يتزايد تعقيد التحديات التي تواجه جوكوي بفعل حقيقة مفادها أن ائتلافه الحاكم فاز بنحو ثلث المقاعد فقط في البرلمان، في حين حصل الموالون لائتلاف منافسه في الانتخابات الرئاسية برابو سوبيانتو ببقية المقاعد. لذا، فيتعين على جوكوي عندما يقدم نمطاً جديداً للحكم، والذي يتجسد في التعيينات الوزارية على أساس الجدارة، أن يتوخى الحذر خشية تنفير النخب السياسية وكبار رجال الأعمال الذين استفادوا لفترة طويلة من إحكام قبضتهم على السلطة.