galvenais jaunā protokola mērķis ir noteikt zvejas iespējas kas eiropas savienības kuģiem piešķirtas attiecībā uz pieejas tiesībām un nozares atbalstu un turpināt eiropas savienības un komoru salu sadarbību izveidojot partnerattiecības kurām atbilstīgi varētu īstenot ilgtspējīgu zivsaimniecības politiku un pareizu zivsaimniecības resursu izmantošanu komoru salu zvejas zonā abu iesaistīto pušu interesēs