<h1>서 론</h1><p>가축에서 소득과 연관되어 있는 경제형질의 선발은 전통적으로 개체의 표현형자료 및 혈연관계에 근거하여 분석되어 왔다. 그러나 최근 유전체정보를 활용한 연구 및 분석기법이 급속도로 발전함에 따라 분석비용이 감소하고 단기간에 대용량의 유전체 분석이 가능해져 가축의 개체별 유전능력 평가에 유전체 정보를 활용하는 기법이 상용화 단계에 접어들고 있다. 국내·외 육우 및 젖소의 경우 50K Illumina Bovine Bead chip을 이용하여 유전체 전장에 존재하는 약 5만개의 단일염기다형(SNP, Single Nucleotide Polymorphisms) 표지인자에 대한 유전자형 자료를 통한 유전체선발(Genomic Selection) 및 양적형질좌위(Quantitative Trait Loci) 탐색에 관한 연구가 활발하게 진행되고 있다.</p><p>가축에서 유전체 정보를 활용한 연관불평형(Linkage Disequilibrium; LD)의 추정은 동일품종 또는 이품종 간 유전적 다형성의 정도를 나타내 줄 수 있으며, 이는 SNP 또는 MS (Microsatellite) 표지인자를 통해 다양하게 측정 가능하다. 또한 연관불평형 추정은 가축에서 경제형질에 영향하는 양적형질좌위(QTL)의 발굴 및 유전체 선발의 타당성을 간접적으로 증명해 주는 도구로 사용된다.</p><p>실제 가축의 양적형질에 영향하는 유전자 수는 무수히 많고 각각의 유전자 효과는 비교적 적으며 이들간의 복합적인 영향으로 발현되고 있기 때문에 모든 유전자를 탐색하여 그 효과를 추정하는 것은 매우 어렵다. 따라서 표지인자에 대한 정보를 활용한 간접추정으로 가능하며, 이 때의 QTL과 표지인자간 연관불평형 크기는 표지인자가 QTL효과의 분산을 얼마나 설명할 수 있는지에 대한 정도로 나타내기 때문에, QTL 발굴에 앞서 표지인자간 연관불평형 크기의 추정은 상당한 의미가 있는 사전작업이라고 할 수 있다. 또한 연관불평형의 크기를 이용하여 세대별 유효집단의 크기를 추정할 수 있으며, 이를 통해 한우집단의 다양성 변화에 대해 간접예측이 가능하다고 하겠다.</p><p>본 연구는 이러한 견지에서 한우의 유전체 선발 및 마커도움선발(Marker Assisted Selection)에 대한 사전작업의 일환으로 고밀도의 단일염기다형 DNAchip을 이용하여 성 염색체를 제외한 모든 상염색체 단위에서 각 표지인자간 연관 불평형의 크기를 추정하였으며, 더불어 현재 및 선조세대의 한우에 대한 유효집단의 크기에 대한 변화를 알아보고자 수행하였다.</p>
전통적으로 개체의 현형자료 및 혈연관계를 분석하여 소득과 연관하여 선발하는 것은 무엇인가?
경제형질