ولدت واتسون في باريس، فرنسا، وهي ابنة المحامين الإنجليز جاكلين لوسبي وكريس واتسون. عاشت واتسون في ميسونز لافيت بالقرب من باريس حتى سن الخامسة. انفصل والداها عندما كانت صغيرة؛ بعد طلاقهم، انتقلت واتسون إلى إنجلترا للعيش مع والدتها في أوكسفوردشاير بينما قضت عطلات نهاية الأسبوع في منزل والدها في لندن. ذكرت واتسون أنها تتحدث بعض الفرنسية، على الرغم من أنها "ليست كذلك" كما اعتادت. بعد الانتقال إلى أوكسفورد مع والدتها وشقيقها، درست في مدرسة دراغون في أوكسفورد، وبقيت هناك حتى عام 2003. من سن السادسة، أرادت أن تصبح ممثلة، وتدربت في فرع أوكسفورد من Stagecoach Theatre Arts، وهي مدرسة بدوام جزئي حيث درست الغناء والرقص والتمثيل. وعلى الرغم من أن واتسون عاشت أربعة أشهر من العمر العاشرة، إلا أنها قد شاركت في مسرحات ومس
ما يصل إلى خمس ساعات في اليوم