بعد تصوير فيلم Where the Heart Is، انتقلت بورتمان إلى مساكن جامعة هارفارد للحصول على درجة البكالوريوس في علم النفس. قالت في مقابلة أجريت عام 1999 إنها لن تلعب في السنوات الأربع المقبلة من أجل التركيز على الدراسة. خلال عطلة الصيف من يونيو إلى سبتمبر 2000، قامت بورتمان بتصوير فيلم Star Wars: Episode II <unk> Attack of the Clones في سيدني، إلى جانب إنتاج إضافي في لندن. في يوليو 2001، افتتحت بورتمان في مسرحية نيويورك العامة لـ The Seagull لـ تشيخوف، من إخراج مايك نيكولز؛ لعبت دور نينا جنبا إلى جنب مع ميريل ستريب وكيفين كلين وفيليب سيمور هوفمان. افتتحت المسرحية في مسرح ديلاكورت في سنترال بارك. في نفس العام، كانت واحدة من المشاهير الذين قدموا العديد من المظاهر الكاميوية في فيلم كوميدي زول ماونتون. في عام 2003، قررت بورتمان أن تلعب دور
للتركيز على الدراسة