وهذه الأجهزة المتميزة كبيرة وغالية الثمن ومكلفة في تشغيلها وصيانتها، وتحد من التطبيقات المحتملة لتضخيم الحمض النووي في حالات خارج المختبر (على سبيل المثال، في تحديد الكائنات الحية الدقيقة التي من المحتمل أن تكون خطرة في مكان التحقيق أو عند رعاية المريض).