<h2>연관불평형 추정</h2><p>일반적으로 연관불평형의 크기는 유효집단의 크기가 적을수록, 집단 내 근친도가 높을수록, 집단의 유전자 빈도가 뚜렷하게 다를 경우 \( r^{2} \)값이 커지게 되며, 가축의 육종에 있어서 연관불평형 정도 및 범위는 마커도움선발(Marker assisted selection) 및 QTL의 fine mapping에 중요한 정보를 제공한다.</p><p>한우에서 성염색체를 제외한 29개의 상염색체내 SNP표지 인자쌍간 물리적 거리별 \(r^{2} \)값에 대한 평균 및 표준편차에 대해 Table 3에 제시하였으며, 한우의 염색체내별 물리적 거리가 \( 0.0 \sim 0.5 \mathrm{Mb} \)인 표지인자쌍에 대해 표지인자거리별 \(r^{2} \)를 Fig. 2 에 나타냈다. 본 연구에서 추정된 연관불평형(\(r^{2}\))은 기존의 보고된 연구와 유사하게 표지인자간 거리가 짧을수록 높게 나타나는 지수분포 형태를 보였다. SNP표지인자간 거리에 따른 \(r^{2} \)를 보면, \( 0 \sim 0.1 \mathrm{Mb} \)일 때 \(r^{2} \)는 \(0.136\), \(0.1 \sim 0.2 \mathrm{Mb}\)에서 \(r^{2} \)는 0.06로 나타났다. Sargolzaei 등은 북아메리카에 홀스타 인종에 대한 연구에서 \( 0 \sim 0.1 \mathrm{Mb}, 0.1 \sim 0.2 \mathrm{Mb} \)일 때 \(r^{2} \)의 값은 각각 0.58과 0.15로 본 연구의 추정치 보다 상당히 높게 났으며, Stephanie 등의 전장의 유전정보를 활용해 앵거스, 홀스타인, 일본화우 등 8개 축우에 대해 연관불평형을 추정한 결과, \( 0.1 \mathrm{Mb} \)에서 \( 0.15 \sim 0.2 \)의 \(r^{2} \)값을 보였으며, 독일 홀스타인에 대한 연관불평형을 측정한 Qanbari 등의 연구 결과, \( 0.1 \mathrm{Mb} \)에서 \( 0.21 \)의 값을 보여 본 연구와 유사한 결과를 나타냈다. 또한 Lee 등은 한우에서 4,525개 표지인자를 이용하여 연관불평형을 추정하였는데 그 결과 \( 0.1 \mathrm{Mb} \)에서 \(r^{2} \)값이 약 0.1로 본 연구의 결과와 가장 흡사한 연관불평형의 값을 나타냈다.</p><p>연관불평형의 값으로 나타나는 \(r^{2} \)은 또한 양적형질좌위(QTL) 발굴에 대한 검정력에 영향을 미친다. Luo의 연구결과에 의하면 표지인자와 양적형질좌위 간의 \(r^{2} \)이 0.15이고, 표현형 데이터를 갖는 개체수가 250두일 때, 전체분산의 \( 5 \% \)를 설명하는 QTL을 찾는 것에 대한 검정력이 약 \( 20 \% \)였으며, \( 0.15 \)의 \(r^{2} \)에서 \( 95 \% \) 이상의 검정력을 갖기 위해선 약 2,000두의 검정자료가 필요할 것으로 추정하였다. Luo의 연구결과를 유추하여 해석한다면 한우의 개량에 있어서 유전체 정보를 이용할 경우, \( r^{2} \)의 증가에 의한 검정력을 증가시키기 위해서는 고밀도의 SNP정보를 이용하면 가능할 것으로 사료되며 현재 Bovine SNP 700 DNA Chip이 개발됨에 따라 기존보다 더 고밀도로 개체유전정보에 대한 분석이 가능해졌기 때문에 이를 양적형질좌위 발굴에 활용한다면, 표지인자간 연관불평형의 크기가 증가함에 따라 기존의 두수로 보다 높은 검정력을 얻을 수 있을 것으로 사료된다.</p>
본 연구에서 연관불평형은 표지인자간 거리가 짧으면 짧을수록 높게 나타나는 어떤 형태로 보였니?
지수분포 형태