اتهام معاونت در قتل به سعید مرتضوی تفهیم شد
سعید مرتضوی پس از عزل از مقام قضایی، به ریاست ستاد مبارزه با قاچاق کالا و ارز منصوب شد و بعد نماینده ویژه رئیس‌جمهوری شد
سعید مرتضوی ، دادستان پیشین تهران به معاونت در قتل تفهیم اتهام شد  .  پدر یکی از کشته شدگان زندان کهریزک در جریان وقایع پس از انتخابات 1388 ، با تایید این خبر به خبرگزاری فارس گفته است سعید مرتضوی پیش از عید و قبل از انتصاب به سمت ریاست سازمان تامین اجتماعی به دادرسی جلب شده‌بود  . عبدالحسین روح الامینی ، پدر محسن روح الامینی ، می‌گوید بازپرس پرونده تاریخ معینی برای صدور کیفرخواست علیه مرتضوی اعلام نکرده ، اما از پایان یافتن کار رسیدگی به پرونده و آماده بودن آن برای ارسال به دادگاه کیفری استان تهران خبر داده است  .  آقای روح الامینی با تایید احضار و تفهیم اتهام معاونت در قتل به سعید مرتضوی ، از اخذ آخرین دفاع از دادستان معزول تهران ورئیس سازمان تامین اجتماعی ابراز بی‌اطلاعی کرد  . در پی وقایع بازداشتگاه کهریزک که به کشته شدن دست کم سه جوان منجر شد ، علاوه بر دادستان وقت ، دستیاران او محمدعلی حیدری فرد دادیار ویژه امنیت ، و حسن زارع دهنوی معروف به قاضی حداد معاون امنیت دادستانی وقت ، در شهریور 1389 به حکم شعبه یک دادگاه انتظامی قضات از مقام‌های خود عزل شدند  .  علاوه بر « معاونت در قتل »، اتهام‌های « نقض حقوق شهروندی » و « هتک حیثیت ناجا » نیز به آنان تفهیم شد  . پس از تعلیق و عزل سعید مرتضوی از مقام خود در قوه قضائیه ، محمود احمدی نژاد در آغاز دولت دهم اورا به ریاست ستاد مبارزه با قاچاق کالا و ارز منصوب کرد  .  چندی پیش نیز برگماری سعید مرتضوی به عنوان نماینده ویژه رئیس‌جمهوری و مدیر عامل سازمان تامین اجتماعی با مخالفت نمایندگانی در مجلس هشتم روبرو شد  . توقیف فله‌ای مطبوعات در سال 1379 ، قتل زهرا کاظمی در سال 1382 و حمله به کوی دانشگاه نام مرتضوی را بر سر زبان‌ها انداخت  .  فروش سوالات کنکور و طرح امنیت اجتماعی نیز ازجمله مواردی هستند که علاوه بر بازداشتگاه کهریزک به او نسبت داده می‌شود  .  در سال‌های 1377 و 1378 نیز دو شکایت از مرتضوی ارائه شده‌بود که به دلایل نامعلوم بی‌اثر ماند  . در جریان وقایع بازداشتگاه کهریزک علاوه بر محسن روح الامینی ، محمد کامرانی ، امیر جوادی‌فر ، احمد نجاتی کارگر و رامین قهرمانی نیز جزو کشته شدگان هستند  .  اما به‌طور رسمی قربانیان کهریزک سه نفر اعلام شده‌اند  . خانواده‌های قربانیان گفته‌اند آنان « جوانان و دانشجویان این کشور‌بودند که نقشی در ایجاد آشوب نداشتند » .  سعید مرتضوی مرگ این جوانان را بر اثر بیماری مننژیت اعلام کرده‌بود ، اما در تحقیقات بعدی روشن شد که آنان بر اثر ضرب و شتم شدید و شکنجه و عدم رسیدگی پزشکی کشته شده‌اند  .