
A Rede Vírus-MCTI comunica que a Rede Corona-ÔmicaBR-MCTI realizou estudo colaborativo que rastreou a transmissão interestadual da linhagem P.1, a diversificação da P.2 e identificou uma possível nova linhagem brasileira de SARS-CoV-2, sinalizando a importância da vigilância genômica. O trabalho é resultado do sequenciamento de 195 genomas provenientes da colaboração de pesquisadores de cinco estados (AM, RN, PB, BA e RJ) representando 39 municípios brasileiros. Participaram dessa inciativa o LNCC/MCTI, UFRN, UFPB, UESC e UERJ.
O esforço foi organizado pelo Laboratório de Bioinformática (LABINFO) do Laboratório Nacional de Computação Científica (Petrópolis-RJ), um instituto do Ministério da Ciência e Tecnologia, Inovações (MCTI), com o objetivo de compreender a existência de variantes genéticas do SARS-CoV2.
As amostras coletadas foram de indivíduos com resultados positivo para COVID-19 no período de 1 de dezembro de 2020 até 15 de fevereiro 2021, com faixa etária heterogênea, variando de 11 a 90 anos de idade, sendo 92 homens e 93 mulheres. Os resultados permitiram a inferência das datas de origem de P.1 (linhagem de Manaus) e identificar que a linhagem do Rio de Janeiro, P.2, descrita no final de 2020, apresenta diversificação à medida que se espalha pelo país. Além disso foi possível reconstruir as rotas de transmissão interestaduais dessas duas linhagens.
Importante ainda salientar que com o sequenciamento de três amostras que continham a mutação E484K, o presente estudo identificou uma possível nova linhagem de SARS-CoV-2 originada da linhagem B.1.1.33, que circula no Brasil desde o início de 2020. Esta nova linhagem contém a mutação E484K, na proteína S, associada ao escape imunológico e, portanto, pode ter implicações para planejamento de novas estratégias para o controle da COVID19.
Todos os dados foram disponibilizados em bases de dados públicos nacionais (Corona-Ômica.BR – MCTI) e internacionais (GISAID) juntamente com submissão do trabalho a periódico científico internacional.
Considerando que novas estratégias para controle da pandemia da COVID-19 necessitam de estudos colaborativos e em Rede e também devido ao surgimento e a disseminação de novas variantes circulantes de SARS-CoV-2, fazemos este anúncio em grupo antes mesmo que o artigo seja revisado pelos pares.
Além disso, fica claro a necessidade crescente de uma vigilância genômica eficaz para poder precocemente identificar potenciais mutações virais auxiliando desta forma o aprimoramento das vacinas atuais contra COVID19.
Os resultados são apresentados na tabela abaixo:





Cidade


Nº amostras


Data da coleta


Variante


Mutações






Floresta Azul/BA


1


24/01/2021


Derivada da B.1.1.33


S:E484K, Orf1ab:A2529V, Orf1ab:F3605L e Orf7b:E33A




Buerarema/BA


1


26/01/2021


Derivada da B.1.1.33


S:E484K, Orf1ab:A2529V, Orf1ab:F3605L e Orf7b:E33A




Natal/RN


1


01/02/2021


Derivada da B.1.1.33


S:E484K, Orf1ab:A2529V, Orf1ab:F3605L e Orf7b:E33A




Manaus/AM


4


18/01/2021 a 26/01/2026


P.1


 




Ilhéus/BA


1


14/02/2021


P.1


 




Itabuna/BA


1


8/02/2021


P.1


 




Conde/PB


1


27/01/2021


P.1


 




Ingá/PB


1


11/01/2021


P.1


 




João Pessoa/PB


2


21/01/2021 a 27/01/2021


P.1


 




Rio de Janeiro/RJ


4


19/01/2021 a 5/02/2021


P.1


 




Natal/RN


15


26/01/2021 a 1/02/2021


P.1


 




Buerarema/BA


1


21/01/2021


P.2


 




Camacan/BA


1


26/01/2021


P.2


 




Cordeiros/BA


1


14/02/2021


P.2


 




Floresta Azul/BA


2


7/02/2021 a 10/02/2021


P.2


 




Ilhéus/BA


4


25/01/2021 a 10/02/2021


P.2


 




Itabuna/BA


27


20/01/2021 a 14/02/2021


P.2


 




Itacaré/BA


1


28/01/2021


P.2


 




Itajuipe/BA


1


20/01/2021


P.2


 




Itapitanga/BA


2


20/01/2021 a 8/02/2021


P.2


 




Jussari/BA


2


31/01/2021


P.2


 




Maraú/BA


1


4/02/2021


P.2


 




Pau Brasil/BA


2


21/01/2021 a 4/02/2021


P.2


 




Alagoa Grande/PB


1


10/02/2021


P.2


 




Areia/PB


1


13/01/2021


P.2


 




Bayeux/PB


2


21/01/2021 a 25/01/2021


P.2


 




Cabedelo/PB


3


10/12/2020 a 23/01/2020


P.2


 




Campina Grande/PB


2


11/01/2021 a 26/01/2021


P.2


 




João Pessoa/PB


5


3/12/2020 a 25/01/2021


P.2


 




Queimadas/PB


2


12/01/2021 a 26/01/2021


P.2


 




Rio Tinto/PB


2


10/12/2020 a 27/01/2021


P.2


 




São José do Brejo da Cruz/PB


1


9/12/2020


P.2


 




Sapé/PB


2


21/01/2021 a 25/01/2021


P.2


 




Sossego


1


9/12/2020


P.2


 




Berford Roxo/RJ


2


25/01/2021 a 27/01/2021


P.2


 




Duque de Caxias/RJ


1


29/01/2021


P.2


 




Magé/RJ


1


5/02/2021


P.2


 




Nova Iguaçu/RJ


3


18/01/2021 a 29/01/2021


P.2


 




Rio de Janeiro/RJ


21


18/01/2021 a 5/02/2021


P.2


 




Natal/RN


24


26/01/2021 a 1/02/2021


P.2


 





 
Desta forma, recomendamos, que as providências cabíveis sejam tomadas pelos órgãos estaduais e federais competentes e agradecemos a colaboração das Universidade envolvidas e do suporte da Rede Rede Corona-ÔmicaBR-MCTI, Rede Corona-ômica-RJ da FAPERJ e da CAPES.
 
Rede Corona-Ômica.BR-MCTI