ciprofloksacīns dažādos audos sasniedz lielas koncentrācijas piemēram plaušās (epitēlija sekrētos alveolārajos makrofāgos biopsijas audos) deguna blakusdobumos un iekaisušos bojājumos (kantaridīna bullu šķidrumā) vai uroģenitālajā traktā (urīnā prostatā endometrijā) kur kopējā koncentrācija pārsniedz koncentrāciju plazmā