توقيف ها، بازداشتها، رفتار با زندانيان، و خبرهای مربوط به جانباختگان رويدادهای اخير در ايران
علی لاریجانی خواستار مشخص شدن صحت مضامین نامه مهدی کروبی به اکبر هاشمی رفسنجانی شد، هشدار وزارت اطلاعات به روزنامه نگاران، نامه علی مطهری به حسين شريعتمداری، وضعيت انجمن صنفی روزنامه نگاران، عليرضا بهشتی
به دنبال اعتراض شماری از قانون‌گذاران و مقام‌های قضایی مجلس شورای اسلامی به ایجاد تغییرات در وزارت اطلاعات جمهوری اسلامی در آخرین روزهای عمر دولت نهم ، وزارت اطلاعات با صدور اطلاعیه‌ای به همه افراد به ویژه روزنامه نگاران هشدار داد تا از افشای هویت و سمت مقام‌های این وزارتخانه خودداری کنند  .  به گفته روابط عمومی وزارت اطلاعات ، اطلاعات مربوط به وزارتخانه از قبیل اسناد ، هویت پرسنل و ساختار وزارت اطلاعات جز موارد طبقه بندی‌شده‌محسوب می‌شود  .  پس از آنکه محمود احمدی نژاد ، محسنی اژه‌ای را از وزارت اطلاعات کنار گذاشت ، نام شماری از معاونت‌های این وزارت خانه در سایت‌های خبری منتشر شد که آن‌ها نیز از سمت‌های خود برکنار شده‌اند  .  این برکناری‌ها ، از سوی برخی از کارشناسان ، تصفیه حساب با انگیزه‌های سیاسی توصیف‌شده‌است  . علی مطهری نماینده مردم تهران در مجلس شورای اسلامی و فرزند آیت‌الله مرتضی مطهری در نامه‌ای به حسین شریعتمداری مدیر مسوول کیهان از مدیریت وقایع اخیر به شدت انتقاد کرده است  .  در نامه این نماینده تهران به مدیر مسول روزنامه کیهان در رابطه با وقایع اخیر در ایران آمده است : ما میتوانستیم این بحران را به گونه‌ای مدیریت کنیم که بسیاری از این شهادتها ، قتلها و آسیبها اتفاق نیفتد  .  و هیجان معترضان را با دادن چند مجوز تجمع و ادامه مناظرات درباره روند انتخابات در صدا و سیما به تدریج فرو بنشانیم و با مردم عادی که مساله‌دار و دچار شبهه شده‌بودند و واقعا فکر میکردند که در انتخابات تقلب‌شده‌با احترام برخورد کنیم  .  علی مطهری در بخش دیگری از این نامه آورده است  .  چند سال پیش در سالگرد حادثه 18 تیر در حوالی کوی دانشگاه به مدت پنج شب گروهی از مردم در خیابانها شعار می‌دادند و خودروها بوق میزدند و تجمعاتی برپا‌بود ، اما در این پنج شب حتی یک قطره خون از بینی کسی نیامد ، زیرا مدیریت آن بحران به عهده فرد عاقلی به نام قالیباف فرمانده وقت نیروی انتظامی‌بود  .  فرزند آیت‌الله مطهری می‌نویسد ما وقتی مدیریت بحران اخیر را به دست افرادی مانند طائب میدهیم که با باتوم بیشتر مانوس است تا فکر و عقل و تدبیر ، نتیجه همین خواهد‌بود  .  در همین حال ، روزنامه کیهان ، امروز در مطلبی تحت عنوان شاهد از دور و نزدیک رسید ، بدون انتشار کامل نامه علی مطهری ، فرزند آیت‌الله مطهری را فردی ساده اندیش و تحریک‌پذیر توصیف کرده که علاقه‌ای به مباحثه منطقی ندارد  . اقدامات هیات مدیره انجمن صنفی روزنامه نگاران ایران برای بازگشایی این انجمن و تعاونی مسکن آن ، هنوز به نتیجه نرسیده است  .  