يعكس الترانسكربيتوم الجينات التي تم تعبيرها بنشاط في أي وقت محدد وذلك لأنه يشمل كل ناسخات الرنا في الخلية باستثناء ظاهرة تحلل "الرنا المرسال" مثل توهين الناسخات (بالإنجليزية: Transcriptional Attenuation).