أشهر سبب للإصابة بنوبات الإسهال الحادة هي العدوى ببعض الميكروبات سواء كانت فيروسية أو بكتيرية أو طفيلية. وغالبًا ما تنتقل العدوى لجسم الإنسان من خلال الأيدي الملوثة، لذلك فإن غسل اليدين بالماء النظيف والصابون طريقة بسيطة للوقاية من الإسهال.  اغسل يديك قبل تناول أي طعام وبعد استخدام الحمام، واغسلها أيضًا بعد تغيير الحفاضات واللعب مع الحيوانات الأليفة والتعامل مع النقود. عند غسل يديك بالصابون اترك الرغوة على يديك لمدة عشرين ثانية قبل شطفها ولا تنس تنظيف تحت أظافرك. الفيروسات التي غالبًا ما تسبب الإسهال (خاصة في الأطفال) هي فيروس الروتا والنوروفيروس والفيروسات الغدانية.  من أشهر البكتيريا التي تسبب الإسهال السالمونيلا والمطثية العسيرة والبكتيريا الأولية والإشريكية القولونية والعطيفة. ومن الكائنات الأولية المسببة للإسهال الجياردية والأميبا المتحولة وخفية الأبواغ.  لا تبالغ في استخدام مطهرات الأيدي المضادة للبكتيريا التي تحتوي على الكحول لأنها تسبب بكتيريا عالية المقاومة تسمى بالبكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية والتي تسبب مزيد من العدوى. فأغلب أسطح الفاكهة والخضراوات الطازجة تكون ملوثة بالبكتيريا مثل الإشريكية القولونية والطفيليات، وغالبًا ما تأتي من سماد التربة و يرقات الحشرات. لذا عليك غسل الخضراوات والفاكهة الطازجة جيدًا قبل استخدامها أو تناولها.   حاول نقع الخضراوات والفاكهة في الماء الدافئ لمدة 30 دقيقة وغسلها جيدًا بفرشاة نظيفة بعض صودا الخبز ثم تُشطف جيدًا. من أكثر المطهرات الطبيعية الملائمة لتنظيف الخضراوات والفاكهة الخل الأبيض واليود المخفف وحمض الستريك وعصير الليمون الطازج والماء المالح والفضة الغروية. أحيانًا تنقل هذه المنتجات الطازجة سلالات معينة من الإشريكية القولونية المرضية والتي تنتج سموم تسبب الإسهال بمجرد هضمها في الأمعاء. هذه البكتيريا والتي تُسمى الذيفان المعوي ETEC هي أشهر سبب لمرض إسهال المسافرين. قد يكون مذاق مياه الصنبور في المنطقة التي تعيش بها ليس جيدًا، ولكن معظم مصادر المياه المحلية مُطهرة بالكلور ومواد كيميائية أخرى، ومن غير المرجح أن تصيبك بالعدوى. ومع ذلك فإن تطهير المياه في البلاد النامية والإستوائية قصة مختلفة، لذا عند سفرك لهذه الأماكن تجنب شرب مياه الحنفية أو صنع مكعبات ثلج منها أو غسل أسنانك منها. وبدلًا من ذلك عليك دائمًا شراء زجاجات المياه من المحلات وليس من الباعة الجائلين.  ومع ذلك قد تظل المياه ملوثة في البلاد النامية. كن حريصًا أيضًا عند استخدام المياه إن كنت تعيش بمنطقة ريفية، حيث أن مياه الآبار تكون ملوثة بفضلات البشر والحيوانات ومخلفات أخرى تحتوي على البكتيريا. إن كنت مهتمًا بجودة مياه الحنفية في منزلك، يمكنك شراء فلتر مياه بنظام متعدد المراحل، هذه الأنظمة لها القدرة على تنقية المياه من الطفيليات والجزيئات العالقة وكذلك المواد الكيميائية الضارة التي تؤدي إلى اضطرابات المعدة والإسهال.
الحفاظ على اليدين نظيفة. غسل الفاكهة والخضراوات الطازجة. شرب المياه النظيفة.