يُعتقد أن المياه موجودة في أعماق الغلاف الجوي، لكن تركيزها المقياس مباشرة منخفض جداً. يزيد وفرة النيتروجين والكبريت والغازات النبيلة في الغلاف الجوي لنجوم المشتري عن القيم الشمسية بمقدار ثلاثة. يفتقر الغلاف الجوي لنجوم المشتري إلى حدود أدنى واضحة ويتحول تدريجياً إلى داخل الكوكب السائل. من أدنى إلى أعلى طبقات الغلاف الجوي هي الغلاف الاستوائي، الستراتيجي، الهيليوم والهباء. كل طبقة لها تدرجات درجة حرارة غير مميزة. على الرغم من أن طبقة الغلاف الجوي لها نظام معقد من الهيدروجين والهيليوم، فهي تحتوي على كميات صغيرة فقط وتشمل الميثان والأمونيا والأمونيا. يُعتقد أيضًا أن الغلاف الجوي له طبقات من السحب الاستوائية المعقدة، والهباء المتناثرة، والتي تُسمَّى بـ "الظاهرات
اثنين أو ثلاثة أرض