لا يزال تمييز المخاطر التي تشكلها مكونات الطعام المصنوعة من هذا النوع من الهندسة الوراثية- والمختلفة عن تلك التي تعرف بإنها جاءت من انواع اخرى من الاطعمة المعدلة وراثيا- في مراحله المبكرة . لقد خلصت اللجان العلمية التابعة للاتحاد الاوروبي الى نتيجة مفادها هو انه بينما يتوجب تطبيق تقييم المخاطر الذي يتم استخدامه في تقييم المتعضيات المعدلة وراثياعلى جوانب من البيوليوجيا الصناعية ، الا انه في حالات معينة فإن هناك حاجة لمقارابات جديدة لتقييم سلامة التقنية.