واکنشها به قتل فرخنده ملاها را برافروخته است
رهبران نیرومند دینی در افغانستان در مورد آزمونی نگرانی دارند که از ناحیۀ مظاهرات فعالان حقوق مدنی متوجه اقتدار ملاها در جامعه شده است.
شورای علمای افغانستان ، باصلاحیت ترین مرجع دینی آن کشور ، یک و نیم دهه پس از سقوط رژیم تندرو اسلامی طالبان ، هنوز هم نفوذ عمیقی در درون بافتهای جامعه افغانی دارد  .  اما مظاهرات اخیر در کابل شماری از روحانیان را واداشت تا حکومت را تهدید به قطع حمایت کنند  . محمد اشرف غنی رئیس جمهور افغانستان بار بار گفته است که فاصله میان ارگ و منبر را کم می‌سازد ، اما به باور برخی از اعضای شورای علمای افغانستان ، آقای غنی به اندازه حامد کرزی رئیس جمهور پیشین افغانستان با علما مشورت نمی‌کند  . عنایت الله بلیغ عضو شورای علمای افغانستان در صحبت با خبرگزاری رویترز حکومت را متهم کرده است که در درون خود سرگرم جدال قدرت است اما به گفته وی در بیرون قانون تطبیق‌نشده‌و کسانیکه به حریم اسلام تجاوز می‌کنند از کیفر به دور می‌مانند  . آقای بلیغ گفته است که حدود 7000 پیرو دارد که همه از هرگونه امر وی پیروی می‌کنند  .  او دولت را ترغیب کرده است تا جلو فعالان مدنی منتقد از روحانیان دینی را بگیرد در غیر آن هشدارگونه گفته است که می‌تواند کابل را از این رو به آن رو برگرداند  . شماری از مظاهرات با وصف کوچک بودن ، برای افغانستان تحریک‌کننده بوده است ، زیرا در آن فعالان آشکارا از قوانین و سنتهای موجود انتقاد می‌کردند  .  در مظاهراتی که پس از مرگ فرخنده در کابل صورت گرفت شماری از مظاهره‌کنندگان حتا شعار " مرگ بر ملاها " را سر دادند  . مزید بر آن ، چندی پیش یک زن فعال مدنی در شهر کابل در اعتراض به خیابان آزاری زنان با زره ستر‌کننده برجستگی‌های بدنش در جاده‌های شهر گردش کرد  .  در اعتراض دیگر گروهی از مردان با چادری زنانه در محضر عام بر آمدند  . عبدالبصیر حقانی رئیس شورای علمای افغانستان چند روز پیش در همایش بزرگی در کابل گفت که روحانیان دینی افغان در هفت ماه حکومت رئیس جمهور غنی به اندازه تحقیر شده‌اند که در هیچ مقطع تاریخ افغانستان پیشینه نداشته است  . در همین حال سخنگوی ریاست جمهوری افغانستان می‌گوید که رئیس جمهور غنی در تصامیم خود دو اصل اجماع و منافع ملی - را در نظر می‌داشته باشد و همواره بر اساس آن عمل می‌کند  . اجمل عبید عابدی می‌گویدکه در همه تصامیم رئیس جمهور افغانستان علمای دینی ، رهبران سیاسی و جهادی و اعضای جامعه مدنی مشورت می‌دهند  .  او می‌گوید که آقای غنی به گونه هفته وار و در روز‌های جمعه پس از ادای نماز ، با اعضای شورای علما دیدار کرده و از آنان در امور مشورت می‌خواهد  . با اینحال به تحلیل خبرگزاری رویترز حدود 3000 روحانی و عالم دینی که از سوی یک شورای مقتدر 150 عضوی در سرتاسر کشور رهبری می‌شود ، این توانمندی را در جامعه سنتی افغانستان دارند که از طریق مسجد و منبر افکار عامه را به گونه چشمگیری تحت تاثیر قرار دهند و کم از کم سنتگرایان دینی را بر ضد نظام بشورانند  .