L'équipage , en mission depuis fin janvier , n'a pas été en contact avec un élément extérieur après cette escale à Brest , au cours de laquelle une relève d'une cinquantaine de personnes est montée à bord et des centaines de marins sont descendus à terre . Les premiers cas de maladie Covid-19 n'ont été identifiés qu'au cours de la première semaine d'avril , soit au-delà de la durée d'incubation ( quatorzaine ) habituellement admise pour le virus . La ministre des Armées Florence Parly avait indiqué vendredi que « plusieurs hypothèses » étaient « à l'étude » , y compris que le virus ait pu être déjà présent à bord avant l'escale . Si l'hypothèse de la montée du virus à bord lors de l'escale de Brest est privilégiée , « nous ne pouvons pas en avoir la certitude à 100 % » , a concédé le chef d'état-major de la Marine , l'amiral Christophe Prazuck , dans le Journal du Dimanche . Deux enquêtes , une de commandement et une épidémiologique , ont été diligentées sur la gestion de la crise d'une part , le processus de contamination du bâtiment d'autre part . Le général Lecointre a concédé que la question du maintien de l'escale à Brest s'était posée mais réitéré qu'au vu des connaissances du moment sur la propagation du virus , il n'avait pas été jugé nécessaire de l'annuler . La France n'était alors pas encore entrée en confinement . « La décision prise par le commandement des armées , par moi-même , par le chef d'état-major de la Marine , a été de maintenir cette escale parce qu'elle correspond ( ait ) à une nécessité logistique » , a-t-il souligné . Les familles n'ont alors pas été autorisées à monter à bord , comme cela avait été initialement prévu , a rappelé le général Lecointre , mais les marins qui le souhaitaient ont pu débarquer .