على الرغم من أن مندلييف قد تم تكريمه على نطاق واسع من قبل المنظمات العلمية في جميع أنحاء أوروبا، بما في ذلك (في عام 1882) ميدالية دافي من الجمعية الملكية في لندن (التي منحته لاحقاً أيضًا ميدالية كوبلي في عام 1905) ، إلا أنه استقال من جامعة سانت بطرسبرغ في 17 أغسطس 1890. تم انتخابه عضواً أجنبياً في الجمعية الملكية (ForMemRS) في عام 1892، وفي عام 1893 تم تعيينه مديرًا لمكتب الأوزان والمقاييس، وهو المنصب الذي شغله حتى وفاته. كما قام مندلييف بالتحقيق في تكوين النفط، وساعد في تأسيس أول مصفاة للنفط في روسيا. وقد أدرك أهمية النفط كمواد غذائية للبتروكيماويات النفطية. يُنسب إليه إشارة إلى أن حرق النفط كوقين "سيكون مثل إشعال موقد مطبخ مع ملاحظات". في عام 1890،
استقال من جامعة سانت بطرسبرغ