قد أشارت أدلة تطور السلالات إلى أن كلًّا من فيروس كورونا البشري-NL63 وفيروس كورونا البشري-229E ربما نشآ من فيروسات كورونا للخفافيش، في حين عُثر على الفيروسات الأب لفيروس كورونا البشري-OC43 وفيروس كورونا البشري-HKU1 في القوارض.