دوسیه فرخنده در سیستم قضایی گیر مانده است
کمیتۀ وکلای مدافع قضیۀ فرخنده از ستره محکمه خواستار پیگیری این قضیه از مرحلۀ ابتدایی شده است.
رئیس کمیته وکلای مدافع قضیه قتل فرخنده می‌گوید که رئیس ستره محکمه از تطبیق عدالت در این قضیه اطمینان داده است  . نجلا راحیل که در راس کمیته پنج عضوی وکلای مدافع قضیه فرخنده قرار دارد به صدای امریکا گفت که یوسف حلیم ، قاضی القضات افغانستان اعتراضات کمیته وکلای مدافع را در پیوند با فیصله‌های محاکم ابتدایی و استیناف موجه دانسته است  . غفلت پولیس در هنگام وقوع رویداد ، گرفتار نشدن افراد دخیل در این قضیه ، کاستی در کار سارنوالی و دو محکمه برای پیگیری این دوسیه ، تغییر وصف جرمی و رهایی شماری از متهمان از اعتراضاتی است که وکلای مدافع برای بررسی پرونده فرخنده مطابق به قانون به ستره محکمه سپرده‌اند  . خانم راحیل به صدای امریکا گفت " ما خواهان نقض فیصله شدیم به خاطری اینکه خلای تحقیقاتی زیاد در دوسیه وجود داشت ما خواستیم که دوسیه نقض شود و از مرحله ابتداییه دوباره از سر پیگیری شود " . خانم راحیل می‌گوید که مطابق به قانون اجراات جزایی بررسی دوسیه در محکمه نباید بیشتر از دو ماه وقت بگیرد  .  او افزود که در چند روز آینده این مدت تکمیل می‌گردد  . مسوولان کمیسیون مستقل حقوق‌بشر نیز با ابراز نگرانی از فیصله‌های محاکم ابتدایی و استیناف گفته‌اند که در قضیه قتل فرخنده برخی اصول مراعات‌نشده‌و خیلی عجولانه تصمیم گرفته‌شده‌است  . ثریا صبحرنگ کمیشنر کمیسیون حقوق‌بشر در بخش زنان درمورد به صدای امریکا گفت " خلاهایی وجود داشت  ...  حکم به صورت دسته جمعی صورت گرفته درحالیکه نقشی که هرکدام از متهمین در قتل فرخنده داشتند باید تفکیک شود و نباید همه تحت یک ماده محکوم به مجازات شوند که قابل نگرانی است " . خانم صبحرنگ گفت که برگزاری جلسه سری محکمه استیناف نیز در پیوند با این قضیه پرسش برانگیز است  .  او افزود که در عدم حضور وکلای مدافع ، برگزاری جلسه محکمه خلاف قانون است  . نهاد‌های جامعه مدنی می‌گویند تا زمانیکه دوسیه قتل فرخنده به صورت شفاف آن بررسی نشود ، آنان به دادخواهی شان برای فرخنده ادامه می‌دهند  . در حال حاضر 12 تن از متهمین قتل فرخنده در حبس به سر می‌برند درحالیکه در آغاز این قضیه نزدیک به 50 تن به اتهام قتل وی بازداشت شده‌بودند  . فرخنده به تاریخ 28 حوت سال گذشته از سوی گروهی از مردان خشمگین به اتهام سوختاندن قرآن در زیارت شاه دوشمیره تا دم مرگ لت و کوب شد و سپس جسدش در بستر دریای کابل به آتش کشیده شد  .  قرار است به زودی کار اعمار آبده یادبود از فرخنده در محل سوختاندن جسدش آغاز گردد  .