rezistence pret makrolīdiem var veidoties mutācijas rezultātā gēnos kuri kodē ribosomu rns (rrns) vai dažas ribosomu olbaltumvielas 23s rrns mērķa vietas fermentu modifikācijas (metilācijas) rezultātā kas parasti izraisa krusteniskās rezistences veidošanos pret linkozamīdiem un b streptogramīniem (mlsb rezistence) fermentu inaktivācijas rezultātā vai makrolīdu noplūdes dēļ