يحتوي مُطهر حمام السباحة على مستويات عالية من الكلور التي تمحو الطحالب وتُعقم حمام السباحة. اختر مُطهر قوي بحوالي 70% كلور، وهو ما يكفي للتعامل مع الطحالب الصعبة والبكتريا. اتبع الإرشادات الموجودة على عبوة التطهير للتأكد من استخدام كمية مناسبة للمياه في حمام السباحة.  إذا كان لديك كمية عالية من الطحالب في حمام السباحة، قد تضطر إلى علاجه أكثر من مرة لمنع الطحالب من التكاثر. قد تبدو المياه غائمة أو متسخة عند إضافة المُطهر، ولكن عندما تمر المياه خلال المرشح سوف يبدأ بتنظيفها. اسمح لمبيد الطحالب بالعمل في حمام السباحة لمدة لا تقل عن 24 ساعة. عندما تموت الطحالب، إما أن تسقط إلى أرض حمام السباحة أو تطفو على سطح الماء وسوف تفقد أيضًا لونها الأخضر.
عالج حمام السباحة بتطهيرة. عالج حمام السباحة بمبيد الطحالب عند اتخفاض الكلور عن 5.0. امنع تراكم الضغط في المرشح عن طريق تنظيفه باستمرار لإزالة الطحالب الميتة.