في أوج الحرب السوفييتية الأفغانية في ثمانينيات القرن العشرين، كانت باكستان تخدم كقناة سرية للمقاتلين المسلمين الفلبينيين، يمرون عبرها إلى أفغانستان ثم يعودون إلى جزيرة مينداناو، التي ظلت لمدة طويلة معقلاً للمتمردين المسلمين. ولقد كانت خبراتهم وتجاربهم في حرب العصابات سبباً في ظهور الزعماء بينهم، من أمثال الأخوين عبد الرزاق و خدافي جنجلاني اللذين أسسا جماعة أبو سيف الإرهابية، والتي تعيث فساداً ودماراً في الفلبين الآن.