به گفته دبیر انجمن صنفی روزنامه نگاران ، ماموران دادستانی چند روز پیش ، مجموعه ساختمان این انجمن را تنها چند ساعت قبل از برگزاری نوبت دوم مجمع عمومی و فوق العاده ی روزنامه نگاران ، در ساعات غیر اداری ، و هنگامی پلمپ کردند که هیچ یک از مسئولان اجرایی انجمن در محل حضور نداشتند و ما هنوز دلایل این اقدام را دقیقا نمی‌دانیم  .  خانم مفیدی ، در گفت‌وگو با ماه منیر رحیمی ، به صدای آمریکا می‌گوید ، بستن انجمن آن هم تقریبا همزمان با روز خبرنگار ، احتمالا به نا آرامی‌های اخیر ایران و بازداشت شماری از روزنامه نگاران ، ربط دارد  . منابع خبری در ایران می‌گویند از ابتدای سال 1388 ، مسولان ، مجوز فعالیت یکصد و شصت موسسه قرآنی را لغو کرده‌اند  .  احمد حاج شریف ، معاون آموزش ، پژوهش و نظارت سازمان دارالقرآن کریم جمهوری اسلامی ، علت لغو مجوز این تعداد موسسه را ، عدم رعایت ضوابط اعلام کرده است  .  وی در سخنان خود اشاره‌ای به این ضوابط نکرده است  .  سازمان دارالقرآن کریم کشور ، خود را متولی امور مربوط به قرآن در سراسر ایران می‌داند  .  اخیرا نیز محسن نامجو ، خواننده مشهور ایرانی ، با شکایت عباس سلیمی ، عضو هیات امنائ سازمان دارالقرآن ، به تحمل پنج سال حبس محکوم شد  .  عباس سلیمی می‌گوید محسن نامجو در یکی از ترانه‌های خود به قرآن توهین کرده است  .  محسن نامجو این اتهام را رده کرده است  . پایگاه اطلاع‌رسانی حزب اعتماد ملی ، نامه‌ای از مهدی کروبی ، نامزد معترض به نتیجه انتخابات ریاست جمهوری خطاب به آیت‌الله هاشمی رفسنجانی ، رییس مجلس خبرگان رهبری منتشر کرده است  .  در این نامه ، از آقای رفسنجانی خواسته‌شده‌است به اخباری نظیر تجاوز شدید جنسی به شماری از دختران و پسران معترض به نتیجه انتخابات که توسط نیروهای امنیتی بازداشت شده‌بودند ، رسیدگی کند  .  به گفته مهدی کروبی ، اگر این مسایل را به‌طور متواتر از افراد مختلف که در روزهای اخیر آزاد شدهاند ، نشنیده‌بود ، باورشان سخت‌بود  .  علی لاریجانی رییس مجلس شواری اسلامی همچنین گفته است کمیته‌ای که مجلس هشتم برای بررسی وضعیت بازداشت شدگان اخیر تشکیل داده ، هنوز گزارشی به او ارائه نداده است  . علیرضا بهشتی ، پسر آیت‌الله بهشتی و نماینده میر حسین موسوی درهیات ویژه آسیب دیدگان روزهای پس از انتخابات ریاست جمهوری می‌گوید نام 69 نفر از کشته شدگان روزهای پس از انتخابات را به مجلس شورای اسلامی ارائه داده است  .  وی اضافه کرده که نام دویست و بیست نفر از بازداشتیان نیز به مجلس داده‌شده‌است  .  به گزارش خبرگزاری‌های ایران ، علیرضا بهشتی ، گفته است که به کمیته ویژه‌ای که مجلس شورای اسلامی برای بررسی وضعیت بازداشت شدگان اخیر تشکیل داده ، پیشنهاد‌شده‌است فراخوانی دهد تا خانواده‌ها اتفاقات رخ داده برای عزیزانشان را به این کمیته گزارش دهند و به آنان اطمینان داده شود که در صورت ارائه گزارشهای خود ، مشکلی برای آنان پیش نمی‌آید  .  در پی مخالفت آیت‌الله خامنه‌ای ، در نمازجمعه بیست و نهم خرداد ماه با برگزاری راه پیمایی‌های مسالمت‌آمیز مردم معترض به نتیجه انتخابات ریاست جمهوری ، چند ده نفر از مردم در خیابان‌ها به ضرب گلوله کشته و هزاران نفر نیز بازداشت شدند  .