ستتسخ النارجيلة بغض النظر كم مرة تقوم فيها بتغيير الماء. يمكنك لحسن الحظ أن تنظفها بسهولة، خاصة إن قمت بذلك بشكل مستمر. تحتاج فقط إلى بعض الكحول الإيزوبروبيلي والملح.  يمكنك أيضًا أن تستخدم منتجات تنظيف أخرى لتنظيف أعمق. تتضمن مواد التنظيف الأخرى التي يمكنك إيجادها في المنزل والتي تستخدم غالبًا لتنظيف سريع بدون وجود كميات ضخمة من البقايا العالقة لإزالتها:   الخل وصودا الخبيز الماء الساخن ومنظف الأسنان الاصطناعية. استخدم منديلًا لتمسح أي بقايا كبيرة الحجم وسهل الوصول إليها، وجفف كل القطع. إن حاولت أن تنظف كل أجزاء النارجيلة دون فصل أجزائها، فقد تسبب كسرها إن سقطت منك دون عمد.  حاول ألا تدع الماء يتصرف عبر قطعة الفم، لأن هذا قد يجلب البقايا لأعلى تجاه الفتحة وأنت لا تريد أن تتذوق هذه البقايا لاحقًا. تأكد من وجود الكحول الكافي لتغطي أسطح القطع كلها، ثم اتركها جانبًا لتنغمس في السائل.   استخدم الكحول الإيزوبروبيلي بتركيز 91% متى أمكن ذلك، حيث أنه أكثر فعالية بكثير من كحول بتركيز 70% في إزالة البقايا. اغمر القطع ليلة كاملة لتجعل عملية التنظيف أسهل إن كانت شديدة الاتساخ. استخدم ملح الكوشر أو الملح ذا الحب الخشن كلما أمكن. استخدم ملعقتين صغيرتين من الملح إن كانت النارجيلة أكبر حجمًا، وطولها يصل إلى قدم. لا يذوب الملح في الكحول، فهو مادة كاشطة ستسمح لك بتنظيف النارجيلة من الداخل بفركها دون حتى أن تحاول الوصول إلى داخلها. سيضعف الكحول البقايا ويزيل عنها الرائحة، وسيعمل الملح على فرك القطع المتبقية عن الجدار. استخدم يدًا واحدة لتغطي القطعة من الأعلى، واليد الأخرى لتسد الفتحة في الجزع السفلي، ثم رج القطعة لتنظيفها. فكر في الملح وكأنه قطعة من الإسفنج، تستخدمها لتفرك أي قطع متبقية. دع القطعة تنغمر بعد أن تنتهي من رجها، بينما تعتني بالصحن والجزع السفلي. دع هذه القطع تنغمر قليلًا حتى تضعف البقايا فيها، إذ أن الصحن والجزع السفلي عادة ما يكونان أكثر اتساخًا من بقية النارجيلة. ضع بعض الملح في الحقيبة، ورجها جيدًا كما فعلت مع النارجيلة وحاول أن تدع الملح يمر عبر القطع.  ينبغي أن تستخدم حقيبتين منفصلتين لكل من القطعتين، حيث قد يسبب ذلك الرج أن تكسر قطعة الأخرى. امسح أي شئ يتبقى، حيث أن البقايا ستزول بسهولة بعد أن تتعرض للكحول. حاول أن تنقع القطع في الكحول ليلة أخرى إن ظللت تواجه مشكلة في تنظيف النارجيلة، وكرر الفرك بالملح في الصباح التالي وسيكون حظك أفضل عادة. نظف القطع من أي ملح أو كحول واشطفها جيدًا. ضعها جانبًا لتجف واستمر في الاستمتاع بها كالعادة. اخلط الماء الساخن مع عصير نصف ليمونة لتجعل النارجيلة تلمع، ورج النارجيلة جيدًا لتتخلص بقع المياه. يسهل ويسرع تنظيف النارجيلة في خمس دقائق فحسب من أن تنظفها في ساعة محاولًا أن تتخلص من البقايا العالقة كبيرة الحجم. خذ وقتًا لتفرك النارجيلة بالملح بشكل متكرر، مرة في الأسبوع إن كنت تدخن يوميًا. ستصير مالكًا سعيدًا لنارجيلة نظيفة لسنوات قادمة.
استخدم الكحول الإيزوبروبيلي والملح لتنظف الأنبوب بسرعة في المنزل. اغسل كل القطع منفصلة بالماء وجففها. ضع الصحن والجزع السفلي في أكياس صغيرة بسحّاب، واملأها بالكحول الإيزوبروبيلي. املأ النارجيلة بملعقة أو ملعقتين صغيرتين بالملح الخشن. صب نصف كوب من الكحول الإيزوبروبيلي ورج القطعة. ضع القليل من الملح في أكياس ذات سحّاب، وضع بداخلها الجزع السفلي والصحن ورجها جيدًا. استخدم أعواد التنظيف ومنظفات الأنابيب لتزيل أي بقايا مختبئة. اغسل كل القطع بالماء الساخن. نظف النارجيلة كل بضع أسابيع، لتمنع تراكم الأوساخ.