За да подпомогне капацитета на държавите-членки за реагиране при възникване на огнища на заразни болести или болести с неизвестен произход, ECDC се стреми да гарантира бързото мобилизиране на екипи за действия в огнища на заболявания, чийто експертен капацитет може да обхваща областите на епидемиологията, клиничната медицина, общественото здраве, контрола на инфекциите и т. н. Особено внимание се отделя и на мобилизирането на експертен капацитет по микробиология чрез мрежата от лаборатории за съдействие при поява на огнища на заболявания.
In order to support the Member States in their capacity to respond to outbreak situations related to communicable diseases or diseases of unknown origin, ECDC aims to ensure the rapid mobilization of outbreak assistance teams, whose expertise may include epidemiology, clinical medicine, public health, infection control, etc. Particular attention is also given to the mobilization of microbiology expertise, through the outbreak assistance laboratories network.