إجهاد الأمونيا (الأعراض الخطيرة التي تظهر على الأسماك عندما ترتفع مستويات الأمونيا) خطرٌ قائمٌ دومًا خلال عملية التدوير. يمكن أن تصبح هذه الأعراض مميتةً للأسماك في النهاية إذا لم يتم التعامل معها بسرعة. قلل مستويات الأمونيا بتغيير الماء لمراتٍ أكثر وتغيير حصصٍ أكبر منه في كل مرةٍ إذا رأيت الأعراض المذكورة أدناه:   الخمول/ نقص الحركة (حتى عند إضافة الطعام). رفض مغادرة قاع الحوض اللهاث للحصول على الهواء عند سطح الماء عيونٌ و/أو خياشيم و/أو فتحة شرجٍ ملتهبة. هناك نوعان منها: المزيل ومزيل السموم. تبيع معظم متاجر الحيوانات المنزلية والأحواض المائية كمياوياتٍ مصنوعةٍ خصيصًا لمعادلة الأمونيا في الأحواض. رغم أن هذه المنتجات يمكن أن تكون مفيدةً إذا ارتفعت مستويات الأمونيا لدرجة أنها بدأت تؤذي الأسماك إلا أنها قد تكون مفيدةً أكثر عند بدء حوضٍ جديدٍ حيث تسمح بتجاوز بعض تغيرات الماء وتقصير الوقت المطلوب لدورة حوضٍ جديد.   يعتقد البعض بأن مزيلات الأمونيا يمكن أن تكون ضارةً على المدى البعيد.  قد يكون هذا نتيجة فهمٍ خاطئ لعملية نزع السموم. تكون الأمونيا السامة (NH3 غاز) في تفاعلٍ قابلٍ للعكس مع أمونيا متأينة ليست شديدة السمية (NH4+) في الحوض. تقوم معظم المنتجات المزيلة للسموم بتحويل الأمونيا السامة إلى صورةٍ ليست شديدة الضرر على الأسماك. رغم ذلك فهي تطلق الأمونيا بعد 24 إلى 48 ساعة، لذا يجب استخدام هذه المنتجات للأسباب التالية:  ما دامت البكتيريا النافعة لم تتأسس بعد و تقوم بعمل تغييرٍ جزئيٍ للماء من وقتٍ لآخر (حسب إرشادات المصنع) لإزالة بعض الأمونيا المتراكمة  و جرعة مزيل السموم للحوض بأكمله وليس للجزء الجديد المضاف (المستبدل) من الماء فحسب حتى وإن لم يذكر ذلك حيث أن الأمونيا المقيدة في الحوض ستطلق قريبًا (بعد 24-48 ساعة من الجرعة السابقة).   تغيير 50% من الماء (أو أكثر) يطيل الوقت المطلوب لدورة الحوض بشكلٍ عام (أو ربما يوقفها) لأن البكتيريا النافعة ستكبح مؤقتًا وستحتاج وقتًا للتكيف مع معامل القلوية الجديد.  لهذا السبب يوصي البعض بتغيير معامل القلوية بمقدار أقل من 0.2-0.3 يوميًا. افترض أن معامل القلوية في حوضك 7.8 فإن استبدال 25% من الماء بمعامل قلوية 7 سيجعل معامل القلوية النهائي 7.6. تقوم البكتيريا النافعة بتحويل الصورة المتأينة (غير السامة) من الأمونيا لذا فهي تستفيد من هذه المنتجات أيضًا. . رغم الاعتقاد الشائع بأنها سمكةٌ متطورةٌ وجوهريةٌ لأحواض الماء إلا أنه لا ينصح بالسمكة الذهبية لدورة حوضٍ في الواقع. تنبع مشكلة السمك الذهبي من حقيقة اختلاف متطلبات رعايته عن أنواع الأسماك الاستوائية الأكثر شيوعًا في الأحواض المائية في الحاضر، لذا فقد يتسبب عمل دورة الحوض بالسمك الذهبي ثم ضبطه ليلائم الأسماك الاستوائية قد في موت بعض البكتيريا على الأقل بسبب ارتفاع الحرارة واختلاف ظروف الماء.  يجهد هذا السمكة الذهبية والبكتيريا والسمك الاستوائي وهو ليس وصفةً لحوضٍ صحي.   بالإضافة لذلك فإن الأسماك الذهبية الحديثة أكثر عرضةً للأمراض بطريقةٍ ما والتي يمكنها نقلها بسهولة في الحوض بأكمله.   لن ترغب في عمل دورة "أي" حوضٍ مائيٍ بما يسمى سمكة "المغذي" الذهبية والتي تتلقى عنايةً ضعيفةً من مربيها وبائعيها وهي أكثر عرضةً للأمراض.
عالج إجهاد المونيا خلال التدوير بتغيير الماء باستمرار. ضع معادلات الأمونيا في اعتبارك إذا تورطت في مشاكل السمية. استخدم السمكة الذهبية فقط لعمل دورة أحواض السمك الذهبي.