والمشكلة لا تكمن في العلاقات المؤسسية بين المنظمتين، إلا حين يتصل الأمر بالمشكلة المهمة رغم ضيق نطاقها، وهي مشكلة تركيا وقبرص، اللتين تصران حتى الآن على متابعة نـزاعهما الثنائي دون أي اعتبار للمخاطر الحقيقية التي يتعرض لها أفراد من حلفائهما وشركائهما، في أفغانستان وكوسوفو. والمشكلة الحقيقية تدور حول العلاقات بين الولايات المتحدة والبلدان الأوروبية، التي ينتمي 21 بلداً منها إلى كل من المنظمتين.