يتم تسمية المواقع المفضلة على متصفح إنترنت إكسبلورير باسم "Favorites" بدلًا من "Bookmark"، ويمكنك من أي مكان لعرضها، أن تحذفها من خلال الضغط بزر الفأرة الأيمن على أحد الروابط المدرجة في قائمة المفضلة ثم الضغط على "حذف". يمكنك إتمام عملية الحذف من خلال "شريط المفضلة الجانبي" أو من خلال "شريط قائمة المفضلة، ونشرح لك كلًا منهما بالتفصيل فيما يلي. يعرض لك هذا الشريط الجانبي كل المواقع التي سبق وحفظتها في المفضلة. توجد أكثر من طريقة لفتحه:   انقر على زر النجمة (☆) ثم اضغط على تبويب "المفضلة". انقر على Alt+C وانقر على تبويب "المفضلة". يمكنك كذلك استعراض المواقع المفضلة باستخدام مدير المواقع المفضلة على المتصفح. يتيح لك ذلك بسهولة توسيع أو ضم مجلدات حفظ المواقع المفضلة.   انقر على قائمة "المفضلة" (Favorites) ثم اختر "تنظيم المواقع المفضلة" (Organize favorites). إذا لم تظهر لك قائمة "المفضلة" فاضغط على زر Alt. انقر على المجلدات لتوسيعها أو ضمها/ غلقها. يمكنك من خلال حذف المجلد أن تتخلص فورًا من كل المواقع المفضلة المخزنة بداخله. يلجأ متصفح إنترنت إكسبلورير إلى تخزين المواقع المفضلة على هيئة ملفات يمكنك استعراضها من خلال مستكشف الويندوز (مستعرض المجلدات والملفات التقليدي للويندوز)، ويمكنك ذلك بشكل أسهل وأسرع من حذف الأعداد الكبيرة من المواقع المفضلة.   افتح مستكشف الويندوز بالضغط على ⊞ Win+E ثم اكتب في شريط العنوان المسار التالي C:\Users\username\Favorites. يفترض أن تظهر لك كل المواقع المفضلة المخزنة في إنترنت إكسبلورير من خلال هذا المسار على هيئة مجموعة من الملفات والمجلدات. يمكنك سحب ملفات المواقع المفضلة إلى "سلة المهملات" (Recycle Bin) أو تحديد ما ترغب بحذفه والضغط على زر الفأرة الأيمن واختيار "حذف".
انقر بزر الفأرة الأيمن على عنوان موقع إلكتروني مفضل ثم اختر "حذف". افتح الشريط الجانبي للمفضلة لاستعراض المواقع المفضلة المخزنة على المتصفح. افتح مدير المفضلة لعرض المواقع المفضلة. اوصل إلى ملفات تخزين المفضلة الخاصة بمتصفح إنترنت إكسبلورير.