تُقسّم السُّلطات الحوت الأزرق إلى ثلاث سلالات أو أربع، وهي: ("B. m. musculus") وهو الحوت الأزرق الشمالي الذي يضم المجموعات التي تعيش في شمال المحيط الأطلسي وشمال المحيط الهادئ، و ("B. m. intermedia") وهو الحوت الأزرق الجنوبي الذي يعيش في المحيط المتجمد الجنوبي، و ("B. m. brevicauda") وهو الحوت الأزرق القزم الذي يعيش في المحيط الهندي وجنوب المحيط الهادئ، وأما الحوت الهندي الكبير ("B. m. indica") الذي يعيش في المحيط الهندي، فهو الأكثر إشكالية بين هذه السلالات، فهناك من يصنفه في سلالة مستقلة، وهناك من يجعله هو وسلالة سلالة واحدة.