تم حرق القصر تمامًا خلال الغزو الياباني في عام 1592 وتم إعادة بنائه في عام 1609 من قبل الملك سونجو والملك غوانغهاغون. تم حرق القصر مرة أخرى في عام 1623 بسبب الثورة السياسية للملك إنجو ضد غوانغهاغون. كما تعرض القصر لهجوم من قبل مانشو تشينغ ولكن طوال تاريخ إعادة الإعمار والإصلاح ظل مخلصًا لتصميمه الأصلي. كان تشانغديوكجونغ موقعًا للمحكمة الملكية ومقر الحكومة حتى عام 1868، عندما تم إعادة بناء جيونغ بوك الجار. عاش آخر إمبراطور لكوريا، سونجونغ هنا حتى وفاته في عام 1926. سمح لأعضاء آخرين من العائلة الملكية السابقة بالعيش في أجزاء من القصر مثل الأمير السابق يون يون يي الذي عاش في قاعة ناكسيون (قاعة) مع زوجته الأميرة بانجا و الأميرة بونجي و أخته الأميرة ديهوك حتى توفي. كما تم إيقاف ابن يون يون يي غير القادر تاريخيًا
عام 1926