قد ينصح الطبيب بالتدخل الجراحي في حالات البثور كثيرة العدد أو اتساع المنطقة المصابة، أو تكرر العدوى بالفيروس. يتم استعمال محلول النيتروجين السائل في تجميد السائل بداخل البثور، مما يتسبب في تدمير الخلايا المكونة للبثور.يتم تنظيف البثور أولاً باستعمال الكحول، ثم يتم معالجتها بالنيتروجين السائل وحتى مسافة 5 مللم من الجلد المحيط بالبثرة. بعد ذلك يتم الانتظار لمدة 30 ثانية حتى يبدأ الجلد في التحول للون الأبيض، ثم يتم الانتظار لمدة من أجل ذوبان البثرة واختفاء اللون الأبيض. في حال كان الألم محتملاً يمكن تكرار عملية التجميد من جديد.  خلال 24 ساعة يتكون كيس ملئ بالسائل فوق المنطقة التي تم علاجها. يمكن تكرار هذه الطريقة بعد أسبوع أو أسبوعيْن على حسب الحاجة.  تختفي البثور في 75 إلى 80 بالمائة من المصابين عقب تكرار الجراحة من مرتين إلى أربع مرات على مدار 6 إلى 12 أسبوعًا.  هناك بعض المتاجر التي تتيح شراء العدة الخاصة بهذه الطريقة، ولكن من الأفضل أن يتم إجراء التنفيذ على يد الطبيب المختص. يستعمل الطبيب إبرة كهربائية ذات تردد عال من أجل فتح البثور. يقوم الطبيب بوضع المخدر الموضعي أولاً على المنطقة المصابة.يصف لك الطبيب العلاج عقب الخضوع لهذه الطريقة إذا ما لزم الأمر. لقد ثبتت فعالية هذه الطريقة في حالات عدد البثور القليل على ساق القضيب الذكري. يقوم الطبيب في هذه الحالة بإزالة البثور جراحيًا بالمبضع. يستعمل الطبيب المخدر الموضعي أولاً (ليدوكين 1%) وفي بعض الأوقات التخدير الكامل في الحالات المتقدمة. يقوم الطبيب بالخياطة بين طرفي الجلد السليم عقب إزالة البثور. تستعمل هذه الطريقة ليزر ثاني أكسيد الكربون من أجل إذابة البثور، وهذه الطريقة فعالة في الحالات المتكررة. من الممكن أن تتم هذه الجراحة في عيادة الطبيب عقب استعمال المخدر الموضعي أو التخدير الكامل.  يصف لك الطبيب بعض المسكنات عقب هذه الجراحة، حيث أن الكثير من المرضى لا يشعرون بالراحة بعدها.  من المهم ألا تتحرك أثناء جراحة الليزر من أجل تفادي الإضرار بالأنسجة السليمة.
استشر الطبيب بخصوص التدخل الجراحي من أجل العلاج. استفسر عن جراحات البرودة الشديدة. اسأل عن الجراحة باستعمال الكهرباء. حدد إذا ما كانت الإزالة الجراحية هي الحل الأفضل. اسأل الطبيب عن جراحات الليزر.