وبدأت الموجة الثانية وأكثر شمولا وعلى نطاق واسع من 29 مارس 1987 حتى 23 أبريل الجاري، 1989، عندما قام الجيش العراقي بقيادة علي حسن المجيد نفذت حملة إبادة جماعية ضد الأكراد، والتي تتميز بانتهاكات حقوق الإنسان التالية: الاستخدام الواسع النطاق للأسلحة الكيميائية، وتدمير بالجملة من بعض القرى 2000، وذبح حوالي 2،000 الأكراد في المناطق الريفية، من قبل أكثر التقديرات تحفظا.