ان فيروس نقص المناعة البشرية يمثل اكبر تحدي نظرا لان الفيروس يستفيد من التقلب الجيني المكثف من اجل الاختباء من النظام المناعي ولكن في الاكتشافات الاخيرة تمكن العلماء من تحديد مناطق عالية الحفظ في هذه الفيروس المتقلب كما تمكنوا من تحديد تركيبتها الجزيئييه وبدأوا بتصميم لقاح الجيل القادم من اجل انتزاع اجسام مضادة تستهدف تلك المناطق وذلك من اجل منع العدوى من فيروس نقص المناعة البشرية ولكن تطوير لقاح فيروس نقص المناعة البشرية مثل غيره من الامراض تحد من نجاعته محدودية النماذج الحيوانية في افادتنا بكيفية الحصول على ردة فعل المناعة الضرورية في البشر.