لا شك أن التجارب السريرية الشفافية ومنصات البيانات المفتوحة تثير مخاوف أخلاقية مشروعة وأخرى تتعلق بالملكية الفكرية. ويظل الاستخدام الرحيم للعقاقير (توفير العقاقير التجريبية في الظروف الطارئة) مثيراً للجدال. ونظراً لارتفاع تكاليف البحث والتطوير فمن الطبيعي أن تخشى شركات الأدوية من إقدام المنافسين على هندسة عقاراتها عكسياً (لمحاولة إعادة تصنيع أدوية مشابهة).