في أبريل 2003، في أعقاب تحذيرات من قبل إدارة بوش لحكومة سوريا، أدان ايغلبرغر احتمال القيام بعمل عسكري في سوريا أو إيران، قائلا ان الرأي العام لن يؤيد مثل هذه الخطوة، وأنه "إذا كان الرئيس بوش كانت تحاول ذلك الآن، حتى أنني أشعر أنه ينبغي أن البشرة على قيد الحياة".