증명, 친자확인 등에 사용되는 기술은 뭐야?
DNA 분석기법