Et ils sont troublants . Dans une étude collaborative avec des bio-informaticiens et des spécialistes de la phylogénie parue le 27 octobre dans le CNRS Journal , le virologue marseillais a entrepris de lire l'histoire de l'épidémie dans l'évolution du génome du virus , " un peu comme on interrogerait un arbre généalogique " , expliquait-il à La Provence . Le Sars-CoV-2 appartient à la famille des coronavirus qui infectent de nombreuses espèces de chauve-souris , " réservoirs " de ces virus . Les séquences génomiques d'échantillons viraux de malades infectés au début de l'épidémie ont révélé un taux d'identité de 99 , 98 % . Confirmant que cette souche virale transmissible entre les humains a émergé très récemment . Mais d'où provient-elle ? La piste du RaTG13 , un coronavirus collecté dès 2013 à partir d'excréments de chauve-souris fut écartée par Decroly . " Son génome est à 96 % identique à celui du Sars-CoV-2 . Mais il reste trop différent pour être directement à l'origine de la pandémie " . Il faut donc rechercher un virus plus proche , dans un hôte intermédiaire , une espèce dans laquelle le coronavirus aurait pu évoluer jusqu'à devenir susceptible d'infecter l'homme . C'est pourquoi tous les regards se sont tournés vers le pangolin , couramment vendu sur le marché de Wuhan , où a commencé l'épidémie , . Dans le génome d'un coronavirus infectant ces animaux , les chercheurs ont découvert un virus , apparenté au Sars-CoV-2 , qui contient une courte séquence génétique très proche , dans un domaine jouant un rôle clef dans l'entrée du virus dans les cellules humaines . Mais là encore , " le reste de son génome est trop différent de celui du Sars-CoV2 pour pouvoir en être un ancêtre direct " , a pu déterminer le virologue marseillais .