¿Qué es el ensamblaje de secuencias de ADN?
En bioinformática, el ensamblaje de secuencias se refiere a la alineación y fusión de fragmentos de una secuencia de ADN más larga para reconstruir la secuencia original. Esto es necesario porque la tecnología de secuenciación del ADN no puede "leer" genomas enteros de una sola vez, sino que lee pequeños fragmentos de entre 20.000 y 30.000 bases, según la tecnología utilizada. Normalmente, los fragmentos cortos (lecturas) son el resultado de la secuenciación de escopeta del ADN genómico, o de la transcripción de genes (EST).

El problema del ensamblaje de secuencias puede compararse a coger muchas copias de un libro, pasar cada una de ellas por una trituradora con un cortador diferente y recomponer el texto del libro simplemente mirando los trozos triturados. Además de la dificultad obvia de esta tarea, hay algunas cuestiones prácticas adicionales: el original puede tener muchos párrafos repetidos, y algunos fragmentos pueden modificarse durante la trituración y tener erratas. También pueden añadirse fragmentos de otro libro, y algunos fragmentos pueden quedar totalmente irreconocibles.
What is DNA sequence assembly?
In bioinformatics, sequence assembly refers to aligning and merging fragments from a longer DNA sequence in order to reconstruct the original sequence. This is needed as DNA sequencing technology might not be able to 'read' whole genomes in one go, but rather reads small pieces of between 20 and 30,000 bases, depending on the technology used. Typically, the short fragments (reads) result from shotgun sequencing genomic DNA, or gene transcript (ESTs).

The problem of sequence assembly can be compared to taking many copies of a book, passing each of them through a shredder with a different cutter, and piecing the text of the book back together just by looking at the shredded pieces. Besides the obvious difficulty of this task, there are some extra practical issues: the original may have many repeated paragraphs, and some shreds may be modified during shredding to have typos. Excerpts from another book may also be added in, and some shreds may be completely unrecognizable.