السبب الأول هو الإرث الذي خلفه الاستعمار. ففي عشرينيات وثلاثينيات القرن العشرين انتهجت بلجيكا سياسات استهدفت تحديد العناصر السكانية على أساس عرقي، وميزت التوتسي في محاولة متعمدة وناجحة لنثر بذور الفرقة في المجتمع وتهييج مشاعر الاستياء بين زعماء الهوتو.