À l'annonce de l'élection du cardinal Joseph Ratzinger sur le Siège de Pierre en 2005 , les milieux œcuméniques se sont interrogés : l'auteur de la déclaration Dominus Iesus ( septembre 2000 ) , qui affirme que les Églises nées de la Réforme « ne sont pas des Églises au sens propre du mot » , allait-il poursuivre les efforts de rapprochement engagés par ses prédécesseurs depuis Vatican II ? Pourtant , dès le début de son pontificat , Benoît XVI a clairement affirmé sa volonté de « faire tout ce qui est en son pouvoir pour faire avancer la cause fondamentale de l'œcuménisme » . De fait , il poursuivit les relations développées par ses prédécesseurs . C'est à l'égard des orthodoxes qu'il manifeste le plus de proximité . Il rencontre à plusieurs reprises le patriarche Bartholomée , soulignant , en 2006 , la proximité théologique de l'Église catholique avec l'Église orthodoxe sur de nombreux points . Il reçoit également des représentants des confessions issues de la Réforme : anglicans et protestants ( méthodistes , luthériens et baptistes ) . En théologien rigoureux , il a aussi encouragé les Églises à s'interroger sur les buts de leur dialogue , qui pour être authentique ne saurait s'accommoder de « bons sentiments » . En 2006 , le pape Benoît prononce un discours à l'université de Ratisbonne sur le thème « Foi , raison et université » . Il commence son intervention en faisant référence à une polémique , vers 1391 , entre un empereur byzantin et un savant persan au sujet de la violence en matière de religion , citation mettant en cause le prophète Mohammed . Le monde musulman réagit vivement . Malgré toutes ses interventions fondées sur la conviction que le dialogue interreligieux est une « nécessité vitale » , il ne réussira pas à rétablir des relations de confiance avec les représentants de l'islam . Il multiplie pourtant les gestes comme ce temps de recueillement à la Mosquée bleue lors de sa visite à Istanbul en novembre 2006 .