من بين أنواع الكائنات الحية الدقيقة الواسعة، عدد قليل نسبياً منها يسبب الأمراض في الأفراد الأصحاء. الأمراض المعدية تنتج عن التفاعل بين تلك العدد القليل من مسببات الأمراض ودفاعات المضيفين الذين يصيبونهم. مظهر وشدة المرض الناتج عن أي مسببات الأمراض، يعتمد على قدرة تلك المسببات على إلحاق الضرر بالمضيف بالإضافة إلى قدرة المضيف على مقاومة المسببات. ومع ذلك، يمكن لنظام المناعة في المضيف أن يسبب ضررًا للمضيف نفسه في محاولة للسيطرة على العدوى. ولذلك يصنف الأطباء الكائنات الحية الدقيقة المعدية أو الميكروبات وفقا لحالة الدفاعات المضيفة - إما كمسببات الأمراض الأولية أو كمسببات الأمراض الانتهازية:  إحدى الطرق لإثبات أن مرض معين "عدوى"، هو تلبية افتراضات كوخ (التي اقترحها روبرت كوخ لأول مرة) ، والتي تتطلب أن يتم تحديد العامل المعدي فقط في المرضى وليس في الضوابط السليمة، وأن المرضى الذين يصابون بالعامل يصابون بالمرض أيضًا. تم استخدام هذه الافتراضات لأول مرة في اكتشاف أن أنواع ميكوباكتيريا تسبب السل. لا يمكن تطبيق افتراضات كوخ أخلاقياً على العديد من الأمراض البشرية لأنها تتطلب العدوى التجريبية لفرد صحي بمرض مسبِّب ينتج كثقافة نقية. في كثير من الأحيان، حتى الأمراض المعدية الواضحة لا تستوفي المعايير المعدية. على سبيل المثال ، لا يمكن زراعة Treponema pallidum ، spirochete المسببة لداء الزهري ، في المختبر - ومع ذلك يمكن زراعة الكائن الحي في خصيتين الأرنب. من غير الواضح أن الثقافة النقية تأتي من مصدر حيواني يعمل كمضيف أكثر مما تكون عليه عندما تكون مشتقة من الميكروبات المستمدة من ثقافة الصفيحة. علم الأوبئة هو أداة مهمة أخرى تستخدم لدراسة الأمراض في السكان. بالنسبة للأمراض المعدية، يساعد ذلك على تحديد ما إذا كان تفشي المرض متفرقًا (حدوثًا عرضيًا) ، أو متوطنًا (حالات منتظمة تحدث في كثير من الأحيان في منطقة ما) ، أو وبائيًا (عددًا كبيرًا غير عاديًا من الحالات في منطقة ما) ، أو وبائيًا (وباء عالمي).  أجب على السؤال التالي:  1. ماذا يستخدم لدراسة مرض بين مجموعات معينة؟ 2. ماذا يُستخدم؟ 3. ما هي طريقة لإظهار أن المرض يمكن أن ينتقل إلى الآخرين؟ 4. كم عدد الكائنات الحية الدقيقة التي تسبب الأمراض؟ خمسة. ما هي المجموعات المعدية؟ ستة لماذا لا يمكن تطبيق اقتراح كوخ أخلاقيا؟ سبعة. ما هو المفيد من استكشافه أثناء تفشي المرض؟ ثمانية من أيضاً يمكن أن يسبب جهاز المناعة للضيف الضرر؟ تسعة ما الذي يسبب السل؟ عشرة ما الذي لا يمكن زراعته في المختبر؟  إجابات مرقمة:
1. علم الأوبئة 2. لدراسة المرض في السكان 3. تلبية افتراضات كوخ 4. قليلة نسبياً 5. كمسببات الأمراض الأولية أو كمسببات الأمراض الانتهازية ستة، سيتطلب الأمر إصابة شخص صحي تجريبياً لتحديد ما إذا كان تفشي المرض متفرق 8. إلى المضيف نفسه تسعة أنواع الميكوباكتيريا 10. الزهري