ينبغي الانتباه إلى أن الانتقاء الاصطناعي أيضًا يمكن أن يساعد على التغيُّرات غير المقصودة في الجينوم الفيروسي، والتي ينتج معظمها على الأرجح من تخلُّص الفيروسات من الضغوط الانتقائية المبذولة، مثل ما يحدث بواسطة الجهاز المناعي للمضيف.